Chy11G196740 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGAAGAAGACACAGAGCCGTAGAAGAAGCCAATCCAATAGCTCGGCTCGCGCAAAGGTATTTGGAACCAACTCTCTTCAGCTAAGTGAGGACGATGCCACGCGATTAGTCGGTGGAATAGTTGAAAAAGGTATCTCCGACACCGAGCAAAGCACGCCCTTTGTCTCATTTCCCCCTCCCAGAACTTCCGTTTTGCCGTTTCCGGTCGCTCGGCATCGGTCTCACGGTCCGGTAAGATTAACTTGATTTTAAGCTATCCAGAAGGACAGTCTATAACAGTACAGGGGTTTTTATTTATTTATTTTTGATTTTATAAATAATGTAACGTTAATATTGTGTAATATGATTGGAAGAAAGGAAATGATAGTGGCATAGTAGACATGAAAATGAGTAGAATATATAACTTTTATTTTCTAGCAAATAGTGTTTCTCCAGGAGTAAATATATTGGTTTGGAGAACATAAGTCACTGGCGGGAAGTTTGGTTTCCTCATAATACTGGATTTTGAGTCCTAATGTTATTAACAATACAATCTGTTTTCTCAGCATTGGGAATCGTTAACTAGTAAAAAGGGTGGGGATAATATCAAGGCTGACAGGCAGGAGTATGGGGAAGAAGATGAAACAATGATGGTGGCTGACTCTATAGCAAATTTTGCTAATCCAATACAGAGGAAAAAGAAAAGTAGCTTAGACTTTGGCCGGTGGAGAGAGGCTGCCTCAGACCACAATCATGGTGCAGCAAAAAGAGAGGAAAAGGAGCTTCAAAGCTTAGCAAAAACTGAAAGTCTAATGTGTGCTGGGGAAGCAAATAGCGGTACAGATGTTATGTCATGCAGGCCCTTCTCAGCCCATGTGCTTGCACCTTCTCTTATGGAAAGTGAACATAGTTCATCTAACTTTGTAAATGATTCCACTGGAAACAAGACAAACAACGCTGGTTTTGAATTGAAGGGGTTGGATAAACAACATCTTCCAGAGAATCTTCAAGATGTTCGTGATCAATGGGGAGATATTTCAGAGAGTGAAGTTAATGAGAGTATGCAACTGGATGGTACGTCATTGCGGGATATGGGCACAGGGTTTCATTTGAATTCCGAAACGACTCCCTGCTTTCACTCCAATATTAAGGGAGATGATGCATTCTTGACACTGAAAAGCCAGATTGATGCAGAGAACCTAGCAAGGATGCAAAAAATGTCACCAGAAGAGATTGCTGAAGCACAGGCTGAGATTATGGAGAAGATGAGCCCAGCACTAGTGAAAGCCCTGAAAATGAGGGGTGAGGGAAAATTGAAGCAAGGCTCATCAAAACCCCATGTGAGCAGTAATTATGAGTTGGGTAATCTACAAAAAGAGAGTACAATTGATAGAAATGGTTCTCTTAACAAAGAGAATGGTGTAACGTCTGTAAAGACAACCTTAAAGGATACAAAGAGTGGGCTTCAGGATGTTTCAGTGCAGAAATTTGATTCACGTAGCAGTATATGGAATGCATGGAATGAAAGGGTTGAAGCTGTAAGGTCGTTAAGGTTTTCCCTGGAAGGCAATCTAGTTGAAAGCTATTCTTTCCAACAGTCAGAGAATGGTGAGACTTATAGTATTTTAGGGTCACGTTTTTTAGGGGAAGGGTGATGGTGCCTCTGATTAACAGAATTCCTTGCTACTTTTGTTTATGTTGTCTATCTCGTCTTTCATCTCAAATTATGAAGAGCTTCTTTCGGATAAGCAAAACTTCGGCATTTACATTTTTCACTAGTTCCATAGAGGACTTGATAGTTACTTAATGACCAGTTGACAACAACTCCAATAGTTTAACTAACTCAAGTTAATTAACACTCCAAGAAAAAAACTAATGGGTTTTTTGATATGAGGCTTTTGATAGTGGGCAGGGGTATTAAATCTCTCAGAATGAAATGTTTATGTTTCTTTGTTAGTAGTTCATTTGATTCTGTCGAAGTGAGTTGGTGTCGTGATGTTGAGGGGATTTGAATAACCATGATGGTATGTTTCCAATTTCCTATCTTCAAATTTACATGAGAATAAAAGAAGCACAAGCATATAAAAACTCATACTCATACCTTCAGAATGAATTTCATGAACAGAATGACAGCTTAGTACTACATTTTTAATAGACAAATTAAAACATTCTTACAATTAATTAATTTGTAATGCTAGAGATCCTGCAAGGATGTAGCAGATGCTAGGAGTTGAGCTGGGAAATTCTGCAGATGAGTTTTTGAATCGAAAACGAATTGATATCAATACGGATTTTTTTGGTTGACAAGACAACAAACTTTTCGTTAAAAATGTGAGAGGTTGGCATAGAACTCCCTTTAGGAGTATACTAAGATTCCTTGCACGAAAACCAGAAAACTTGTAGACAAAACACATTCTTGGGGAATGAATAGAACACAACCCAACTAAAGAGAGCTTGCTAAAGAATAGTGTGAACCTTTTTGTCAATTGTCACGTGTTTTGAATATTTTCGTTTCTTCATGAAGAGCCAGAAGAGCCAGAAATTATTACGTCATTTTCTTTTTAATTAGGTTGCTAGGGATTTTTATTTTTTTTCTTTTTCGTTTCCAAAGCTTTCAATCATCGTTTGAACTTATAAAAATGTACTCTGTTTACTAGGTACTCTGTTGACTAACTGTATATTTTTCCTTGTGCGGGTGATTATGCAGTTCATGGGTACAGCACTGAGAATGTTGCTTCACGAGATTTTCTTCGAACTGAGGGGAATCCAAGTGCTGCAGGTTACACAATTAAAGAAGCTGTGGCACTGACGAGGAGTGTGGTCAGTTTAGTTTCATTGTAGTGACAATTTTTTTCAACCATAAAATACTGTTAGTTTTTTTCCACTTTTGGCCCCTTATTTTTCTCATTCCTTATGAAATAGCTCTTTTTTTCATTTAATTCAAGTCTTCTAGAAGTTTGTTATTTTGAACTCTTTAAACCTTCTGTCATTTTTGTTAGAATTTATGGGCTTGTTGTATGTTGAAAGCCCAAGGGTATTTATGTAAATTATTTTACCTAGTGTTTTTTTTCTTTTTTGTCAAGGCTTTTGTTGCCTGTTAATTCTTTGCCTTTGTTTTTTTGTGTTTCATAAGAAAATAATAAGAAAAGTCTCCATCGTGGTTTTTCTTCCTATACAGGTTTCCACCTATATCGATTTGTTATACTTTTTGTCTTTTTCAATAATTTTCACTCTAGCTTCTCATTGGTGTCAGATACCAGGTCAACGTGTCCTTGGGTTGCATGTCATTTCAAATGTGCTTCACAAAGCATTGCTTAATACACACCTAACACAAGTTGGGTCCACAATGATTAAAAATAGGAGCTCTGTTGATTACAATGCAATTTGGGCTTATATTCTTGGCCCTGAACCAGAGCTTGCTTTATCCCTGAGGTCAGACTCTGAACACTTTTATATTGACATTCATTTAATGTGCTGTTAGGAACCAAGGTAGTTATGAGATGCCTTTGTTCCATATCAGTTAGAATAGGATAACCAATGTGGTACTTAAGTGACCTCTCTCCTACCCCAATAGCTGGCTTTTACGGTGTGGTTCTTCAAGGTGTTTAAGTACCTAATGCATGCTTTGACCTACTCATTGGTTGATTCATGCTACGCCTGACTGTTGCTGCTATCATCCTTTCAAATTTGTATAAATTGACCCATGGTTTGTCATTTAAATATTATGTTACCCTAAGATTTGGTTACTTCACCTTAACCTCAATGCTTTACGTTTTTTCCCTTACCCACCTCTAGGAAGTGTTATGATTTTCAGTATCCCAAGTTGCTTGATTATTTTTTATTTTTTATTTTTATCAATGTATAGGATGTGCCTGGACGATAATCACAACTCTGTCGTTCTAGCTTGTGCTGAAGTTATTCAGAGTGTATTGAGCTGTAATTTGAACGAGTCCTTCTTTGATAGCTTAGAGGTAGGATCATTATAACATAGAGCTTTTCCTTTTTATGTTCTCTCTACTTTTAATTCTTAGTCTGAGTCTATTTTCTTCAGAAAACATCAACTTATGAAAAAGATCTCTACACTGCTGCTGTATTTCGAAGTAAACCAGAGATCAATGTTGGTTTCCTCCAAGGCGGATTTTGGAAGTATAGTTCTAAACCTTCTAATATTCTTCCTATTACCGAAGGTTTTGGGAATGTTGAAGATGGGGAGAAACATACAATCCAGGATGATATTGTGGTTGCACAACAAGATATTGCAGCAGGTCTGGTTCGAATGGGAATTCTTCCTAGGCTCCTCTATATTCTAGAGGTATGCATTTTCATTGTCTGGACTTTGTACTCTTTAATTTGACTATTGAGGGCGACTATGCTGTTTTTTTCCTTGGTTATGTGAAAATACTAATGGATCTCAACAGTATTAAATTTGTATGTCTGTTTGATGAAGAAAGTAATGACAACCTCAATGAATAATGAACTATTATTAGATTTCCCACTGAAGTCTGTATATTGTGTAAACTGTAAAGAATATGTGAGATGGATAATAACTATTGCAATTAATGAAAGGATCTACCTCAGGGGTTCCAAGCAAACAAATTACTGATTTTTTAACTCTTAAATACATGTTGTAACAACCCGGCTTTTCCAAAGACGACTACACGTGTTGCTCATGAATGCTAAAATAAATTTTATTAAAAGTAATAATAACAAATATTTTAGAAGAAAAAGAAAGCATCAAACCAACTTAAAGTAATAATTGAAACAAAGTTTTCATTCTAGGGATTCCTTAAAAACATTTAAAAATTTATATAAAAAATAAAATAAACAAGAGTGAAAATGGTTCTCAAAACATTCCAATCGGAAGTTCAACACGACACAGTTCCATGGCTCAATAGCAACAACACATCTCTTGCCTCACACACCTTTGTCCTATGCTGGAAAAAAATGTGGATAGGGTGAGTGTTAAAAGTACTCAATAAGCAACCCTTCGGATGGGGTCAAACATGTACATC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ATGGAGAAGAAGACACAGAGCCGTAGAAGAAGCCAATCCAATAGCTCGGCTCGCGCAAAGGTATTTGGAACCAACTCTCTTCAGCTAAGTGAGGACGATGCCACGCGATTAGTCGGTGGAATAGTTGAAAAAGGTATCTCCGACACCGAGCAAAGCACGCCCTTTGTCTCATTTCCCCCTCCCAGAACTTCCGTTTTGCCGTTTCCGGTCGCTCGGCATCGGTCTCACGGTCCGCATTGGGAATCGTTAACTAGTAAAAAGGGTGGGGATAATATCAAGGCTGACAGGCAGGAGTATGGGGAAGAAGATGAAACAATGATGGTGGCTGACTCTATAGCAAATTTTGCTAATCCAATACAGAGGAAAAAGAAAAGTAGCTTAGACTTTGGCCGGTGGAGAGAGGCTGCCTCAGACCACAATCATGGTGCAGCAAAAAGAGAGGAAAAGGAGCTTCAAAGCTTAGCAAAAACTGAAAGTCTAATGTGTGCTGGGGAAGCAAATAGCGGTACAGATGTTATGTCATGCAGGCCCTTCTCAGCCCATGTGCTTGCACCTTCTCTTATGGAAAGTGAACATAGTTCATCTAACTTTGTAAATGATTCCACTGGAAACAAGACAAACAACGCTGGTTTTGAATTGAAGGGGTTGGATAAACAACATCTTCCAGAGAATCTTCAAGATGTTCGTGATCAATGGGGAGATATTTCAGAGAGTGAAGTTAATGAGAGTATGCAACTGGATGGTACGTCATTGCGGGATATGGGCACAGGGTTTCATTTGAATTCCGAAACGACTCCCTGCTTTCACTCCAATATTAAGGGAGATGATGCATTCTTGACACTGAAAAGCCAGATTGATGCAGAGAACCTAGCAAGGATGCAAAAAATGTCACCAGAAGAGATTGCTGAAGCACAGGCTGAGATTATGGAGAAGATGAGCCCAGCACTAGTGAAAGCCCTGAAAATGAGGGGTGAGGGAAAATTGAAGCAAGGCTCATCAAAACCCCATGTGAGCAGTAATTATGAGTTGGGTAATCTACAAAAAGAGAGTACAATTGATAGAAATGGTTCTCTTAACAAAGAGAATGGTGTAACGTCTGTAAAGACAACCTTAAAGGATACAAAGAGTGGGCTTCAGGATGTTTCAGTGCAGAAATTTGATTCACGTAGCAGTATATGGAATGCATGGAATGAAAGGGTTGAAGCTGTAAGGTCGTTAAGGTTTTCCCTGGAAGGCAATCTAGTTGAAAGCTATTCTTTCCAACAGTCAGAGAATGTTCATGGGTACAGCACTGAGAATGTTGCTTCACGAGATTTTCTTCGAACTGAGGGGAATCCAAGTGCTGCAGGTTACACAATTAAAGAAGCTGTGGCACTGACGAGGAGTGTGATACCAGGTCAACGTGTCCTTGGGTTGCATGTCATTTCAAATGTGCTTCACAAAGCATTGCTTAATACACACCTAACACAAGTTGGGTCCACAATGATTAAAAATAGGAGCTCTGTTGATTACAATGCAATTTGGGCTTATATTCTTGGCCCTGAACCAGAGCTTGCTTTATCCCTGAGGATGTGCCTGGACGATAATCACAACTCTGTCGTTCTAGCTTGTGCTGAAGTTATTCAGAGTGTATTGAGCTGTAATTTGAACGAGTCCTTCTTTGATAGCTTAGAGAAAACATCAACTTATGAAAAAGATCTCTACACTGCTGCTGTATTTCGAAGTAAACCAGAGATCAATGTTGGTTTCCTCCAAGGCGGATTTTGGAAGTATAGTTCTAAACCTTCTAATATTCTTCCTATTACCGAAGGTTTTGGGAATGTTGAAGATGGGGAGAAACATACAATCCAGGATGATATTGTGGTTGCACAACAAGATATTGCAGCAGGTCTGGTTCGAATGGGAATTCTTCCTAGGCTCCTCTATATTCTAGAGGCAGATCCTTCAGTAGCTTTAGAAGAATGCATCCTTTCGATACTTGTTGCAATAGCAAGGCATTCCCCAATATGTGCCCAAGCAATCATGAAATGCGACAGGCTTGTTGAGTTGATTGTCCAGAGATTTACAATGAGCGAGAAAATAGATATTCTTTCCTTAAAGATTAAATCGGTTGTTCTTTTGAAGGTTTTAGCTCGTTCAGACAGGCAGAACTGTATTGCGTTTGTGAAAAGTGGTACTTTTCTAACCATTATATGGCATTTGTATCACTGTACTTCCTCCATCGACCAATGGGTCAAGTCAGGGAAGGAAAAGTGTAAACTTTCATCAACTTTGATGGTTGAACAATTAAGGCTGTGGAAGGTTTGCATTCAGTATGGATATTGTTTATCTTACTTCTCTGATGTTTTCCCTTCCTTGTGCTTATGGTTGAACCCACCAAATTTTGAAAAACTTATAGAGAATAATGTCCTGCGTGAATTTACAACCATTTCTATGGAGGCATACCATGTTTTAGAGGCTTTGGCACGAAGACTTCCAAATTTTTTTTCAGAGAAATATTTAGACAGTCGAGAACCAGGACTTGCTGGTAATGAATCTGAAGCTTGGTCCTGGAGTTGTGCTGTTCCAATGGTTGATTTAGCTATAAAATGGTTAGGTTCAAAGAATGATCCATTCATATCCAAATTCTTTTCGTCACGAAAAGGGATTAAGAATGACTCTGTGTTTGAAGGAATATCACTGGCGCCATTGTTGTGGGTTTATTCTGCTGTCTTGAAGATGCTGTCTCGAGTGGTTGAAAGGATCATCCCGCAGGACATCATGACCCAGATTGGAAGTGATCAGATTGTGCCTTGGATACCAGAGTTTATACTACAAGTTGGACTTGAGATAATTAAGAATGGCTTTCTAAGCTTTGCAGATGCATCAGATATGAATCCCAAAACCAGTTCCTCTGGAGGTAACTCTTTTGTAGAGGATCTTTGTTTTTGGAGAGAACACGGTGAATTTGAAATGTCTCTGGCTTCTGTATGCTGTCTTCATGGGTTGATACTGAGTATCGTGAATATTGACCGTCTGATTCTGTTAGCTAAGACTGAGAGCCAGGCTTATCCTTCGAAATATGTTAATTCCTCAAGGGAAGGCGAAATTTTAAGGGTTGGGATGTTTAAGACGTCCCTCATGGAACAGAGAAGCATGCTTGACCTTTTCACTAAGAAAATTGCTTTGGAGTGTGATTCTCTGCAGTTAATAGAGACCTTTGGCAGAGGGGGCCCTGCACCTGGTGTAGGAATTGGTTGGGGTGTGTCTGGTGGTGGATATTGGTCCCTGGCTGTTTTATTAGCACAAAATGAATCAGCATTTCTCATGTCCCTCGTTGAAGCATTTCACACCATTCCAACTTTAAATGGACTGACTGCTCAGGAATCCTTGACTTTGCAAAGCATAAATTCTGCCTTGGCTGTATGCTTGGTTCTTGGGCCAAGAGATATAGGATTGATTGAGAAAACTATGGAATTTTTTATCCAAGCTCCTATTTTGTATAATTTCAATCTTTATATTCAGAGGTTTCTCCAACTCAATGGAAAGCTGAAGCAATTTGGCTGGAAGTACAGTGAAGATGACTGCTTGATCTTTTGTAGAACATTACGTTCTCACTACAAGGATAGGTGGTTAACTCCCAAGGGATCCACATCCGTGAAGAATAAGAGCAACTTAAGTGACAGAACATTTAAGAGTGGCAGAGTATCTTTGGATACAATATACGAAGAGTCAGATGAGACTAATACAATGGCCCAAGGCTGTACTTGTTTGATAGTACAGTGGGGTTACCAAAGACTTCCACTTCCTGGGCATTGGTTTCTCAGTCCAGTTTCAACTGTCTGTGATAGTATGCATGCTGGTCATCAAAAATCTGATGCTCAAAGTATTATGCAGGAATCTAGTGATTTGCTTGATGTTGCTAAGAGTGGGCTGTTCTTTATTTTAGGCATTGAAGCATTTTCTGCCTTTCTACCCGATGATTTCCCTAAACCTGTCCTGAGTGTGCCATTGATTTGGAAATTGCATTCCTTATCTGTTGTTTTACTCACAGGTATTGGAGTCTTGGATGATGAGAAGAGTAGAGATGTTTATGAGGTTTTGCAAGACCTCTATGGTCAGCGTCTTAACGAAGCTATGTCCTGTAGACTTCCTGCAGATATCATGGAGAATGATGCAAAACATTTACTATCACAACCGGAAAATAAGAAGAGCAATATAGAGTTCCTAATGTTTCAATCCGAGATCCATGATAGTTACTCAATACTTATTCAAACTCTAGTGGAGCAGTTCTCCTCTGTATCCTATGGTGACGTACTATATGGTCGGCAAATTGTACTATATCTTCACCAATGTGTTGAATCTCAAACACGTCTTGCTGCTTGGAATGCACTAAATAGTGCTCGCGTTTTTGAACTTCTTCCACCTCTTGAAAAGTGCTTAGCTGACGCCGAAGGGTATCTACAACCAATTGAGGATAACGAAGCCATTTTGGAAGCTTATGTGAAATCATGGGTTTCAGGTGCCCTTGACAGATCTGCAAGTCGAGGTTCAGTAGCCTATTTACTATCTCTGCACCACCTCTCATCATACATATTCCATTCTTACCCAGTCGACAACTTGTTGCTTCGGAACAAGCTCTCAAGGTCTCTTTTGCGAGACTGCTCCCACAAGCATCACCACAAGGAAATGATGATGAATCTTATCTTATATACCAAACCATCAACCCATCTTATTGCTGGACAAAAGGGTGTTGGCACATCAATTGGAAGGAGCGATGTAGAAAAAAGGCTTGAGGTGTTGAAGGAAGCTTGTGAAAAGAATTCCTCTCTTTTGACAGTAGTTGAAGAGCTCGGTTCTTCTACGAAAGGAAAACTGTCTTCAATGTTCAACAGTGATGATGATAAGACACCGCCTCAATGGCTGATTGGATATGATAGGGTCAGTATGCTCATTCCTGGCATTGGACGTATCGCATTGTCACCATATGACAAAGGCAGCCATGGAGGAGGGCATTCGAGTTCATATGGCAGTAACCCAGCTCCAAGACGTCAATATGTTCCAGGTGGGGATGATAATTTCATTCAAAATCCTGGATATGAGGTGCCAATTCCTGCCGATATCGGTGGTGTTAAAGAAACATCCTATCCTTGA