Chy11G202920 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview


Name	Chy11G202920
Type	gene
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Golgi to ER traffic protein 4 homolog
Location	chrH11: 23545587 .. 23561772 (-)
RNA-Seq Expression	Chy11G202920
Synteny	Chy11G202920

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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mRNA sequence

ATGAGTTCGCATCCATTGCAGAAGACCATGTCCCGTGCGAGATCTAGGAGAATTGTACTGCCTCCGGTTCAAGAGCATATTATTAAAATAGAAGACGTTATCGATACTGGTGACTACTATGGGGCTCAACAGATGTACAAATCTGTCAGCGCAAGATACGTGGCTGCAGAAAGGTACTCAGAAGCCTTGGATATTCTTCAGTCAGGGGCTTGTACCCAGTTGAAACATGAGCAGATTACTTGTGGATCAGAGCTTGCTGTGTTATTTGTCGAGACACTTGTTAAAGGCAAAGTTCCTTATGATGATAATACTCTTGATCGTGTCAGGAAAATTTACAAGAATTTCCCTCAGATTCCATTACCTCAACACTTGGGGGAAGATGATGATATGCAACAACTCTCTGAAGCACTTGGTGCTGCAAAAACACGGGTTGAAGGATGTTCCTCTTTTTTGAAAGCAGCTTTGAAGTGGTCTATAGAGTTTGGATCGCAAAGGAGTGGATCTCCAGAAATTCATATCATGCTTGCTACATATATATATTCCGAGTCACCAGAAGTGGACATGACCAGAGTATCATATCACTTTATTCGAGGAGATAACCCCAAGAAATTTGCTTCTATCTTAGTGAATTTTATGGGCAAGTGTTATCCAGGTGAAGATGATATGGCTATTGCACGGGCAGTTTTAATGTACTTGTCTCTTGGTAATCTAAGGGATGCTAATATCCTATTTGATGAGTTAAAGAAAGTAGAAGAACGTGAAGAACTCGAGCTTCCTGATTCAGAACTGATTGAGTTTATCGTCTATCTTTTGCTAACGTTGCAAAGAGACGCGTTGCCTCTTTTTAATATGCTAAGGGCAAATTACAAGTCAAGTTTAGAGAGAGAACCTGCCCTGAATGAGCTTATCGATGAAATTGCAGAGAAATTTTATGGAGTACGGCGTAGAAATCCCTTGCAAGGGATCTTTGGAGATTTCTTGAAGCTTTATCCTTTCGACCCCCTCTCCCTCTCCCTTTGTCATGTGGAATCAGCAAACTCCTCTGCTCCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTCGCCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCAGTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGACTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGTAACTACTTCCAGTGCACCATTATTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTTGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCTGGTGTCTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTAGCATGGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCTCCATTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTTGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTATGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAGTTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTCTGGCATCCGCTTCCACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAATCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGCCAGAAGTTGTGGATGTCTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGTTCGCATCCATTGCAGAAGACCATGTCCCGTGCGAGATCTAGGAGAATTGTACTGCCTCCGGTTCAAGAGCATATTATTAAAATAGAAGACGTTATCGATACTGGTGACTACTATGGGGCTCAACAGATGTACAAATCTGTCAGCGCAAGATACGTGGCTGCAGAAAGGTACTCAGAAGCCTTGGATATTCTTCAGTCAGGGGCTTGTACCCAGTTGAAACATGAGCAGATTACTTGTGGATCAGAGCTTGCTGTGTTATTTGTCGAGACACTTGTTAAAGGCAAAGTTCCTTATGATGATAATACTCTTGATCGTGTCAGGAAAATTTACAAGAATTTCCCTCAGATTCCATTACCTCAACACTTGGGGGAAGATGATGATATGCAACAACTCTCTGAAGCACTTGGTGCTGCAAAAACACGGGTTGAAGGATGTTCCTCTTTTTTGAAAGCAGCTTTGAAGTGGTCTATAGAGTTTGGATCGCAAAGGAGTGGATCTCCAGAAATTCATATCATGCTTGCTACATATATATATTCCGAGTCACCAGAAGTGGACATGACCAGAGTATCATATCACTTTATTCGAGGAGATAACCCCAAGAAATTTGCTTCTATCTTAGTGAATTTTATGGGCAAGTGTTATCCAGGTGAAGATGATATGGCTATTGCACGGGCAGTTTTAATGTACTTGTCTCTTGGTAATCTAAGGGATGCTAATATCCTATTTGATGAGTTAAAGAAAGTAGAAGAACGTGAAGAACTCGAGCTTCCTGATTCAGAACTGATTGAGTTTATCGTCTATCTTTTGCTAACGTTGCAAAGAGACGCGTTGCCTCTTTTTAATATGCTAAGGGCAAATTACAAGTCAAGTTTAGAGAGAGAACCTGCCCTGAATGAGCTTATCGATGAAATTGCAGAGAAATTTTATGGAGTACGGCGTAGAAATCCCTTGCAAGGGATCTTTGGAGATTTCTTGAAGCTTTATCCTTTCGACCCCCTCTCCCTCTCCCTTTGTCATGTGGAATCAGCAAACTCCTCTGCTCCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGACCTCATCCACCTCCTTGTTTGGGGCTGGGAGCTCGCCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGGAGCTCAGTTGCGCCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCTCATCTGCCGGGACCTCATCTGCGCCCTTGTTTGGGACTGCTCCATCTGCAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGTAACTACTTCCAGTGCACCATTATTTGGCACATCTGCATCCGCTGCAAGTTTGGGATCAGGGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCTGGTGTCTCTCTGTTTGGGACACCAGCTACATCTTCAGGCAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTAGCATGGGCTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTGTCCACTTCTCCATTCCAGAGCTCCATTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCTTCTTCACCGTTTGTGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTCCGACCGGTTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCAATGTATCTTCTTCTTCTTCTTCTCTTACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTTGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCAGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTATGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCTCGGCTTCTTCATCAAGTGCAGTTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCTCAAGCGCCAGCCTCTTTCGGTTTCCCTTCTCTGGCATCCGCTTCCACGGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTGTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTCGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTCCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATTCTTCTTAGACTTGAGATTGAGGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCACCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAGGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAATCTGAATATATAGAGCGGGAATTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCGAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACACCGCTAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGCCAGAAGTTGTGGATGTCTTAA

