Chy11G190790 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCATCGACTGCCTCGTTCTTGGTAATCCTCTAGTTTTTCCATAAGTATTCTTTATTTATTTACATTTTTCTGAATTTGATCTTAATCTTTACCTCTTTTAGGCGCTGGGCAAGAAGTTGGGAAGAGTTGTGTGGTCGTTACAATCAATGGAAAGCGAATTATGTTTGATTGCGGGATGCATTTGGGCTATGTCGACCATCGTCGATATCCTGATTTTTCTCGCATATCTGCTTCTCATGATTATAATAATGTTCTCTCCTGTATCATCATTACACACTTGTATGCTGCTGTTGTTGTTATTATTATTATTTTGTAGTGATCGATAAATCTCTGTTACATTCCTTACAACGTTGTGTTTTTGTCTTTTCTCAACTTCTATGCTATTTTGCAGTCACTTGGACCATATAGGTGCTCTTCCATACTTCACCGAAGTTTGTGGCTATAATGGACCCATTTACATGACGGTAAGTTTCATTTCATACACATGCTTATGGATGTTTGTTTATGTGCTTTTGGTTTTACCATGGCCATGTTAGATTTTTTTTTTTGAAGAGGTAAAGAATTTTGTCATTACAAAATTTACATGAAGTGAAGCCATCAAAAGAAAAAAAGAAAGAAATTGAAAAAAAAGTAAACTCAAATTATGGTTGGAAAATGTTTGAATTGAGGCGTTCTTTCATAGATCTTAATTAAGAGATACAAAAGCTTTGAAGAAAAAAGTGCACACAAACCATGGTTGAAAAGATTTTGAATTGATGTGTAGCTTGCTTCCTGTGGGCTGTGGTCTTGGTGTTGTCTTCCCCAGGCCCTTCTTCAATTTCTTTACGTTTTTGATGTCCTCCTTTGCATGATAGAAAGGTGTGGCAGGTTATTGTAAGGTCTCCAATCACTCAAACATATGTAGGGAGAGGCAAAAGAGGTATTCACACAATGTAGTTGCTTAGAAATGTTTTGAGTGGCACATTTAAGATGTAGAGAACATTGAGACAGGTTTTCGTAGGGTTTTGTGATTTCTAAAGAAGGGAGGTAAAGTTGTAGCACCTGAGTGCTTGAGTAGGAGAGGTTTGATTCTTTCGAGTAACTGGGTTATCCTATTTTTTCAAGCATTATCAGTGTCTAAAAGGAAGACTAAGGGAGGACAAAAGGCTAGTGGTGAGAGCCCAAACATGATGGATACGGAGCTCCAAAAGCTCGAGAGTTCGGTTAACTACGATAGGGGAAAGGCTTCCGAGGAAGCAGATATAAACCATCCTAAAGTTTTGTGGCAAGCTAGTTTTTTTTACAGGTATGTGGGCCATTCTAATTGAGAGGAATGATAGAATTTTTAGAGAGGTGGAGAGATCTGGGGGCTATGGATGTTTGAGAAGTGGCTAGGTGTACTTTCTTGTGGGCATTGATCTCAAGGTCTTTTTATAATAATGAGCTTTGGTATTGTGGTTTTGGATTTGAATCTTTTTCTATAATTAGGTTCAATCAAACTCTCTTTTTGTTTGGGCTTATTTTTTGTGTGACCTTGTATACACTTTCATTTCTCTCCATGAAAGTGGTTTCTTACCAAAATGGTGAAACTTTTGTCAATTTTGGTTTCTTACATTTTGGCATTGAAGTTTTCTCTTTACTTCCTCTTGATTGCAGTATCCAACAATGGCATTGGCCCCTATAACGTTGGAGGACTATCGAAAAGTGATGGTTGATCGAAGGGGTGAAGCAGAACAATTTACTAATGACCATATTATGGAGTGCTTGAAAAAAGGTAACTTAATTATGTCAAGATCTTAAATAGTATGCAATTAGTCTCTGGCTGGGCCTGTGATTGTTTAGGCGGCCAAATTTTAAGTGTTATCTCTATTTCTTTAAAATGGTTGAAACATCGAAGTTTCATGGTCCATAGAGGAGTATGGTACTACATGTCCATGTTGGTTAATCTCACAATGTTTATTTATTTAAAAACAAATATTTTCATTGAAGTAATTAATGCTTCTTCCTAGTTCTCTCTTGCCAAGTCTTTCACTGATTTCGCTTTCATGTCTCCCACTGGACTTTGATTTTGAAGACTTTTTGTAATCATTCTATGAACTTGATTTTGTAGTTGGAGTCCTTTCTTATAGTGGGATTCCTCTTTTTGTGGGCTCGGTTTTGTATGCTCGTGTTTTCTAATGAAAGTTGTGCTTTTCATTAAAAAATGGAAATCTTTAGTTGGGATATGATTGCAGCAAGCTTGCCAAATATTTTGGAAATCTCGATCATTAGCATATAGTTCAGGTAAATGATCAGAAGCTATAATTTCTCCACGAAGTAGAGTTAGGAGTGTACCTTTCCTCCTTAGAGCGTCAGACACTTTGTTTACTTTTCCTTGTGTATGTGCGATGACAAAGTCAAATCGTTGGAGGAAATGAATCTGCCTAGCATGGATACGACTGTTTTCCTTTCGTGCTTGTAAGAACTTCAAAGGAAAGTGGTTAGTTTACAAAACAAATTCTTCCCCAAGCAGATAACGCTCCCACTGTTTTAAGGACGTAGTAGGAGAGTAGAGTTCTTGCTTGTAGGTTGACCATTTCTGTCTAGAAGAGCTTAGGCCTTGTTTGGTTCGTGGTTCAAAAGTTATTTTAGAGAACAAAGAATTTAGTAGAAAACACAAATCTTCTTTTTCACAATATATTAAAACACGTTTGGATTCAATTTAAAATTTTGAAATTTGAACTCAAAATTCAAAATATGTGTTTGATTGTGAATTTGGAAATGCAATAGTGTATTCCATGTTCATAATTTCTGAAAACAAAATTTAAAAAACAAAAAAACGAGATTTTTTTTTTGAAAATGGGCTACTTCAAAGGTATTTGGAAATCGTTTTTAAAAATAGGTATACCAAACGTGCTTTAATTGTTTTTCTTGTATTTTTTGTTTTCTAAAACATAAAAGCAAAAATGAATCACGAACCAACGAACCAAACGAAGTTTTTTGCTAAAGAATTCTATGGGATGTTTATTTTGACTTAAAATTGCCCCTATTCCTATTCCAGAAGCATCTACAAATACCTCAAAAGTTTTATTAAAATCTGAAATCCTAGAACTGTTGTTGAGCTTAAGACTCTTTTCAACCAGAAAAACTGTGTTTGGTTTTCCCCCATTCAAAGGGAACTTTGGTTTTAAGTCCTCTCTCCTCTCTCCTCCTCCCCCAGTCCACGGTTTCTACCCGGCTTTGGCATTCTCTAATTCCGGCAAGACAATAGTTTCAGATGTGGAGGTGAAAAGCTGCAAAATCCAAGATTCGTTTTACTGCATATGGTTTGAAAGAGGATATTTCCATATTGAGGATGTGGATTACAGAAAAATTCTCAAAGTGTCTAAGATCCAACTTGAATGGTTCATGGGAGCTATCACGAACCTAGTGAAAGAACCAAGTTCTTTTTGGAAAACAGAAATGAAGGACGTGAATCAGCAAGGCTAACTAAATTTCGAACTCATTCAGGTGGTTCATGAGGTTTGTAGCACGAAAGGGATACAGTGACTTCTCCTTTATTGACATTGAGGTTTAGATGCTAAGTTCCATCGCGTACCACCTTCATTACCTTTCCAAAAGACTTCCATCAAACACTCTAAATCCAAGCTCAACTTGAGAAGGCATAAATGCATATTGGAAAGAGAAGTAGTTAAGGGGATACTTGAGATTACTGAGTTGCAAAGAGTTGATCATCTCCTTGTGAGGGATAAAAATGTTTCTAGCAAGCTTGTTAATTTTTTTTCAATTACCATTTGCCGAAAAAATGACTGGCTGACCACCAAAGGGGAAGGCCAAGATAAGGAGATGTAAGGTTACCACCTTACAATTGGTCCGCCTTGACACTTCAGACAACTTTAAGTTTTCCACATTTAGACCACAAATTGCTAATTTCTCCTTCATTAACTATCAGACCTGATCATGCTTCAAAAAGAGCAATAATTTTATTAACACAACAGGCATTGCATTATTATATTTACAGAACAGTTAGGTGTCATCAGCAAACTGGAGGATAGAATGAATTTTATCTCTTCAAATTTTGTATAGTAAGCTCTCTTTAGTGGTTTCTGTTCTTGGTATATTTGGCCTCGCGTTGTGCTTTTTGTCTGATTCCAAATGATTTTGGATTTGGCCTTCTTGTGCAACTCTTACTTTGCCCTTATTTTTTTATTAACCGGAACTTGTTCTTTCTTTCGACCTAATATACATAGTGTAGAAGGAGAAACCTTTAACTGAATATGGAAAATTGCTATTTTATGAGATCCTCATGCTTCGTGCTCAATTACTTGTTCATTATTTATGTTTGTTCCCATTTACTAAGGGTGTGTTTGGATTAACTTTTGAAGTGTTTAATTTTTAAATTAAACCATTTTAAGAGAAGTTGAGGTGTTTGGTAAATATTTAAAATAACTTTTCAAAAAATGAGTTTTTGAAATAAAATATTTTAGAGAGAACACTTGGAACCAAATTTTAGGAAAAGAGATTATTTGGTGCTTAACCGGAAATTCCTCTCAAATTTTAAGCATATACTAAAATGACTAAACTACCCTTGCATTAACCCACCTCTCCCATCCACACTCCAACGATAATAGTTGTTGACTTTATTTAATGAATTTTAAATCTTAAAATTTTTAAAAACAACAATAGAAATAGATAATTTTCAACAAATTTCAAATCTTAAATCTTAAAATTTAATGAATCCCTCCAAAATTTTAGAAGGGATGTACTAAAATGACTAAAATTTATGTACTATGGTTGGAGATGAAATTGTTTTATTATGATTATGTATTTAAATTTCAAGTTAGACGTGCTTCTATAATTCTATAGTCCGAAAATATTCTATTTTTAACACAAGAAAATTATAAAGTTAATATTTCATAGACCTTTGTGGTAATTTGACATTAATATAAACACTTAGGTGTTGAACTAACCAAACAAAAATGTGTATATGAACACTTATGAAAAAATTTAACAAAAAATTATGGTGTTTAAA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MAIDCLVLGAGQEVGKSCVVVTINGKRIMFDCGMHLGYVDHRRYPDFSRISASHDYNNVLSCIIITHFHLDHIGALPYFTEVCGYNGPIYMTYPTMALAPITLEDYRKVMVDRRGEAEQFTNDHIMECLKKVVPVDLKQTIQVDEDLQIRAYYAGHVLGAAMFYAKVGDAAMVYTGDYNMTPDRHLGAAQIDRMQLDLLITESTYATTIRDSKYAREREFLKAVHNCLASGGKVLIPTFALGRAQELCVLLDDYWERMNLKFPIYVSAGLTVQANMYYKMLISWTSQKVKETYTTRNAFDFKNVQKFDRSMIDAPGPCVLFATPGMISSGFSLEVFKRWAPSKLNLITLPGYCVAGTVGHKLMSGKPTKIDLDKDTQIDVQCQVHQLAFSPHTDSKGIMDLVKFLSPKHVILVHGEKPKMAVLKERIHSELGIPCHDPANNETVSISSTLSVKAEASSIKNFKHAYTRMLKSPFQAFEKKFGRQVSDDRVNEGILVMESGKKTKALHQDELLLLLGQQEHEVRFAHCTPIYFGSLDEIHVMDSLSRKSLWLSQLSFKLSTELSDRNVQNLGEYLQVESITLSICSKENCPYRTTDRIKNESTAMVSNNLPLMKWNFMMKNTQGRLVERTVRSNERKARVKAENDIYYREKEVNFGICSLN* Homology
