Chy12G210050 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCTCTTCTTCCATGGAAGACCACCAGAGCTTCTCGAATCTCCCAAATCGTCGCCGACCTTCACTCGCCGAAGCGCGCCGGTTCGCTTGTTGTCCAGACTGGATTTCCAACCTCTATTGTTGATCTATTCGTCAAGCACCGCGATCGACTGAGGAAGCACTCGGCGAGAAGGAAGTCGAAGAAGAAGAAGAAGATTGCGAAGAATGAATTTCACGACTCAATTGCTCAACTGTCTCCTTTGGAACTCGATTCTATTGGCTCTTCAGGCTATTGCGTACTGCGCGGTAACCTAGAAATTGAGGGTTTGGATGAAGCTCGTAAATGTAGCGGTCGTGGATGCGAACCGATCCGGGATCGGACTGAGACGTGTGTTGTCGTTGGCCATGCGGCGTGCGGGAACGGCTTCTGTTTGTTTGTGTTGAAGATATTTGTGGTTGCGGTTTTGGCGTTAATTGCCAAGAAGCTTGTGGTTGGTATTACTCTATCTGCTTTTCTACTTTTTCTTCTGGAATTTGTCGGTAAACGTACTGTACGCTTCTTCAAACCGTGCACTCATGGCGAGGCTGCTCTGAGATCCTTGATCCAAAAGGTATCGAAGCATCTATGGATTGGAAAAGATGATCCAGTGATTCAAGACTCAAGAAATTGCGAAGGAGAATCTGTTCCGAAAGTTTCGCTCAATGCTTTTCTAAACGAATCGATTGATTCACCCGAATTAAGTTCCTCAGTCGAAGAAATTCAACTCTTGGAACTGGAGATCGACACCGATGTAACGCCTAGGAGAAATGAAGATGAAAAACGCTGTCTGAATGGAGGGGATCTTCAATTGTGCGAAAATGAACGTGGAATACGAAGGAAACAAAACAGGAGGATGTTTGACAAACTAGTGCGAAGGAAATCAGGAAGTCAAGCAAACGAGAAAAAGAACAACACAGAGGAATTGGAGTTCAGAAGTGGCGGACTGGACAAGGACTCTATTGAAGAACAAGGGAATGAAACCCTAGAAAAAGAACAAGAACAAGATGGTGAAACCATAAGCATTTGTTGCAAAGATGAACGAGATAGCGGAAAACCTCCAGATTTCGATGAACAATGGCAGATAATGGAAGTTGCAGAGTCGTCATGTGAAATTCATGGAATCAAAATCAAGAGAGAAAAGAGTTTGAGTTATGCAATTCTGTTTCTGATTGTTCTTGTTGGGTTATTCGGAGGTCGGTTTGTGGCGGTGGTGCTGGCAACCGCATGCTGTTTCATGATCAAACTGAACGAAATTGCAAGGAGAAAGTCTTTGAATACGCCATTAAAGGTCAGTTAGAAGTATTCGTTTCCCCCATTTTTCATCTTTGATACAAATGTTGTGTTCGTTAATCCAAATTAGTTTTAGTTGAAAGTGAAAATTTCCCATGGAAGTTGAAAAAATTCAACTGGGGTTTTTGTACCAAGTGCTATAAAATTACACTCACAAAGTTTTTGTTACACTTTGTTAGATCAAATTCTGTCTTCGGGTGATACCCTTTTCAGTTAATTGTGTTCTTGAGACTTTGTTGTTGAGATGATTCAGCATATGTTTGATCAACTTCGAGGAGAGATTTTTGTAAAATCGAGTTTGAGGAATACAATTTGTCTATATCAGCAGATAAATTAAGCACTATGTTTATGTATATTATACACATATTTTTTATAATGTATAAAATTATCTCCATAATTTAGGTACGTGTCTCCATTGAGTTACTATTTTGTGATCCTCACTGACCACTCTCAAGTTGTGGCGGTGCAACATACTATATGATCTAAAAGTTTGTGCTTTTGGAACTTGCAAACCATAGTTTTCATTCTTCGCATTAAAATAAATAATCCATTTTGTTTTCTTTTTAATATGAGGTTCTCATAAAAAGTTGGACATAATTTCATACTTTTCCTCCTCTCTAAAAAAAATAAACTTTGAAAAAGGAAAAAAAAAAATTTGCCAATTATATATTGGGGCAGGGACCAACTTTTTTACTTTCTATAATTTTGAACTTAGAAAAATATTTAAACTATCTTGAGGAGTAGAAATGACTTTTCTACCTTGTTATTGTACTTTCTTATATAATATAGGAGAAATGAATGAAACTAATCTAAAAACGAATAAAAATGTGTCATAATAAAGAATGCGTGTGCGTGTGTCTAATTTTAACACGTGCAACACGATGATATTTTCTAGTGTATAATAAAAATTGTCAACATGATTTAGAAGGGAAAGAATATGACAACTTGATAATAGCTTACATTTAAGTGGTTGAAAGTTATATTCACACAATTGCAATGTGATACTTATAAAAAAATGAAAAACGTAAGGAGTAAATCATCTTTGGGTATGTATAGTAGTTATATAATAGCGATTTTAAGAAACGTAAGGTATAGAGAGTTGTGAACTTCTTAGACTACAAGATTGTTTTTAGTACAACGATTGTGTCTTTGAGCCAAATAATGATGAGGTGAGTTTACCCACTCCCAGGGTTGGTGGATTGGTAGGTTTGGAATTTAAATCTGTTAGTGTTAAGCCTATGCTATCAGGTGCAAATTTATAAATCTTTGAATTTGTGAAATTTTCTTGCATTAATTAGAGGTTAGAAGTTTAAAATTGGCCTCTTATATTTTAATATTGTTAAGTTCAAAACATAATAAAAAATTTAGAAGATTTATTTTTTTAAAATTTTGAAAAAAAAAGTGTTTGGTTCAATATCTGAATTAATTTTAATTTATACGTGTTTAATATCATATTTATAAACCACAAAATTAGTTATAACTATCCGATTATAAATTCTTCTTTTTAACACCTTCCATGTCCCAAATTTAAATTTTAATAATTGATCTTCTAAACCTTGTAATTAATTATTAATAAGCGCTTAATATATTTTGGCTACTCAAATCTAGATTTAACTACAGGATAATTTAGATTTGACTACTCAAATTGTTTGGCTATTGTTTGGTATGTGATTGTTAGATTTTGGTAGCCAAGTACCAATATCTCAACTATTTTTGTTTTATATTTGGTACACAATCTTGAACAAGCAAAAAATAGTTTGAAAAAAAATTGTCGAAAAAAAAGAGAAAAAAACAATTATAGAACGAAAGAAAATGAACGGAAGGGGAAATCTGAAAAAAAAAAAAATGGTTGGTACTTTTTTTTTATTTTGTTATATGGGTTCTAAATATTTTGGTGTTTTTGTTATATTTATGAAAATTTCTCAATTAATAATGATGTAATATTAATTTATCTATTAATAGTAAAAGTTCAAGTGGGATGTTTTATCTTGGTGATACTATGGATACATTCTAGTTTATAATGGTTTCAAATGTTTTTTATACAAGCCATTCACGTGGAGACGTGTGAGTGAGGTATTCTATACAAAAAAAATTATAAGATCAGATCGCAAAATAATTAATCTTTTTGAAAATTAGTTAACTGATGAGATTAACATTATTTCACAAGATGATCATGTGTTACACAATCTTAATCTCCAAATGGGTTATATGAACTCTTGTTTGTGTAGCGTATTTTTTGATTTCCACGAGTGAGAGTGACTTGAGTCGCCCACTCAATATGCCTAACATTTTGGAGACTCAAGCAAATAAAGAGCTTCTCAGGATAGAATTCACTATTTCATGCGTTGAGTTAGTAGACGAGTGATTCGCTTAATTACTCTCTAAGACTTTAAGTATGAGAACGATTCAATTACACTGCTCCTAATCATACTTAAGTGGATACAACAAATAGAGATAAAATTTATGATAGGATTCATGCACTGGAATAATAAACTACTTCGATTCATGCAACAAACATAAGCCAAGAAGATACTATTATTATTAAATATGTTATCTCTCTCCTCAACTCAGTCAATTCTCCTGTAATGTTATAATTCAATTCCCACCATTCTCAGCAGTCAGCAGAACCCGAATCAAATATCATTTATTAAATGAGCAAAATATTAAAAGCATTAAACTTTCAATTTGGATGCTATTGTAATATTAAAACAATTAAAATATAATATATAAATAATAAAATCATTAAAATCAATAAATTAGAAAATTTCCACTATTTCCATGTGTCTTTCAAAACCCATCAAATGCTACCATCTATAGGCAATTTGACAAGTTTGAGATGGATTACATGACTACTAAGATTCGGTATCTTCAAGACACATGACAAAGGCAAAATGTGTAGAGGAATGCGACACATGACATGCAATAACACTAAGGATAATGGATAATGTGCATCTATTTTTTTTTATGATATTTAATAATACTTCTCCTTAGATGTGCATTATATATATGAAATATGTCTTGTTAAAACCTTAATAAGAAAAAAATCCAGGAAAAAATTTATAGTGAAAGAAAAAGAGTACATATTTCATATATAATTACAAAAATAAAATTTACTCCCTCTCATGAACATATCATTTGAGATCTCTGAGCCATCACATTCGAGTGTTGTGCACCAATTATTCAAAGGTTGCGGTAGGTAATGATTTTGTTAAGTTTGCTAGGTTATCATTTGAACAAATTTGTTGTACCGTGATATCATCATTTTCTTCAAGATCATGAGTGTAGAAAAGTTTTGGTAAAATATGGTTTGTTCTATCTCATTTAATATAACCTCCTTTGATTTGAGCTATGCATGTTGTGTTGTCTTTGTATAGTATCGTTGGAAGAATTTTACTAGAAAACCAGCCACATGTCCCACGAATGTGTTAGAGTCGTTTATCATAGACATACACATCTCAATTTGCTTCATGCGTTGCAAGAATTTTAGCATGATTTGAGGAAGTGACTATTATTGTCTGTTTCACTAATCGTCATGTTATAATAGTTGTCACACCTTTTTCCAAACCACCTACTCTCGATCTGAGAGATGACACGAGGCCAAAAATCCCGTCACTAGCTACTCGACGACACCTGCCGACCTTATCTTAACTTGAACTACTAAACCTTATACGCAATCCTTACTAA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Homology
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2KJJ5 (Transducin beta-like protein 3 OS=Bos taurus OX=9913 GN=TBL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 551.2 bits (1419), Expect = 3.3e-155 Identity = 299/808 (37.00%), Postives = 446/808 (55.20%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5U2W5 (Transducin beta-like protein 3 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Tbl3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 548.5 bits (1412), Expect = 2.2e-154 Identity = 292/808 (36.14%), Postives = 450/808 (55.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8C4J7 (Transducin beta-like protein 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tbl3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 548.1 bits (1411), Expect = 2.8e-154 Identity = 295/808 (36.51%), Postives = 455/808 (56.31%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q12788 (Transducin beta-like protein 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TBL3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 540.4 bits (1391), Expect = 5.9e-152 Identity = 291/812 (35.84%), Postives = 447/812 (55.05%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9USN3 (Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 13 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=utp13 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 416.0 bits (1068), Expect = 1.7e-114 Identity = 260/812 (32.02%), Postives = 409/812 (50.37%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LVT4 (WD_REPEATS_REGION domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G537520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1836.6 bits (4756), Expect = 0.0e+00 Identity = 919/951 (96.64%), Postives = 932/951 (98.