Protein sequence

MSSHPLQKTMSRARSRRIVLPPVQEHIIKIEDVIDTGDYYGAQQMYKSVSARYVAAERYSEALDILQSGACTQLKHEQITCGSELAVLFVETLVKGKVPYDDNTLDRVRKIYKNFPQIPLPQHLGEDDDMQQLSEALGAAKTRVEGCSSFLKAALKWSIEFGSQRSGSPEIHIMLATYIYSESPEVDMTRVSYHFIRGDNPKKFASILVNFMGKCYPGEDDMAIARAVLMYLSLGNLRDANILFDELKKVEEREELELPDSELIEFIVYLLLTLQRDALPLFNMLRANYKSSLEREPALNELIDEIAEKFYGVRRRNPLQGIFGDFLKLYPFDPLSLSLCHVESANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGTAPSAGASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASSLSTSPFQSSISSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS*

Homology

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6GKV1 (Protein GET4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MDC12.19 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 428.7 bits (1101), Expect = 1.7e-118
Identity = 205/323 (63.47%), Postives = 265/323 (82.04%), Query Frame = 0


Query: 10  MSRARSRRIVLPPVQEHIIKIEDVIDTGDYYGAQQMYKSVSARYVAAERYSEALDILQSG 69
           MSR R +R  LPPVQEHI K+  VI+ G+YYGA QMYKS+SARYV A+R+SEALDIL SG
Sbjct: 1   MSRERIKR-ELPPVQEHIDKLRKVIEEGNYYGALQMYKSISARYVTAQRFSEALDILFSG 60

Query: 70  ACTQLKHEQITCGSELAVLFVETLVKGKVPYDDNTLDRVRKIYKNFPQIPLPQHL---GE 129
           AC +L+H  + CG++LA+LFV+TLVK K P +D TLDR+R I+K FP++P+P HL    +
Sbjct: 61  ACIELEHGLVNCGADLAILFVDTLVKAKSPCNDETLDRIRCIFKLFPRVPVPPHLVDVSD 120

Query: 130 DDDMQQLSEALGAAKTRVEGCSSFLKAALKWSIEFGSQRSGSPEIHIMLATYIYSESPEV 189
           D+D+Q L E+LG A++RVE  +SFL+AA+KWS EFG  R+G PE+H ML  Y+Y+E PE+
Sbjct: 121 DEDVQNLQESLGEARSRVENLTSFLRAAIKWSAEFGGPRTGYPELHAMLGDYLYTECPEL 180

Query: 190 DMTRVSYHFIRGDNPKKFASILVNFMGKCYPGEDDMAIARAVLMYLSLGNLRDANILFDE 249
           DM R+S HF+R ++P+KFAS+LVNFMG+CYPGEDD+AIARAVLMYLS+GN++DAN + DE
Sbjct: 181 DMVRISRHFVRAEDPEKFASMLVNFMGRCYPGEDDLAIARAVLMYLSMGNMKDANFMMDE 240

Query: 250 LKKVEEREELELPDSELIEFIVYLLLTLQRDALPLFNMLRANYKSSLEREPALNELIDEI 309
           +KK  E +  EL +S+LI+FI YLL TLQRDALPLFNMLR  YKSS++R+  LNEL+DEI
Sbjct: 241 IKKQAETKNPELSESDLIQFISYLLETLQRDALPLFNMLRVKYKSSIDRDQLLNELLDEI 300

Query: 310 AEKFYGVRRRNPLQGIFGDFLKL 330
           AE+FYGV+R+NPLQG+FGD  K+
Sbjct: 301 AERFYGVQRKNPLQGMFGDIFKM 322

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L7F7 (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 395.6 bits (1015), Expect = 1.6e-108
Identity = 362/693 (52.24%), Postives = 453/693 (65.37%), Query Frame = 0


Query: 344 SANSSAPLFGAASSSG---TSSTSLFGAG-----SSPAPS-FGAAPSSGSSVAPS----- 403
           SA+SS P FG  SS+     S+T  FG G     S+PAPS FG++ ++ SS AP      
Sbjct: 83  SASSSTPSFGFGSSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFG 142

Query: 404 ----------------FGALSSSAGTSSAPLFGTAPSAGAS----SAPSLFGGASSVTTS 463
                           FGA +SSA T S+  FG AP++G++    S+PSLF   SS + S
Sbjct: 143 FVTSSASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASAS 202

Query: 464 SAPLFGTSASAASLGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS-------- 523
           ++ LFG S+SAA+  S LFGA             +++A GS  S+FG   +S        
Sbjct: 203 NSSLFGASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASS 262

Query: 524 -SGSTGS--GLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASS------LSTSPF-QSSISSSSSQ 583
            SGS+ S  G  GSSPF  SSS      ST +LFASS       S SPF  S+ +SSS+ 
Sbjct: 263 ASGSSPSIFGATGSSPFFGSSSSA---GSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTS 322

Query: 584 NLT--SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSS 643
           N +  S+SPF AS +GFSF   + S TTS T  S+   +    ++SSSSFSFGT A+S  
Sbjct: 323 NTSNASASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT----ASSSSSFSFGTSANS-- 382

Query: 644 QSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS 703
               GF++    STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P+
Sbjct: 383 ----GFNL----STGSSAAPAS--------STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPA 442

Query: 704 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLS--LPTK 763
            S PA + +  +    S A ++ P  ASS A  S TGFG+ SS  ++ +  S +     K
Sbjct: 443 SSAPASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPK 502

Query: 764 TSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT 823
           TST ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T +TLVV SSS   TST  A 
Sbjct: 503 TSTPASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAP 562

Query: 824 VSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEI 883
           V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEI
Sbjct: 563 VAGSPKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEI 622

Query: 884 EVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 943
           EVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAM
Sbjct: 623 EVAKVVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAM 682

Query: 944 YEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID 968
           YEQSE +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWID
Sbjct: 683 YEQSELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWID 739

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G0SBQ3 (Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) OX=759272 GN=NSP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 3.7e-12
Identity = 204/661 (30.86%), Postives = 327/661 (49.47%), Query Frame = 0


Query: 344 SANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSS--AGTSS 403
           +  SS P F   ++SGT S SLFG         GA     +S+   FG  SS+  AGT +
Sbjct: 32  TTGSSTPAFSFGNTSGTQSGSLFG---------GATTGQKTSL---FGNTSSTTPAGTPA 91