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUU3 (Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CPSF73-II PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 814.3 bits (2102), Expect = 1.0e-234 Identity = 394/594 (66.33%), Postives = 467/594 (78.62%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54YL3 (Integrator complex subunit 11 homolog OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=ints11 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 609.4 bits (1570), Expect = 4.9e-173 Identity = 280/468 (59.83%), Postives = 365/468 (77.99%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3MHC2 (Integrator complex subunit 11 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Ints11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 589.7 bits (1519), Expect = 4.0e-167 Identity = 300/613 (48.94%), Postives = 415/613 (67.70%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CWS4 (Integrator complex subunit 11 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ints11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 589.0 bits (1517), Expect = 6.9e-167 Identity = 295/584 (50.51%), Postives = 405/584 (69.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5TA45 (Integrator complex subunit 11 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=INTS11 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 585.1 bits (1507), Expect = 9.9e-166 Identity = 294/584 (50.34%), Postives = 405/584 (69.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LQW3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G435430 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1151.0 bits (2976), Expect = 0.0e+00 Identity = 581/647 (89.80%), Postives = 586/647 (90.57%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C9L2 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498350 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1142.5 bits (2954), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/650 (88.62%), Postives = 588/650 (90.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: Q6E435 (ACT11D09.9 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=ACT11D09.9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1107.8 bits (2864), Expect = 0.0e+00 Identity = 564/642 (87.85%), Postives = 575/642 (89.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7M0 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484204 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1095.1 bits (2831), Expect = 0.0e+00 Identity = 543/646 (84.06%), Postives = 573/646 (88.70%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FYI7 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448716 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1094.0 bits (2828), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/646 (83.90%), Postives = 574/646 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. NCBI nr