MEKKTQSRRRSQSNSSARAKVFGTNSLQLSEDDATRLVGGIVEKGISDTEQSTPFVSFPPPRTSVLPFPVARHRSHGPHWESLTSKKGGDNIKADRQEYGEEDETMMVADSIANFANPIQRKKKSSLDFGRWREAASDHNHGAAKREEKELQSLAKTESLMCAGEANSGTDVMSCRPFSAHVLAPSLMESEHSSSNFVNDSTGNKTNNAGFELKGLDKQHLPENLQDVRDQWGDISESEVNESMQLDGTSLRDMGTGFHLNSETTPCFHSNIKGDDAFLTLKSQIDAENLARMQKMSPEEIAEAQAEIMEKMSPALVKALKMRGEGKLKQGSSKPHVSSNYELGNLQKESTIDRNGSLNKENGVTSVKTTLKDTKSGLQDVSVQKFDSRSSIWNAWNERVEAVRSLRFSLEGNLVESYSFQQSENVHGYSTENVASRDFLRTEGNPSAAGYTIKEAVALTRSVIPGQRVLGLHVISNVLHKALLNTHLTQVGSTMIKNRSSVDYNAIWAYILGPEPELALSLRMCLDDNHNSVVLACAEVIQSVLSCNLNESFFDSLEKTSTYEKDLYTAAVFRSKPEINVGFLQGGFWKYSSKPSNILPITEGFGNVEDGEKHTIQDDIVVAQQDIAAGLVRMGILPRLLYILEADPSVALEECILSILVAIARHSPICAQAIMKCDRLVELIVQRFTMSEKIDILSLKIKSVVLLKVLARSDRQNCIAFVKSGTFLTIIWHLYHCTSSIDQWVKSGKEKCKLSSTLMVEQLRLWKVCIQYGYCLSYFSDVFPSLCLWLNPPNFEKLIENNVLREFTTISMEAYHVLEALARRLPNFFSEKYLDSREPGLAGNESEAWSWSCAVPMVDLAIKWLGSKNDPFISKFFSSRKGIKNDSVFEGISLAPLLWVYSAVLKMLSRVVERIIPQDIMTQIGSDQIVPWIPEFILQVGLEIIKNGFLSFADASDMNPKTSSSGGNSFVEDLCFWREHGEFEMSLASVCCLHGLILSIVNIDRLILLAKTESQAYPSKYVNSSREGEILRVGMFKTSLMEQRSMLDLFTKKIALECDSLQLIETFGRGGPAPGVGIGWGVSGGGYWSLAVLLAQNESAFLMSLVEAFHTIPTLNGLTAQESLTLQSINSALAVCLVLGPRDIGLIEKTMEFFIQAPILYNFNLYIQRFLQLNGKLKQFGWKYSEDDCLIFCRTLRSHYKDRWLTPKGSTSVKNKSNLSDRTFKSGRVSLDTIYEESDETNTMAQGCTCLIVQWGYQRLPLPGHWFLSPVSTVCDSMHAGHQKSDAQSIMQESSDLLDVAKSGLFFILGIEAFSAFLPDDFPKPVLSVPLIWKLHSLSVVLLTGIGVLDDEKSRDVYEVLQDLYGQRLNEAMSCRLPADIMENDAKHLLSQPENKKSNIEFLMFQSEIHDSYSILIQTLVEQFSSVSYGDVLYGRQIVLYLHQCVESQTRLAAWNALNSARVFELLPPLEKCLADAEGYLQPIEDNEAILEAYVKSWVSGALDRSASRGSVAYLLSLHHLSSYIFHSYPVDNLLLRNKLSRSLLRDCSHKHHHKEMMMNLILYTKPSTHLIAGQKGVGTSIGRSDVEKRLEVLKEACEKNSSLLTVVEELGSSTKGKLSSMFNSDDDKTPPQWLIGYDRVSMLIPGIGRIALSPYDKGSHGGGHSSSYGSNPAPRRQYVPGGDDNFIQNPGYEVPIPADIGGVKETSYP* Homology
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GYU3 (Transcriptional elongation regulator MINIYO OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=IYO PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1147.9 bits (2968), Expect = 0.0e+00 Identity = 687/1589 (43.23%), Postives = 966/1589 (60.