Chy11G187600 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTATGGAGCAATGAGATTGATCAAATGGGGTTTGTTCATAGCCAAAAGGATAGAGAAGATTATTTTCAAAACAGATTGATGGTTGTGCTTTTCTCTCTTCTCTTTCAAAAACTTCTTCTATTGTTTAGCAAACTACTTGCCAAACTTGGCTCAATTGTTGAGTTTTGCCTCAACTTGGTCTCTTCTAATGGTGGTTTTCTTATGCTTCAAGGTTTGACCTACTTTCTTTTTAATTTCCTTTCGACCTATAATTACTTATACAGTTCCATTTTTTTCGTTAAACAATTCTCTTGTGAAAATCGACAAATAATTATCGACTTTTGAGATAAAAACGGGTGTATTAAGCATGTTTTTCTTTAACCTAATTAATCTAATAGAGAGGGTATTTATGGAATTAGGGAGTTTAATTTGAGGATGTGCAATGACTTGCCTTTGTCAAGGGTTTACATGTGCTTCATGTTGAATATATAAATATTATATGCTCATTTAACTCTATCTCTCTATTTTGGTTTGTGCAAAGAAAATGTGTGATAAAAGAATATTGTTAAAACATTTGGATAATGAACTACTAGCTAGAGTGCTTGAGATCAAACTTAATCAAACCAAATCATATGAATTGTTTTAATTTGTAAAGAAGGTTTTAAAATCACATTGGTTCAATTTAGTTTCACACAGAATTCAAACCATATAAGAATTAAAATGATAATTTAACTCAACTTATACCATTAAATTCAAATTTGATTCAGTTTAATAACCATTTGATTTTATAAACACTGTTTCTGTACTTCCACATATGGAGTTTTATATATAACACACACTTTTCTTTACTACTGTTTTCAAAATTGAAGACAATTTTTTAAAAGAGAAAATAGATCTTAAAAATCAAGTGTTTTATGTTTTCAAGATTAAGCTGAGAACTAAATGCACACTGCTCAGCTTACTTTAGGAAAAGCAAAAACCATGAGAGATTAATAAAGATGTGAGATAAACAAGGATACAATTTAAAAAGTAAAAATAAAAACCAAAGCAAAGCAAAGTTTTGAAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAGTAGTTTCAAAAACATGTTTTTGTTTTTGTAGTTTGAATTCAACTACCTAACAAGCATGAAAACTATCGTAAGAAAATAGTGTGTGTTGATTTCTATTTTCTAAATTTATTGTGTTTGAAGGGAAGATGGAAATCCCAAAACCAGAATCAGAGAAGTTCATGTCATTCATTGGACAAATTGACAGAAGAGTTGAACTTGATAGCAGCATTAAGACTGGAGATTATAGATATTTTTCTTCACTTACTGTTATGGCCTCAAAGCTTTCCTATGAGAATCACGCCTTTGTTAAAGTCACTGTCCAAGATCATTGGAAGGTAAACTTCTTAATAATTAACTTCTTAACACCCATCGCCCTAACCTCCCTTCCTTCCTAATTCTCGTTATCAAACAAGTCTTAGACCCCCATTTTGTAACCATTATGTTTCTTGTGTCGAAAAATATAATGGCATTCCTTCCTTGCAATTTGTAAACTACCAATGGTCATGTTTTTTCATAATGTGCAGATGGAATTGATTGGATTCTATCATTTTTGGAACGGTAAGAATTAAATAATAAGCTATATATTTGAGTAAGGTCGAACATCTTCAAACAAATAATAAAGTTTCTTATTTGATAATCAACTTGAAATTTTATTTCAAAACCAACTTATAATAAAACAGATAGCTCATATTATACAGATTTTCAAGAGAATCACACGACGAATGCCTTCATTCTTCGAGATAAAAGATCAAATCCAAACATTATCCTCGTTGTCTTTAGAGGAACGAAATTCTTTGATGCAAATGCATGGTGTACGGATGTTGACCTATCCTGGTACGAGTTTGAGGAGATGGGTGCAATCCATGGTGGTTTTATCAAGTCCCTGGGCTTGCAAAGGAAAATCGGTTGGCCCAAATGTGTAAAAACCGACCCGGACAGACCGGTGGCTTATTACTTCATAAGAGAGAAACTAAAGGAGTTGCTACGGCTGAACCGGCGGGCCAAGTTCATCATCACCGGCCATAGCTTAGGCGGTGCTCTTGCTGCTCTTTTTCCTGCTGTTCTTGCTTTACATGAAGAAACATGGCTTTTAAACAGGTTCTACTTTTTACTTTTTAATTGCATTATTGTCTTGTTTTTCTTTTTTTCTTCTTTTTGAAAGCTAAATTGCATTATCGTGGTTAGTGTTTGAGATTTTCCTTAGTACATGAATTATATAGGTGGGGCTCGACTTCCAACTTTTAGTAGGGTGTGTATAAATCGGATTGGGCCGTGTTGGAAGAAAATTATGGACCAACTCAAATTATCTGGATTCACAAAAAAAAAATGTTTCAATATGCAATAGTCAATCCAGTCTAAAAAATCTGGATTGGGTTGGTGGGTTGGTTTTTTTTCTTTTCATCTCTATAATTTAGACGACTTTTCATATGTTTTTCAACCTGCAATGTGAACAAATTATCATTCAAAGTGCTATGTGATATATATATATATATATATATATATCTTAGGTTTTAGGTTTATATATATGTATTATATACATAATCGGGTTGAATCAGATCAACGTGACCCCTTATTTTGTACAACTTAACTTTTTAACCCAATCCAACCTAACCTCCTTACGATTTTGTGTTAGGTAATCTAAGTTGGTTGGGTTACCATTTTTTTTAACATCCCTAACTTCTAGGAATTGAAGTCATACTAATATCATAGGCAACTATGGATTGGGGGATTGAACCTCCAACCTCTATGTTTAAAGGTTATGCCAATATATGTTTATTATTTTCATCTTTCAAATTTAAATTGTGAATATATTTTTATTTAAATATTTTCTAAATTTTAAATTTCAAATTTCAAATTTTACATTATATAAATTTTTTTACTAAGATAATCATTTCGATTATCTTTAATATTTTACAATCATGACATTTACACAATAATATCGTGTTGAATTTAAATCAACATCATTTAAGAGAAATTAATTGAATAAGAAATATTAGTTCTTATCAAATTTTAACAACATATGATTAGTAAAAACTATTGTATTATAGTTATTAATTTTGTAAGGGGATTTATGTGTATTTGATATTGTTAATGTTTTATAATTGTTTATACATATATATTTTTTAATGAGTTCTTATATATTTTTATTTTTTACCTAATTAAATAATATTTAAACTAAAAATAAGCGAAAATGTTAGAAAAAATAACACAAGAAATGATTAACAAAAGAATTTCTACTTTTGTATATTTTTTCAAGAAACAGGAAACAATAATAGTTATCAAACAATTTTTTTTCTTGTTTTAAGAAAATAAACAAGAAATGAGAAACATGAAACCAGATACAAAAAACGGTAACATTATCAAACATGCCCTAAGATGCTTGAGAAAAACACTTTTCTAGCTAAATACCACAAATCTATAAGAAACTTATGTGTAAAGTGTAAAATCGAACCTTTAAAATGATTTTGAAATAATGAAATGTCTGTTAGGGGTGATTTACACACTTTCAAACATACTCTAAAATGGTGAAGTGAAATTGTTATGGTTAGAAAGAAAAGTTGAGTTTCAAAGTTATTTTTATAGGATTCATACCTTCAAAATATTTTTAATAGGTTTCTAACTTTGAATTGTGTGTTTAAGCAAATTTGTGAGGATAATTGTAAATAATTATATTGGAAGCTAGTTTTGACAAGTTTAAGTTTTACTATTATAGCATGAGCAATGATTTTAGTGAAGTTAGTTAATAGCGAGATATTTATTTAACATAAATTTGAAAGCTTAAGGTGACGTTTTCGAAGTATATGAATTTTTGTCTGTGTTTAAGCATAAACTAAATACATATATACAAATCTAAAATTTATGGATTTTAAAATATCTTTTTATGGTTAAATAAAAAATCTTTATGATAAACAAGACCCACGTAACTTAGTTTCAAAACATGAACTAGTTTGAAATCAACCAAAGAGAGTAAAAACTAGATTGATCTTGACGATCAAATTACCTAGAAGTATAAAAGATGCAGGTGAGATCTACATAATTCACAAGTAAGAATAACCCAAGTTAAACTTGAATAATTTTAAGCATACAACATAGCTAAGCTAGAGTATAAAACTGCAACAAAAAACTTAGCTATAGGCTATAAGAAACCTAAAAAGTTATTGTTGCTGCATTTCCAAGAATATCAAGGATGTGTTTGACACATGATCTTGAAAGAAGGAGTAGGAAAGCATGAAGTTATGAATTCTACTAGTTGTTTGACCTAAGGAGCTGTTAGTGGCTCCCACTACTAAAATGTATCAATTTTATATCTTATCAACTTCTTACATTATGGATCTCATGAGTTCAGAACTCTTTACTCCTACTATTCCACTTCTTACCTCCAAACACCTCCCAAATCTTAATTCTACAAAGAAATTAGACTATATGCTACCCTACATGGTTGCAACTCCAAAGTAAGTACATAGAATGTCATAACAAATCACAAACTTCAAATATTCAAAATGAGATTCAAGTCCATTAGTCAACCTTAAATTGTTTTTGTAATCTTGTGATGCATATATAAATAAAGCTCCACCTTGAACTATTTTAATTAAAGAGTGGTTGCTAATTCATTGATTGATGCTTCATTTTATGTTTATATAATGGAACTTAACTTTGAGTTTGCCATGTGATTATAATGCATCTTAGCAAAATGAAAAACTATCAATATTAATGTTTAATTAATTACATCTTATATACCATTTGGTAATTAATGAAGGCTTCATGGGATCTACACTTATGGGCAACCTAGAGTTGGTAATGACAAGTTCAAAGATTTCATGGAAAAGGTGCTACATAAACATGGTTGTAGATACTTCAGATTTGTTTATAGTAATGACATAGTGACAAGATTGCCCACAAATAATCCAAATTTCATGTTCCAACACTTCGGTACCTGCCT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ATGCTATGGAGCAATGAGATTGATCAAATGGGGTTTGTTCATAGCCAAAAGGATAGAGAAGATTATTTTCAAAACAGATTGATGGTTGTGCTTTTCTCTCTTCTCTTTCAAAAACTTCTTCTATTGTTTAGCAAACTACTTGCCAAACTTGGCTCAATTGTTGAGTTTTGCCTCAACTTGGTCTCTTCTAATGGTGGTTTTCTTATGCTTCAAGGGAAGATGGAAATCCCAAAACCAGAATCAGAGAAGTTCATGTCATTCATTGGACAAATTGACAGAAGAGTTGAACTTGATAGCAGCATTAAGACTGGAGATTATAGATATTTTTCTTCACTTACTGTTATGGCCTCAAAGCTTTCCTATGAGAATCACGCCTTTGTTAAAGTCACTGTCCAAGATCATTGGAAGATGGAATTGATTGGATTCTATCATTTTTGGAACGATTTTCAAGAGAATCACACGACGAATGCCTTCATTCTTCGAGATAAAAGATCAAATCCAAACATTATCCTCGTTGTCTTTAGAGGAACGAAATTCTTTGATGCAAATGCATGGTGTACGGATGTTGACCTATCCTGGTACGAGTTTGAGGAGATGGGTGCAATCCATGGTGGTTTTATCAAGTCCCTGGGCTTGCAAAGGAAAATCGGTTGGCCCAAATGTGTAAAAACCGACCCGGACAGACCGGTGGCTTATTACTTCATAAGAGAGAAACTAAAGGAGTTGCTACGGCTGAACCGGCGGGCCAAGTTCATCATCACCGGCCATAGCTTAGGCGGTGCTCTTGCTGCTCTTTTTCCTGCTGTTCTTGCTTTACATGAAGAAACATGGCTTTTAAACAGGCTTCATGGGATCTACACTTATGGGCAACCTAGAGTTGGTAATGACAAGTTCAAAGATTTCATGGAAAAGGTTCTTGGCATTCCATGGGACGTCGATACAGAAGGGCTAAGAGAATACATGAGCAAATTTGGGGAGTTGGAGGATTGTATTGTTATGAAGGAGAGGTCAACTGGTCGGTCTCGTGGTTTTGGATATGTGACATTTGCAACCGACGAAGATGCTAAGAATGCACTATCAAGTGAGCACTTTCTTGGCAACAGAATGATGGAAGTTAAAGTTGCCACACCTAAAGAGGAGATGAGAGCACCTCCTAAGAGAGTCACAAGGATTTTTGTAGCAAGGATCTCACAAACTGTGACTGAGGCTGCCTTCCGCAGTCATTTTGAGAAATATGGAGAGATAACAGATCTTTACATGCCAAAGGACCAGGGATCAAAAACCCATCGCGGAATAGGTTTCATCACTTTTGCAAGTTCAGATTCTGTGGAAAATTTGATGGCTGATACTCATGAATTAGGAGGTTCTAATGTGGTTGTTGATAGAGCAACCCCCAAGGATGATGATTTCAGGCCCATAGGGAAAATGCCGCAGGGGGGTGGTGGGGGTGGGGGTGGATATGGTGCATACAATGCTTATATTTCTGCCGCAACAAGATATGCAGCACTTGGTGCTCCTACCTTATATGACCATCCAGGCTCAGTTTATGGGAGAAGGGAATTTCGAGGGATGGGAAAAAAGATTTTTGTTGGTAGGCTCCCACAAGAAGCATCTGCTGATGATCTCCGCCAGTACTTTGGTAGATTTGGTCGTATATTGGATGTCTATGTTCCAAAGGATCCTAAAAGATCTGGCCATCGAGGTTTTGGTTTTGTAACTTTTGCTGAAGATGGCGTAGCAGATCGTGTATCTCGAAGATCTCATGAAATTTGTGGACAACAGGTTGCTATTGATTCAGCCACTCCTCTTGATGATGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCATCTGGAGCCAGTGGAACTTTTATGATGAATAGTGCTGCCGATTCTTTTGGCGGCTATGTGGGGCCTATGAGGACTTATGGAAGGATGTATGGAAGCCTGGACTTCGATGATGTTCCAAATAGCACAGGAAACCGTACCCGAGAAAATGCATTCTCCAATATCTCTTTTCGTTCTAAATTTCTTGACTCCTTCCCTTTTATGGGCAGAACCATCATCAGGAAACATACCAGGTCAAGGCAATCCTTGTCCGATGAGAAAATACCAAGTTGA MLWSNEIDQMGFVHSQKDREDYFQNRLMVVLFSLLFQKLLLLFSKLLAKLGSIVEFCLNLVSSNGGFLMLQGKMEIPKPESEKFMSFIGQIDRRVELDSSIKTGDYRYFSSLTVMASKLSYENHAFVKVTVQDHWKMELIGFYHFWNDFQENHTTNAFILRDKRSNPNIILVVFRGTKFFDANAWCTDVDLSWYEFEEMGAIHGGFIKSLGLQRKIGWPKCVKTDPDRPVAYYFIREKLKELLRLNRRAKFIITGHSLGGALAALFPAVLALHEETWLLNRLHGIYTYGQPRVGNDKFKDFMEKVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDVPNSTGNRTRENAFSNISFRSKFLDSFPFMGRTIIRKHTRSRQSLSDEKIPS* Homology
