Chy12G213590 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy12G213590
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH12: 11701970 .. 11711514 (-)
RNA-Seq ExpressionChy12G213590
SyntenyChy12G213590
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CAAAGCCTCTTCAATCAAAGTTGGCTTCTTTTCCTTAGCAGAGAACTATCCATCCTTGAGCATGGCAGGTCCTCCGCAGCCACCATCACGAGCTGGCCCCTCAAGGATATTGCGTTTTGTCATAATTTTCTTAGTGGCATTGATCATACTCGTCGGCCTTGCCGTGCTCATTATCTGGCTGACTATTAGGCCGAAACGATTGAGCTACACGGTGGAAAGTGCTGAGGTCCACAACTTCGACATGACCGACACCCAACTCAATGCATCCTTTAGTTTTGGGGTAAGAGCATATAATCCCAATAAACGAGTCTCGGTTTACTATGATTCCATCACTGCCACAGTTGGCTTCGGTGATCAAGACTTGTCTTTCGGCGTGCTCAGTCCTTTCTACCAACCTCACAAAAACGAGCAATGGTTGAACATCCACCTCAACGCTCAAAACTTTCTATTGCACGACTCTGTGTCGAAGGAATTGGCACTTGAAAGGTCAGCTGGAGAGATGGATTTGGATCTTTGGATCAAGGCAAGAATTAGGTTTAAGGTTGGGGTATGGAAGTCCGCGCATAGGACGCTTCGAATCCGGTGTTCGCCGGTGATTGTCTACTTGTCTAAATCCAAGACTTTCAAGAAGACTACTTGCTTTACAGAAGTCTAAGGTTATGGAATTTGGTTTTTTGCTTTTATCAAAAGCGTTTTTCTTTTTTCCTTCCTACTTTCTGAAAATTGTATTGTTGGTGTGGTTGTTGGGTTAATCTTTAAAGTGTTTAATCTGTGAGCTGTGATTGTTGCTTGGGTTTTTAATATGTATATGCTCTTTTTGATCATTTTTTTTGTTCAGTACAAATGTCAGTCCATTCTTTAACAAATAAGTGCAACCATTTGTAATTTGATTTGATTTAAATAATTGAAAATTTTTATGTATACGTGTATTGTTTTCTATATTGCATAAACGAAGTTGGGAGTTTTTTTTTTTTTCCTTTATGGAGAAAAAGATGGATTAAATCTCTCTCCTAGCACATAATATATAGGTACTTTTAAGCATCGACACTCATTGATAGCATTATTGTCATCACACATACTATATGCTAGTGGAGATAGCTCGCTATGAGCATGCATTTGTTTTAAATTAGTTAGTTATCTTATTTAAATAATATTTGACTTTTGCTTCTTGTTTAATTATAAATAATATTTTTTAAAATACACTTTCTCATTCTTCTATCTTTTTGGAATTTAAAAAAAATTATAACAAACCAGCAAAATATTTACACTGTATAGAATAATTTTGAAAACGAAAAAAGCTCACAGACCCCATAATGGAAAATAAAAAAATGTCTCAGTCAACGCACGATTAATCGACCACATGCGCACATGCAATTCTTCTTTTATAAACGATTATGATATGCGATCGTGTAGAAAACGATACCGAATTGTGTAGGTAGTATCAACACCATTGTGTAGTTCTTTTAATTTTAACGATGGAAAAATGCTTAAAATCTAAATGATTGTGTGTTAACCACATTAAATATCATGTTGACTATGGTAAGTGATCATTTAGATTATATCCAAACGATTGTGTAGTTCTTTTTAAATGATGGAAAAAAGGTTTCAAATTTAAACGATCGCATGTTGACTATGGTAAGTGATCGTTTAGATCATGTCCATATGATCGTGTAGTTCTTTTTATACGATGGAAAAAAGGGCTTCAAATATAAACAATCGTGTTGACCATGCTAATCGATTGTGTTGACTAGATAAATGATCATTTAGATCATATCCACACGATCTTGTAGATCTTTTAAATGAATGGTTTCAAATCTAAATGACCGTGTTGACTATGTGTTAGATGATCGTGTTGACCATGTGCTAGACTATCGTGTTGACTAGGTAAGAGATCATTTAGATCATATCAAAGTGCTATTTAAATGATCTTGATATTGTGGAAGAGGAGTTGGAAGAAAGAAAGAGAAGATGAAGAAAGATAGAAAAAGAAGATGAATAAAAATAGAAGAAAGAAAATCTGCGAGAGGAGTTGAAGAAATCTGGAAGAGAAGAGATGAATAAATTGCAAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAGAAGTGACTGTTCACACGAGATTTTAAGAGAAATTTGGTTCGTGGAGTTAAACTTGTGTTGATGTTATGCTTTGTTGATTTGATGTGATTGATGTGATGCGATTGATGTGGTTCAATCTCTAGTATTTGATTATCTGATTCTCTCTCAGTTGAATGCCTACGCTTGATTTGAGGAAGTGGAACACGTGATGTTCTTGAAGTTACAGTCTTAGAAGAAAACTTGTATCTCCAAAAGAACTTCAATCTTCGGAGATGGTTGACTTCAAGAGTTAGAGAGTCTTCTGACTTTTGGAAGAATTCTCTCTAAACCTTATGGAGTAAAAAATTTTCAACTCCCACAAATGAAGAGAATGTAACGACTCGAACTTTTAAACTAAGCTAATGCCATTACTCAAAAGATAAGTATCAAAAGACAAACTTTCTTGAAAATGAAAAACTAAAATTTTTATCAAACTAATATCAATAAATGTTCGAAGATATAAAATTGACAAAACCAATAAAAATAATTTGAAAACGTGACCCGCGGGTTTTGAAAATTCTTTAAAGAAATAAAGATAAACAAATGAGACAAAAATTTAAATAAAGTGTCTAAAACCAAAATATTGAAAAACTGATACATAGAAGCGGAAGCAAAATTGAGTCCCCATATGACATGTCACAGACCTTTCTTGTCACTTGACAGCTTTTCAGATCCTCTACCTCTGCCTAAAGTATTAAATATAGAAAAGAGTGAGTATATAAAATATGTCCAGTAAGGGACCCACTACTAGTCTCGTTAGGTGATTTGTTAACTTCCCGTTAGAAACATAATGATAGTGTTGTGAGTCCAATGGAGCACACCTAGGCGAGTGAGATAGTACGAACACCCCTAATCGTGCGAGCAATCTCATAGGAACACACTTAGTTGTGCGAGTGATCGTAGATACACACTGAGTGAGACCGTACGAACACTGCTAGTCGTGTGAGTGATCGAACATACACACTCTTAAACTTTTCAGTGATATGTAGGTACACCGGTACACCTCTTATTGTACCCAGTCTAAACGATCTCTTAGTAACGATCTTGTAGCAACGATCTCGCAGCAACGATCTCGTAGAAAGTTTAAACGATCTCGTAGCAAGTCTAAACGAACTTGTACCCTTGTACCCAACCTAAATGATCTTGTACCCTTGTACCTAGTCTAAACAATCTTGTACCTAGTCTAAACAATCTTGTACCTAGTCTAAACAATCTTGTACCCAGTCTAAACGATCTTGTACCAAGTCTAAACAATCTTTGTATCTAGTTTAAACGATTTGTACCAAATCAAAACATCTATTAGTGATAGTGGTCTATCTGTCTATCTAGGATAGACAACTAATCGTTTAAACATTGATACACGATCGTTTAGATCCTGTAACAATATCATTTAAATCTTGTACCAAAAAGAAAAAAAAAAGAAGATGAGAAATGAAGAAAAAGGAAGAAATTCTAGAAGAGGAAATAAAGAAATTGGTAAATATTTACATAAATAACCATAATATCGTAAAATGAATAAGAAGTAATAATATGAAGAAATTAATAATAAGAAGAGGAGATGAATAAATCGCAAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGTGAAAAATCGTCAGCATTATTCAAGGGTAAATATGAAATTTATGAAAATATGGGCTTTTTGATTTTATTTCATGGGTCATAAATATTTTGATGCTTTTTTATATTTATAAAAATTAATCAAACATAATAGTACAAAAAATTATACATGGTGTAGTAAAATAACCTAAATTTAATTTAGAGAAATTGCATCAAATGACAAAAATATTAAAAACAAAACAGCTCATGACACCTATTTTTTTTGCATATTGCGAATATGACAAAATTAGTGATATTAGACGGCTATCATACGGTAATCATAGGGCTATCAGAGGGCTATTACACGGTAATTATAGGGTTATCGACTTTTAAATTTGCTACTTTTGCAATTTAGAAAATGTGGTGAGATGAGTCCTATTATCATAATTTTTTTTTTGCTATTTTTGCAAGGGCCCCTTTAATTTACATATGGTTATAATTTAAACAATTATAATTTGCACTCAAAGCACAATCTATTATAACACAAACTAAAATAATTAACATCCCAAACATAGATTATAGTAACACACAATTTATTATAACCCACCAACTATAATTACAACTCCAGACTATAATAGTCCACTATGCATTCCAAACACACTCTAATTAAGAAAAAAAGAAAACTCACATTAATTTGTGTGTTTACAACATTATGTAGCATCCTTTTCAGGTACTCACAATTAGTCTGTACAGTCTAAGATAATTTTTGTTTGTTGTTCTAAGTGGTTTAAGGGTGATTTTTATTGAGTTAATTGAAGTAAGTTTTTCTTGAATTGTGTGAGTTTTTTTCTTCTGTGTGTTTCATTTTGATTGTTTTCTGTATTTTCCTTTTAACAAGTCTTTTGGTTTTGTTTCAGTTCTCTTTTAATTTCAGGCTGTACTGAGATCTACTTCTCACTATTGCAATTCAAATAACCTTTGCAAAAGAAAGTAAAATTCTCACATTTATAGTAGTTTGTTTAATTCTTTTTTCCTACAATATTATGATACAATAGTAGAGTACATAACCGTAGTATACACTTGTTCCAATGAAGAAAGTGATATTTTACAAATTATTGATTATGGTATCATCTTTGAAAGGTAGATATCGATCAGTACAAGATACCTCATAAATGAGATCCTCTATTTTGCTACGGCATGTTTGAGAGTGAGTTTTAAAAATTTAAAATTACTTTTGTCTATTTAAACATACTTTAAATTGCCTTTTAAGTTACTAAAAATTAATTTAACATTTAATTTTAGAATTTTAAATGCAATTTTTATATAATTAGAATTAATTTTTAAAT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mRNA sequence

CAAAGCCTCTTCAATCAAAGTTGGCTTCTTTTCCTTAGCAGAGAACTATCCATCCTTGAGCATGGCAGGTCCTCCGCAGCCACCATCACGAGCTGGCCCCTCAAGGATATTGCGTTTTGTCATAATTTTCTTAGTGGCATTGATCATACTCGTCGGCCTTGCCGTGCTCATTATCTGGCTGACTATTAGGCCGAAACGATTGAGCTACACGGTGGAAAGTGCTGAGGTCCACAACTTCGACATGACCGACACCCAACTCAATGCATCCTTTAGTTTTGGGGTAAGAGCATATAATCCCAATAAACGAGTCTCGGTTTACTATGATTCCATCACTGCCACAGTTGGCTTCGGTGATCAAGACTTGTCTTTCGGCGTGCTCAGTCCTTTCTACCAACCTCACAAAAACGAGCAATGGTTGAACATCCACCTCAACGCTCAAAACTTTCTATTGCACGACTCTGTGTCGAAGGAATTGGCACTTGAAAGGTCAGCTGGAGAGATGGATTTGGATCTTTGGATCAAGGCAAGAATTAGGTTTAAGGTTGGGGTATGGAAGTCCGCGCATAGGACGCTTCGAATCCGGTGTTCGCCGGCTGTACTGAGATCTACTTCTCACTATTGCAATTCAAATAACCTTTGCAAAAGAAAAACCCCACGTCTCATGGTGGAAACTAGCAAAGTGACAGCCCATGGTTCAACTAATAGAAACCTCAAAGCAACCATAGTTTTCTATATCAAAAGCTACAACCCTAACAAAAAAGCCTCCATTCACATGGATTCTGTGAAGATGATAGTCAATGATTATATGGGGCTACCGTTTCAATCCGCCATCCCCACCTTCACGTTGATGCCTCGAAACGAGATTGTCTTCAACTCAACCGTTCGTGTCAACTTCATGTACCCATTTGGGCGCCCGGTGCATTCGGACTGGGTACATCTAGAGCTTCGCTTCTCCGCTCAAGTTAGTTACATTGTGAACAGATGGAGGTCGAAACCCCGATTGCTGGAGATCTATTGTGATCACCTTTGGCTTAGGATTAATGACTCTACACCTAATTTTGATAAAACCAAATGCAGAGTGGATCTTTAA

Coding sequence (CDS)

CAAAGCCTCTTCAATCAAAGTTGGCTTCTTTTCCTTAGCAGAGAACTATCCATCCTTGAGCATGGCAGGTCCTCCGCAGCCACCATCACGAGCTGGCCCCTCAAGGATATTGCGTTTTGTCATAATTTTCTTAGTGGCATTGATCATACTCGTCGGCCTTGCCGTGCTCATTATCTGGCTGACTATTAGGCCGAAACGATTGAGCTACACGGTGGAAAGTGCTGAGGTCCACAACTTCGACATGACCGACACCCAACTCAATGCATCCTTTAGTTTTGGGGTAAGAGCATATAATCCCAATAAACGAGTCTCGGTTTACTATGATTCCATCACTGCCACAGTTGGCTTCGGTGATCAAGACTTGTCTTTCGGCGTGCTCAGTCCTTTCTACCAACCTCACAAAAACGAGCAATGGTTGAACATCCACCTCAACGCTCAAAACTTTCTATTGCACGACTCTGTGTCGAAGGAATTGGCACTTGAAAGGTCAGCTGGAGAGATGGATTTGGATCTTTGGATCAAGGCAAGAATTAGGTTTAAGGTTGGGGTATGGAAGTCCGCGCATAGGACGCTTCGAATCCGGTGTTCGCCGGCTGTACTGAGATCTACTTCTCACTATTGCAATTCAAATAACCTTTGCAAAAGAAAAACCCCACGTCTCATGGTGGAAACTAGCAAAGTGACAGCCCATGGTTCAACTAATAGAAACCTCAAAGCAACCATAGTTTTCTATATCAAAAGCTACAACCCTAACAAAAAAGCCTCCATTCACATGGATTCTGTGAAGATGATAGTCAATGATTATATGGGGCTACCGTTTCAATCCGCCATCCCCACCTTCACGTTGATGCCTCGAAACGAGATTGTCTTCAACTCAACCGTTCGTGTCAACTTCATGTACCCATTTGGGCGCCCGGTGCATTCGGACTGGGTACATCTAGAGCTTCGCTTCTCCGCTCAAGTTAGTTACATTGTGAACAGATGGAGGTCGAAACCCCGATTGCTGGAGATCTATTGTGATCACCTTTGGCTTAGGATTAATGACTCTACACCTAATTTTGATAAAACCAAATGCAGAGTGGATCTTTAA

Protein sequence

QSLFNQSWLLFLSRELSILEHGRSSAATITSWPLKDIAFCHNFLSGIDHTRRPCRAHYLADY*AETIELHGGKC*GPQLRHDRHPTQCIL*FWGKSI*SQ*TSLGLL*FHHCHSWLR*SRLVFRRAQSFLPTSQKRAMVEHPPQRSKLSIARLCVEGIGT*KVSWRDGFGSLDQGKN*V*GWGMEVRA*DASNPVFAGCTEIYFSLLQFK*PLQKKNPTSHGGN*QSDSPWFN**KPQSNHSFLYQKLQP*QKSLHSHGFCEDDSQ*LYGATVSIRHPHLHVDASKRDCLQLNRSCQLHVPIWAPGAFGLGTSRASLLRSS*LHCEQMEVETPIAGDLL*SPLA*D**LYT*F**NQMQSGSLX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy12G213590.1Chy12G213590.1mRNA