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0JN53 (RNA polymerase II-associated protein 1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=RPAP1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 8.0e-18 Identity = 127/541 (23.48%), Postives = 226/541 (41.77%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9BWH6 (RNA polymerase II-associated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPAP1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 5.2e-17 Identity = 121/524 (23.09%), Postives = 216/524 (41.22%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3T1I9 (RNA polymerase II-associated protein 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Rpap1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 1.2e-16 Identity = 130/547 (23.77%), Postives = 223/547 (40.77%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80TE0 (RNA polymerase II-associated protein 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Rpap1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 85.5 bits (210), Expect = 6.4e-15 Identity = 129/544 (23.71%), Postives = 225/544 (41.36%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BKC4 (LOW QUALITY PROTEIN: transcriptional elongation regulator MINIYO OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490563 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2916.3 bits (7559), Expect = 0.0e+00 Identity = 1498/1624 (92.24%), Postives = 1543/1624 (95.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V3U3 (Transcriptional elongation regulator MINIYO OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold89G002670 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2875.1 bits (7452), Expect = 0.0e+00 Identity = 1487/1660 (89.58%), Postives = 1533/1660 (92.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J5I2 (transcriptional elongation regulator MINIYO OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483661 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2585.1 bits (6699), Expect = 0.0e+00 Identity = 1323/1629 (81.22%), Postives = 1440/1629 (88.40%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXF4 (transcriptional elongation regulator MINIYO OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448455 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2564.6 bits (6646), Expect = 0.0e+00 Identity = 1317/1632 (80.70%), Postives = 1430/1632 (87.62%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CFK3 (transcriptional elongation regulator MINIYO OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011072 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2391.3 bits (6196), Expect = 0.0e+00 Identity = 1243/1641 (75.75%), Postives = 1390/1641 (84.70%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. NCBI nr