Query: 404 APLFGTAPSAGASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFG---TSASAASLGSG---LFGAS---- 463
             LFG   S  +SS PSLFG AS     S  LFG   TSA+ +S  +G   LFG+     
Sbjct: 92  TSLFG--QSTSSSSGPSLFGNASK---PSGNLFGNTSTSAAGSSTPAGTPSLFGSKTATT 151

Query: 464 ---------AAASGSGVSLFG-TPATSSGS---TGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNL 523
                    AA +GSG SLFG T AT+ GS   T +GLFG S    +S       +T   
Sbjct: 152 SAGASSTTPAATAGSG-SLFGSTTATTQGSSTPTSTGLFGGS--STASKSLFGSTTTPAT 211

Query: 524 FASSLSTSPFQSSISSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSK---TTSITNVSSSSSS 583
             S   T+P +    S  S     + P  A+ +   F  G+LSK   T + T     S+S
Sbjct: 212 GTSGSQTTPAKPLFGSFGSTTPAGAPPTDATKTAGLF--GNLSKPATTGTSTPTLFGSTS 271

Query: 584 LTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAP-STTATKPTSLSLSNSVAP 643
            T    SS+      PA +S+ ++      + A+T  +SAP STT T     +L++S   
Sbjct: 272 ATTQGQSSTPLFGAKPAETSTTTA-----ASGAATPATSAPASTTPTLFGGATLTSSAPA 331

Query: 644 LFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLS----IAASSAPSAASSGAMSS 703
             ++ +T +ASTPAA   T+P F   A +S+  ++TT +     + + A +AA+  + ++
Sbjct: 332 ASTSTSTATASTPAA---TKPLFGATATTSAPGSSTTTATPGLFSTTPATTAAAGSSTAT 391

Query: 704 FTGFG----VTSSASSSSAVGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASA---STAATTT 763
            T FG     T++A++SS   + S P+   +  +S+ APAS G P+  +A   ++A  TT
Sbjct: 392 STLFGTKPATTTAAAASSTPAATSTPSLFGSKPASTTAPAS-GTPTTTTAPASTSAPATT 451

Query: 764 SGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSA-TVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ 823
           +    S  S T+ST      +  TT+ + A TV    +LP  +  KT++EII  W  +L 
Sbjct: 452 TAAPTSGASATASTTTAGQDAKTTTAGLGASTVGPQSQLP-RLKNKTMDEIITRWATDLA 511

Query: 824 ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDK 883
           +   +F++QA  + EWDR +++N + + +L     +      E+E++L  +E+ Q+E+  
Sbjct: 512 KYQKEFKEQAAKVMEWDRLLVENGEKIQKLYTSTYEAERASNEIERQLSNVESQQEELTA 571

Query: 884 ALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTL 943
            L   E + + +Y  + G    ++AA     R+  Y+ +E +  +L++M + +  +I+ +
Sbjct: 572 WLDRYERELDELYAKQMGSAAGEQAAGPDQERERTYKLAEKLTDQLDEMGKDLAKMIKEI 631

Query: 944 N-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATE 953
           N      ++G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A + 
Sbjct: 632 NDMSNTLSKGSKPD-----DPLTQIVRVLNGHLAQLQWIDTNAAALQAKVAAAQKAAGSM 655

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q63850 (Nuclear pore glycoprotein p62 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nup62 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 1.2e-10
Identity = 165/565 (29.20%), Postives = 276/565 (48.85%), Query Frame = 0


Query: 412 GASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFG--ASAAASGSGVSLFG----TP 471
           GA +    FG A + TT+ A  F  SAS    G   FG  +  AA+    SLF     TP
Sbjct: 10  GAPAGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSASGTGTGGFNFGTPSQPAATTPSTSLFSLTTQTP 69

Query: 472 AT-----------SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASSLSTSPFQSSISS 531
            T           +SG TG  L  S+P   S S   A  +T+N  +  L +S   ++ISS
Sbjct: 70  TTQTPGFNFGTTPASGGTGFSLGISTP-KLSLSNAAATPATANTGSFGLGSSTLTNAISS 129

Query: 532 SSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASS 591
            S+ N  +      +P+GF F                 SS+ +  ST S+ FSF T  S+
Sbjct: 130 GSTSNQGT------APTGFVF----------------GSSTTSAPSTGSTGFSF-TSGSA 189

Query: 592 SSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQ 651
           S   + GFS+ +     GSSA      +PT+LS  +   P     TT  A+ PAA + T 
Sbjct: 190 SQPGASGFSLGSV----GSSA------QPTALS-GSPFTPATLVTTTAGATQPAAAAPT- 249

Query: 652 PSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTK 711
                   ++++SA +TL  + ++AP+++S+  +S        ++ S+ +   SL  P  
Sbjct: 250 --------AATTSAGSTLFASIAAAPASSSATGLSLPAPVTTAATPSAGTLGFSLKAPGA 309

Query: 712 TSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT 771
              A+++S    +    + A+A+ A+TTT+GF+ S +   S+     SS + T    S+T
Sbjct: 310 APGASTTSTTTTTTTTTTTAAAAAASTTTTGFALSLKPLVSAG---PSSVAATALPASST 369

Query: 772 VSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEI 831
            + T   P+ +T   +E +I +W+ EL+++   F +QA  +  WDR +++N + +  L  
Sbjct: 370 AAGTATGPA-MTYAQLESLINKWSLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHR 429

Query: 832 EVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 891
           EV KV   Q  L+++L+ I + Q+E++  L  +EE      K++ G +    A   R+  
Sbjct: 430 EVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQKELEDLLSPLEESV----KEQSGTIYLQHADEEREKT 489

Query: 892 YEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID 951
           Y+ +E I+ +L++M + +K II+ LN   GG  D  D   PL  + +ILN  + SL W+D
Sbjct: 490 YKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIEHLNM-AGGPADTSD---PLQQICKILNAHMDSLQWVD 518

Query: 952 EKAEEFSSRIQKLA-ATEGPAADRE 959
           + +     R+++ +   EG   ++E
Sbjct: 550 QSSALLQRRVEEASRVCEGRRKEQE 518

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P17955 (Nuclear pore glycoprotein p62 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Nup62 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 58.9 bits (141), Expect = 3.6e-07
Identity = 172/589 (29.20%), Postives = 277/589 (47.03%), Query Frame = 0


Query: 366 FGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPL-FGTAPSAGASSAP--SLFGG 425
           FG   +PA  F    +  ++  P+ G   S++GT +    FGT PS  A++ P  SLF  
Sbjct: 6   FGGTGAPAGGFTFGTAKTATTTPATGFSFSASGTGTGGFNFGT-PSQPAATTPSTSLFSL 65

Query: 426 ASSVTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPAT-SSGSTGSGLFGSSP 485
           A+  +T+  P F    + AS G+G    S   S   +SL  T AT ++ +TGS   GSS 
Sbjct: 66  ATQTSTTQTPGFNFGTTPASGGTGF---SLGISTPKLSLSSTAATPATANTGSFGLGSST 125

Query: 486 FGASSSGTLAWASTSNLFASSLSTSPFQSSISSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLS 545
              + SG    AST     SS  T+P      SS     T+S+P   + +GFSF +GS S
Sbjct: 126 LTNAISG----AST-----SSQGTAPTGFVFGSS-----TTSAPSTGT-TGFSFTSGSAS 185

Query: 546 KT-TSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTA 605
           +   S  N+ S  S     + S S F   TPA+             A +T G++ P+  A
Sbjct: 186 QPGASGFNIGSVGSLAQPTALSGSPF---TPATL------------ATTTAGATQPA--A 245

Query: 606 TKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSI---AAS 665
             PT+ + S       ST+  + A+ PA++STT  S S PA ++++  A TL     A  
Sbjct: 246 ATPTAATTSAG-----STLFASIAAAPASSSTTVLSLSAPATTAATPTAGTLGFSLKAPG 305

Query: 666 SAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASAS 725
           +AP A+++   ++ T    T+S SSS+     +L  K    A     P+S    +L ++S
Sbjct: 306 AAPGASTTSTTTTTTTTTTTASTSSSTTTTGFALSLKPLVPA----GPSSVAATALPASS 365

Query: 726 TAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEW 785
           TA  TT+G                                       +T   +E +I +W
Sbjct: 366 TAVGTTTG-------------------------------------PAMTYAQLESLINKW 425

Query: 786 NAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQ 845
           + EL+++   F +QA  +  WDR +++N + +  L  EV KV   Q  L+++L+ I + Q
Sbjct: 426 SLELEDQERHFLQQATQVNAWDRTLIENGEKITSLHREVEKVKLDQKRLDQELDFILSQQ 485

Query: 846 QEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQ 905
           +E++  L  +EE      K++ G +    A   R+  Y+ +E I+ +L++M + +K II+
Sbjct: 486 KELEDLLSPLEESV----KEQSGTIYLQHADEEREKTYKLAENIDAQLKRMAQDLKDIIE 504

Query: 906 TLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK 947
            LN   GG  D  D   PL  + +ILN  + SL W+D+ +     R+++
Sbjct: 546 HLNM-AGGPADTSD---PLQQICKILNAHMDSLQWVDQSSALLQRRVEE 504

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAD4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 951.0 bits (2457), Expect = 3.7e-273
Identity = 597/626 (95.37%), Postives = 607/626 (96.96%), Query Frame = 0


Query: 344 SANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAP 403
           SANSSAPLFGAASSSGTSS SLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAP
Sbjct: 136 SANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAP 195

Query: 404 LFGTAPSAGASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGSGVSLFG 463
           LFG APSAGASSAPSLFGGASS TTSSAPLFGT+ASAAS GS LFGASA ASGSG SLFG
Sbjct: 196 LFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLFG 255

Query: 464 TPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASSLSTSPFQSSISSSSSQNLTSS 523
           T A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT +  STSNLFASSLS+SPFQSS+SSSSSQNLTSS
Sbjct: 256 TSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPFQSSLSSSSSQNLTSS 315

Query: 524 SPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV--SSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFG 583
           SPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV  SSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFG
Sbjct: 316 SPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFG 375

Query: 584 FSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPA 643
           FSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPA
Sbjct: 376 FSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVPA 435

Query: 644 FSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKTSTAASS 703
           FSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG +SSFTGFGVTSSASSSSA+GSLSLPTKTSTAASS
Sbjct: 436 FSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASS 495

Query: 704 SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKL 763
           SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKL
Sbjct: 496 SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKL 555

Query: 764 PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE 823
           PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE
Sbjct: 556 PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE 615

Query: 824 TQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQSEYI 883
           TQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQ+EYI
Sbjct: 616 TQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYI 675

Query: 884 ERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFS 943
           ERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFS
Sbjct: 676 ERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFS 735

Query: 944 SRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 968
           SRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 736 SRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KA27 (Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 879.0 bits (2270), Expect = 1.8e-251
Identity = 594/785 (75.67%), Postives = 601/785 (76.56%), Query Frame = 0


Query: 344 SANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAP 403
           SANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGS PAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAP
Sbjct: 133 SANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAP 192

Query: 404 LFGTAPSAGASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGSGVSLFG 463
           LFG APSAGASSAPSLFGGASS TTSSAPLFGTSASAAS GSGLFGASAAASGSGVSLFG
Sbjct: 193 LFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLFG 252

Query: 464 TPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASSLSTSPFQSSISSSSSQNLTSS 523
           TPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTL+ ASTSNLFASSLSTSPFQS++SSSSSQNLTSS
Sbjct: 253 TPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTSS 312

Query: 524 SPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV---------------------------------- 583
           SPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV                                  
Sbjct: 313 SPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 372

Query: 584 ------------------------------------------------------------ 643
                                                                       
Sbjct: 373 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 432

Query: 644 ------------------------------------------------------------ 703
                                                                       
Sbjct: 433 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 492

Query: 704 -------SSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATK 763
                  SSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATK
Sbjct: 493 SSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATK 552

Query: 764 PTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSA 823
           PTSL                SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSA
Sbjct: 553 PTSL----------------SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSA 612

Query: 824 ASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATT 883
           ASSGA+SSFTGFGVTSSASSSSA+GSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATT
Sbjct: 613 ASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATT 672

Query: 884 TSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQ 943
           TSGFSASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQ
Sbjct: 673 TSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIINEWNAELQ 732

