Chy11G188420 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview


Name	Chy11G188420
Type	gene
Organism	Cucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
Description	Unknown protein
Location	chrH11: 2462134 .. 2475656 (+)
RNA-Seq Expression	Chy11G188420
Synteny	Chy11G188420

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGAAGAAGAGAGTGGAAGATATTTAAGAGAGGGAAATCGTAGGAGCGAAGGAAAAACAGAGCGTGTCGGTTTGCGTTCAGATGAGCCGAGTAGGCGCGTGGCACTCCTTCATGTTGCCGCGTACAACTCGTGGAAACTTAGCCGTTTTCAACAAACAAATTTGGATTATAATTTTGTAAGGAACTTTAATTAAAATCTAAAATACACCATTCAAGTCAACCAAATTTTATTAAATTAGAGTTCTAACATTGATTTTCCAAATTAAAATTGGGAGGCCTCTAAGGCCACTTTGGTATGTTTTCTTTTGCTCTCTTGTTTCTTTCTTCCTCCTTTCATTTTTGCCTTTGTTCTCAGAATTCACTCACAAACTAGTCAAGTCTTATACTCTCAAACTGACTTTTCAGAAGCCATATTTATAGGATAAGTTCCTTGTATGTTGTTAAGGTAGTGTTCACTTAGCATGTTTGAATTCAGGTTCCATTATTAATAGGGCTTGTAGTGGGAGAAATGGGCTCGATTTCACAGATCCTTTGTGCTAAATCAGTTCAATGATATATGTACATTTGGAATTAAATCTTCTCGTGTCCTGTTTCAATGAAAAAAAAAAATTTAATCTTTTTATTGACTCTCCTATATTCAATGCTATAAATTTATTAGTATGAATTTGTTTTCTAATAATTGAAATGCAGTTGTATCACTCCCCATAAAGAGGCTGCAGCAAATTTCTGTGTGAGGTTGATCATGATGATGCAGAAGATGAAATTATCTTGCTTCATTGGTTTTGCTGGAGAAATCGAAGTTTGGCTGGGTGTCTATGTTATGTGTGTAACTGGTGTACGTTTTGTTCAATGCAGTAGTTAATAGGTGTTGTAAGAGACATGATGGGAAGTTTTGCCGTTATAACACAGATTATGTCCTGCCATTTCCGCTATTGAGGAAAAACTACTAGGTGTGTGTACTTTGCTTCACCATAGAAGGAAGTTCAAAACCTAACGCCACGATAATATTTATTTGAAAGTATTCTTACGACTCTAGTTTGTTGAAGTTATTGGATTTGATTAGTTTATGTGTGTTGAGGTGCTATGGTAGTCTTTTTTTTAAAAAAATTATTTAATATGTGTTTAAATGATCATTTATTCCTAAACGTGTTTCGATAGGAATTTGATTAACTTATTGGCTCTCATTAACTTGTATTAACTTGTGTTGTAACTTTTAAACATATTAGTTTTTGAATTGTTGCTATTGATTTAGAAATGTCCCTTCACATCTTAGTTTCTATTGTAGTTCAAAACTCTCCATGCAAATCTAATTTATTTGTTGGGTTTATTTTCACACGGAGTTTGGATGTGAAAGATTCTGACTTGATTTGAATCATCAATTTTAACTCTTTTTTTTTGTTAGAGATTTAATTTATCTGGTATGGTTGGATTTTACATAATACATTCATCCTTTTTATAAAATTTTAATTATTAATACGTAGTTTTATGAAATTTTAATTATTAATACGCGTGGTAAATGAGAAACATAAGTATTTTAAGTTAATAAAAAGTATATTTAAACAAAAAATTAAAATAAATAAATAATCCGACAACTCAAGTCAAATTTGAATTCAGATATAATATTCTAGTTAGATTATTTGGGTTGATAATTTGAACCACTCAAAATTTTGGATGGATTAAAAAAAACATTCCTAATCCAACCAAACTTAATTCATCTATCCTCCTGTTTAAAACTTTTGAAATTTGAACAGTTTGGTTGTCTAAAATAATTTTAGATTAAAAATTTTGAAATTTTGAAATTTTAAGAGTGATACAAAGTTATTATATATATAAGTCAAATTGATTTTTAACTACACAATTATATTTTATTTAAATGAATGAACTTGAAATTACTTTACATTATTAATTATTTATCATTATCATCCTTCTTTATTTTTAGGGGTATTTTTAAAAATAACAAAATAAATTAAAATATTTACAAACTATAGCAAAATTTTGAATTCTATCAATGACTATCCGTGATAGAATTTGTTATAAATTATAAATATTTTGTAAAATTTACCTTATCTTATCTTGGGGTATTTATTTTCTTTTTTTAATGGATTTTTATCTTTTAGTTAAATAGTATAATCAAATATTTATGAGCGAAGGAATCCTATAGTTATTAGGATTTTCCAATTACTTTCTATAAATTCAACACTTCATATACAAAAACCCCCACAGCTTTCTAAGAACAAAGCTTCCAAAATTAAAATCAAACATAAACAACGTTAGTAAATGGGTGGAAGAAATCAAACCCGATCAACAGGAGAACAGCCTTTGATTCGACAAGTTTGGGCTTCGAATTTCGATTCAGAAATTGCCCAATTTGATGAATGTCTGCGATTCCACACCATTCTTACCATCGACACTGAATTCCCTGGCTTTCTTGCACAATCTCCACGGGGTTCCATTGATGATGAGCTTTACAAAGACTTTCGTTTCAATGTAAACCAAACTAAGCTCATTCAACTAGGTATCACAGCTTCAGATGATTTGGGTCAAATTGGCGGTTCATGGGAGTTTAATTTCTCCGATTTTGACTTCGAAGCTGACGCTCATTCTCCATCTGCCATTCCGTTTTTAGAACATAATGGGTTGGATTTGAAAAAATTGAAGAAAGATGGAATACCCATTGCTTCATTCACTAAAAAATTCTTACCTATCATTCGAAAACGTGACATCTTTCGATGGGTTACCTTCCATGGCCTCTACGACATAGGTTATCTAATCAAAGCGATGGGGTTAATCACAGTGTTGCCGAAATCAATGGAGGCTTTCGCAACGGTGGTGGTTAACGAAGTTGGAATTGTGAGGGATTTGAAGCATATGGCTAAATTTTGTGAAGGACTAGAAGATCATGGAAGACTTGGACTTGAAAGATTAGGAAGATTGTTGAATCTAAAACGATTTGGAATGAAACATAATGCTGGATCTGATAGCTTGCTTACCGCATCTGCACATTTTGAGATGGTGGAAAGATTCGACATGAATTCTAAAGTTTGTAATGGCTTTTTGTATGGTTTTTCAGAAACGCTTGAATCCATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATTTGTCATCACACCATTCTTAGATTTAGTCTTATACACATTATTATTTTATTTTTCATTATTTTGCTTTTTATGTGTCCACTTAATTTGGTGGGTTAATTAGTAGACTTCCACTGTTTTATTTGTTTATTTAATTTCACACGAACGTATTGAATCACTTAGACATAAAAAAAAATAGACATTTGTGATTAATGGAAGGAATGGGTTGTTGGGAAGTATAGGATATATATTTAATCAATCGTATTAATTAAGTGAAGCTCAAGAAGAGACATAAATTCATGATTCAATCTTATTGCTAATGCTAAGTTTTCAAAAAAAATTAATTCTTTTAGTCCAGTTCAGATTTGATTAGTTGGTTCGGATTAATCATGTCATTTATTTTAATTAATTCTTGTCTTGAATTAAGCATAATGTTAACATGTAAAAGTTTTATTTCATTACTTGTATATATTAAATTAATATTAACAACTCAATCTCAATTTACATTAGGTGTACAAAATAAAGCTAATTCTTCTAACTTTATATAACTCATTTAAAAAATTATTTTTTAAATTCAACTCAACCTAAAAAGTTAATAATTCAATCCATAATTAGATTCGATGGATGAAGTTTTTGGGTCATTGAATTTTTTTAACACCCTTAGTTATTGTTATTATTATTATTATTCTAAAATTCTCTTCCTACAAATCAAAAGGTCAAAAGAGTTCTTTGGATTTGAACTATTTATATAATAATAGTATAATTTTGAAGTGGATGTGATACATACCAAACCCACCTTTAATGGGTGCAAATGCATTCTCATGTGTTCTTAAAATTCAATTTGAAAATTTGATAAAATTGGTGAACCAAATCAAATTAAAAGGAAAGTAATAGTGTTAGCAATTTCTTGTTAAATAGTTACCTATGTGGTAGATTATCATTTAGCTCAAATGGTAATCTACATTTTTCACCCACTAACCTTCCTTTAATAATTAATTAATTAATTGGTCATTATATTCCCAAACATTCACTCCAATTTCTAATGATTTTGGTTGCTACAACCATACCTAAAATTTTGAGCATAATTCTATAAGAATGAGATTGATTCCCAACATAGAAAACCCATATAATAACACAAAAAGACAGTGGCTTTCCATAAGCTTCAACTACAAGTGTTTATTACAAGTAAAGCTTTGTCAAAGTCAAAGATATTGACAAAGTTAACAACCAGATTCACAAGCATTGAATCCAACAATTAAAACCTAATAGTAAACAATAACCATAGAAGTAATAAATAGAACTCCTGGAAATTTGTTCAATTTGGTATCACTATCTAAGATTTACTTTTTAAGTCTTTTCAACACTCAAATATTATAGTCGTACCAATAGTCTAGTGGAAGTGTGTCTAAATTGATCTAATATTCATTCAATATTTTATCTTTCTTATGAATATATTCTCTTAAATACATATTATTATAACTTAGACTAAAATAGTTACTTTCTTTCATTATCTCTTTTTCAAAGTAAAGTAATTTGCACATGAAATACATTATTAGAAGTAAAATATTCTAATTACGGACTCATTGATTGAGTGCTCAAACAATAGCAATTTGAAAAACTCCCCTAAAAACAGAAATATCCAAATCCCAAGAAGGTTGAATGGAAGAGAAGCATATTGGAGCATTAAATAAAGGGTCCTGTTTGTAAGTTCCCAATTGCAAATTTCAACCATATGCTAAAAACCTAACCATGCCATCATCATACAAGTGTCTTTTTGGGATTGCCATTCAAAATAAACCCCTGTTTTCCTCTCTGGTGGCTCCACCATTCTTATATCAAAAATCAATCAATCAATCAAATTCAAACCCATAATTACTGCCTTCAAATCATCCCCCACGTCAGAATAGAAAAA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TCCTTTTAATAACTCCAAACTCCATTTTCTTTTATTCCTTTCAATATCACATCAAAGCTAAGATAGAAGACAAATATTAAAATCTTCATTATTTAAATAAACAACAAACTTAATTATGATATCATATTCTTATGAAACTTTACTTTGAAAACTAAGCAAAGATTAGACACAGTACTTCTTTTTTTCTCAATCTCAAAATATAAATATAGATCATCATGTTATATACATTATTTAACATCACTACATCAATCATACTTTATAGCCTTTCAAATGTCCATTATTTTGCTTTAAGAATGTATAAGTTTGTGTGGTCCATAAGTTGACAAAGCAAATGAATGAGCTGTGAATATCTAATTAAATTTAATTTTTATATCGTAAATTGCTTTATGGACTTAAAAGATATACATATAAACTTTAATCTATGAAAATCTTTAAAGGCTAACGATACATTGTTTTATTAAATTCAATACCCGATTGGCATTAGGTGAAGAGGAGAGAATATTGAAAGAAAAAGGGTCTTGAGGCCTCGATGCCTCCAACTTCTAAGTAAACCACCTTTGAGAAAGCTTTCTGAGGCATAACATTATAATAGATGAAAATAGATGAATTTGAATGGTGTAAATGTTGTGTAGTGAGAGGCCATGGAGATGATATCGTACTCAATTTGTAGCATTAAAAATTGTCAAGGTGTGGAAGAATGGTTTGAGGTTGAAAGAAAATAGAGTGGAGGGTGGTTTGTTTGGAAAGGGTGGGTGTGGGTGGCATAGGAAGGCGTGCCCGTTTTGTTTATTTGTTTTTTGGGCAAAACGAAGGGAACGCATAACATAACTCTAACTTTTCTTTTTTTTTATGATCCAACCGTCCATTTTCAAATGCGAACTCCGAATCAAGGGTTGAGATCTAGTAATTGAGTGGATCCCACAAATACTAAGTTAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGAAAAGAGAAAAGAGAAAAGATGGTCAAATGTTTCCTCCGTATTTGTCGCTAAGTTTGTTATTTGAATTAATTACTTTCCAATGTAAATTTAAGAGAAAGCGATTGTAATACTAAATTACTTTATTAAATAAAGACAATGCTTATTTATTGAGGGCATAAAATTAAATAAAATGTAAAAAGAAAATTAAAAAAGTGAAATATTTGGATATTTTTTCAAACTAGAATGCCCACAAAATGCCTGTGAATAATATTTTTCATTTTACACCTTGTCTAATAATACTCATTATTATTGGAACATGAGGATCTTCCAAAGATGAAGAGTCACTCGTTTTTTTTAAAAAACTTTTACTTACGTCAAATTTAAGTTGAATTAGTGAAAAATTAGTCTTATCTTGCTCGTTTAGTTAGTGTCTTTCAATCTCTCCCTTTTTGGTTGGTGTTACTCTTGTCCATCACTTGGTGTCACTCGATGTTGGAGAAGAAGAATATGTGTGGGAGATGAGGGAAAACGTGTGGGTGTTGGACGAGAAAGAAGAAGACCATGAGAGATGAGAAAAAGCTACAGTGGTTGACAGGAAGCTGATAAATATCCTAAATCAATATTGAGAGTAATGTTGTAATTTCACGCAATGATGTGACATCATTAAAGAGGCGTTTGAAATTCCTTTAAAGAATTTGGGTCATTTGTCATTTTGGGCATTTAAAATAAGTCTTTTAAACAAATAAATCTTGAACGATTGTTAACAAAATTGAAATAATATAGTTAAGTGTGAGGATTACTCATAAATTATTTAAAGTGAAGGGAGCTATTTGGAACTTCCTAAGAAGGATTAAAGGATCAACAAGAACCGTAAAGGCCAATCTATAGAAATTGACGGTGGAAGTCTAGAGAGTACATACTAAGCTCGACCCCAAGGGTTGACCATTATGGACAAGACATGCATGCATGCCCAAGTGTTTAAACACAACTTTATAGTTTGGATTTGTCGATTAATAATAGTTAAGGTAAACTAGTAACGGTTAAATATTAATTATACCAAAATTTAATTAAATAAGTGATCGTTATAATATAATTGTTTTCTATATAATCAAAATGCCTCAACACAATTCGAGGTATTCTAAAAACCCTATATGAAATATCTATTCTCTAACTCTCTTTAATTAAACTATATATATTGAGTAGATCGTTGGAGTCTCGATGGACAAGCACCAACCTGGTGTGTAAGTTAATGAAAAAGTTTTTGTTGTAGAAAGAAGTTTAGATATGTAAATTCATTAGATCCTTACAGAGTCATAAGGCATACAAGTAGGCGACTTGACTTGGGGGCATTCCTTATCCTCTCAAGATTTAGGGCCTTCAAACATCCCATCATTCTTTAATCTTTGATATACTTACTACATTGTGGGTGTGCATGGCCACCCACGACTTCATATTCAATTGAGGTTGAGGGTGAACTTAAGAGAGGCCTTACTTCGTGGCTCACCTACCTCAAACCCTATTTAAACCTTCATTTAACTATTTTAATTCTTCTTTTAGTCATGGTTGAATATTAGAAAGAATATCTAACTTTATTCAAATATGATTGTAATGCTCATTTTCCTCCCCTTACTAGCAAAGAGGACATTTTGAGGCCCATAACATCTCTTATGTCCATTTCAAATATCCAAATGGGCCTATAAAACCAAACCACAAAATCATCCCCATCCTTTTTGGGCCTCCTTTGGGGCCCATAATTAAATAAAAACGGGCCTACGTAAAACCTTTTACAAGAGGGAATTTTTTTTTTTATTAGATTCAAAATTGGTATTACTAGAAGGAAAAGAAAAAGCATAGTTATATATATATATACTGATTAAAAACATTTAGAAAAAACAGTTCTTCTATCTATGACAAATATGACAAAATTAGTGATATTAGACAGCTATTACAAGACTAGTAAAGGCTTATCTAGGCCCTGTTACCATAATTTTTGTTGCTAGTGCCCTATATATTATTTCTAATTCAACTATCATAGACTTGTAGTACTTGTACAATTAGCCTTTAGATTAGATTATCTACCGACAATATTTTAGTACGATGGTATGCATATGTGTGCCAACTTGACCGAGTAAATAAATAATTTATTTAAATTAATAATGGAATTACTTTTACTTCCAAACTAAGTTATACATCTTATTATTAGTATTCATATATTTATATAGAGGTTAATAGATGATAATTTTAAATTGTTTTATGGATCTTTTTCCAATACAACATAATAAACCAAAATATAACAAAGTTTCAGATTCTATACTGATAGACACTGATTGACTAATATCATATCAATCAACATTTATAGATATTGACTATCAATACTTATCGTTGATAAATTTGAATAGACATCAATATTCTTATAACACGTCACAAAAGTATATATACTTATTCCAAAATTAACCCTAACAAGAAACCATTGATGATGGTTATATGTCATATGTTATTTAATTAATTGTCTTTATGTCTACTTTCTTGCAGCTGAAAAAGAAAATGAACCATCATTACTCATCTTTCATCCAAAACCTCAACACATT

