Chy1G008240 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCATGCCCTTTGCCTTGTCACATAGAGGTTCTTAGTACTACCCTGGCCGCATAGCATCACACAAAGACTTGGTTGCGTAGTTTTTTCCTTAGTCGCAAAGCCTCATCCACCATAAACCTACTTCCTTGGCCATGTCGCCTAGTACTTGCTTGACACTCCTCGCCTAGCACTTCCCTTTGCCCAACCTCTAGCACCCATGGCCACCTAAAAGCTTGTCTTTTGGAGGTTCTCATGATACTCTTGGTCGCCTAGTACTTGTCCAACCATTCTAAAAGTCTAGCTCACTAGCCTAACACTTAGCCAAAATTTCCATCTTTCTTTCCTTCCTTTTTAAATCTACCTAGCAACAACAACCACTAATCTTAACCGTAACTCTCTTGCTAAATTACTTTAAAAATCTAAGGTTAATGAGGACTAGTGTTTACATTGTGACTTCGGTAGAGAAACATTATCATAAAGAAAAAGCTCCACAAGAAAAAAGAAAAAAAATTGGAAGCAAAATTTGTATTTCAGGATAATGATACATTTGACCTATCCAGTATGAAAAATTTGGATGTAACAGACTTCTTTGAATCATCTTAAAAGAAAAGTGACATAATGATGGCATGACATATTAAGTATCTTTTTTTTTTATTTGTAAATATTTATTAATGTTGTTTGTTTTGTTTATCTATCTTTCAAATTTTTTTTTTTTGAAAAAAAGGTTAGACTTTTGTATTTCAAATTTTCTTTTCCTTATTATAATTATTTTGTTTAATGAAGAATCCTGGATCATTTTCATATGCTATATAACTAAAATGAAGATATATGTCCGGTAGATTATGCAACTACACATACAAATGCTTACAAATAGAAAATATTTTTTTCAAGCTTTCAATGTTGTTAACAAAAGTCAATACAATGTCAGGTTTTACAAATCTAATTGAAGAATTTGGAAACTTCTAAACCTTGACTACCAAACTTTTGAGACGAGTTTAAGCACTTAATTTTAGCATTCTCATATGAAGATATCAAATTTACATACATGTAGATTTAATTTAGCTTCTAAAAGGTATTAAAATAAAAACATAATGAGAGATGAATTCATATTGGAAAGTTGCTTCATTGAAACAAAATCATATATAGTTGGATTGTTTCTCCTCTCTTTTGATATCTTTGTTTCTATCACAACAGTAGTAGCAACTTGATATACATTTTCCTAACTTTTGCCTATACAAATTTAGTCAATGGGAGGAGATGATAATATACTTGAGAATATGTTGATTTTCATATATTACTTTGTATTATTCAATAGTATTAAATTTTGCATGTGTGATAAGACATTTTCATTTCCATGGATTTGATTAACTTGAAGAAGTAAATCGATATTTTCATGAAACATAAATTGTGTTAACAAGGTTGTCCAAGCTCACAAGCAGGTCAAAGCCCAAGAAGACCAAGAGGTATTGTGAGGGACCTTGCATTATCCTTAAATTTGAAAAATTGGACTCTCGGATTCTAGGTCGACCAAATAAGTTTGAGGGATCGTATAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAACTGAGTTGAGCTTGTCATCGACACTCTGACCTCGAAGGGCATAATGATCATTTCATGACACAGTTGATGTTCCATGTAAATCACAACTCCAAAGAGAAGTGCTAAAGGAAAAGCCTTACAAATAACCTCATTTCGACGGGAGCAAATAAGCAACTCCACCATAAATTATAATTCTTACTATGCTTAATTGAGCTAAATGCTCATTGGACTCACTTAGTTATTAAGGTATAATTAAGGCGGATTTATTTAGTTCAAATATTATATATATAATTCTTTTTTTTTTTTTCTAACTTTAACTTTCGTTTACCTTTTTTTTCTCTTTTCTTTTTTCTTTCTTTGGAAGTACTTTTTTCTTTTCTAACATTTAAAATTGTTTATTTTTTAGAAAATCACAATCTATTCTAAAATCACATCACATCGGTGCATACTACAAGTACTTTACATATGTCAATTTTTATTGACGAAAGATTGAACTAAAGAAGATAAGAGTTAAAAGAAAATCCAAAGGTAGCAACGTTACACATGAGTTATCCATGCAATAATAAAAAACAAAGCAACAAAAGTTTATAAATGTAAACATAGTTGGAAATGGGGCCAAAAAATTGTATAGTGCTTAGATAAGAGAATGACTAGAGAGGGAGATATAAGTGAGAAAAATCTATCACCATTAATATGAAGTAAGAAAGAGTTTTGTGTGTGGTAGTGGGGTGGATAGTTAATGGTAGGGAAAGTGATTTTAAAATTAAAGGGGTTGGTAAGTTATAAATGGTAATTAAACAAAGGGCTTAGCGCAGCAAATCCAAAGCACTTTGTTTTGTTGGAGTGATTTTGGGCAGTATAATAGGTAAGCTCATTTAATCCTAACAAGTCACAAAATAAGTACCCCCCTCCTGCCCCCCACGTGGCTTACAGTTACAAGCAATTTAACCCTATAATAAATTCTATACACTTTTGTATTTTAAAAATCAAATCACACATACCGGAGTTTTTTAAAAAATATAATAAATCGTTTCAAAAATGAAAAAAAGTCCACAAACCCACGATAAAAAATACTAAAAATACTTTTGATCTTTTAGATTTGACTATTTTTGATAAATTTAATCATTTAAATTTGAATCTTTTTGGTGGATTGTTTATATTTGGTACGCGAACGTTTAAATTTGGATCGTTTAGATTTGGCTATTTTTTTATACGACCAAATCTAAACTACAATTTTGTCAAAGACGATCTTGGACAACCAATAATTTGAAGGAAAAAAATAGATATTTTATATTTGATACATGATCTTGAACCAAATAACAGTTTTTGAAAAAAAATAAAAGAAAAATGGTAGAAGAAGAAATAAAAATGATACAAGAGGAGAAAAAAGACAATGGAGGAAAAAAATCGCAGAAGAGGAATAAGAAAAACGATGAAAAGAAATGACAAATCTAAAATATTTTAAGAGAATGACTAGCTTAACGAGTTTTTTTATTTTGTTAACGGATGGTAAATATTTTAATTGTTTGTTATATTTATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAAAATTAAATATATTTCACTCCAAAAGTCCAAAAGCCAAAAAGTATAAATATTTGGTGAATTTTGTATTTTGTTATGAAGTTTTTAATTTTGCTATTTCTAATAGTTTCTTAAAAAAATATATAATAATATTATTTTTTTATTGCCACGTCCATATTTTCATATATCGATATTTCTACATTTCTATAGGTTGGACATTAACATGACCAGTCAGTGAAAGTAAAAAACAAGCAATGAAATATCGTTGATTAAAATATAAAGGGCATTGTTATGAATAAAAAAAATGAAACTATTTACAAAATATAGAAAAAATTTAGATGAATCGAAGAGAATTTGATAAATTTTTCTATATTTTGCAAATAATTTTAAATGTTGAAAAATGTTAGAAAATTAAACATTTGATTAAATATTTATACTTTATAAAAAAAATTAAGTGTAATAAATTTTGTTGTTAAGTGGTTTTGTTCCTAAATAGTTTTTCAATTTTTTCTATTTTTAGAAAAAATCTTTAATATTTTGTTATTTTTAAAAATGTTTTATAAATAATATACATTTTAGTTTTTTTTATTAAAATTACATAATGTTATTTGCAGATTTAAAATTATTTTTTAATTTTTGATTTTTGATTTTTGTTTTTTTTATGAAAATATCTATTAATATCAACATTATATCAATATTTTTATAGATAATTTTGTAAAATGAAGATTTGATATTTTGGTGCACACAGTATTTAGAACCTTGATTACAATCCAGTGCACTGTATTTAACTCTTATTATAAACTTAACCTAATTTTCTAAATTCAAATTGTTTGTTTCTTATAAAAGGTTAAGTGAAAGTTGAATTACGTATGCCATCTTTTTATGTAATTATAGAGAGAAAGAAAAAAAAGAATAATATTATATTACATATCTGAGAATTTTTATTTATAAAATATGAAAGTATAGTTTAGTTCAACTCATACAAAAATAAAAAAAAACAATGCAAAATATTATTTGAGATGGAAGTGTTTAAATGATTTGATGAATGTAAAAATTCCAATTGTTCAACCAAGATGGTATGAGTTGGGTCTTTAAAAAATCCAGTTTAGATTAGTTTAGATTTTCTTGAAACTTTAATTCATATTGAGTTAGGATTTTTTTCACTTTGATGTAGATTTTATTTCTTCATGAGATCTTTGGTTCAAAGTTTGGGGTTCTCAAATTGAGAAATTGTTTTGATTGACTCAAAACCCACCAAACCCAAATTTTGTTTAAGTTAAGAGAAGAAATATATTATTTATACAATAAGTTGGGAGTATGTAACTTTTTATTAGAATATATGTATTGTTTCTATTGGTTCGTAGATGAACAGTTGGATTTTCTATGGGATTATATGAATAATCATTCTCTTTGATTATTTCTCTCCTAAACCCTAACCCTATGATTGATCCCACGATCGATCGCCTATTGATTCTTCATCCTCTTATGCTACTAATTTGTATACAACTTCTTCAATTCTTGAACAATATGTCAATCCCTACTATGTTCATCATTATGATTCTACCAATCTTGTTTTTGTTTCGAATTTATTAAACATCCAAAATTAATTACAGTTCTTGCTTTTGCTTGAATTTGATTTCCTTTATTGTTGTTGCTAAATATGTATACAATAAGTGTAATAAATTTTGTCTTTTAATGATTTTGTTCTATGAAGTGTGAATAGAGTTTGTCAATTTTTCTATTTTTGAAAAAAATCTCATATATTGGTTAATTAACACTCACTCACCAACTTTTTTTTTAAAGAAAAGATGTCTTTTTTAAGTACAACATGTGAGGGAAAAAATTGAACTCAAGACTTTTTGTCCTCGAAAACATATAAATGCCAAGTTAAAC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ATGGCATGCCCTTTGCCTTGTCACATAGAGCATTATATGTATATACGTGTCATGGGGCTAAAGCGTGACAGATGTAGGTATCGAAAATTTTCTCATGTGACGCCAAAGCTCCTCCTTTTTCTCCTTTTTCATGCATGCGTTCGACCTGCCTTAAGTGCTTCCATTGTGTTATGTGAATGCAAAATCAACAACATGAAGGACAACGGTGTTGAGTATCTTAGCAACAAGAAGCACAAAATCGTGTTCGTTATGGGCTCTACAGCTACCGGAAAATCAAAACTCTCCGTCGACTTAGCCACTTTCTTCCCATCCGAGATCATCAATTCCGACAAGATTCAGTTCTATAAAGGCCTCGACATAATCACCAACAAGATCAACCAATCCGATCGTCGCGGCGTTCCTCACCATCTCCTCGGTGTAATCCACGATCCAGACGCCGATTTAACTGCCGGAGAGTTCTGCAGTCTCGTCGAAGACGCAATCGCCGACGTTATCAGTCGCGGATGCCTTCCAATCGTCGTCGGAGGATCAAACAACTACATCGAGGCACTAGTTGAGAATCCGATTACTGATTTTCGGTCGCGGTTCGATTGTTGTTTCCTGTGGACCGATGTTGCTCTGCCTGTTCTGTACAAGTACATCGCGAAACGAGTGGATCAAATGGTGGAATTAGGGTTAGTGGAAGAAGTTCGTGAGATGTTCGTTCCTGGTGCTGACTACAGCCGCGGAATCCGCCGCGCAATCGGCGCTCCGGAGCTAGATAGTTACTTCAAAGCAGAGAAGAACAACGAAGAAGAAACGTACAAGAATGATTTATTGAAATCGGGGATTCATGAAATTAAGGAAAACACCTGTAAACTGGCGCTCCGTCAGTTCGGAAAGATCCACCGGCTGAGAGATGAGGTCGGTTGGGGACTCCACAGGATCGACGCAACGGCGGTGTTTGAAAAGAGCGGAGAAGAGGCGGCGGATGAGTGGATGAATGAGGTTCTGAAACCGAGTTTGGGGATCGTTGGAGAATTCTTAAACGAAAAACAGAAAAATTATCAGATGGAAACGACGAAGAAGAACAGATCAATGGGGGTTATGAATGA