Query: 944 ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDK 968
           ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDK
Sbjct: 733 ERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDK 792

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L2D4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 780.8 bits (2015), Expect = 6.6e-222
Identity = 520/632 (82.28%), Postives = 553/632 (87.50%), Query Frame = 0


Query: 344 SANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGT 403
           S +S  P FGAA +SG+S   LFG    +GSSP PSFGA+PS+GSS  PSFGA SSS G+
Sbjct: 169 SGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSS-GS 228

Query: 404 SSAPLFGTAPSAGASSAPSLFGGASS-VTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGSG 463
           SS+P FG APS G +SAPSLFGG SS  TTSSAPLFGTSA  AS GS +FGASAAASGS 
Sbjct: 229 SSSPFFGAAPSVG-TSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGS- 288

Query: 464 VSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLF---ASSLSTSPFQSSISSS 523
                          S LFGS+ F +SSSGTL+  STSNLF   +SS ST+PFQ+S SSS
Sbjct: 289 --------------SSSLFGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSS 348

Query: 524 SSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSS 583
           SSQNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT V+SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+
Sbjct: 349 SSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT-VASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSA 408

Query: 584 SQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQP 643
           SQSSFGF+I+NAAS  GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QP
Sbjct: 409 SQSSFGFNISNAASLEGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQP 468

Query: 644 SFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKT 703
           SFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPSA SSGA SSFTGFG+TS+A+SSSA+ SLSLPTK+
Sbjct: 469 SFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSATSSGAASSFTGFGITSTAASSSAIVSLSLPTKS 528

Query: 704 STAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATV 763
            TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATV
Sbjct: 529 LTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATV 588

Query: 764 SSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIE 823
           S+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIE
Sbjct: 589 SATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIE 648

Query: 824 VAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY 883
           VAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY
Sbjct: 649 VAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY 708

Query: 884 EQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE 943
           EQ+EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE
Sbjct: 709 EQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE 768

Query: 944 KAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 968
           KAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 769 KAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQKFWMS 782

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5C8 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 773.9 bits (1997), Expect = 8.1e-220
Identity = 520/645 (80.62%), Postives = 549/645 (85.12%), Query Frame = 0


Query: 344 SANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFG----AGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSS---- 403
           S +S  P FGAAS+SGTS   LFG    +GSSP PSFGAAP SGSSVAP FG+  S    
Sbjct: 141 SGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSS 200

Query: 404 ---------SAGTSSAPLFGTAPSAGASSAPSLFGGASS-VTTSSAPLFGTSASAASLGS 463
                    SAG+SS+P FG APSAG +SAPSLFGG SS  TTSSAPLFGTSA  AS GS
Sbjct: 201 PLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGS 260

Query: 464 GLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLF---ASS 523
            +FGAS AASGS                S LFGS+PF +SSS      STSNLF   +SS
Sbjct: 261 SIFGASTAASGS---------------SSSLFGSNPFASSSS-----VSTSNLFGSSSSS 320

Query: 524 LSTSPFQSSISSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTS 583
            ST+PFQ+S SSSSSQNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT  +SSSSSLT ASTS
Sbjct: 321 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSASTS 380

Query: 584 SSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTT 643
           SSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTT
Sbjct: 381 SSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTT 440

Query: 644 SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASS 703
           SASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASS PS  SSGA SSFTGFGVTS+A+S
Sbjct: 441 SASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAAS 500

Query: 704 SSAVGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVAS 763
           SSA+ SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSSTLV+AS
Sbjct: 501 SSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPASFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIAS 560

Query: 764 SSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI 823
           SSSGTTSTVS TVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI
Sbjct: 561 SSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI 620

Query: 824 MQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLL 883
           +QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLL
Sbjct: 621 LQNRDILLRLEIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLL 680

Query: 884 LDDEAASTRDAMYEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRI 943
           LDDEAASTRDAMYEQ+EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRI
Sbjct: 681 LDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRI 740

Query: 944 LNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 968
           LNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 741 LNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQKFWMS 763

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DSI7 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023501 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 2.2e-209
Identity = 501/624 (80.29%), Postives = 538/624 (86.22%), Query Frame = 0


Query: 352 FGAASSSGTSSTSLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAPLFGTAPSA 411
           FGAA ++G+SS S+FGA                  APS G+ +SSAG+SS  LFG APSA
Sbjct: 1   FGAALAAGSSSGSVFGA------------------APS-GSSASSAGSSSFSLFGAAPSA 60

Query: 412 GASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGSGVSLFGTPATSSGS 471
           GA SAPSLFGG SS T+SS PLFG+SA  A+ GS L GAS AASG   SLFGT A+SSGS
Sbjct: 61  GA-SAPSLFGGVSSATSSSTPLFGSSAPTATPGSALPGASVAASG---SLFGT-ASSSGS 120

Query: 472 TGSGLFG----SSPFGASSSGTLAWASTSNLFASSL---STSPFQSSISSSSSQNLTSSS 531
            GS LFG    ++ FG+++ GT    S+S LFASS+   STS FQ+S SSSSSQ+L+SSS
Sbjct: 121 AGSALFGAPLSTNSFGSNTFGT----SSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSS 180

Query: 532 PFVA-SPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFS 591
           PF A S SGFSFPT SLSKTT+    SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFS
Sbjct: 181 PFAASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS 240

Query: 592 INNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFS 651
            +NAAST  S+AP TTATKPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQPSFSVPAFS
Sbjct: 241 FSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFS 300

Query: 652 SSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKTSTAASSSQ 711
            SSSAATT+S AASS PSAASSGA SSFTGFGVT++ASSSS + SLSLPTKT TAASSSQ
Sbjct: 301 LSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQ 360

Query: 712 APASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPS 771
            PASFGFPSL SASTAATT+SGFSA SQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSA VS+TPKLPS
Sbjct: 361 PPASFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPS 420

Query: 772 EITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQ 831
           EITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ
Sbjct: 421 EITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ 480

Query: 832 AELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQSEYIER 891
           AELE+KLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQ+EYIER
Sbjct: 481 AELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIER 540

Query: 892 ELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSR 951
           ELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSR
Sbjct: 541 ELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSR 596

Query: 952 IQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 968
           IQK+AAT+GPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 601 IQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS 596

