Chy11G191770 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAATATAATTGGTTTGTGACATCCAATGTAGTTGTTAGTGTTACGGTTTGTAGTTCATATCTATCAATCCAAACATGGCTGTATTGCATTCTTTTATTTCATGAAATTGATTGGTTTTGAGTTTGTTGGTTCCCTTTGGCAGTCATAAGTTTCATGGTGATCTTTTAATGAAGATGTGTTCACTTGGTTTTTCTATCCTTGTGTTTGATTTGAAAAGAAAAGCAATTTATATTTCAAAAGTAGGTAGGATGAATGCTTCTAGAATTCGATCTCAATTTGAAATTATTGATTTGTTACTCATTCTATATTCTTGTTATCTCCCTCTTAGTAGGAATAGCTTGATTAATTGGCTACCCAAAAAACTTTTATGATGGGTTATTGTGTTCTTTATCATAGGATTCATTTGTTAGCAATGCCAAAGGTGAGTCTTTTAGAGAAATTGATCTCGAGAAGGGAACTCGAGTTCTGCGAAGCAATTCTGACATGGGAATGGAGGCCTTCAATAAGCAGGTGTAACCATGGAGTAATTTCATTTTATTTTCTCCCTTCCCCTTTGCTTTTGTACCCTTGTGGGACTTCGTTTGTTCTTTTATAGCCATCCTTTTAGTTTTCACTTCTTTTGCCTAATTTTTCTTCTCTTCTTTGAGGTCAGATACAAGACGTTGAGGTTCAAGTAGATAAGCTCGCTGGGCTTCTTATTAAACTGAAGGTATGTATGATTCATTTTGATTTAGATTCATTATTCTTTGAATCTTGATGTACTGAATTCTGAGGAATGACCACGTACTCTTTTATAGGAAGCTAATGAAGAATCGAAGTCTGTTACAAAAGCATCAGAGATGAAAGGTATATGTTTATCCTTGTCTTATGTCGAGTGGCACAAACATTAACAAAAGGGAATGTAAATTTATGTCCTTTGAATTACTTATCTGCAAGTTAGGTTAAGGTTTAACCAAACCACTAAGCATGCCTATGTAAATGTTTCAATCCGTAAGGCTCCATAATAAGTCAATTTACATCAATTGTGAATACTCCTTTTCTTCTTAAGCATTTGTTTCAGTCTTGGTACCTACATGTCTGCTTTCGCTAAGGGCACTTGTCATTTCAGCTATCAAAAAGCGAATGGAAAAGGATATTGATGAAGTTGGAAAAATAGCGCGCAATGTCAAGGGGAAGCTGGAGGCTGTAAATAAAGATGTAATACAGGACTTGCTCCAAGATTTTCAAAACTTGTTTGGCTTCTTTGTTGTTGAAGTTTTCTCAATTATTTGAAGAACAGTTGCATAGTAATTCAGTTTTCTTCTCTCTAGAACTTGACCAATAGGCAGAGGCCTGGGTTCGAGAAGGGAACGGCCATTGACCGAGCAAGAATGAACGTGACAAAGTTTGTTGCCAATAAACATTTTATTTTTGGAACTCTTGTTTTGGATTGATAATGTTCCTTATGGTAGAATTATGTTCTGAATGGCAGTGCGTTGACAAAAAAGTTCAAGGATCTGATGATAGAATTTCAGGTATTTTGAAGCCTCCTTGTTATTATTTGATGAATGTTTGCCTAATACCCTTGCCTGTTATCCTTGTATCATGTTTAAGACTCTTCGTCAAAGAATTCAAGCTGAGTACCGTGAAGTCGTGGAAAGACGAGTGATTACAGGTTCAAATGCTTCTATTACTAGATTGTCAAAATTATGGTTATGATTAATTATGTGCAGAAATATCATAGTTATCCTTTTCTTTCCCTCTTTTTGATGGCTGAGGCTGACTAATTTTCTGATATAAACTTTATCAATGTGGGCCTTTATTGAGCAGTTACGGGTACCAGACCAGATGAGACGGTAAGCTTATCTTTCAAGTCTAAACTTGAAATTTGAGAACAAATCAAAATTTTTGTCTCTGACTGGAATTTTAATGAAATATTAGACTATTGATCACCTTATAGAAACTGGAAACAGTGAGCAAATATTCAAGAATGCATTTGAACAAATGGGACGAGGACAGGTATGCTGAACGTAAATAGGGTTTCAGTTAAATTTATTGTACTCCAGAAAGTATAACTTCAAACTGTATTCGTCCTGTTTCTTTGACTATCCAAAATATTTGAGTGATTGACTATGACCACTCTTAATTTTCCACTCTTTACATAGGTTATCAGTACTGTGGAAGAAATTCAAGAGCGACACGATGCAGTTAAAGAGATCGAGAAAAAGCTCTCGGAATTGCATCAGGTATATATTATCTCTTGGAGCTACAATGCAAGAAGATCCTCAGTAGTCTTATGTGTTTCTCTTTTCTTGGTCAGATTTACCTTGACATGGCAGTTTTAGTGGAAGCCCAGAGTGAAATTTTGGATAACATAGAAAATCAGGTTTGTCCTACCTCTAACTCTAGGTATGTATATATAGTTTTCGTCCGTCGGTCCTAGGTGTTGACGAGATTTCATCCAGATTAAAATGTAGTTAATCATGTCCGAGGAAGACTTCGCTTCAAAAGGATGTGGATTGCTATTATTGTTCTTCTTTTCATAGTTGCTGTTGTAATTTCTTTGTGTGATCCAACCATAGAAGAATGAACAATAGATCTTTTTTGGCCATTTTTTATATCTCCGTTTGCTCAATATGGAAAATGGTTAGTTGATGAATGGTCGAGTCAGTCGTGCTCAATAGTTATTTTGTTCATAATTCTGCTAAGTTCAAATTGATTAAGTTGAATATCTTTCATTTTATTTTATTGGATTTCCAACATTTTCGATATAGGTAACGAACGCAGTCGATCACGTTCGAACGGGAACGGATGCACTCCAAACCGCAAAGAGCTTACAGAAGAGATCAAGAAAATGCATGATGATTGGCATCATATTGCTGCTGGTTATTGCAATTATAATCATCCTCTCAGTGTTGAAGCCATGGAAGAAGTAAGCGATGGAAATGATATACCAAAATGTGGACTCAGTTTCACATTTTCCATTGCTTACTAGAGTGTCCCTTCGTTGTAGAAATCGTTAGCTCCTTCAATTACAAGTTTTATTTTGTTTTATCTCTGAATACATAGAAGGCTTTTGTTTTACTTTTTTAAAAATTACCATCTGCTTGGTAGAGAATTTAATAACATAAATTTGAAAATAACAAATTTAATGAAAGAAAATTGTATTTTGTATTTTTTAGATACGGATTTGGAAATGATTAAAATGTTAAATTCTAATTTAAACAACTGCTTAGAATGTGTTTGGTACCATATATTCAGTAATCTTCCATTTTTTAATTGTAAAAATTGAACACTTAAACTTTATTAAAATCAAACTCTTAAATTTATATAATTATAGAAATCATAATAATTGTATTGATTGATAGTTTAACTTTTAGCACTTCTTATAGATATGTCAATATAGATTTTAAGAATTAGACTCATAAGATAAATTTGTTACTTTTGCAATAATGACAAGTCGAACTTATGAAATGTAGAAAGAGTATGGATACACTTGAGATACTGGCTAGAAACTTGATACAATTGATATCTTTGATACATTATTGATATAGAGTTGATACGCTATTGATATACATTTGATACTACACTTATTAGAAGTTTGAAGGTTTAGTTTTTACAATTGCAAATTTGAGAGTGTAACTACGGTTACCATCATATTTTGTAAATAGATTTCAATAATTCTGATACTATCGATCTATAAATATATCAGATATACTTAGGATAAAAATTAATAAAGTTAGAACAATAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAATGGAAGTAAAAAATTTAATATACTTTTTTATACATACATATATATATATATATATGCCACCGATAGGATTTTCATGTTGGTTATAACATTCTAGCATTGTTTAAGAAAAAGTTTAGTCAATATGGTTGTTAATTGCCACCTAAACAATATTATATATTGTAAGCTTATAATTTACTTTCCCTCTAAAATGAAAAGATGCTCTTAACTATAGATGCATCTCGTCTTTCATATTTTAAATGGATCATTTTAGTTAATGACTTAATTAAGAATATGTTTAAAGTTTAAAGGTTACCTCAAATAATTAAATTTATATTTATATTTTCATTGTTGGTAATTGATCTTAACTAACATATATTCTCCACGTACCATAAATGCAAAAATAATAATAATAATAATAATAATTGAAAATATAATTAAATGTGCTCTAGAACAATTTTAAAAAAAGAAACATGAATTAACAAAAATATCCAAGATTAATCGGTTACACACGTGCGAGAGATGATCTTGTATCCATCCAAACAATTTTACTATGTGATCTTGTACTAAATATAAGCGATATTGGTACGCGATATTGGTACACGATCTTGTATCAAATATAAACGATTGTTTGAATCTATCACTTATCTATATCCTTGTCTATTTCAGATAGATATTGACTGATCATTCAAACATTGGTACATGATCGTGTAGTGAAGAAAGAAAGAAGAAAAAAAAAAGGACACAATATCTAATAATGAAAAAAGAATAAGAAAAAAAATAGTCCACTAAAAAGATGATCTCGAAGATGAAAGATGACGAAGAAGGAATAAATTTAAAAGAGCAGATGAAGAAATTTTGGATTGGCAAATCTTGAATTTATGAAAAAATTAATCCAAGTTATACATACTTCATTGGGTTTTTATAAAATATGTTTATACGTCCCTAAATATTTTGTAACCAAGAATAATAATAATAATAAAATAAACAATTAATTTAATTTTGTCCCACCGTTTACGACCATTCAAAATACGTCAACATCAACCATAGTTAATATTAATAAAATCTCATATTCATCTAATGTTTTGTATCATTTTCTTTGAAAATTAAACATTTTCAAACCTTTGGCCTGTTCAACTAGAGGAACCAATTTATGAGAATAATATTAAATTAAAAGATATGTCAATTCAAAAGAAAAATGTAATTGTCAGCATTGAAGGAACACGTAGAAAATTAGTTCACGAAGAAACTCAGAGTTATGA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MQYNWFVTSNVVVSVTDSFVSNAKGESFREIDLEKGTRVLRSNSDMGMEAFNKQIQDVEVQVDKLAGLLIKLKEANEESKSVTKASEMKAIKKRMEKDIDEVGKIARNVKGKLEAVNKDNLTNRQRPGFEKGTAIDRARMNVTNALTKKFKDLMIEFQTLRQRIQAEYREVVERRVITVTGTRPDETTIDHLIETGNSEQIFKNAFEQMGRGQVISTVEEIQERHDAVKEIEKKLSELHQIYLDMAVLVEAQSEILDNIENQVTNAVDHVRTGTDALQTAKSLQKRSRKCMMIGIILLLEPFIVRDAEGQASEETDLEKGTQVLQSNSDFGMDVFNKQIQEAEIQVDKLSGLLIDLKTLLKDANEESKSATNTSEIKAFKNRIEKYIDDVGKNTGEVRGKLQVITIDNVFHRQMPGCEKGTACDRERMNCTNVLTKKLKELLTEFEALHRTIQDEYREVVERQVNTVTDTRSDGMIIDHLLETGSSKKIFPTTFEQTEGGKVIGIMEEKIQERFNAIKEFDKRFLDLYQLYVKTAVLVEGHAKVLDNMENKVKDAVDRIEKIDKNQKEQKLENMSGKNMTNYYLCFMVVIIIINILSASASK* Homology
