Chy12G215080 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATTCGTCTTGTTCCATTTATCTCCTTATATCTAGACATTTTTGTAGCCTTGTAGGTAGCCTTTGGTGTAAAGCCACGCGGATTACCACTTGCATTCACCATGCATGGTACGTATCATTAACCTTGTTTTTGAACACTCGCGTCTTCTTTTTAGAACTAATTCTCATTACCTGGACATCTCTATCATGCATTAAAGTAACTTGCCCCTTTACATCGTTTTCCTTCTTTTCTTCTAAAGACTTACTTGTAATAGTAATAGTAGAAAGATTACATGGCAGGCAATGTGGTAGTTAATCATTTGATTACAATTTACTTTTGTATATATTGTGGAAATTTCATGCTTTCATATTCTCTTTTAGCTTATGCGGATTGACTTTCCATGCATACAGAAATACTCATTAGCATTTTGGAAAGAAAGTAAGGCGGTGTGCTATAGCATATACTTTATAGAAGTGGCTAACAATAGAATCATTGATCGTACTCTAGATTCTGTGTTTTCTATTCTCTGACGTTGTTTAATGATCATTAATCAGTTGGCTTTGAAAAAAACAAGTTAACCTTTTCATTTAATAATCCATTACTAGCCCTTCATAGATTCAGTTTTGTGTAGTCTGTACATGAAACCCATCCCACCTGAGTTTTGTAGAAAAATGAGGAAACTATATATTTGTTGTTTACATATGGGACATGATTAGATCAGTATGTAAGTGAATATATGAAGCCTGAATTTCTAACCGTATTGAATAGGATGTAATGCCTACTAGGAAGAATAAGTAAAGGTCATTGCAAATAATTGTGAGTTGTTGAGCTAGGTATGTGCCTTTCAACTAATTCTATTAGCATTAGTACCAATTCTTGACCCTACCATACGATATTGTGCATTGAAAATTTTATGAGATGTTTAATATTTTAGCATATGGTCATGATGATTTGAACCTATAATGTGTACCAAGATCATAAAACTATTAAGATGATTAGTTTGCTCTTTTTTTTTCTTTGGGGGGGAGGGGTGGGGGGTGGGGGATATTTAATGAACAAGAAAATTAAGGAACTTGGTCCCAATGGTTAGGTAGCTGTAGTTTATCCATATTAGGGAGGAAGTTATGGACCATCTATCTGTTTGTCAAATTATTACACATGGAACAATTGATATCATAATTCTCACAACATCATCTATGGATTTGATTGGCCATTCTAAGAATATGTTGTAAGCCTTACCAAGTAGACTTCCCACAAACTAGCCATTAGTGTTTGGTGGTTGTAACAGAGACTAAGTGATAGTGGGAGTGGGAGGCCCTCATTATGCAGTCATATGCCTAGGCCCTTACAAGTGACCCCCAATATCTTTCTTTCTTTTTAATTTTGTGATGCAATTTTTGACAATATTACCACTTGCAATAATTGACTGTCTTGGTTAGTTTGTGGCTTTCCTGTTTTGAGTGATTATGTGCCACAATTTCAACTCGCAACATCCTTGTAGGTAGATGGTGTGAGGATTGTGATGATGAGTTGTCTCAAAGGCAATTGGATTGTGACCATCCTTCTTTGGCCTACAAAAAAATATGTTAAAATATTTATTTAGACATTCTTTTCTTTTCTTTTTTTCTCCCTTTTGGAATGGTAATAATTGATTAGCCTCCAAACTTTATTTTGATGTCAGATTCCCTTTCTGATTTAGGCTTTTTATTGGCAATGAGATTGTTTGTTGCATTGTGGCACTTTTCCCTCAATTTAAGGACTAGTTGGCAAAGCCCAAAAGTGGTTATGATGACCTATTTCTTTATAGACATTCATTTCATACAATCATAGAAAAAGATAAAAGCCCTCCTCCAGAATCAGTAAGCATATCTTTTTGTTATCTCCCCATCTTTCTATCAACCAATTTTAGCTTGATTAGTTTTAGAAAAGAATAGCCTCATAGTTTCAATCGTTTTGATTTAAACTGACTATTTTCAACTATTCCTCCCTATGCTACGTTGCCTATTGCTGCAAGATCTGAATCCACTATGATAAAATTTGATACTCTACTCAAGGATTTTTTTATTTCTTTTCTTAAAAAAGAAACATCATGTACTTTTTCAGTTACTTAACTGATTCAAATTTAAATCTTATCACATTAAACATTAAACTTGAATAAATAGAATATCAAAGTTAACATGAGCAACATAATTAGTTTATTAAACCACCTAATAATTTAACTACCTAGCCCCTCTGGCCTCTACTAATGGCCACCCAAGGCACCTTAAGTTTTAACTTCTAATTGACTCTTGTTCTTCTTTCTTTCCCCACTTTTTGGAATAAATAAATAACCTTATTAGATCTGTGAATGTTTCTATTTTTTTTTTAGTGAAGATATTTTCTCATGTATACCCTAAACCATATTTAAACAAAAATGTATATAAAATTTCTGTTGAAGTAAAACTAAGAAAGAACAAGTAACTAAAACATAGATCCATAAGGCGATATATGTTCTAGACATCAAAGACATTGATTTTTCATGCTTTACACACTTTAATACGAGCAATGAAATTATAGATTTGTGGACAAAAAGCCTAGAACAATGTTTTGTCAACGAAAAACTCAAATGTTACCAACAAAGACTTGGACTTTGTTGTTGAAATAATCTTGAATGCATTCAAGTAAGTTTTAAGAGAATCGTCAAATCCATTTCAACTTATAAAGAGTAAGTCTTTGCTTTCTCATATTAGAGAACAACCTCAAGCACTAGTGAACCTCAAAGTTGTTCACATTAAAATCATAAGATCACCATTAGAAACATGGACAAAATGACTCAAAATCTCACCACCCCAACAGTAAAGAAAGTACAGGTGGCATCAACGTAAAAAAGTTAGAATCTCAGTGAACCTAAGATTTTGTGTTAGAGATTAGTTGAGGAGTTGTGGAGGCAGAAACAGAGGCAGAGGAATCTATCAGTCACTTACACCTCAAGGTTTTTGGACTTTTTTAAACCCTCAAGTCTTCTCTTTTCTTTGGTCAAAATAACTTTTCTGTTGTACCAATTTTCTGAACTGGCCTTGATTTTGACATTATATTAACAAAAATATTTAGATGTATATATGGTTAACCCTAACCAAGTCTTGTGCTTTGTCGTTTCTTTTCTCACCTTTTCCTTTTTGGGGAAAATTTTCTTTAAAAATACTACTTTTATTGTTTCTTATTTTCATTTTAGAATTATAAACAAACTGTCTTCTTTTATTAAAAAAAAAAAAACAATGTGTAGTATAATAATTAACCAGAATAGTTTTTCATATTATTGTGGTGAATCCCACTTTACTTTTTCTATAAAAAAATCCAAATATTTATAAATAATTGGAAAAACAAACAATAATTTTACCTTAAATGTTTAATTTCATCGAATTTAGATAGATACCTGAATCTTAATGTTACCCTTAAAGAAGGAAAGAGAGAATTGTAAGTTATGACAATATATACATTCAATTTTAAACTGATTCCATGATTTAATTTGATGAAATTAGAAATTTAGGGTTGATAAAACTAATGGAGTATAGAGTAAAAACTAATCTCAAAGATCTAAAATTAAATGAAGCATCCAACTCAAACACCATATCCTATGTTTAATTAATAATAGCATATGTCAAAATCCAATATTCATATCATATTATGATGATTACATTAGAAAAATTAAAAGAAAGAAATGTACAATTTTTCACATGTGCTTTATGGAAAGGTAAAATAAAAAGGAAATCCAAACTCACATTTTTGGTATTAAAAAAAGAAACAAAAATCTCTTGGAATCTCCCAACCCTATCCCTAATAATAATTTAGGGAAGTAGGAGAAGAGAGAGGCCACGTTAGCAAAAAAAATTGTCACAAATTTCCATTATTTTAAATTCTACAAATCTTAAATTACATTTTATTTTAAAAAAAAGTTTGGAAATTTTGAATCTCACTTTATTCCCTTCATTTAAAAAATATATATTTTATATCTTTCCCACTTTAGTTCTTGAACCCTCTAAGAGCATGTTCATCAAGATCTTAAAGAATCAAGAAAATATATCATTGATAAACTTTAAAAAGTTAGATCCAAATTTGTTATATTTGTAAATTTTTTTGCATTGTATTATATCTACTAATATTAGTATTATATTTGTGATGGTCCTTCTAAAAGATTAGTCACTGTGATCTCTAATGATAGTCAATTGTCACTTACTTATATCATAAACTCAAAGAACCACTACACATTCTTAATTAAACGAAGAATGAAATGAATAGATTATAGATATCAAAACAACAACCATCCTTATAATTATATTTTTATAAAGTAACGAACTAAAATAGATATTTAATTAAGCAAGGAAAGGAAAGGAAGAAGAGAGATTTTTTTAAAGGTGTTTGAGATTAAGGTTTAAATCTAAAGACAAAATTTGTAGCTCCACCTGAAGAAGAAGAAGAAGGATATGTTTTTTCTAAAAAAGAAAAAAGTGAAAAAGATGACATGGTTGGGAAGTGGGAGAGAGTGGGGAATTGGGAGAAAGAAAAGATATATAATTATATATATAGATATATAATTATATATATAGATATATAATTATATATATAGATATAGATGTGAAGAAGATGAAGAGAAGAGGACAATTATGATTGCATGAAAGAACAGACTCAAATGGGTTGGAGCCACCATTGCTTTTTCTTCTTTTCTTTTTCTTTTCTTGTAGCCTTATATATGAATCAAACTTAGTATAATGGAAATTTGGGCCATTTTTTTTCTGCCTCAAAGTTTGAAAACAAAACACTATATTTGACCCCACACATCTTGGGCTCTATGCCTTCCACCTCATCCCCCTATCTTTTTATATTATCTCCCACTTCCCACCATATACTTTCTTCAGTATAGTAAATGGAAATCCCAACCCTTTGATTCTTCAGATGAAAAGTTGTATTCATACTCCTCAATTAGTTCACTTTTGTCTTAATATCTAAGATTCAATTCTATAATCGTTACGCTTTGAA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MIRLVPFISLYLDIFVAL*VAFGVKPRGLPLAFTMHELILITWTSLSCIKLMRIDFPCIQKYSLAFWKESKAVCYSIYFIEVANNRIIDRTLDSICGQKA*NNVLSTKNSNVTNKDLDFVVEIILNAFK*VLRESSNPFQLIKKIS*GVVEAETEAEESISHLHLKVFSQTHTSKTFLVLNRSLPALPTTKELLMIVKNVLRKSKETGVEKVCFGKRQKQEYK*ILS*STT*IITYVTDL**S*PFLLS**QNQNC*TILLLPQSAYAPLLHIL*N*GKD*VSTMIPYLPISPLCELCH*EYFENKISL*WHWT***SFP*FHD*LDIRCNPLTCVNNETPX Homology
BLAST of Chy12G215080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LRZ4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G075590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 69.3 bits (168), Expect = 3.5e-08 Identity = 35/36 (97.22%), Postives = 35/36 (97.22%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G215080 vs. NCBI nr
Match: KGN64709.2 (hypothetical protein Csa_013551 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 277 bits (708), Expect = 1.18e-87 Identity = 159/224 (70.98%), Postives = 181/224 (80.80%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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