Chy1G002150 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACAAGGAAGAAAATTCAGATCAAGAAGATTGACAACATAGCTGCAAGACAAGTAGCATTTTCCAAGAGAAGAAAAGGGCTTTTCAAGAAGGCTAAAGAACTTGCAATTCTCTGTGATGCTGAGATTGGCCTTCTTGTTTTTTCTGCTTCTGGGAAGCTCTTTGATTATGCAAGTTCAAGGTTTTTCTTCTCTCCTTCTTCTCTCACTTTTAAAAATTTCATTCTATTCTTGTTTCTTGCATCATGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGAATCTTAGCTTCAAACCACACACACAAAAAAATAAAAAATTGCACTTTAAAATCAATTAAAATAATTCTGAAGAAGCCAAGTAAAACAAATCCTAGTCAAAAGAGACCATATGAGTGCAATCTGAAATGTAGGCTAGTTGGGATTTGAAAACCTTTTTATATAGGAATTTTCACCCCATAAAATATAGGGTAGATTGTTCTGGTAGATTATTGAGTTCTTTGAAGATGTGAGTTTTGAGGTCAAATTTCATGAAAGTTTAGTATAAGATTGGGAGAGGAATTAGTTTGGAAGTTTTGAGAAATGGGTTTGGTCCTAAATTTGAATAATTAATTCACACATTGGGTTCTCTTGCAAGATAGAAAATTTGTTTATATGTTCATATTATGTATGAGTTATAAATTTTCAACACTATTCATTCACATTTTGTGATTGTTTGCATTCATTTTTCTGCTATATACATAAAACATCATATATTCATCGTCTGATAAAAGAATGCCCTTCCAGTAAGATTTGAAATGAAAAGAAGAGAGCAGAGAAAAATACATAAACATAGGTTGGGATGGGAAAATTGGAAAGAAATGAATTTAAATTATCAAAGGATAATAATAATAATAATAATAATATTAATATTATTAATAATAAAGAAGCTTTTATGGTACATTATTACAAAAAAGCTTTTATTGAAAATTTTGGAACCTATGTAAGCTTTATTCAAAGATAGATTTTTAAGTATAAGGTTTCAAACAAAAAAAATATTTTGTTTATAGTCCTGATCTTTTTAAAGAATTCAGTACATATAGGCCTCAAAAAGTGGCATTTTGCATGATGGGTTTTCTTATTAATTATCTCTTAAACTTTGGAATAGGCAGAAGGTTAAAGCTTAAACCCTCCATGTTCTTAACAAATGAAACATGAAATATACATAAATTTCCCCTTGAAAAATTAGACCAAGTACTATAAAGAAAAAGAACTTTTTCAATAGATAGGCATAGTGAGAGAGGTTGAAAATATACCCTTCTATATATATATTTAGACACACCAAACACAAGATTATTTCCTAGCTTCTCTCTTTCTAGAATCTAATAACTTTTTCTCTCACTATAATGTACCTAAAATTTCTACATTTTCTTAGTTTGGTTACAATGTCCCACACCTCATAATGATAATGATGATAACGTAGTTTCTCTGTGTCATCTTATGACCTTTAAATTTTGTCCTATGTTTTATATAAGGGAAATATAAGTTATATATGTAATATATATATATATATATATATTCAACTACGTTTTCTTTTTGCATTATAATTTTTTTTAACAAGCATTGGAAGATGGGTAGGTATGTTCGAATATTTCAACTAAATTGACACATTCATAACACCCTCATAAGACTCTTCGAGATAGTGATATTCATATAAAAAAGTACCAAAAAGTTTTAGAGAGATAGAGGAGCCCAATGTGAACAAAATATCTTTTTTGGAATGATATTTGTTTTTCAAATTTTAACAAATGGATAAAAGAAAAAAAAATATAGGTTTCGGTTTTGAAGGTAGATTTTCTAGTACAAAACTCTAAAACATAGAAACTAGTTTTACTATTGAAGATGGGGGTAGAATATAAGCATATATATATTATTGTTGAATTATATCAAGAATCATATTAGATACTTGCACCATATATATAAACCTAGCTAAAATTAAAGCTTAAGAAAAATCAGATATAAATAATAATTTTAACTTAGAAAGTAAAAAAATGTCATTAAATGGACTGAAATAGTTTCTGTAATAATAAGACATGCATAAAGCCAATATTCCTTTTATTTATTTATTTCATTGCACTCTCCTTGTGTTTATGCTCTCTTTACAACTTTTCTTTCATATTTTCTTCCTTAATATTATGTTATTGTTCTAAGAAACCTTTGTTATATATATCTATATATATATAAATATAAGAAAACGATTTGGAGTTATACAAACATGAGGTCTGACTCAAACTCATGTTTGAATTCAAGAGATATCAATACTTGTTGGTTTTATTCAATTCTATCCATCAAGGATATAATATGATAGAATGAGTAGTTGATCAATATCATTCTAAATAATAACAATAAATAAATAAATACTCTTGAAGAAGGAAAAGAGAAAAGAAAAAAAAAAGTTAATATTACACAAATTAACTCAAAGAGAATAATTACAGTAAAAACTATACAAAACTGCCATTAATTAAAAAGTAAAGAAATAAACTTTCCTGGTTTAATTTCTTCTTCCTCTCCTTTTCTTATTTGCCTTCAAATACTCTTTTTTGTAATACTCATATTTTAAGAAACAATTCTACAAAAAGATTTGGGATTATGTCCCAATATAATTATGTTATGAGATTGAAATAAATGTTATAAATGAGAGTAAATTAAAAAAAAAAATGTTAGTAAGAAACCCTAATTGGTAGTCCCTTTTAGAACCTTAGAAAAATTTAATTTCATAAGGTTCTAAATACTATTTTTCTTTCAAGAATTTATTCTTCAACCACTGACAAAATGTATAAATTCTTAATCTGTCTTAATTAGATTTTAATTCTTTATATTATAAGCTATGTGTATGTATATATATATATTATATGCACATTTTTATTAATTGATATTGACATTATTAAGTTTGTTGATTTTGCAATGACAACCTTTCCCCTCCCTCTCCCATATGATCTTCCTTCATCTAGACCAAAACCCTACATTTTGAATTCTCTCCTTCTCCATAGAAGGTGAATTTACACTATAGAATCATTGTGTCCTCCTAATCCTTCTCTCCATTGATATTTTGACAAACCACTAAACTTTCATGCATGATCAAAATTTCATATATATATATATATATACATACTTATTTTATTTTATAATTATAATTTGAAATGATTGTTGATCTCTAAGCATATCTTTTATCAACTAAATTACATGATTTATTTGTAATAGTGATAATAAAATGAATGTTTGTTGTAGATTGATCATTAAAATACTTTTGAAAAAGGCCTCACATAAATGTAATTTTTTTTTTTTTGGAATCCTGTTATATGTTCTTTTCTTTTAATATATTGAGGATGTGTGAAAGGGTTTAAGCTTAATTAATGTGCCTACTGAAAACCTTCCTTTGAATTGCTTAGGGTATTAGTGAGTTTCATCCATTGCAAATGCTCCATATGACTTTTTTGTGTACAGTTTCGTTCCACTATCATTCAGCCATAGTCTCTAGCTTCCAAATTAATATCAATAGATCAGAAAGAAGAAGAAGTTCTACAATTAATGTAGGAATCTTGGTGTACTTAACCTCAAACTTACACTTTCATGAGGAATGGTTGTGTATATGGTTGAGCCAAAGTGCCCATTGTTGTTTAGTTTATTCCCTTCCAAACGTCACTAAGTCACTAGGTCCCTAAGTTGTAACATTTGAGACATGTAATATCAAGTTTTTTTTCCAATGTTTTCATCTGGGTAAAAACCAGTAGAATTTGAAATATAGCGGTAAACTCTCATTAAAACAGTTAGATGGTTACAAATATTTGACAATATAAGTGCTCTAGAATCGTGATGAAATACGAGTTAACATAAAGTGTTACACTAGAGAGTGCAAGTGAGAGTCATATATTCTTAACTTGTTGAGCTTCTTTTCCAAGAAATAAAGTCTTTTTAAACTGCTATTCACAATGGGTGTAGGTCAATTAAGATCAAACCACTATAATCCCTTAGGTCATCTTCTTCCTCTTCTCTGATCGTTTTTTCTTTCTTTCTAAATGTTGGTATCAGATTCATTCCACAAACATTTTGGTGTGTTTTGTGTGTACAGACGTTTATCAATCCTTTGGTGTGTTTATTGTGTATAAAGAAGGGACGCATCAAAACGTTGTATGAATAATCAAAACAAGAGTTTATATTTAAACCTATAACTCAACACATTATGATAAAAGCATATTTATCAATACAAGCTTTGAAATAACTCATAAATATAATTAAACTCATAAGATACTTCTGTTAAAAATAAAATTTTCTTTTAGGAAAAGGACACTCACTGTCGTGGTCGTAAAACTAAGGGTTGAAGTTTTTTGTTGACCCAGTTTTTCTACTTTAAGCTCCCTTCTTTCCCAGCTAAACCCTCTTAAATCAAACTTCCTTCGTAAGAAAAACCTCCTTTGAAGAGGTTTTCAACAGTTTCTCTTCAAACAACAGAGTTGGACGCATGAGAGACCTCTTCAACGCATGGTAGTTTTCTTTGGACACATGAATGGCAAGTTCAACGCATGATAGCTCTGTTGGGCGCGAGCATGTTGTTGACCAATCTGATCCCCTTTTTTCTTCTGAATACATAAGATCTTCCCTCACTCTTATTTCTTTAGGAAGCTTAGCAAACGAATATGTGAATTTACTCCTCTCAGATCTTTTATTTGTAAGCCCCCAGGATTTGTTCCTGTCACCCACTCCACGTCCCTTTGTTTGCTAGCTCCTCCCTCAAATTTGGCTAAGTATCCACTTAAGGTGCTTCTACACCTCAGATTTGGCCACCTTTAAACACGTGTGATCTGCTTCTAAGGTTTCCTCACCTCAGAGTTGATCACCCTCCTTCTTTTACTTAGTCAATTTCCTTCTTGTTTCACCACCTTCTACTTCCAAGCTTTACTTAACTCAGCTGATCACTTAACCCTCCTTGTTAAGCAATCTAATTGGACACACTTCCTAGCCTAAA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ATGACAAGGAAGAAAATTCAGATCAAGAAGATTGACAACATAGCTGCAAGACAAGTAGCATTTTCCAAGAGAAGAAAAGGGCTTTTCAAGAAGGCTAAAGAACTTGCAATTCTCTGTGATGCTGAGATTGGCCTTCTTGTTTTTTCTGCTTCTGGGAAGCTCTTTGATTATGCAAGTTCAAGCATCCAGGAGATACTTGAGAGGCATAATAGTGTCCACTCAGAGAACCTTCCCAATTTAAATGAACCATCAGTTGAGTTGCAGCTCGAGAGCAATATTCGAGCGAAGTTGAATGAAGAAGTCGAAAAAAAGAGCCATGAACTAAGGCAAATGAAAGGAGAGGAGCTTCAAGGTTTGGGGATGGAAGAACTTAAGAAATTAGAGAAATCACTTCAAGGAGGACTCAGTCGTGTTGTTGAAATTATGGATGGAAAAAATACTGATTTGCTCAGCGATATTGGAAGGAAGGTTGATTTGCTGATAGAAGAAAACAAGAGATTGAACCAGCTTGAAGTGGACAAATTGGGAGAGCAAATAATGCAGAACATACAAGGAAATTCTTCTGAGTCTATAGGGAATAATTCAACTTCATCAAATAACCCTTCTCAAGATTATGACAGCTCTGACACTTCTCTCAAACTGGGGTTAGTTTAA 