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZU2 (Syntaxin-132 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SYP132 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 311.6 bits (797), Expect = 1.9e-83 Identity = 171/276 (61.96%), Postives = 215/276 (77.90%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SRV7 (Putative syntaxin-131 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SYP131 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 287.3 bits (734), Expect = 3.9e-76 Identity = 152/263 (57.79%), Postives = 203/263 (77.19%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SXB0 (Syntaxin-125 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SYP125 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 218.4 bits (555), Expect = 2.2e-55 Identity = 128/290 (44.14%), Postives = 181/290 (62.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O64791 (Syntaxin-124 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SYP124 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 209.9 bits (533), Expect = 7.9e-53 Identity = 119/271 (43.91%), Postives = 173/271 (63.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZSD4 (Syntaxin-121 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SYP121 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 208.8 bits (530), Expect = 1.8e-52 Identity = 117/258 (45.35%), Postives = 166/258 (64.34%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TPD4 (Syntaxin-132-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold1639G00280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 732.3 bits (1889), Expect = 1.7e-207 Identity = 409/469 (87.21%), Postives = 418/469 (89.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LTA3 (t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G420980 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 525.8 bits (1353), Expect = 2.4e-145 Identity = 275/308 (89.29%), Postives = 288/308 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LMX3 (t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G420480 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 519.6 bits (1337), Expect = 1.7e-143 Identity = 281/283 (99.29%), Postives = 281/283 (99.29%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2K1 (syntaxin-132-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495947 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 517.7 bits (1332), Expect = 6.5e-143 Identity = 279/285 (97.89%), Postives = 282/285 (98.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CGH4 (syntaxin-132-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011201 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 482.3 bits (1240), Expect = 3.0e-132 Identity = 252/285 (88.42%), Postives = 274/285 (96.14%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. NCBI nr
