Chy11G185900 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGTTGTGTATCTCTATTCCTTCCTTCTCCGATTCTTCTACCGCTCCTTCCCTATCTCAAACGTATTTCAGTCTCAGTCGCCGGCGGCCTTCCAATTTCATCCACTTTCTTAATTTAAGCCTTCCCAACCGCCCACTATGTCTTTGCCGAGCTTCCAATTCTCAGCCTGGACCGTTCCCCAAACAGTCTGCTTCTGCTTCTTCTAAGAAAAGGAAGAAAAAGGATAAGGGAGATTCCAAGGTTTTTAATCCTACCAATATCGAAGTTGTGGACGATTTTAGCTTCGATGACGCTGGACCCTCTAGCTCCACTTCCAATTCCACTTATTCGTCGTACCATCCTTCGACCTTGCCCAAACCGCCAGCTGGGTTTGTACTAGACGACCATGGAAAGGTCCTCATGGCTTCAAACAAGCGAATTGCTACCATGGTAACATTTCTTTCTCAGTTCCCTCATGGAGGATTTATTTAAAATTTGTATCATTTTAGTGCTTCCCTGTTCACCTAGCCGCTAGTGCCTTTTGATTTTCATGTATGAACGAGAAGTTCAGTTTACGTTGATAATGAATACATCTGTAATTTATAGGCACTCGGTTACTGAATCTAAACTAATCAAACTAAAAGTATGCAGTTAATAAATTTTTCTTATTTACGTTCATCCCGTTTTCCTCTTTACAGGTGGTTTTCTCATTATTCATGGGTTGTTTTATGTATTTGGGTTTGCTAACCTTTGATCAATTGTACTGCCACAAGTGTATGACTGGTTTTTTCATGTATTCAGTTTATTGCTCTAGCTTTCTTTCATAGATATAATGAAATGATACCGATTCTCGGAAAAATAGAAGAGACGGTCATCAGTGATTTAATACAGTATATAATCTCCAGTTGGAGTATTCTTTCCTGTTTCTTTTCTTGTAATTATACTATCAGATCAACCTCAATTGGGGAATCGCCTTCCTCTAGCCTTAGGGAGTGATTTATTATTATTATGATTATTTTACGAATCCTGCTTGTCCTTATCAAAGAAAGGAAATTATATCATTTACTAAATCCTTTACAATTTTTTATTATTGTTATAGTTGTTCTTGTATTTGTGACTTAATTAAATTCTTACTTTTTTTCTTTTCTTTTTGATTTTGCATCTTCAATTTTTTAATTTGACAGGTCGATCCTTTGAATAATTTGCCTCTGGAATGCGTTATAAGAAGAATTTTTAGAAGTTCAAAAGGGGATGATTGCATGCTTCTTTGCCCCGTGGACACGTGAGTGTTGTTTGTTGCTACCAGATCATTATGCTATAGCCTCGACACTTTGAAAGTTTGACCTTTTTTGATATTATTTACCTCAAAATTGCTGCAGGCCTGTTCAAATACTAAAGAGCAAGAATATTGATGGATGGTCAGCTGTATGCTTTCTTTTCATATGGTTAACTTCCTCGCTAGTTTGAGTTTGTTCATGAACTTGAGTGCGGATGGTTTTACAATATTAATTCACATCATGAAACTTTTATATTTCACATTTCTGTATGCTGTATAAGTAAGAAGTTCCTGCATGTATTGTTCATTTGTTTGTCCCTTTTACCATATTTGTTCTATTTTTTTGAAAAGGAAACAAGTCTCTTTATTCTTACAGATGCCATATGAAAGGGACTAATGTTCTAAGTGTTATGATATATATATATATATTTATATTTATATCATATGTCCTTTATTGTAATTGTACACAGTCTCTAGGGTTTAGTTTATTCTCTATATAAATATGTAACATTCCTTTGACTAAACATAATAAGAAATATACTTCTCTGAATTCGAGATTACATGGTATCAGAGCCATTAGGGTTTTGAATGGCCATTAGCTTCCTCCTCCATTAGGTTTGAGTTTAGGTTACCTTCCGCTGACCTTTTGTTGACACCACCCATACCATAAGAAGCCCCACCTCCAGACGCCCAAGTTTGTCTTCGCCGATCGCCGGAAAACACCGCGCGTGGCCTTCACGCGCCGCCGGAATTTCCTTAGTCGTCACCCACGCGCCGGCGCGTGAGAGCGCGTGAGACGTCCGATTTGTCCTCCGTCTTCTGGGCTTGTCTCAAACCATTGTTTCCGCTCAGTCTGTACCATTGGGTCTATCAAATAGCATTCGGGTTCGACGAAAACCGAAGGTTACGCTATTAGTTTTGGGTCCTTTTCCAATTTTGCAACTGTTTGGATTGATTCTCTCTTTGTTTGTGTGGACTACAATCATTTTGACTTCAATATGGCCGACATAAAAAATTTGGTAGTCTCCAACGTTATTCCCTTAGCCTCTAAGATCACAGAACATAAGTTAAATGGATCTAATTATTACGATTGGCGTCGGACAATTTTATTTTATTTGAGAAGTACTGATATGGATGATCATATGACCGAAGATCCCCCAGAAGATGCAAAGCAAAAGAAGGATTGGCTTTGTGATGATGCTCGTTTATATCTTCAGATCAAAAACTCAATTGAGAGTGAGATAATTGGATTGGTTGATCACTGTGAGTCGGTTAAAGAACTTCTGGAATTTTTAGAATTTCTATATTCAGGTAAAGAGCAAGTGCATAGAATGTTTGAAGTTTGTATGCAATTTTTTCGCGCGGAACAGAAAGCTGAGTCTGTCACCAGCTACTTTATGCGGCTTAAGAAGATCACCGCCGAGCTTGGCTTGTTGTTACCTTTTAGTCCTGATGTTAAAGTTCAACAAGCTCAACGAGAGAAGATGGCTGTCATGATTTTTTTGAATGGACTCTTACCTGAATTTGGAATGGCAAAGACACAGATTCTCTCTGACTCTAAGATTTCATTATTAGATGATGCCTTCACTCGCGTCCTTCGCATTGAAAGCTCTCCGACGGGTGTGTCTATTCCTCAACCCCATAGTGCTCTCTTTAGCAAGAACAATAATCCTCGGGCAACTCAGAGGAATAGTATTGATCATCGAAAACCAGATTCTGTAGAGATTGTTTGTAACTACTGTCGTAAGCCAGGCCATATGAAACGTGATTGTCGGAAATTGTTATATAAGAATAGTCAACGATCTCAACATGCTCAGATAGCCTCCACATGTGATATACCAGAGGCTTCTGTTACTATTTCTGCAGATGAGTTTGCTAAGTTTCAGAATTACCGAGATTCATTACAAGCATCATCTTCCTCTACTCCGGTTGCATCCACTGTTGCCCCAGGTAATACAAAGTGTCTTCTTACATCATCTACCAAATGGGTCATAGACTCTGGTGCCACAGCTCATATGACAGGTAATTCTCACCTATTTTCTAGACCGTTGTCCCCTGCCCCTTTTCCATCTGTTACATTGGCCGATGGCTCCACATCTTCTATTCTTGGCTCTGGCACTATTCACCTTACCCCATCATTTTCTCTCTCTTCTGTGTTACATTTGCCTAACTTATCCTTTAATTTAATTTCTACTAGTCAACTTACTCATGACCTCAATTGTGTTGTCATGTTCTTTTCTGGTTATTGCTTGTTTCAGGATCGTGTGACGAAGAAGATTATTGGTAGAGGATATGAGTCGGGAGGCCTTTATCTCTTTGATCATCAAGTATCGCAAGCTGTGGCGTGTCCTGTCGTTCCCTCTCCTTTTGAAGTCCATTGTCGTTTAGGTCATCCATCTTTGTTCATGTTGAAGAAACTTTATCCAGAATTTAGGTCTTTGTCCTCTTTAAATTGTGATTCGTGTCAATTTGCTAAATTTCATCGTCTTAGTTCAAGTCCTCGAGTCGATAAACGAGCAATTGCTCCATTTGAGTTAGTTCATTCTGATATTTGGGGTCCGTGTCCAGTTGTATCTCAAACATGATTTCGTTATTTTGTTACTTTTGTTGACGATCATTCTCGTCTAACTTGGTTATATTTAATGAAAAATCGTTCTGAGTTATTATCTCACTTCTGTGCCTTTCATACTGAAATAAAAAACCAGTTTAATGTCTCTATCAAAACTTTCCGTACTGATAATGCGGGTGAATACTTTTCTCATTCTCTTGGCTCTTACTTGTGTGAACATGGCATTATTCATCAGTCTTCCTGTGCTGACACTCCATCTCAAAATGGTGTTGCAGAACGAATAAATAGGCATTTACTTGAAACTGTTCGTGCTTTATCGTTTCAAATGCATGTTCCAAAAACCTTTTGGGCGGATGCTGTCTCTACAGCTTGTTTTTTTATTAATAGAATGCCTTCCTCTGTTCTTAATGGTGAGATTCCCTACCGTGTTCTTTTTCCTACCAAGAATTTGTTTCCTATTGCTCCTAAGATATTTGGTTGTGTCTGTTTTGTTCGCGACGTTCGTCCTCATCATACTAAGTTAGATCCCAAATCCTTGAAGTGTATCTTCTTGGGTTATTCACGTGTTCAAAAGGGTTATCGTTGTTATTGTCCTACCCTTAAAAGGTATCTGGTTTCGCCTGATGTTGCATTTTTTGAGGATACACCCTTTACTTCATCACCATCGAGTTTGTGTCAGGGGGAGGATGACAATTTGTTTATATATGAGGTTACCTCTCCCACACCATCCTTGTCTATTGATGTGCCTCCTTCCCGCCCGTTGATTTCTCAAGTCTACTCACGACGACCTCCACCACAACCTTCATACTCATGTCCTCCATCAATGCTTCCTTCATCATGTGATCCGGGGCCAAGTGATGATCTTCCCATTGCTCTTCGCAAAGGTAAACGCAAGTGTACTTACCCCGTTTCTTCCTTTATTTCCTATCACCAGTTATCTCCCTCCACATATGCTTTTATTACGTCTCTTGAGTCCACATCTATTCCTAACTCTGTTCATGAAGCTTTATCTCATCCTGGCTGGCAAAATGCAATGATTGAGGAGATGAATGCTTTAGATGATAATGGTACTTGGGATTTGGTATCTCGTCCTGCAGGAAAGAAGGCCATTGGTTGTAAATGGGTGTTTGCTGTCAAGATGAATCCTGATGGAACAGTGGCTCGATT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ATGGCGTTGTGTATCTCTATTCCTTCCTTCTCCGATTCTTCTACCGCTCCTTCCCTATCTCAAACGTATTTCAGTCTCAGTCGCCGGCGGCCTTCCAATTTCATCCACTTTCTTAATTTAAGCCTTCCCAACCGCCCACTATGTCTTTGCCGAGCTTCCAATTCTCAGCCTGGACCGTTCCCCAAACAGTCTGCTTCTGCTTCTTCTAAGAAAAGGAAGAAAAAGGATAAGGGAGATTCCAAGGTTTTTAATCCTACCAATATCGAAGTTGTGGACGATTTTAGCTTCGATGACGCTGGACCCTCTAGCTCCACTTCCAATTCCACTTATTCGTCGTACCATCCTTCGACCTTGCCCAAACCGCCAGCTGGGTTTGTACTAGACGACCATGGAAAGGTCCTCATGGCTTCAAACAAGCGAATTGCTACCATGGTCGATCCTTTGAATAATTTGCCTCTGGAATGCGTTATAAGAAGAATTTTTAGAAGTTCAAAAGGGGATGATTGCATGCTTCTTTGCCCCGTGGACACGCCTGTTCAAATACTAAAGAGCAAGAATATTGATGGATGGTCAGCTGTGAGTGATGATGAAGTCGAATCTCTTTTGCCTGCTGCTGCTTATGCTCTTGCCAAAATACACATGCATTTGGTCCACAGCGGATTTTGCTATACGGCGAGGGGAGCATTTTGCTATTCAGAAGATGACATTTTTGATTTCCGCACAGATGATGGACAAGATGTAGATGGCTTGCCTAATGAGGGTGTAGAGATCACTTGCTTTCATATGGATGGAGCACATTACATGATTTATACGCCATCTGATCCACTTCTTTTTGTTGCTATCAAGGACAAGCTTGGCCAACTAACAATTGCTGATGATGAGCTGTTGGAGGACCCAGCAATTATAAGTGCCATTGACGAAGAGACTGAATTTAATGCACTGGTGGAGGAGGAGGCTGCTCTTCTTGAATCAGTTTTAGGGAAAGAATAG ATGGCGTTGTGTATCTCTATTCCTTCCTTCTCCGATTCTTCTACCGCTCCTTCCCTATCTCAAACGTATTTCAGTCTCAGTCGCCGGCGGCCTTCCAATTTCATCCACTTTCTTAATTTAAGCCTTCCCAACCGCCCACTATGTCTTTGCCGAGCTTCCAATTCTCAGCCTGGACCGTTCCCCAAACAGTCTGCTTCTGCTTCTTCTAAGAAAAGGAAGAAAAAGGATAAGGGAGATTCCAAGGTTTTTAATCCTACCAATATCGAAGTTGTGGACGATTTTAGCTTCGATGACGCTGGACCCTCTAGCTCCACTTCCAATTCCACTTATTCGTCGTACCATCCTTCGACCTTGCCCAAACCGCCAGCTGGGTTTGTACTAGACGACCATGGAAAGGTCCTCATGGCTTCAAACAAGCGAATTGCTACCATGGTCGATCCTTTGAATAATTTGCCTCTGGAATGCGTTATAAGAAGAATTTTTAGAAGTTCAAAAGGGGATGATTGCATGCTTCTTTGCCCCGTGGACACGCCTGTTCAAATACTAAAGAGCAAGAATATTGATGGATGGTCAGCTGTGAGTGATGATGAAGTCGAATCTCTTTTGCCTGCTGCTGCTTATGCTCTTGCCAAAATACACATGCATTTGGTCCACAGCGGATTTTGCTATACGGCGAGGGGAGCATTTTGCTATTCAGAAGATGACATTTTTGATTTCCGCACAGATGATGGACAAGATGTAGATGGCTTGCCTAATGAGGGTGTAGAGATCACTTGCTTTCATATGGATGGAGCACATTACATGATTTATACGCCATCTGATCCACTTCTTTTTGTTGCTATCAAGGACAAGCTTGGCCAACTAACAATTGCTGATGATGAGCTGTTGGAGGACCCAGCAATTATAAGTGCCATTGACGAAGAGACTGAATTTAATGCACTGGTGGAGGAGGAGGCTGCTCTTCTTGAATCAGTTTTAGGGAAAGAATAG MALCISIPSFSDSSTAPSLSQTYFSLSRRRPSNFIHFLNLSLPNRPLCLCRASNSQPGPFPKQSASASSKKRKKKDKGDSKVFNPTNIEVVDDFSFDDAGPSSSTSNSTYSSYHPSTLPKPPAGFVLDDHGKVLMASNKRIATMVDPLNNLPLECVIRRIFRSSKGDDCMLLCPVDTPVQILKSKNIDGWSAVSDDEVESLLPAAAYALAKIHMHLVHSGFCYTARGAFCYSEDDIFDFRTDDGQDVDGLPNEGVEITCFHMDGAHYMIYTPSDPLLFVAIKDKLGQLTIADDELLEDPAIISAIDEETEFNALVEEEAALLESVLGKE* Homology
BLAST of Chy11G185900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E324 (uncharacterized protein LOC103499586 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499586 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 639.8 bits (1649), Expect = 6.2e-180 Identity = 322/329 (97.87%), Postives = 323/329 (98.18%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EW11 (uncharacterized protein LOC111438664 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438664 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 580.5 bits (1495), Expect = 4.5e-162 Identity = 296/331 (89.43%), Postives = 310/331 (93.