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BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FVC1 (MADS-box protein SVP OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SVP PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 197.2 bits (500), Expect = 1.9e-49 Identity = 121/238 (50.84%), Postives = 171/238 (71.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FUY6 (MADS-box protein JOINTLESS OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=J PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 3.6e-48 Identity = 122/239 (51.05%), Postives = 171/239 (71.55%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5K4R0 (MADS-box transcription factor 47 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS47 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 167.2 bits (422), Expect = 2.1e-40 Identity = 113/227 (49.78%), Postives = 156/227 (68.72%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XJ66 (MADS-box transcription factor 22 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS22 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 4.7e-40 Identity = 105/223 (47.09%), Postives = 159/223 (71.30%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82794 (MADS-box protein AGL24 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL24 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 157.9 bits (398), Expect = 1.3e-37 Identity = 99/218 (45.41%), Postives = 155/218 (71.10%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1G2 (MADS-box protein SVP-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495384 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 374.8 bits (961), Expect = 2.5e-100 Identity = 206/217 (94.93%), Postives = 214/217 (98.62%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZT6 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495384 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 342.0 bits (876), Expect = 1.8e-90 Identity = 193/217 (88.94%), Postives = 200/217 (92.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CLA0 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012209 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 3.0e-90 Identity = 189/216 (87.50%), Postives = 205/216 (94.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKS2 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012209 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 336.7 bits (862), Expect = 7.5e-89 Identity = 189/217 (87.10%), Postives = 205/217 (94.47%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4L2 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 8.5e-85 Identity = 181/216 (83.80%), Postives = 196/216 (90.74%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. NCBI nr