MACPLPCHIEHYMYIRVMGLKRDRCRYRKFSHVTPKLLLFLLFHACVRPALSASIVLCECKINNMKDNGVEYLSNKKHKIVFVMGSTATGKSKLSVDLATFFPSEIINSDKIQFYKGLDIITNKINQSDRRGVPHHLLGVIHDPDADLTAGEFCSLVEDAIADVISRGCLPIVVGGSNNYIEALVENPITDFRSRFDCCFLWTDVALPVLYKYIAKRVDQMVELGLVEEVREMFVPGADYSRGIRRAIGAPELDSYFKAEKNNEEETYKNDLLKSGIHEIKENTCKLALRQFGKIHRLRDEVGWGLHRIDATAVFEKSGEEAADEWMNEVLKPSLGIVGEFLNEKQKNYQMETTKKNRSMGVMNX Homology
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94ID2 (Adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPT5 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 296.2 bits (757), Expect = 5.1e-79 Identity = 150/299 (50.17%), Postives = 204/299 (68.23%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93WC9 (Adenylate isopentenyltransferase 3, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 277.3 bits (708), Expect = 2.4e-73 Identity = 146/269 (54.28%), Postives = 189/269 (70.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94ID1 (Adenylate isopentenyltransferase 7, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPT7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 269.2 bits (687), Expect = 6.6e-71 Identity = 142/289 (49.13%), Postives = 187/289 (64.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5GHF7 (Adenylate isopentenyltransferase OS=Humulus lupulus OX=3486 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 243.0 bits (619), Expect = 5.1e-63 Identity = 132/304 (43.42%), Postives = 184/304 (60.53%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94ID3 (Adenylate isopentenyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IPT1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 238.8 bits (608), Expect = 9.6e-62 Identity = 135/295 (45.76%), Postives = 185/295 (62.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K7L1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G253720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 589.7 bits (1519), Expect = 8.2e-165 Identity = 292/300 (97.33%), Postives = 295/300 (98.33%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CPK4 (Adenylate isopentenyltransferase 5 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold179G00270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 568.2 bits (1463), Expect = 2.6e-158 Identity = 280/300 (93.33%), Postives = 290/300 (96.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BH37 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489774 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 565.5 bits (1456), Expect = 1.7e-157 Identity = 279/300 (93.00%), Postives = 289/300 (96.33%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4L3 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470933 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 476.5 bits (1225), Expect = 1.0e-130 Identity = 232/291 (79.73%), Postives = 259/291 (89.