Match: XP_011650067.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II [Cucumis sativus] >KGN63379.1 hypothetical protein Csa_021902 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1151 bits (2978), Expect = 0.0 Identity = 581/647 (89.80%), Postives = 586/647 (90.57%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. NCBI nr
Match: XP_008459147.1 (PREDICTED: cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1143 bits (2956), Expect = 0.0 Identity = 576/650 (88.62%), Postives = 588/650 (90.46%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. NCBI nr
Match: AAS80153.1 (ACT11D09.9 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1108 bits (2866), Expect = 0.0 Identity = 564/642 (87.85%), Postives = 575/642 (89.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. NCBI nr
Match: XP_022986472.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1095 bits (2833), Expect = 0.0 Identity = 543/646 (84.06%), Postives = 573/646 (88.70%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. NCBI nr
Match: XP_022944195.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3-II isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1094 bits (2830), Expect = 0.0 Identity = 542/646 (83.90%), Postives = 574/646 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. TAIR 10
Match: AT2G01730.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor 73 kDa subunit-II ) HSP 1 Score: 814.3 bits (2102), Expect = 7.1e-236 Identity = 394/594 (66.33%), Postives = 467/594 (78.62%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. TAIR 10
Match: AT1G61010.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor 73-I ) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 5.9e-81 Identity = 159/426 (37.32%), Postives = 237/426 (55.63%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. TAIR 10
Match: AT1G61010.2 (cleavage and polyadenylation specificity factor 73-I ) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 5.9e-81 Identity = 159/426 (37.32%), Postives = 237/426 (55.63%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. TAIR 10
Match: AT1G61010.3 (cleavage and polyadenylation specificity factor 73-I ) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 5.9e-81 Identity = 159/426 (37.32%), Postives = 237/426 (55.63%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G190790 vs. TAIR 10
Match: AT5G23880.1 (cleavage and polyadenylation specificity factor 100 ) HSP 1 Score: 154.1 bits (388), Expect = 4.0e-37 Identity = 103/363 (28.37%), Postives = 176/363 (48.48%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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