Chy1G002310 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACAGTTCCTTGGCATCAATGGACGATTCTCCGACTAGTCCCCTCAAGGCTTTTGCTACCTTTCTTATTCGCCACCACTCCGATCAGCTCCGCTCCATTGCTCACTCCCCTGATCCTAAGCTCCACTACCCTTTATTCGTGGAGTAAGCAATTCCGTTTCCTTCCTTCTGAACTCTTTTCTCTCTTTTCTCATTTGCATTTTTCCCTTTCATTAGATTTGCTGAGCTGATGGACGACGACCCACCTCTTGCTCGTTTTCTCTTCTCCCGTCCGACCGACTACTTGCGTGTTTTTGACGATGCAGCTGTTTGGGCTCATGTTGGTAATCTAATTAGTTTTGCAAAAGCTCACTTATGCTCTCCTTGTGCTTATTGATGTTCGTTTTTGTGATTGTGGTTGCAGATGATCATTTTGGGTGATTCAAAAGGGTCCATGAATGGAGTTAAAAAAGACTTCATCCATGTTCGCATTAATGTAACTGGCTCTCCGCTGGAGTTTCCTGGTATGTATCTGTTTCTGAGTTTTATAGCTGAAATGTTGATTAATCTTATGTGAAAGATGGGGTTCGTTTGATTGAGTTATTGTTGGTTGTGTTCTGCTTGGTTTTAGAGACTTTTCCTAGTATTGGGTCTGTCAGAGTGAAGCATCATGGAGTGCTTCTTACACTTAAAGGAACGGTAATCCGATCCGGGGCAATTAAGATGTACGAGGGTGAGAGATGGTATATCTGCCGGAAATGCAAGCACAAGTGAGTTGAATTTTACTTATGTTTCAAACGTCATTCATTTACGTATCTACTTACATTCAACACCTTGTTGGTTCGAGGTTTCACCATGTTATGATTTGGTTCTACCATCTTTGGGACCTCAATTGTATGATCCACACCATTTTCTCCTCTCCTTTCTCGATTGTATTAATCCTGAATAGGATATTATCAACGGTTAAGGACGTTAGAGCCTGTTTAGGAAGTTGGAATGTAATAGGTATAATCCCAAGCCCACTTTTAGATTAGAGCTCAGGGCCTTGTTTGTAATCCTTACTATATTCACTTCCCACCATTTTCAATCAAACCTTCTTTCCCACTATTTCGATGCTTCACGATTCCTTCCAACACGGGTTTTAATATTTTATTGTAATCTCGATTACATTTCAGCCTCCCTAAAAAAACCCAGAGACAGAGGAGGGGAAGTTTCCAAGCCCTTGGGTTCAATTAGTAACGCTAATATTATTGCTGAATTAACAACAAAACTAGCTTGAACGGGCGAGAGAATGTTGGTATATCTTTTGAAAGGAAAGGACACTAGTAATTTGGTATTTGGTAGCTTTGCATTTCAATTTTGCTCTAATAAATGTGATAGTTGTGAACACTGTGGTCTCCTCTTCTTTCCCCCTTCCCCTTTCAACAGTCTCCCATCACCGATTCACCTTAGACCTTCCCTGATCACCATCTTGGTGGTCTTCTTTCACCATGAAAGATTGGAGCAACACTGAGTGGTCCATCGTTATTGATACTAAATCCGTCATCATCAATATGGATGGGGCTTATTAAGGAAGTGGAGCTAGACTTGCAGGTCTACATGATTAACTACTCTTTGTCATTGATTTTTTATATTTATTAGGTAGCTGAAACTAAAATCTTATGATGAAAATGTAAACTTCTATTCCTTAACCTTTTTAATGTAGTGTTGGATTTTAATCTTTATTTGAGCATCCTTTTAAGGATGCCAAATCTATTAAATATGAACATGGCCTTCTTTTGGGTTATTTGGAAATAGAGGAATCAAAGAGTTTTTTTTTTGTTTGGACAAATGGCACACCTTTGAAGTGTTCTTTGATCTCGTTCAACTTTTTCTGTAGTTACACTTCCCTTTCTTCGTTGGGATAGCCTTTTGTGATCATCATGGATTATCCATCCCTTTTGTAAATTTCATCACCAATGAAATTGTTTCTTTTGTGTGTGTGTGTATATATAATAGAATATTTTATGATTATCCAGTTGGTAAAGGTAATCTAGCATGCCTGTTTGTATTCACCATTTCTAGATTCTTCTTATTTCTTTGACAGTTTTACTTTTCTCTGTGAAGGTTTCCAGTTTATCCAGAGCTAGAAACTAGAAACTCAATACAGTTACCATCATTTTGTCCTTCTCAGGTACTTAGTTTTCTAATTCCATGTCGTCTGTCTCATTTTTATTAGCTCCACATCCCTGCCAAGTTATCTCATATTTCATATCTCCCATGTATTATGCATATGAACCAACGCACTAGCATATTGCTCCAAATCGTTCTAATAAATCCTCGCCTCGGTCTAATTAACATACAGTAGATTTGCCTCCCTTTCTATTTGTAGCGAGCCACAATGTGTGGGTTTATGAGAAACTGAATTACTGTAATAACTCAGCCTGTAACGGTACACATACTAGGAGCTAAAATACTGTTACATTACATGATTAGCCAAGGATTTGTGACAGAATTTTCAAGTAGTTCTATTGTTTATTAATATTGGTTAAAGATTTTAATTCTGGAAAGTCTCCTGTTTTAGCATTCTTCCATTGAAGTAGAGGATGTTGAAGTATTGATATAATTAGGTTTACATAACCCACCAACTTAAGCTTTTGGGTCAATTAACGATTTAACAAAGGCGATCTCAGTTTTTCAGTAGGTTTTTTCTTCTTTCTCTAAGCATTTTGTTTTGGCAATCCACTGGTCCTTTCATTCTAAGCACATACTATTTATTTACTTTTTACTTTTTAATTTTTTACAATTAATTATTAAAAATTATTATAAAAAAATGTGAATGAAAGTAACTGCATATCTGCATTTACTAAATTTAGAAACTTAAGTTAGTTATAAATTTAATTGGATACTACGTCGTTTCCTAATTCTTTCTTTCTATTATTGAATATCTCATTTGTTTCCTAGTCCAATCCAAATGGTTTATGCTTTGGAATTTATTAGTAATGTATCATGAATTCATTTCATAATGTTACTGTGTTGATGAGTTCAAGATTGATTTGATCCTTGTCTTTTCAATTGTCTATCTAGTATAATTTTTCTGGTTACAGCAAGTTTTTGTGAATCGGACTAATTTATTAACTTTGATCATAGAGGTCAAAACCATGTGAAGGGAAAAGTTTTGAGTGCTTGGAAGGTTCTGTCGTACGTCATGATTACCAAGAGATAAAAATTCAGGAGAGTACACAAGTTTTGGGTGTGAGGTCCATTCCTCGTTCTGTTCTAGTCATTCTCAAGGATGACCTTGTTGATCTTGTTAAAGCTGGAGGTATGGAGGGATGCATTGTCTTATTTTTCTCCCTGAACATCCCATTCCATTCATCACTTACCTAAATTTCATCCCTAGAATATCCATATGTATATTTGATTTGTTTCCAATTAAAAATCAGATCAAGAGTCTGCCTGCCTTTAGAAAACATTTTGTGTAGGATCAACAGTAGATGACATTTACATTTTTTTTCTTCTTTTGAGAGCGACATTTACTTTTTTAATTTTTATGTTTACACTATACGAAGCTTTATATACTAAAGGTTGTATTTATTATAGTACTTTATATATATACATATTGTGTAAGTGTGTTTTGAACATCAGTCTCTTTTTTTTTTTCAGATTCATTTTGTAGAAAAGACATAATTTCTTTTCTTTTGAAAGGAAACATGTCTCTTTTATTAGTAATAGTGAGACAAGCTCACAGTACAAGAGAATTATACAATGAACAAAAGAACCTAAGGATCAGTACGCGCACTTCGAAATCTTTACTAGGTTGACACCCCCTTAGCATCCTCGTCGTATCGATAGAAACTAGGAAATACATAACTACTGAGTCCAAGAAACAACCTTTACATCATAAATATTCATGAAAGAGAAAAGCTAACTTAAAGCTTAAAGCTATTAATTTTAAGTCAGATTAACTCCTTATATTCTAGACCCCAACAGTATTTAGTGAAAAAGATAAGCGAGGTTCTTCTCCTTCCCATTGAAAACTTTATCGTTCCTAATTCTGGCTGCCATAAGTATTTAGTGAAGAAACAAATCTCCAAGTCCAAATGAACTTGAGAGTGAATTCTTAAGTAGTTGGGATTTAACAATGGAAGATTGCATGAGATGATCAAAAACTTCCATAGAAATGGGTGCCTAAGCACTTGCATCAAGCAGAACTTTATTTGAAATGTTATCTTCCAGTTAATCTCACTACTTCAGGATATTATGTCTTTTCCGAAAGGATCCATAACCAAACATTGGGATTTTGAGTTGAACTCTTGGGCTATTAATTTTCGTCGGTTATTAAAGGAAGAAGAGATAGCAGAATTTCAGAAGTTGATTGTTAAAATTTCAGTAAGGAGAATTTCTGAGGCACCTGACAAAAGAATTTGGTCCCGAGAGAGTAATGGAAGATTTTTTTGGTAAAATCTCTCGCAACTCATCTTTCCCCATCTTCACCTTTGGATAATGTGTTGCACATGGCTTTATGGAAACTAATAGTCCAAGAGTTAACGTTCTTGTTTGCGTTTTGTTGTTTGGTCGTTTGAAGATGGCTTCAGTATTGCAGCAGAAATTGCCAGCTAGTTGCCTTTTCCCTTCAGTCTGCCCAATCTGTCTTCAGCATGGAGAAGATCCGTCTCATCTGTTTTTCCTTTGTCCATACTCAGCTAAGTGCTGGGAAAAATTGCTCTCCGCTTTTAATATGTCATGGGTTTTTGATGAGTGTAGTGAAACGGTTAGACAGCTTCTAGGAGGGCCTTATTTCAATAAGGCCTCATGGTTATTATGGTGGAATGTGGTAAAATCATTATTGACAGATTTATGATTTGAAAGAAACCAAAGGACTTTTCATGACAAATCTCTTGGTCAGTTAGATTGTTATGAAGTTGCTCATAGAAATGCTTCATCGTGGTGCATTCTTGTAAAGGAAATTGATATGTACAGCATCTCAGAGCTAAATCTTAATTGGAGTTCATTGATCACCTTTCAAAGCTA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BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IFF3 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 983.8 bits (2542), Expect = 9.7e-286 Identity = 497/639 (77.78%), Postives = 559/639 (87.48%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8B406 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 874.0 bits (2257), Expect = 1.1e-252 Identity = 446/629 (70.91%), Postives = 516/629 (82.03%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69QA6 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MCM9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 870.2 bits (2247), Expect = 1.6e-251 Identity = 445/629 (70.75%), Postives = 515/629 (81.88%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: I0IUP4 (DNA helicase MCM9 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=MCM9 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 585.5 bits (1508), Expect = 7.7e-166 Identity = 319/632 (50.47%), Postives = 416/632 (65.82%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F1QDI9 (DNA helicase MCM9 OS=Danio rerio OX=7955 GN=mcm9 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 582.0 bits (1499), Expect = 8.5e-165 Identity = 316/628 (50.32%), Postives = 406/628 (64.65%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K618 (DNA helicase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G064040 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1264.2 bits (3270), Expect = 0.0e+00 Identity = 634/642 (98.75%), Postives = 638/642 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C107 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1263.1 bits (3267), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/642 (98.60%), Postives = 638/642 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E118 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1256.5 bits (3250), Expect = 0.0e+00 Identity = 632/642 (98.44%), Postives = 637/642 (99.22%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1I3 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1247.3 bits (3226), Expect = 0.0e+00 Identity = 628/642 (97.82%), Postives = 632/642 (98.44%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZV6 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495403 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1231.5 bits (3185), Expect = 0.0e+00 Identity = 622/642 (96.88%), Postives = 627/642 (97.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. NCBI nr
Match: KAE8645814.1 (hypothetical protein Csa_017277 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1256 bits (3251), Expect = 0.0 Identity = 634/642 (98.75%), Postives = 638/642 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. NCBI nr
Match: XP_004137058.2 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1256 bits (3251), Expect = 0.0 Identity = 634/642 (98.75%), Postives = 638/642 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. NCBI nr
Match: XP_008455167.1 (PREDICTED: probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1255 bits (3248), Expect = 0.0 Identity = 633/642 (98.60%), Postives = 638/642 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. NCBI nr
Match: XP_016901680.1 (PREDICTED: probable DNA helicase MCM9 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1249 bits (3231), Expect = 0.0 Identity = 632/642 (98.44%), Postives = 637/642 (99.22%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. NCBI nr
Match: XP_008455168.1 (PREDICTED: probable DNA helicase MCM9 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1240 bits (3208), Expect = 0.0 Identity = 628/642 (97.82%), Postives = 632/642 (98.44%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. TAIR 10
Match: AT2G14050.1 (minichromosome maintenance 9 ) HSP 1 Score: 983.8 bits (2542), Expect = 6.9e-287 Identity = 497/639 (77.78%), Postives = 559/639 (87.48%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. TAIR 10
Match: AT1G44900.1 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 5.2e-69 Identity = 197/602 (32.72%), Postives = 310/602 (51.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. TAIR 10
Match: AT1G44900.2 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 5.2e-69 Identity = 197/602 (32.72%), Postives = 310/602 (51.50%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. TAIR 10
Match: AT2G07690.1 (Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 251.5 bits (641), Expect = 1.9e-66 Identity = 187/600 (31.17%), Postives = 295/600 (49.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002310 vs. TAIR 10
Match: AT2G07690.2 (Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 250.4 bits (638), Expect = 4.2e-66 Identity = 187/600 (31.17%), Postives = 293/600 (48.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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