Match: XP_004136891.2 (MADS-box protein SVP isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011658821.1 MADS-box protein SVP isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8645819.1 hypothetical protein Csa_017269 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 390 bits (1003), Expect = 3.68e-136 Identity = 214/216 (99.07%), Postives = 215/216 (99.54%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. NCBI nr
Match: XP_008455140.1 (PREDICTED: MADS-box protein SVP-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 375 bits (963), Expect = 4.76e-130 Identity = 206/217 (94.93%), Postives = 214/217 (98.62%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. NCBI nr
Match: XP_038886862.1 (MADS-box protein SVP-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 356 bits (914), Expect = 1.25e-122 Identity = 200/216 (92.59%), Postives = 208/216 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. NCBI nr
Match: XP_038886863.1 (MADS-box protein SVP-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 354 bits (909), Expect = 6.50e-122 Identity = 199/215 (92.56%), Postives = 207/215 (96.28%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. NCBI nr
Match: XP_022141962.1 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 342 bits (876), Expect = 7.68e-117 Identity = 189/216 (87.50%), Postives = 205/216 (94.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. TAIR 10
Match: AT2G22540.1 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 197.2 bits (500), Expect = 1.4e-50 Identity = 121/238 (50.84%), Postives = 171/238 (71.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. TAIR 10
Match: AT2G22540.2 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 186.8 bits (473), Expect = 1.8e-47 Identity = 119/238 (50.00%), Postives = 167/238 (70.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. TAIR 10
Match: AT4G24540.1 (AGAMOUS-like 24 ) HSP 1 Score: 157.9 bits (398), Expect = 9.1e-39 Identity = 99/218 (45.41%), Postives = 155/218 (71.10%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. TAIR 10
Match: AT4G37940.1 (AGAMOUS-like 21 ) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 2.8e-27 Identity = 77/192 (40.10%), Postives = 117/192 (60.94%), Query Frame = 0
BLAST of Chy1G002150 vs. TAIR 10
Match: AT3G57230.1 (AGAMOUS-like 16 ) HSP 1 Score: 111.7 bits (278), Expect = 7.5e-25 Identity = 81/219 (36.99%), Postives = 129/219 (58.90%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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