Chy1G001070 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy1G001070
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH01: 698625 .. 703411 (+)
RNA-Seq ExpressionChy1G001070
SyntenyChy1G001070
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GCAGAAGCAGAAGCAGATGCAGATGCCATAGCCATTGCCATTGCCATTGCGCCATTGTCACCGTACTCTGTTTCGGAAATGCGAGTGCCTCCTCCTTACTTCACTTTATTATTATCCAAAACCATACCTTTTCTTTTATATATCTTATAAGAAAGTGAAAGATGTGAGCATTTGAAGATGTAATGAAAATACAGTGAAGCGTAGATTGAAAATCTTTGGAACTAAATGAGTTTTGTATTACGAATTGGGTAAAATAATTTAATCTAAACATAGTTTTAGATTAAGTTACATTACAAACACATCACATTAATTAAGGTTCACCAAACACCCCTTAACGGTTTGTTAATGTTGTGACGATTAATTTAGATTAAAACATCAAATTTCATGATGATGAGCTTAGCTTGATGTTGTTACGAGCTTACAATTGTTGTACTAAAAAATACATTAAATTTGTACTTGACACATGGAGTTCGTATCCTAATGAAACAACACAATTTGATTGAAAAATTAAGAGTGATCACTTTGATTATGTCTGGGAATTACGTCGTATTGTTTCCGTTACACTATTGTTTTTGTTACTGTTATAATTGAAAAATTACACTTTTGACATCTTCATTTTTGTTACCACTATCGTTATTGCTTGATCCTCAAAGATAAAGGTAGAGGTAGAGACAACGATAAGAGTAATAAACAAAATTGACAAAATCCATAATTTTAAGTAAACATGGTAAAGAAAAACGGTCTATAACATTCACAATTCGAACTTATTACAATTACTTCATCAATGAAATTTCATTACAATTGCATCAATTTTCAATACCCTTTCGATCTTAAATAAATTTAACTTAGATTGAAATAAAGTGACAAATATATCATACAAAAGACAAAAAGAGAACAATGGTAGATGAAATTTAAAAGAGATTTTAATAAAGCTTAGGGAGATTTCATAGGATGTTGTGTTTCCTCAACACCTCGACGGTGGAATGCTCTTTTATCAACGCCCTCCCATGGTCCCATGTCTCGGCCACTGCCACCACCACCCCCTTCTATTTTCTTTTTTCAATGCAACAAAATCTATGTTCCCATAACACACATTACTCGTTTACGTTTGTATTAATTACATCTACTTTTCTCATCTTTAAATTATTTTTAGTTTTATTAAAAAAATATTTTATATTTTTCCATACATCTAGCTCAACGGTGGTTAAAATGACTTTTTAATCTAAAAGTTGGAGATTTGATTCTTCGTTCTTATAATTGTTGTACCGAAAAATGGTAGACATAGATAAATTAATTGGAATAGAATCTATAAAATTAAAATAAATAAATTGGTCTATAAATATGTCTCATAAATTTTTTTTTTACTTGACATGAAGAGAATCACTTTTAAACGTGTAGTGATGAAACCAAATGACAAACATGTATTTATGAATTCTGCCACTCACACACACGCATGCAAATACTATCTAATTCAATGATTGAACAAAAATTTAAGCGAACAAAAATAGTCACCATAGGTTCGAACTTCCTTAAGTTACAAAAAGGAAATTGCTAACTTAGACTTGACTTTGTATCACGAACACAAATGTTCTAATTTCGAAAAACATATTAATTTTAGACTTTATAATTCAAGTATGTTCTCTAAACAATCTCTTTAAGAACTAGTTGGGCATTCTTTCCATTATGTGATACTTCACCAAACTGGGTGTAACGCCCAAAATTAGGAGGGAGACATGAATGAACCGATATCACATCTGAATGGGAGAGATCCTGAGGACATGAAAGTAACGTTAAGAAAAACTTAAAAGAATTAAAAGTTAATACTTATACCAACAAGGTGCACCTTCCTTTTCGATGACTCGATCATAAAAACTCCAAAGTTAAGCGTGCGAAATTTTCCTAGGATGCATGTAAGGCATGTGAGTGAGGACAAAGTATGCTAAAAAGACTCGTGTTGGCTTGTGAGGAGAACTCTTACTCTAATAAGTCTTTAAGGATAGTAAGGATGTTTCTGCTAGGTCTCAAGGGATGCAAGGAATGTCGGAGATTCGAATTCTGAATCCTGGACCTAGGGCATTACACTAGGTCACCAATTTTTGTGTCTTCCTATTTCTATTTTGTTTCTTTAGTTTGTCAAATTGTCATTTTAATTGTTTCGTACATTATTGTTTGTGGCTTGTGCTACTATTGCATTATATTCATTTATTTTTCATTAGTATAATACATCATCTTAAACATTCTCACTCACACAAATCACAATTATCTAAAAAAAATCCTTAAGAGTTATGAAGTCTATAAAAAATTGTAAACTCTTGAGACCCACCGTGTAAAAAGTTGGTAAGATATAAAATCGATGTATTTGATACCCACAAACTCCTTAGACTAAACTAGGAGTGAAGTTCATAATTTCCTACTTCTCTACTCGTACTTACAAACTCCTTAGACCAAACACACCCTTAAAGATTATTATTTCAAAACAAATACACTCATTTTTGACTTAAGGATATCTATGTTTCCAAAATCAACCGATTTTTCATCCTCCAAATTTAAAAAAAAATGATAATTGCAATTACACTAACACAATAATTCTAGAAATTGAAACGTAACTCGAAATTTGGTTCATGTTTGGAAATTTGACCAAGTCATTGCCATGAATTATTATTGAATGAACTTTATAGGTAACTTGAGGGATAAGGTTAGTGTCAATGTCAAAAAGAAAAGCAAAAAAGCAAAAAACACCATAAAACAAAGAAGATTTCAATCATCTTAGGAATTGCTTTTGTAGTTTGCTCTTCTATCGATAAGCTTCAAACGCTTAAACACTGACACTTCGTTGTATCATTGCAACGAAGATCTTCCTTGGCTTCTTCAATCGATTCCTCCATTTTACCAACCACGCTCTTTTAGGTTTTCCACTCTGTTCCCCTTTCCTATTCGATTACGATAATTGATCAGAATTTGTTCATAATTTCTTTTCAATCCACTCCAGAACTATCTATGCTTTTACGTTGATTTGAATTTTATCATTCGATGTGATCCATGCGTTCTTCGTTGAATTGAATGAGATGGGGTTAGAACTTTTGCATTGGTGGGTTGGGAAATTAGTGCCAACAAAATAAAGAATGCAATGCTCCTTTTTATATGGTTTTGTGTTTCTAGGTTTTCTCTTTTGTTATTTTAGATTTGAGCTTCTAATATTTTCGGATCATTGCTATATCATTGAGAAGTTTCGATTTCTTTGAAAGATTTAGTATTGCGCAATAATTAGGTGGATGCTACGATGAACCAAAGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTAGTAATTGCTTCTTATTTTATTTGTGCTAGTTAAAAAAGGTGTCGTTGTAATGTCCATGAGTTTGTTTAATTTAATGTTTTCTTACTTTCTTGTGCTTTGGGAATCTTTTTATCAATTCGATAATTGTTTTGGGTTTTTTTATAATTAATTTATTGGGGTTGCTATCATGAAGAAAATGGGTTTTGAAAGTTCACATGTTCCGTTTTATGTTTAGCCATTTGAGTGAAAAAAGGAATAAGAAGATTTTCAGTGTAATGTTGGGGTTTTGAAAATGTTTTGGATTGAATTTCATTCTTTGCTTACTGCTGGTAGAAAATGAAAAACCCTTTTCCTTTGAGATTTTAGTTTTATCCCATGATATCGATTGCTTTTATTATTGTACACGGATTTTGTTAATGTAATGTTGAATCCGCGATGTATAAATGTTGAATTCTTAATGTGTCCAATCGTTTGGTTCAATGATTAATGCCGTGAATGAGTTATTGTTGGCATTCTTCTTGGAGTATTACCCAGAAGACAGTTTCAAACTTGAAGTCTCTTAATTCTGTTGTAGCAAAAATTGTCAGAAATCTTGGTCTTGCATATAGGACTTAGTTCATACCATCCCTGGTTTAGGGTTCTTTTGTTTTTTCGCCCCAAACTCATTGCATTTACACTTCTTCGACCATCTTTACTTCCTATATCTTTCTCTATAATGATTGGTGATGCTTCCAATATGTCGTATCAAACAGTGTGAGGAGGGGAAATGAACGGCAATCCAATGAAAGTTCCAGAAACCGGTTATTCATGTAGTTGCTTGTGTTAGCATCTTGGTGGCAATGGTTACTTTCTTCCAGGGTCCTATTTTAAAGATCCTAAGGTTAAATAATTCTATAATTCTAAACTCTTGTTGTCTTTTAGAATTGGTCTTGCGGTAGGCAAAGCCTTGCCCGGGATTAGCAAAATATCAGTTTTGAGGAAGATAAGAAAAGGCAAAAGTTTTGTAGCTTTTTGTTGGTGTAACGGTAATGATTATTTCAGGTTTAGCTTAGCTTAGCATTTCATGTCCTTGTATGGTTTTTATTAGTTTTATAATACTATCTTTTTCTTTGTAATTGTCTCTCATTTATTTTAAACTTTGACAATATTTCAAGGTCGAGTTATCTATCTTTCTTGACCTTCTGATTCTGGTTAGGAATTAGGATAGTGTTTGAAAATTGATTGATACCGTGTAGTGCAACTTTGTTGAATAGCCGAGATTGTCGACGTTATCAAAAGAGTGCAATCAAGCTCTAAGTGGTGACTCCTTGATTGATGTCTAACACTAGACAGTACTAGTAGCTGGAAAATACATCGGTTTTGGAGAATTGTCTGTTATCATGGTCAACCATTTCATTACTTGTATGATACAGGGCTGTAGAAATTCTTATAGGAAATTTTAACTTTCTTCTCGTTCGTATGGTTTGATTGGTTAATTGATTTCAGGATCCATAGTTA