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. NCBI nr
Match: XP_031743587.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical protein Csa_005518 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 971 bits (2509), Expect = 0.0
Identity = 611/626 (97.60%), Postives = 618/626 (98.72%), Query Frame = 0


Query: 343 ESANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSA 402
            SANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGS PAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSA
Sbjct: 132 SSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSA 191

Query: 403 PLFGTAPSAGASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGSGVSLF 462
           PLFG APSAGASSAPSLFGGASS TTSSAPLFGTSASAAS GSGLFGASAAASGSGVSLF
Sbjct: 192 PLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGLFGASAAASGSGVSLF 251

Query: 463 GTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASSLSTSPFQSSISSSSSQNLTS 522
           GTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTL+ ASTSNLFASSLSTSPFQS++SSSSSQNLTS
Sbjct: 252 GTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSPFQSTLSSSSSQNLTS 311

Query: 523 SSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSS-LTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFG 582
           SSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSS LTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFG
Sbjct: 312 SSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFG 371

Query: 583 FSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPA 642
           FSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPA
Sbjct: 372 FSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPA 431

Query: 643 FSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKTSTAASS 702
           FSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGA+SSFTGFGVTSSASSSSA+GSLSLPTKTSTAASS
Sbjct: 432 FSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASS 491

Query: 703 SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKL 762
           SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKL
Sbjct: 492 SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKL 551

Query: 763 PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE 822
           PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE
Sbjct: 552 PSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVE 611

Query: 823 TQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQSEYI 882
           TQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQ+EYI
Sbjct: 612 TQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYI 671

Query: 883 ERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFS 942
           ERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFS
Sbjct: 672 ERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFS 731

Query: 943 SRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 967
           SRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS
Sbjct: 732 SRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 757

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. NCBI nr
Match: XP_008459731.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 944 bits (2440), Expect = 0.0
Identity = 597/627 (95.22%), Postives = 607/627 (96.81%), Query Frame = 0


Query: 343 ESANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSA 402
            SANSSAPLFGAASSSGTSS SLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSA
Sbjct: 135 SSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSA 194

Query: 403 PLFGTAPSAGASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGSGVSLF 462
           PLFG APSAGASSAPSLFGGASS TTSSAPLFGT+ASAAS GS LFGASA ASGSG SLF
Sbjct: 195 PLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSALFGASAPASGSGASLF 254

Query: 463 GTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASSLSTSPFQSSISSSSSQNLTS 522
           GT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT +  STSNLFASSLS+SPFQSS+SSSSSQNLTS
Sbjct: 255 GTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSPFQSSLSSSSSQNLTS 314

Query: 523 SSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV--SSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSF 582
           SSPF ASPSGFSFPT +LSKTTSITNV  SSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSF
Sbjct: 315 SSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSF 374

Query: 583 GFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVP 642
           GFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVP
Sbjct: 375 GFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAASSTTQPSFSVP 434

Query: 643 AFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKTSTAAS 702
           AFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG +SSFTGFGVTSSASSSSA+GSLSLPTKTSTAAS
Sbjct: 435 AFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAAS 494

Query: 703 SSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSSTPK 762
           SSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSGTTSTVSATVSSTPK
Sbjct: 495 SSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPK 554

Query: 763 LPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVV 822
           LPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVV
Sbjct: 555 LPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVV 614

Query: 823 ETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQSEY 882
           ETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQ+EY
Sbjct: 615 ETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEY 674

Query: 883 IERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEF 942
           IERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEF
Sbjct: 675 IERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEF 734

Query: 943 SSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 967
           SSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 735 SSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. NCBI nr
Match: XP_038874708.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 827 bits (2135), Expect = 2.29e-288
Identity = 555/632 (87.82%), Postives = 572/632 (90.51%), Query Frame = 0


Query: 348 SAPLFGAASSSGTSSTSLFGA----GSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAGTSSAP 407
           S PLFG+A SSGTSS  LFG+    GSSPAPSFG A SSGSS+ PSFGAL SS G+SSAP
Sbjct: 91  SLPLFGSAPSSGTSSAPLFGSASSSGSSPAPSFGPASSSGSSLVPSFGALPSS-GSSSAP 150

Query: 408 LFGTAPSAGASSAPSLFGGASSVTTSSAPLFGT-SASAASLGSGLFGASAAASGSGVSLF 467
           LFG  PSAGAS APSLFGG SS TTSSAPLFGT SAS AS GS LFGAS AASGS  SLF
Sbjct: 151 LFGATPSAGAS-APSLFGGVSSATTSSAPLFGTTSASTASPGSALFGASVAASGSSSSLF 210

Query: 468 GTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASS---LSTSPFQSSISSSSSQN 527
           GT +T+SGS+GS LFGSSPFGASSS      STSNLFASS    STSPFQ+S SSSSSQN
Sbjct: 211 GT-STTSGSSGSALFGSSPFGASSS-----LSTSNLFASSSSSTSTSPFQNSFSSSSSQN 270

Query: 528 LTSSSPFVASPS----GFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSS 587
           L SSS F AS S    GFSF T SLSKTTSIT  SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+
Sbjct: 271 LNSSSLFAASSSSSSSGFSFSTVSLSKTTSITTASSSSS-LTTASTSSSSFSFGTPASSA 330

Query: 588 SQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQP 647
           SQSSFGFSI+NAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLS+SVAPLFSTVTTTS STPAANSTTQP
Sbjct: 331 SQSSFGFSISNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSSSVAPLFSTVTTTSGSTPAANSTTQP 390

Query: 648 SFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTKT 707
           SFSVPAFSSSSSAATTLSIAASS PSA+SSGA+SSFTGFGVTS ASSSSA+GSLSLPTKT
Sbjct: 391 SFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSVPSASSSGAVSSFTGFGVTSMASSSSAIGSLSLPTKT 450

Query: 708 STAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATV 767
           STAASSSQAPASFGFPSL SA T ATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTV+ATV
Sbjct: 451 STAASSSQAPASFGFPSLTSAPTPATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVNATV 510

Query: 768 SSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIE 827
           SSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIE
Sbjct: 511 SSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIE 570

Query: 828 VAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY 887
           VAKVVE+QAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY
Sbjct: 571 VAKVVESQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMY 630