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V9T7 (Transducin beta-like protein 3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold437G00150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1802.7 bits (4668), Expect = 0.0e+00 Identity = 899/942 (95.44%), Postives = 917/942 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BCL9 (transducin beta-like protein 3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488579 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1699.1 bits (4399), Expect = 0.0e+00 Identity = 844/871 (96.90%), Postives = 858/871 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FSD8 (transducin beta-like protein 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448362 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1595.1 bits (4129), Expect = 0.0e+00 Identity = 796/882 (90.25%), Postives = 836/882 (94.78%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JG41 (transducin beta-like protein 3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484196 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1582.8 bits (4097), Expect = 0.0e+00 Identity = 792/882 (89.80%), Postives = 832/882 (94.33%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. NCBI nr
Match: KAA0063747.1 (transducin beta-like protein 3 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK14950.1 transducin beta-like protein 3 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1796 bits (4652), Expect = 0.0 Identity = 899/942 (95.44%), Postives = 917/942 (97.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. NCBI nr
Match: XP_004135541.1 (transducin beta-like protein 3 [Cucumis sativus] >KGN66363.2 hypothetical protein Csa_023194 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1701 bits (4406), Expect = 0.0 Identity = 851/871 (97.70%), Postives = 861/871 (98.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. NCBI nr
Match: XP_008445600.1 (PREDICTED: transducin beta-like protein 3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1692 bits (4381), Expect = 0.0 Identity = 844/871 (96.90%), Postives = 858/871 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. NCBI nr
Match: XP_038902231.1 (transducin beta-like protein 3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1613 bits (4178), Expect = 0.0 Identity = 812/875 (92.80%), Postives = 835/875 (95.43%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. NCBI nr
Match: KAG6571171.1 (Transducin beta-like protein 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1588 bits (4112), Expect = 0.0 Identity = 797/882 (90.36%), Postives = 835/882 (94.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. TAIR 10
Match: AT5G16750.1 (Transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 1196.8 bits (3095), Expect = 0.0e+00 Identity = 594/860 (69.07%), Postives = 697/860 (81.05%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. TAIR 10
Match: AT3G21540.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 2.9e-37 Identity = 153/686 (22.30%), Postives = 286/686 (41.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. TAIR 10
Match: AT5G25150.1 (TBP-associated factor 5 ) HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 7.4e-25 Identity = 77/281 (27.40%), Postives = 125/281 (44.48%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. TAIR 10
Match: AT4G20880.1 (ethylene-responsive nuclear protein / ethylene-regulated nuclear protein (ERT2) ) HSP 1 Score: 113.2 bits (282), Expect = 1.6e-24 Identity = 131/432 (30.32%), Postives = 193/432 (44.68%), Query Frame = 0
BLAST of Chy12G210050 vs. TAIR 10
Match: AT1G62020.1 (Coatomer, alpha subunit ) HSP 1 Score: 100.5 bits (249), Expect = 1.1e-20 Identity = 68/252 (26.98%), Postives = 116/252 (46.03%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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