mRNA sequence

ATGGAAGAAGAGAGTGGAAGATATTTAAGAGAGGGAAATCGTAGGAGCGAAGGAAAAACAGAGCGTGTCGGTTTGCGTTCAGATGAGCCGAGTAGGCGCGTGGCACTCCTTCATGTTGCCGCTTGTATCACTCCCCATAAAGAGGCTGCAATGAAATTATCTTGCTTCATTGGTTTTGCTGGAGAAATCGAAGTTTGGCTGGTTTTGCCGTTATAACACAGATTATGTCCTGCCATTTCCGCTATTGAGGAAAAACTACTAGGTGTGTGTACTTTGCTTCACCATT

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGAAGAGAGTGGAAGATATTTAAGAGAGGGAAATCGTAGGAGCGAAGGAAAAACAGAGCGTGTCGGTTTGCGTTCAGATGAGCCGAGTAGGCGCGTGGCACTCCTTCATGTTGCCGCTTGTATCACTCCCCATAAAGAGGCTGCAATGAAATTATCTTGCTTCATTGGTTTTGCTGGAGAAATCGAAGTTTGGCTGGTTTTGCCGTTATAACACAGATTATGTCCTGCCATTTCCGCTATTGAGGAAAAACTACTAGGTGTGTGTACTTTGCTTCACCATT

Protein sequence

MEEESGRYLREGNRRSEGKTERVGLRSDEPSRRVALLHVAACITPHKEAAMKLSCFIGFAGEIEVWLVLPL*HRLCPAISAIEEKLLGVCTLLHHX

Homology

[Close]

BLAST of Chy11G188420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LMC4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G270200 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 80.9 bits (198), Expect = 3.3e-12
Identity = 45/51 (88.24%), Postives = 46/51 (90.20%), Query Frame = 0


Query: 1  MEEESGRYLREGNRRSEGKTERVGLRSDEPSRRVALLHVAA-CITPHKEAA 51
          MEEESGRYLREGNRRSEGKTERVGLRSDEPSRRVA+  VAA  I PHKEAA
Sbjct: 1  MEEESGRYLREGNRRSEGKTERVGLRSDEPSRRVAVPDVAAFTIIPHKEAA 51

[Close]

BLAST of Chy11G188420 vs. NCBI nr
Match: KGN61927.1 (hypothetical protein Csa_006589 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 82.0 bits (201), Expect = 1.46e-17
Identity = 55/88 (62.50%), Postives = 60/88 (68.18%), Query Frame = 0


Query: 1  MEEESGRYLREGNRRSEGKTERVGLRSDEPSRRVALLHVAA-CITPHKEAAMK-LSCFIG 60
          MEEESGRYLREGNRRSEGKTERVGLRSDEPSRRVA+  VAA  I PHKEAA   L+  + 
Sbjct: 1  MEEESGRYLREGNRRSEGKTERVGLRSDEPSRRVAVPDVAAFTIIPHKEAAPNYLASLVL 60

Query: 61 FAGEIEVWLVLPL*HRLCPAISAIEEKL 86
                 W        + P ISAIE+KL
Sbjct: 61 LEKSKFGWFCRSNTDYVLP-ISAIEKKL 87

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Chy11G188420 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Chy11G188420 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0LMC4	3.3e-12	88.24	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G270200 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Chy11G188420 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KGN61927.1	1.46e-17	62.50	hypothetical protein Csa_006589 [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of Chy11G188420 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..26

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Chy11G188420.1	Chy11G188420.1	mRNA