Chy11G196260 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATCACGACGGTCACAGCTAGAGTAATCACAACAGCTCGATCATTGGTTCCATCCAGCCAGCTCTCTCTTCTACGTCCGTCTTCTTATGTCTTCGCTGCCCAGAAATCTCACTCCCACACCCTTCTCATTCGTCAGGTAATCAATCATTGTTCCTTATCTAGTTATTTGGATTAAGAAATCGAGTTTCTGGATGTGGGATTTATGCCATTATGCTTGGATTTTAAAGGGTTTTTAGTAGTTTGGCTTCTTACCTGTTCATCTGATAGTTGGTGTTTTGATCCGGGAGAAGGATCGTTTTTTTTTAGTTTGTTTGTTATGGAATCTTTTCGGGCTAGTGAAATTAGAGCGTTTTCAGTGGTGCGGAGAGGGACCCAAATTATTTTTGGTCCTTTTGTCGAGGTTCCATGCTTGGCTCTCTATTTGCGACGTTTAATATTGTTGGGATTACTTTATTTAATGGGGACTTTGCGGTTGTTTTTTTCTGTTCTCTTTAGATTTTTCCTTTCCTCTCAAAGTTGTTGTTTCTATCCAAGAAAAAAATATCAAAAAGAAAATTTGCTTGGATTTCAGATGAGCTCGGAGGCGCAGAGCATCACTACTCGTCTTCACAGTTCTGGATTATTACGAAGCCAAGGTCTCATTGGAGGGAAGTGGATTGATGCTTATGATGGGAAGACCCTTAAGGTATGGCTGAAAGGATTTTGCGTTTTCTGATGCTTTCAACAACAGATATTGGGTTTGTTAAATTCAGTTTTCAATAAGTTGAGTGATGACTTCTTTTGCTCTTTCCTGCAAAATTTATCATGGATTCCTTGAACTTTAGTCTTTTTTTGGTTTGAGAGGGAAATTGTATATTTTCACCATATGTTAGAAATGGGCTGATTGGTTTTCTTTATACAGAGGTGTGAGTAACCGTTACTTTCAACAATTGTTAAAATTTATTCTTTTATATTTGCTCGCAGTTTTGTTGGCAGAATATTGAGAAAATTCATCTTTGTGTTCCAGGTTCAAAATCCAGCTAATGGTGAAGTTATAACCAATGTTCCGCTCATGGGCAAAAGGGAGACCGATGATGCTATTTCATCAGCTTATGATGCTTTTAAGTGTAAGTTCCAAAGATTAGTGCTAACTAAAGCTTACGTGTGCCAGGAGATTAGTTACAACGTCAGGTTGAATTGCTGAACTAGCATGTCGTTTCTGCGTCATTATATTATTGATGCTGCATTCCGCTTCCTTTTTTTGTGGTGCAAACACTACAAACTTTTTGGTTACTATGGCTCATCACTATTTTTGCCACTTCGATGTGTTTTTCTGTGACTTTCATTGCTTTGGTTGTTGCTCACCTTCCCCGTTTTTTGTCATTGAATTTGTTTATGGGCAGCTGTTTGTTGTAAAAAGATTTACTTGCTAACTTCAGCTATCTGCCATATTTCGCCTTGAAGCTTGGAGCAAGCTCACTGCAGCTGATCGGAGTAATCGACTACGCAAATGGTATTAACTTATTTATTTTTATTATTTTCTAAATATGTTTACTTAGTATCATTATTATACTTCTTTTATCATCTCCACTCCAGAACTTGAATTATTTTTCATTCATTATTTGGATTTGTTTTTACGATATGCTTTGAAGATATCAATATGAGAATAACAAGTATTTTTATGCAAAGATAAATTCATGGAAATTTAAGTAAGAAGAGGGCATACAAAAGGTAGCTGAAGCATTGAGCACTTCTGATACTGAACCATTTCAACATTGAGTGTTGCCTAGTTCATTGGAATAGTATTGCATTGGTTTGCCTGCCATACTTAGGATGTTTCTTCTGTCTTCGGTATTTTGAAGGTATGAGCTCCTAATGGCCCACAAAGAAGAGCTTGGACAACTGATAACCTTAGAGCAAGGAAAGCCCTTAAAGGAAGCTTTGGGTGAGGTACCATATGATTCGCTCTAACGATCATCAATCTGATATGTGATACTATCACTTTGTTCCTTTAACATACACTTTCCAACTCATTATACAGACTAATTATGGAGCCAGCTTTATTGAGTTCTTTTCCGAAGAAGCAAAGCGAGTATACGGTGACATAATCTCACCAACTATAGCTGATCGTCGACTTTTGGTCTTGAAGCAGGTCAATTGACAGTCTTATTCTGTTTTCCTTTTCCTTTTTTTTTGAAGAATTACCTGAATGCCATATGCATCAGTATGTTTGCACTTGGGAAAACTACTCAAATTTAATCATCCAACTCTTATTCAAAAAAAAAAAAAAACCAACCTACACAATTTAGTTGCCATTTTAATATGGAGATATTTGGAATATTTATATATTGTACGCGAGCATTAGTATGCAGGTGTGTCATGGGCTATGTGCACAAGATTCTAAGCGACCAGTCAATAAATTTATGTTATTGTATCTGGTGGTTCCTTATAATGTTGCTGTGTTATTGTTAAAATTGACCTGACCATGTAATATAACACTTAGGTCTGGGAATTGGTTCTGAAGAGAGTCTCCCTTTCATCTCGCTAGACTTTTTTTTCTCTCTTGTAATGTTGTACATATTACATTTTGTTTGCTAGATAGCGTATGGTGTAATTGTAAATTTAGATTTTGGGAATTTGGAAAGTTTTAACGTTATTGGGAATTCTACCTGTAAATTTCTGCACACCAATGATATACATGTTTACTCTCAAACAAAATGTTGATGACTTTGACAATACTCCGTACCATGGTGTTTCATAAACATTTTCTTCTGCAGCCAGTTGGAGTTGTTGGCATCATTACCCCTTGGAACTTTCCGCTGGCTATGATTACACGGAAGGTTGGTCCCCTTCATGAACAATTGTATTCAATTGTTTACAGTGTTGTCATATTACTTTTATGAGAACATGACCTTTCCAATTAATATATGCTGTCTAGAAAACCTTATTTTCTATTACCCTTGCGTTTCAGGTTGGACCTGCTCTTGCAAGTGGTTGTACGGTGGTCATAAAACCCTCTGAGCTTACCCCCTTGACAGCTTTGGCAGCAGCTGAGCTCTCACTTCAAGCTGGAATTCCCCCGGTGATTACCAATGAGAAGCCCAGCTATTATTTAATTTTGAGATTTTTTGTTTCCAAAAATTTTTTTCTTCTGAAAGTTATCTTTTTACATATATATTCTGAAAGTGGTAGTTCTTGTTTATCTGATAGTCTAGGTCTTCGCTTGATTTTTTCATGAATTGCTTTTAGGAGGTTGCATGTTGTCATTAACTGCTAATGAAAAGCTAGAAGATTTGTAGAATATTAGTTGGGCATGAATGACTTCTCTTAGTTCACTTTGTTTTACATATTTTTTAATCTATCAGATAGCATCCTTGTTAATCTGCGTTGTGTGATCCAAACTTTGTATTTGCATTGGTAGTAAAGTATAAACCTCAGCGTTGGGTGCACTTCTCAGTTCCTCGTATATGTGTGGTTGATTTTTCTTAATGTGTAGGGTGTCGTGAATGTGGTTATGGGAGATGCTCCTGCTATTGGGGATGCTATACTTGCAAGTTCTCAGGTTACTTTATTAACAGTACTATTATTTTTGCAGTATGGTGCTGCTGCTTTAATCTTAATGGTATATCGAACCTATGCAGGTAAGAAAGATCACGTTTACCGGCTCAACTGCAGTTGGAAAAAAGTTGATGGCAGGTGCTGCTGGAACTGTTAAAAGGGTAACTCATAGTTCAGAATATTAAAGCATTTTTTCAGGATGAAAATTTGAAACCTTATGTGGCTTATGATACCCGTTTCTCTTCTCTAGGTGTCCTTTGAACTTGGTGGTAATGCCCCCTGCATAATATTTGACGATGCAGATGTGGATGTTGCAGTAAAAGGATCTGTAAGTGAAATTATTAATTATTAAAGTTATATGTGTGCATAATTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTTCTTGTTCTTCTTGTTCTTCTCCCATTTTTATTTATTTATTTTAACATTTTAATTTCAGTATTTGCTACTCAATGTAGATTTATGGTAAAATATTGATGTAGCCAAGTTGGGAGAGAAACAATCTTTGAGGGAATACTTCAGCTGTCTCTTTAAAGGAATACGGCTTGGCCTATATTCTGAATCAAAATTAAAGTACCAACCTAATTGCTATAACAGAGTTGCCACATGGTCACTTGAAACAAAATACAATTGTTCCTTAAATAAAAAACCTAAACAAAGTATCTTAACTTGAAACATCCTAGTGCACCTTCTGATCCTCTCTCTCTCCCATTTTGAGACGTCTCTATTATTCTCACTATATAACTCTCTTGTACTTTGAGATTATTATTATTATTATTAATAAAGAAGCTTGTCTCCGTTTAAAAAAAAAAAACCTAAGTAAAACTTAAAAGAAACTAAAATCACGGACAGGGTCGGACAAAACTTTAGGAAACGTATTTGGTGTTGCATTATCTTTGCAGTTTTATGGAGGATTTGAGAGGAAAAATGCAAGAATCTTCCAAGGCGAATGCAAGACTTCAAGGGACATCATTGACTCTCACATCTTTATGCTTTCTTTTTGTGTAAAGATATACTGGCTATAAAAATTCTATGGGATTACAGAAATCTACGTCGAATCGTTAATCTAATTTGGAAAATGGCTTTTGGACATTGTTTGTCTCCTTCAATCTGCACTTTTGCTCTGCCACTAGTGACTCTTTATATAACCTGGTTTTGATTGCTTATTCTCAACTTGTTTGCATTGTTGTTAGAATTGTGTTTGGGAAGATTCTAAGGATTTTTTCAAAGCAAGCTTGTAACGCCTCGAGTTTAGGAGGGAGTCATGAATGGACCGATATCACATCTGAATGAGAGAGATTCTAAGGACATGAAAGTAAGGTTAAGAAAGACTTAAAATAATTAAAAGTTACTACCTATACCAACAAGGTGCATCTTCCTTTCCGGTGGCTTGATCATAGGAACTCCAAACTTAAGCGTGCTTAGCTTGGAGCAATTTT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MITTVTARVITTARSLVPSSQLSLLRPSSYVFAAQKSHSHTLLIRQMSSEAQSITTRLHSSGLLRSQGLIGGKWIDAYDGKTLKVQNPANGEVITNVPLMGKRETDDAISSAYDAFKSWSKLTAADRSNRLRKWYELLMAHKEELGQLITLEQGKPLKEALGETNYGASFIEFFSEEAKRVYGDIISPTIADRRLLVLKQPVGVVGIITPWNFPLAMITRKVGPALASGCTVVIKPSELTPLTALAAAELSLQAGIPPGVVNVVMGDAPAIGDAILASSQVRKITFTGSTAVGKKLMAGAAGTVKRVSFELGGNAPCIIFDDADVDVAVKGSIAAKFRNSGQTCVCANRILVQEGIYEKFTNAFSKAVQNLQVGDGFGEGVAQGPLINEAAVQKVEKFLQDATTKGAKVLLGGKRHSLGMTFFEPTVVAGVKSDMLLSREEVFGPVAPLLPFRTEEEAIALANDTNAGLAAYIFTNNIQRSWRVTEALEYGMVGVNEGLISTEVAPFGGVKQSGLGREGSKYGMDEYLEKHVWTSIFY* Homology
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SAK4 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ALDH5F1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 782.7 bits (2020), Expect = 2.6e-225 Identity = 383/497 (77.06%), Postives = 448/497 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9F3B6 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ALDH5F1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 772.3 bits (1993), Expect = 3.6e-222 Identity = 379/497 (76.26%), Postives = 441/497 (88.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P25526 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] GabD OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=gabD PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 556.2 bits (1432), Expect = 4.0e-157 Identity = 266/473 (56.24%), Postives = 356/473 (75.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9I6M5 (Glutarate-semialdehyde dehydrogenase OS=Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) OX=208964 GN=davD PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 4.9e-155 Identity = 262/473 (55.39%), Postives = 356/473 (75.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3MSM3 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial OS=Hylobates lar OX=9580 GN=ALDH5A1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 547.0 bits (1408), Expect = 2.4e-154 Identity = 280/474 (59.07%), Postives = 353/474 (74.47%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KGA1 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G135470 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1010.7 bits (2612), Expect = 2.2e-291 Identity = 524/529 (99.05%), Postives = 525/529 (99.24%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2Z2 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496279 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1000.0 bits (2584), Expect = 3.9e-288 Identity = 517/529 (97.73%), Postives = 522/529 (98.68%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UJC6 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold24G005340 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 946.8 bits (2446), Expect = 3.9e-272 Identity = 491/503 (97.61%), Postives = 496/503 (98.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D7B8 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018025 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 938.3 bits (2424), Expect = 1.4e-269 Identity = 482/529 (91.12%), Postives = 500/529 (94.52%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FYC2 (Succinate-semialdehyde dehydrogenase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448470 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 929.1 bits (2400), Expect = 8.4e-267 Identity = 478/531 (90.02%), Postives = 502/531 (94.54%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. NCBI nr