mRNA sequence

GCAGAAGCAGAAGCAGATGCAGATGCCATAGCCATTGCCATTGCCATTGCGCCATTGTCACCGTACTCTGTTTCGGAAATGCGATTTGCTCTTCTATCGATAAGCTTCAAACGCTTAAACACTGACACTTCGTTGTATCATTGCAACGAAGATCTTCCTTGGCTTCTTCAATCGATTCCTCCATTTTACCAACCACGCTCTTTTAGGATCCATAGTTA

Coding sequence (CDS)

GCAGAAGCAGAAGCAGATGCAGATGCCATAGCCATTGCCATTGCCATTGCGCCATTGTCACCGTACTCTGTTTCGGAAATGCGATTTGCTCTTCTATCGATAAGCTTCAAACGCTTAAACACTGACACTTCGTTGTATCATTGCAACGAAGATCTTCCTTGGCTTCTTCAATCGATTCCTCCATTTTACCAACCACGCTCTTTTAGGATCCATAGTTA

Protein sequence

AEAEADADAIAIAIAIAPLSPYSVSEMRFALLSISFKRLNTDTSLYHCNEDLPWLLQSIPPFYQPRSFRIHSX
Homology
BLAST of Chy1G001070 vs. NCBI nr
Match: KAE8645849.1 (hypothetical protein Csa_023854, partial [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 121 bits (303), Expect = 3.86e-34
Identity = 62/72 (86.11%), Postives = 65/72 (90.28%), Query Frame = 0

Query: 1  AEAEADADAIAIAIAIAPLSPYSVSEMRFALLSISFKRLNTDTSLYHCNEDLPWLLQSIP 60
          AEAEAD  AIAIAIAIAPLSPYS SEMRFAL SI+FK LNT +SLY CNEDLPWLL+SIP
Sbjct: 1  AEAEADTIAIAIAIAIAPLSPYSASEMRFALHSITFKLLNTHSSLYQCNEDLPWLLRSIP 60

Query: 61 PFYQPRSFRIHS 72
          PFYQPRSFRIHS
Sbjct: 61 PFYQPRSFRIHS 72

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
KAE8645849.13.86e-3486.11hypothetical protein Csa_023854, partial [Cucumis sativus][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy1G001070.1Chy1G001070.1mRNA