Match: XP_011656928.1 (transcriptional elongation regulator MINIYO [Cucumis sativus] >KAE8646844.1 hypothetical protein Csa_021054 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 3076 bits (7975), Expect = 0.0 Identity = 1568/1622 (96.67%), Postives = 1592/1622 (98.15%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. NCBI nr
Match: XP_008448341.2 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: transcriptional elongation regulator MINIYO [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2912 bits (7549), Expect = 0.0 Identity = 1498/1624 (92.24%), Postives = 1543/1624 (95.01%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. NCBI nr
Match: KAA0061970.1 (transcriptional elongation regulator MINIYO [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2871 bits (7443), Expect = 0.0 Identity = 1487/1660 (89.58%), Postives = 1533/1660 (92.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. NCBI nr
Match: XP_038900571.1 (transcriptional elongation regulator MINIYO [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2695 bits (6985), Expect = 0.0 Identity = 1387/1636 (84.78%), Postives = 1480/1636 (90.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. NCBI nr
Match: KAG7010830.1 (Transcriptional elongation regulator MINIYO [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2584 bits (6698), Expect = 0.0 Identity = 1329/1632 (81.43%), Postives = 1438/1632 (88.11%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. TAIR 10
Match: AT4G38440.1 (LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: RNA polymerase II-associated protein 1, C-terminal (InterPro:IPR013929), RNA polymerase II-associated protein 1, N-terminal (InterPro:IPR013930); Has 276 Blast hits to 220 proteins in 102 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 151; Fungi - 65; Plants - 41; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1147.9 bits (2968), Expect = 0.0e+00 Identity = 687/1589 (43.23%), Postives = 966/1589 (60.79%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196740 vs. TAIR 10
Match: AT2G20870.1 (cell wall protein precursor, putative ) HSP 1 Score: 46.6 bits (109), Expect = 2.3e-04 Identity = 29/84 (34.52%), Postives = 39/84 (46.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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