Match: KAA0043421.1 (syntaxin-132-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 734 bits (1894), Expect = 5.61e-261 Identity = 409/469 (87.21%), Postives = 418/469 (89.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. NCBI nr
Match: XP_004151881.1 (syntaxin-132 [Cucumis sativus] >KAE8652298.1 hypothetical protein Csa_021839 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 525 bits (1352), Expect = 1.12e-181 Identity = 282/285 (98.95%), Postives = 283/285 (99.30%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. NCBI nr
Match: XP_011650017.1 (syntaxin-132 [Cucumis sativus] >KGN63266.1 hypothetical protein Csa_021934 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 524 bits (1350), Expect = 2.61e-181 Identity = 275/308 (89.29%), Postives = 288/308 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. NCBI nr
Match: XP_008455846.1 (PREDICTED: syntaxin-132-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 521 bits (1341), Expect = 5.23e-180 Identity = 279/285 (97.89%), Postives = 282/285 (98.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. NCBI nr
Match: XP_038902006.1 (syntaxin-132-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 498 bits (1282), Expect = 4.59e-171 Identity = 264/285 (92.63%), Postives = 278/285 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. TAIR 10
Match: AT5G08080.1 (syntaxin of plants 132 ) HSP 1 Score: 311.6 bits (797), Expect = 1.4e-84 Identity = 171/276 (61.96%), Postives = 215/276 (77.90%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. TAIR 10
Match: AT5G08080.3 (syntaxin of plants 132 ) HSP 1 Score: 303.1 bits (775), Expect = 4.9e-82 Identity = 171/287 (59.58%), Postives = 215/287 (74.91%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. TAIR 10
Match: AT3G03800.1 (syntaxin of plants 131 ) HSP 1 Score: 287.3 bits (734), Expect = 2.8e-77 Identity = 152/263 (57.79%), Postives = 203/263 (77.19%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. TAIR 10
Match: AT1G11250.1 (syntaxin of plants 125 ) HSP 1 Score: 218.4 bits (555), Expect = 1.6e-56 Identity = 128/290 (44.14%), Postives = 181/290 (62.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G191770 vs. TAIR 10
Match: AT1G61290.1 (syntaxin of plants 124 ) HSP 1 Score: 209.9 bits (533), Expect = 5.6e-54 Identity = 119/271 (43.91%), Postives = 173/271 (63.84%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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