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLR3 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455496 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 5.0e-130 Identity = 231/294 (78.57%), Postives = 260/294 (88.44%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. NCBI nr
Match: KAE8646129.1 (hypothetical protein Csa_016307 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 594 bits (1531), Expect = 1.89e-212 Identity = 294/301 (97.67%), Postives = 296/301 (98.34%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. NCBI nr
Match: XP_004148309.1 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 590 bits (1520), Expect = 1.62e-210 Identity = 292/299 (97.66%), Postives = 294/299 (98.33%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. NCBI nr
Match: KAA0036515.1 (adenylate isopentenyltransferase 5 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK13465.1 adenylate isopentenyltransferase 5 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 568 bits (1464), Expect = 5.46e-202 Identity = 280/300 (93.33%), Postives = 290/300 (96.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. NCBI nr
Match: XP_008447303.1 (PREDICTED: adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 565 bits (1457), Expect = 6.35e-201 Identity = 279/300 (93.00%), Postives = 289/300 (96.33%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. NCBI nr
Match: XP_038888774.1 (adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 549 bits (1415), Expect = 1.47e-194 Identity = 272/300 (90.67%), Postives = 286/300 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. TAIR 10
Match: AT5G19040.1 (isopentenyltransferase 5 ) HSP 1 Score: 296.2 bits (757), Expect = 3.6e-80 Identity = 150/299 (50.17%), Postives = 204/299 (68.23%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. TAIR 10
Match: AT3G63110.1 (isopentenyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 277.3 bits (708), Expect = 1.7e-74 Identity = 146/269 (54.28%), Postives = 189/269 (70.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. TAIR 10
Match: AT3G23630.1 (isopentenyltransferase 7 ) HSP 1 Score: 269.2 bits (687), Expect = 4.7e-72 Identity = 142/289 (49.13%), Postives = 187/289 (64.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. TAIR 10
Match: AT1G68460.1 (isopentenyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 238.8 bits (608), Expect = 6.8e-63 Identity = 135/295 (45.76%), Postives = 185/295 (62.71%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G008240 vs. TAIR 10
Match: AT3G19160.1 (ATP/ADP isopentenyltransferases ) HSP 1 Score: 224.6 bits (571), Expect = 1.3e-58 Identity = 123/288 (42.71%), Postives = 178/288 (61.81%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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