Query: 888 EQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE 947
           EQ+EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE
Sbjct: 631 EQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDE 690

Query: 948 KAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 967
           KAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 691 KAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 713

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. NCBI nr
Match: XP_023548092.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 776 bits (2003), Expect = 1.92e-267
Identity = 525/633 (82.94%), Postives = 551/633 (87.05%), Query Frame = 0


Query: 343 ESANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGA----GSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAG 402
            S +S  P FGAA +SG+S   LFG+    GSSP PSFGAAPS+GSS  PSFGA SSS G
Sbjct: 168 SSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSS-G 227

Query: 403 TSSAPLFGTAPSAGASSAPSLFGGASSV-TTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGS 462
           +SS+P FG APSAGAS APSLFGG SS  TTSSAPLFGTSA  AS GS +FGASAAASGS
Sbjct: 228 SSSSPFFGAAPSAGAS-APSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGS 287

Query: 463 GVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLF---ASSLSTSPFQSSISS 522
             SLF               GSSPF +SSS      STSNLF   +SS STSPFQ+S SS
Sbjct: 288 SSSLF---------------GSSPFASSSS-----VSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSS 347

Query: 523 SSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASS 582
           SSSQNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT  +SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS
Sbjct: 348 SSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASS 407

Query: 583 SSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQ 642
           +SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST Q
Sbjct: 408 ASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQ 467

Query: 643 PSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTK 702
           PSFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS  SSGA SSFTGFGVTS+A+SSSA+ SLSLPTK
Sbjct: 468 PSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTK 527

Query: 703 TSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT 762
           + TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT
Sbjct: 528 SLTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT 587

Query: 763 VSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEI 822
           VS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEI
Sbjct: 588 VSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEI 647

Query: 823 EVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 882
           EVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM
Sbjct: 648 EVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 707

Query: 883 YEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID 942
           YEQ+EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID
Sbjct: 708 YEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID 767

Query: 943 EKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 967
           EKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 768 EKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQKFWMS 777

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. NCBI nr
Match: XP_023006514.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 773 bits (1996), Expect = 2.60e-266
Identity = 520/633 (82.15%), Postives = 553/633 (87.36%), Query Frame = 0


Query: 343 ESANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGA----GSSPAPSFGAAPSSGSSVAPSFGALSSSAG 402
            S +S  P FGAA +SG+S   LFG+    GSSP PSFGA+PS+GSS  PSFGA SSS G
Sbjct: 168 SSGSSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSS-G 227

Query: 403 TSSAPLFGTAPSAGASSAPSLFGGASSV-TTSSAPLFGTSASAASLGSGLFGASAAASGS 462
           +SS+P FG APS G +SAPSLFGG SS  TTSSAPLFGTSA  AS GS +FGASAAASGS
Sbjct: 228 SSSSPFFGAAPSVG-TSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGS 287

Query: 463 GVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLF---ASSLSTSPFQSSISS 522
             SLF               GS+ F +SSSGTL+  STSNLF   +SS ST+PFQ+S SS
Sbjct: 288 SSSLF---------------GSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSS 347

Query: 523 SSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASS 582
           SSSQNL+SSSPF AS SGFSF T SLSKTTSIT V+SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS
Sbjct: 348 SSSQNLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSIT-VASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASS 407

Query: 583 SSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQ 642
           +SQSSFGF+I+NAAS  GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST Q
Sbjct: 408 ASQSSFGFNISNAASLEGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQ 467

Query: 643 PSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLSLPTK 702
           PSFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPSA SSGA SSFTGFG+TS+A+SSSA+ SLSLPTK
Sbjct: 468 PSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSATSSGAASSFTGFGITSTAASSSAIVSLSLPTK 527

Query: 703 TSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT 762
           + TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT
Sbjct: 528 SLTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT 587

Query: 763 VSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEI 822
           VS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEI
Sbjct: 588 VSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEI 647

Query: 823 EVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 882
           EVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM
Sbjct: 648 EVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 707

Query: 883 YEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID 942
           YEQ+EYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID
Sbjct: 708 YEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID 767

Query: 943 EKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 967
           EKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 768 EKAEEFSSRIQKLAATQGPAADRELLGQKFWMS 782

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. TAIR 10
Match: AT5G63220.1 (unknown protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Uncharacterised protein family UPF0363 (InterPro:IPR007317); Has 304 Blast hits to 301 proteins in 161 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 110; Fungi - 121; Plants - 35; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 38 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 428.7 bits (1101), Expect = 1.2e-119
Identity = 205/323 (63.47%), Postives = 265/323 (82.04%), Query Frame = 0


Query: 10  MSRARSRRIVLPPVQEHIIKIEDVIDTGDYYGAQQMYKSVSARYVAAERYSEALDILQSG 69
           MSR R +R  LPPVQEHI K+  VI+ G+YYGA QMYKS+SARYV A+R+SEALDIL SG
Sbjct: 1   MSRERIKR-ELPPVQEHIDKLRKVIEEGNYYGALQMYKSISARYVTAQRFSEALDILFSG 60

Query: 70  ACTQLKHEQITCGSELAVLFVETLVKGKVPYDDNTLDRVRKIYKNFPQIPLPQHL---GE 129
           AC +L+H  + CG++LA+LFV+TLVK K P +D TLDR+R I+K FP++P+P HL    +
Sbjct: 61  ACIELEHGLVNCGADLAILFVDTLVKAKSPCNDETLDRIRCIFKLFPRVPVPPHLVDVSD 120

Query: 130 DDDMQQLSEALGAAKTRVEGCSSFLKAALKWSIEFGSQRSGSPEIHIMLATYIYSESPEV 189
           D+D+Q L E+LG A++RVE  +SFL+AA+KWS EFG  R+G PE+H ML  Y+Y+E PE+
Sbjct: 121 DEDVQNLQESLGEARSRVENLTSFLRAAIKWSAEFGGPRTGYPELHAMLGDYLYTECPEL 180

Query: 190 DMTRVSYHFIRGDNPKKFASILVNFMGKCYPGEDDMAIARAVLMYLSLGNLRDANILFDE 249
           DM R+S HF+R ++P+KFAS+LVNFMG+CYPGEDD+AIARAVLMYLS+GN++DAN + DE
Sbjct: 181 DMVRISRHFVRAEDPEKFASMLVNFMGRCYPGEDDLAIARAVLMYLSMGNMKDANFMMDE 240