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E3T2 (uncharacterized protein LOC103499586 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499586 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 577.4 bits (1487), Expect = 3.8e-161 Identity = 286/293 (97.61%), Postives = 287/293 (97.95%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I6V6 (uncharacterized protein LOC111471694 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471694 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 5.0e-161 Identity = 295/331 (89.12%), Postives = 309/331 (93.35%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DXG8 (uncharacterized protein LOC111024390 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024390 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 558.5 bits (1438), Expect = 1.8e-155 Identity = 281/328 (85.67%), Postives = 302/328 (92.07%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. NCBI nr
Match: XP_011649451.1 (uncharacterized protein LOC101207357 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8652000.1 hypothetical protein Csa_016960 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 639 bits (1648), Expect = 8.63e-231 Identity = 325/329 (98.78%), Postives = 327/329 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. NCBI nr
Match: XP_016902634.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499586 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 635 bits (1638), Expect = 2.89e-229 Identity = 322/329 (97.87%), Postives = 323/329 (98.18%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. NCBI nr
Match: XP_038900636.1 (uncharacterized protein LOC120087801 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 587 bits (1514), Expect = 2.36e-210 Identity = 299/331 (90.33%), Postives = 314/331 (94.86%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. NCBI nr
Match: XP_011649452.1 (uncharacterized protein LOC101207357 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 585 bits (1509), Expect = 6.28e-210 Identity = 305/329 (92.71%), Postives = 307/329 (93.31%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. NCBI nr
Match: XP_022932311.1 (uncharacterized protein LOC111438664 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 575 bits (1483), Expect = 1.25e-205 Identity = 296/331 (89.43%), Postives = 310/331 (93.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy11G185900 vs. TAIR 10
Match: AT4G33480.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF3727 (InterPro:IPR022203); Has 348 Blast hits to 348 proteins in 78 species: Archae - 0; Bacteria - 101; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 183; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 64 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 392.9 bits (1008), Expect = 2.6e-109 Identity = 213/333 (63.96%), Postives = 255/333 (76.58%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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