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A1S3ZP85 (Triacylglycerol lipase OBL1 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=OBL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 232.6 bits (592), Expect = 1.3e-59 Identity = 143/369 (38.75%), Postives = 191/369 (51.76%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JFU8 (Triacylglycerol lipase OBL1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=OBL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 217.2 bits (552), Expect = 5.8e-55 Identity = 127/323 (39.32%), Postives = 181/323 (56.04%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5VKJ7 (Triacylglycerol lipase OBL1 OS=Ricinus communis OX=3988 GN=OBL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 179.1 bits (453), Expect = 1.7e-43 Identity = 115/332 (34.64%), Postives = 165/332 (49.70%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W034 (Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RNP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 1.2e-28 Identity = 73/201 (36.32%), Postives = 110/201 (54.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O43347 (RNA-binding protein Musashi homolog 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MSI1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 120.6 bits (301), Expect = 7.3e-26 Identity = 85/233 (36.48%), Postives = 117/233 (50.21%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6K4X2 (Uncharacterized protein OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_014603 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 738.8 bits (1906), Expect = 2.1e-209 Identity = 404/681 (59.32%), Postives = 471/681 (69.16%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LMN9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G285910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 698.0 bits (1800), Expect = 4.1e-197 Identity = 345/345 (100.00%), Postives = 345/345 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C728 (RNA-binding protein Musashi homolog 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497417 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 687.2 bits (1772), Expect = 7.3e-194 Identity = 342/345 (99.13%), Postives = 342/345 (99.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A444ZAA2 (Uncharacterized protein OS=Arachis hypogaea OX=3818 GN=Ahy_B05g079566 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 681.8 bits (1758), Expect = 3.0e-192 Identity = 401/813 (49.32%), Postives = 468/813 (57.56%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7PDY7 (RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein OS=Striga asiatica OX=4170 GN=STAS_06860 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 670.2 bits (1728), Expect = 9.2e-189 Identity = 375/782 (47.95%), Postives = 453/782 (57.93%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. NCBI nr
Match: KAF2283727.1 (hypothetical protein GH714_014603 [Hevea brasiliensis]) HSP 1 Score: 733 bits (1892), Expect = 3.95e-256 Identity = 404/681 (59.32%), Postives = 471/681 (69.16%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. NCBI nr