Match: XP_004139912.1 (succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial [Cucumis sativus] >KGN46791.1 hypothetical protein Csa_020657 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1005 bits (2599), Expect = 0.0 Identity = 524/529 (99.05%), Postives = 525/529 (99.24%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. NCBI nr
Match: XP_008456285.1 (PREDICTED: succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 994 bits (2571), Expect = 0.0 Identity = 517/529 (97.73%), Postives = 522/529 (98.68%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. NCBI nr
Match: XP_038901457.1 (succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 953 bits (2464), Expect = 0.0 Identity = 496/529 (93.76%), Postives = 510/529 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. NCBI nr
Match: KAA0054707.1 (succinate-semialdehyde dehydrogenase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 942 bits (2436), Expect = 0.0 Identity = 491/503 (97.61%), Postives = 496/503 (98.61%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. NCBI nr
Match: XP_022149643.1 (succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 934 bits (2413), Expect = 0.0 Identity = 481/525 (91.62%), Postives = 499/525 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. TAIR 10
Match: AT1G79440.1 (aldehyde dehydrogenase 5F1 ) HSP 1 Score: 782.7 bits (2020), Expect = 1.9e-226 Identity = 383/497 (77.06%), Postives = 448/497 (90.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. TAIR 10
Match: AT3G48170.1 (aldehyde dehydrogenase 10A9 ) HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 1.8e-91 Identity = 187/474 (39.45%), Postives = 280/474 (59.07%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. TAIR 10
Match: AT1G74920.1 (aldehyde dehydrogenase 10A8 ) HSP 1 Score: 330.9 bits (847), Expect = 1.9e-90 Identity = 187/472 (39.62%), Postives = 277/472 (58.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. TAIR 10
Match: AT1G23800.1 (aldehyde dehydrogenase 2B7 ) HSP 1 Score: 323.6 bits (828), Expect = 3.1e-88 Identity = 187/476 (39.29%), Postives = 275/476 (57.77%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G196260 vs. TAIR 10
Match: AT3G48000.1 (aldehyde dehydrogenase 2B4 ) HSP 1 Score: 323.6 bits (828), Expect = 3.1e-88 Identity = 185/468 (39.53%), Postives = 272/468 (58.12%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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