Query: 250 LKKVEEREELELPDSELIEFIVYLLLTLQRDALPLFNMLRANYKSSLEREPALNELIDEI 309
           +KK  E +  EL +S+LI+FI YLL TLQRDALPLFNMLR  YKSS++R+  LNEL+DEI
Sbjct: 241 IKKQAETKNPELSESDLIQFISYLLETLQRDALPLFNMLRVKYKSSIDRDQLLNELLDEI 300

Query: 310 AEKFYGVRRRNPLQGIFGDFLKL 330
           AE+FYGV+R+NPLQG+FGD  K+
Sbjct: 301 AERFYGVQRKNPLQGMFGDIFKM 322

[Close]

BLAST of Chy11G202920 vs. TAIR 10
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )

HSP 1 Score: 395.6 bits (1015), Expect = 1.2e-109
Identity = 362/693 (52.24%), Postives = 453/693 (65.37%), Query Frame = 0


Query: 344 SANSSAPLFGAASSSG---TSSTSLFGAG-----SSPAPS-FGAAPSSGSSVAPS----- 403
           SA+SS P FG  SS+     S+T  FG G     S+PAPS FG++ ++ SS AP      
Sbjct: 83  SASSSTPSFGFGSSASVTPASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFG 142

Query: 404 ----------------FGALSSSAGTSSAPLFGTAPSAGAS----SAPSLFGGASSVTTS 463
                           FGA +SSA T S+  FG AP++G++    S+PSLF   SS + S
Sbjct: 143 FVTSSASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASAS 202

Query: 464 SAPLFGTSASAASLGSGLFGA-------------SAAASGSGVSLFGTPATS-------- 523
           ++ LFG S+SAA+  S LFGA             +++A GS  S+FG   +S        
Sbjct: 203 NSSLFGASSSAATSTSPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASS 262

Query: 524 -SGSTGS--GLFGSSPFGASSSGTLAWASTSNLFASS------LSTSPF-QSSISSSSSQ 583
            SGS+ S  G  GSSPF  SSS      ST +LFASS       S SPF  S+ +SSS+ 
Sbjct: 263 ASGSSPSIFGATGSSPFFGSSSSA---GSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTS 322

Query: 584 NLT--SSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSS 643
           N +  S+SPF AS +GFSF   + S TTS T  S+   +    ++SSSSFSFGT A+S  
Sbjct: 323 NTSNASASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPPQT----ASSSSSFSFGTSANS-- 382

Query: 644 QSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS 703
               GF++    STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P+
Sbjct: 383 ----GFNL----STGSSAAPAS--------STSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPA 442

Query: 704 FSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAMSSFTGFGVTSSASSSSAVGSLS--LPTK 763
            S PA + +  +    S A ++ P  ASS A  S TGFG+ SS  ++ +  S +     K
Sbjct: 443 SSAPASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPK 502

Query: 764 TSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAT 823
           TST ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T +TLVV SSS   TST  A 
Sbjct: 503 TSTPASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTAPATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAP 562

Query: 824 VSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEI 883
           V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEI
Sbjct: 563 VAGSPKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERTGRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEI 622

Query: 884 EVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAM 943
           EVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAM
Sbjct: 623 EVAKVVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQSMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAM 682

Query: 944 YEQSEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWID 968
           YEQSE +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWID
Sbjct: 683 YEQSELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGGELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWID 739

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q6GKV1	1.7e-118	63.47	Protein GET4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MDC12.19 PE=1 SV=1	[more]
Q8L7F7	1.6e-108	52.24	Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1...	[more]
G0SBQ3	3.7e-12	30.86	Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI ...	[more]
Q63850	1.2e-10	29.20	Nuclear pore glycoprotein p62 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nup62 PE=1 SV=2	[more]
P17955	3.6e-07	29.20	Nuclear pore glycoprotein p62 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Nup62 PE=1 SV=1	[more]

BLAST of Chy11G202920 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A1S3CAD4	3.7e-273	95.37	nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 ...	[more]
A0A0A0KA27	1.8e-251	75.67	Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3...	[more]
A0A6J1L2D4	6.6e-222	82.28	nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 P...	[more]
A0A6J1H5C8	8.1e-220	80.62	nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L...	[more]
A0A6J1DSI7	2.2e-209	80.29	nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC11102350...	[more]

BLAST of Chy11G202920 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_031743587.1	0.0	97.60	nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical pr...	[more]
XP_008459731.1	0.0	95.22	PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo]	[more]
XP_038874708.1	2.29e-288	87.82	nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]	[more]
XP_023548092.1	1.92e-267	82.94	nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
XP_023006514.1	2.60e-266	82.15	nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima]	[more]

BLAST of Chy11G202920 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT5G63220.1	1.2e-119	63.47	unknown protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Uncharacterised protein family UPF0...	[more]
AT2G45000.1	1.2e-109	52.24	structural constituent of nuclear pore	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 809..839
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 871..891
None	No IPR available	GENE3D	1.20.5.170		coord: 796..855 e-value: 1.8E-8 score: 36.2
None	No IPR available	PANTHER	PTHR12875:SF1	GOLGI TO ER TRAFFIC PROTEIN 4 HOMOLOG ISOFORM X1	coord: 10..329
IPR011990	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	GENE3D	1.25.40.10	Tetratricopeptide repeat domain	coord: 20..328 e-value: 4.5E-82 score: 278.0
IPR007758	Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal	PFAM	PF05064	Nsp1_C	coord: 753..857 e-value: 3.1E-21 score: 75.3
IPR007317	Golgi to ER traffic protein 4	PFAM	PF04190	DUF410	coord: 57..327 e-value: 6.0E-65 score: 219.6
IPR007317	Golgi to ER traffic protein 4	PANTHER	PTHR12875	UNCHARACTERIZED	coord: 10..329

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy11G202920.1	Chy11G202920.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0006913	nucleocytoplasmic transport
biological_process	GO:0045048	protein insertion into ER membrane
biological_process	GO:0015031	protein transport
cellular_component	GO:0005829	cytosol
cellular_component	GO:0005643	nuclear pore
molecular_function	GO:0005515	protein binding
molecular_function	GO:0017056	structural constituent of nuclear pore