Match: XP_011649346.1 (RNA-binding protein Musashi homolog 1 isoform X2 [Cucumis sativus] >XP_031737421.1 RNA-binding protein Musashi homolog 1 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN62007.1 hypothetical protein Csa_006754 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 696 bits (1796), Expect = 1.76e-246 Identity = 345/345 (100.00%), Postives = 345/345 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. NCBI nr
Match: XP_008457826.1 (PREDICTED: RNA-binding protein Musashi homolog 1 [Cucumis melo] >XP_008457827.1 PREDICTED: RNA-binding protein Musashi homolog 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 686 bits (1769), Expect = 2.06e-242 Identity = 342/345 (99.13%), Postives = 342/345 (99.13%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. NCBI nr
Match: XP_038877270.1 (RNA-binding protein Musashi homolog 1 [Benincasa hispida] >XP_038877271.1 RNA-binding protein Musashi homolog 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 678 bits (1749), Expect = 2.24e-239 Identity = 337/345 (97.68%), Postives = 341/345 (98.84%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. NCBI nr
Match: RYR11084.1 (hypothetical protein Ahy_B05g079566 isoform A [Arachis hypogaea]) HSP 1 Score: 677 bits (1747), Expect = 1.91e-232 Identity = 405/831 (48.74%), Postives = 475/831 (57.16%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. TAIR 10
Match: AT4G36960.1 (RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein ) HSP 1 Score: 521.5 bits (1342), Expect = 1.0e-147 Identity = 262/369 (71.00%), Postives = 304/369 (82.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. TAIR 10
Match: AT4G36960.2 (RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein ) HSP 1 Score: 521.5 bits (1342), Expect = 1.0e-147 Identity = 262/369 (71.00%), Postives = 304/369 (82.38%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. TAIR 10
Match: AT5G42930.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 298.5 bits (763), Expect = 1.4e-80 Identity = 152/318 (47.80%), Postives = 217/318 (68.24%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. TAIR 10
Match: AT5G67050.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 295.0 bits (754), Expect = 1.5e-79 Identity = 150/316 (47.47%), Postives = 217/316 (68.67%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G187600 vs. TAIR 10
Match: AT1G45201.1 (triacylglycerol lipase-like 1 ) HSP 1 Score: 275.4 bits (703), Expect = 1.3e-73 Identity = 141/314 (44.90%), Postives = 206/314 (65.61%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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