Chy10G184320 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChy10G184320
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationchrH10: 16995399 .. 17000535 (+)
RNA-Seq ExpressionChy10G184320
SyntenyChy10G184320
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGTTTTTTAAATGTTTTTTCCCCTTCTGTATGAATGAACTAAGGATTGAAATGTCAAGGTCTCAGTTAGAAATGTCAATTCAAACAAAAATCAAGTTTCTTAAATAGAAAAATAGTTGGGTGCATTTAGGTTTCCTCATTTTTGCATTGTCCACCTAAGTCTTTAATGTCGCCGTAATAAGAAACTTTTCTTTTTTAAAATTAAAAGATTTTCTAATATATATTTTTCCTTTATAATTGAAGGGACATGAAGATGGGTGTCATTGAATTACTCTCTAAATTTCGTTTTCGTTATTGTTTGAAAATGTAGATTTACTAAAGTGGCCTCAAGTTTGATGTCGATAGTGCAAATTCATGGCAGTTGATGGCATGTGAATAGGTAGGTAGGCAAATAATTTGTTTGTGATTGCCCATGTGATTTAGGTACAAGATCATGCAATCGGAAGTTGTGACGATTGATATCTGGATCGTGTTGCTGGAGGTCACATTCCGGGTAAGTGATGATATCTTCTTACGTCTTTCTCAATCTGGTATCCAAAGTTAAAAGAAACGGTAGATGACTAGTAATTTTTTAGAGAAGATAGGTAAAATTGCATCATTGAGAAAAATATTTACAAAATATAACAAAATTTTATATCCTATCATTGATAAGACACAGATAAACACTGGTTGACATTTTAATATCTACCAAATGCACTTTGGACAACTAATCATTAACTTGTAAAATGAGAATCTGTCGAAAGGGTTTTGGTTTTCAAAATGTTCAAATTTAGTTCTTATACAATTAATTGTCTAACTTTATTTCTTAAAGTTAGATTTTTAAAATATAAATAAATAATAACAATAACTTTCTTTCCTAAAGTTAGATTTTTTAAAATATAAATAAATAATAACAATAACTTTCATGGAAAGAAATTGTGGAAATTTTTTAAAATAGTAGATTTTATAAAATATTTACAACTTATAGCAAATTCTATCACGGATAATCATTGATATCCTATAGTGATAGAATCCAAAATTTTGCTATAGCTTGTAAATATTTTAATTTATTTTGCTATTTTTAAAAATATCTCAAAGAAATATATGATGTGAATATGTTTTCAAAGTTTATAGTAAAATCTTACACATAACAAAAAAAAACATTTAAATTGCACAATTAAAAGTATAGAAACTAAAATTGAACAAACTTTAAAATATATAGAGTTAAATAATATTTTAACAAATAAATAAATGTGAGAGAAGTCCTTAAAATAGCTTCTAGGCTTCTAACACTCATGTTCCTCAATCCAAACGTCAATAGTACATGTCGGTCTCACACGATTAACCTTGTGACGACTGTACATGGCAACTTGTAATTTGCATAATAAAAGATTCTAAATACACAAGTGTATTGCACATTATAAAAGGTTTGGAATGTGTTTGGATATCATATAAATCTACACAAAAGTGCAATAGAGATGGAAACACCAATTATTATAAACTCTATATAGTTGTTATGACGATTTCCAAGGTTGTGGCTATGCTTTCCATGGCGGCCTGATGAAGCGCCAGCCACATATATTGGGATCACTCCCCTACCTCCCCCTCGACGTTCAACAAATCTTGAATTATTGTGTTCTCTAACAATTAATTGCTGTTTAGAATCTACAAAATACAAACATAATTAAAAAAAAAAAAAATACAAACATTATCATGGCTATGATAATTGTCACATGGATTTGATAAAAAAAAAAAAAGCTGACACATTAATTTTTATTTTAGTACATGTTTAATAACTATTTCAAGTTTTTGATGTTGTTTATCAAAAGTAAAAACCATATATGTTTTGATAATTGGTTTTTGTTTTCTGTTTTAAAAACAAAATGTATATTTTTCATTTTTTTTTCATTTGGAATATTGCTTTGTAATTTTAAAAACGTGTCTGGATCAAAAAAACAAAAAAGTAAATTAGTCATTAGATCTACTTCTCTTTTAAAAAACAAAAAACGAGTTACCAAACATGCTCAAGCTTAAAAATATCATACATTAACCATTTTTTTAGCTTATAAATTTACAAGACACATAACTGAACAGTGTTCGAGATTATTAAACAGTTACTTAATATAGGTTTGAAAACCATTTTTTAAGGAATTGAACTCAGTAAGCATAACCTATATCTATACCTACAATTCGCTTTTTGTTTGGTTGTGTATCCTACTAGATTGTTAATCAAAATCCAAGCTAAATTTTGTAAACTAACGAAGATATGTTTTAAGAACTAGATTTGGTTTTTACAATTTGGTTAAATATTCAAATGTTTTTTTTAAAAAGAGTGAGAATCGCCAATAATAAAATGGTGAAAAGACAAGCACATTTTTCAAAACTCAATAATGAGGGCATAAACCTTTTTTCTTTTTGGTATTTGAGAAGTAAACTTGTTTTGTCATTCTTTCTTTACAACCTTCTTCATAAAATTTGAATTCTTAGGCACATTGTACACATAAAAAAACAAAAATGGATATTTTTTCTTTTAACAAACGAATAACAAAAAAAATTAAAGGAGCTTATTTAGAAACTAATGATCAAATATTAAAGATTGTATAAAAAAAATAAACACTTATTAATCCTCAAAACAACGAGATTTGATTTCTCCACTTTCACATATTATGAAATTAAAAAAAAAAAACTCATTTGGACAATAAGTATCTTTAAAAATGAAAAAAAGAAGAAAAGAGAGTGGAGAGGAAATGAACCTATTGTGAAGAGTTGTGTGAAAGCAAAGGAAGCCATCATAGATGAACAAAGAATTACGAAAATGAATGCCATCTCTCTTCTTCTTCTTCCCATTTTTATTTCTCTATTTTTCTCTCTCAATGGAACTAATTAATGGAGGAACTGTACAAAGAAAGAGGGTATTTTCTGTGGTTTATATATATATAAAGTAAAAGAAATTGGTGGGGAAAATTGAAATATGGGTTGGGTCTTATCTCCTGTCTTTTACCTTTCGCAAGTACTTGGAGTGTTTGGAACTAAAAGAGAATCTTTTTAGAAAATAAAATAAAATGAAACTATAAAATACTATTTCGGTCTTTTATTAATTTAAAAGAAGTATTTTTAAAAATAACAAAATAAATTAAAATATTTACAAACTCAAAATTTTGAATTTTATCATTGATAGTCTTTTATCACTATAGCATATCAATCATTATCAGTGATAGAATCTATAGGTTATAAATACTTTATAATTTTAGTTTTGGTTTGTAATTTTATTTGAATAGAAAAAAAAATTGAAACTATTTATGAATTATATAAAAAAAATAGTTTCAATCTTTTTTTGTTACATCTAAAAATTCTCATTTTAATAAATTTTAATTAAATTTATTTGCTACTTCTAGTTTGTTGTTAAGTTTGATTAAAAAAACAACAATAAATAAGGTTTGTTTTAAAAAAATAGAGATTAAAATTTTACATTTAAAAATAGGAAATTGTCAAAAAAAAAAAAAATTACACTCCAAATGTAGTAGGTTTTATCTTTTAGTTGTTTTGTTTTTAAACAAAATAGAGATTAAAATTTTACATTTAGAAGTGGGAAATTGTCAAAAAAAAATTCATAAAATATTTACAGTTTTTTATCTTTTAGTTGTTTTGTTTTTAGTTTTGTTCTACAAAGTGAATAATTTGGTTTTTTTTTTCTATTTTTGTAAATAACCTTTAGAAACAATATTGAAGTTGGAATAAATTTCAAAGCATAAAGATAGAAAATGATAATTTAACTTTAGAAAACTTATGAGAACCTTTTTTTTCTTCTCGTTTTACAGCTGTGTTCTTGCTTTTCGTTTTTATTTCAACAAATCATTATTAGTAGTAATTATTTTGTTTTTAAAAATTAAGTCTATTATTTTTACCATTTTCACCCTGATTATTAGCATATTAGTGGAGTAGAAAAGTTGGATTCTTAGCTTAATTCTAGAAAAAACACAAGTTTTTAAAAACTTTAAAATTTCAAACTTTTACTTGGTTTTAAAAATACTCCAACAATATTATCAACACTAATGGATGAAATTAGAATTGTGAGCATAATTTCCCAAAACCAGAAATAAAAAACTAAATAATTTCCAAAAACCGTACATAGTTATTAAAAACTTGTTTTTACAAAAATTCTTACTTTTTGACTAATTTCATTTAAAGTATATATCTATCTGCTTTCGGCCTTTATTTTAATAAACTACCTTCGTTTTGTTCATGATGAAATTCTTTAAATTATAAAAAGTCAGTTTTTGAACTGATTTGGGAATTAAATTGACGTTTCAGTTATGCTTATTAACTTATAAAAAGAATCACTTTTATTCTCAAATCTTGAAAATAATAATTTACAACAAATATATATATATAATGAGATGAGATAGAAATTAATACACCATGGTTAGTTCTTATGTATTAAAGGTCTTAATTAGTATCAATTACAACATCATTCATGTACATTACCTTGACAACTAACGAATAATTGACTTTAAAGTGATTTTAGCTATGCATTCTTTTAGATAAAATAAATGTTAAAACTATTCTTAATCTTCTATGAGAGATAATGAAAATAGTATTTTGAGAGACTAATATATAATTGTATAAAATAATGAACAATTGAATTGGTCTGCACAAATGATTTTATGTAATGGTAACGAATTGTCTAAACTGATTTACTATAAACCTCATGCTGATTTCCTGTCCCTCTGTTATCCACTCGTCCCCGGTCTCTGCTGTCATCCGCACTGCCACTTCCACTTCCACCGCCGTCGTCACCACTGCGTCTGTCACCTCCAGTACTTCCACTTGCACCCACACCTCCACCTCCACCATCACCATCATCTCTGCCGCCACTTCCTCCTCCACCTCCATCTTATGAAAGGGGCAGTAGAAGAGGGTAAACGAGTACAGAAAGTTTGGTAATCTTAGATGAATTGTTCTTGATTGATTTATTTAGGTAGAGAACATTTTCTTTTATAATGGGAAATGATTTGAACAGAAAAACTTCTATCTTTAACCGTAAAACTGTATAACAACTAAACTGAATCTTTAACAACTAAACTGTTCAAGAAGGCTTTCTTAGTGAGCTCTCTTAGTACATCTGATCTACGCATTATT

mRNA sequence

TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGTTTTTTAAATATTTACTAAAGTGGCCTCAATGGAGTAGAAAAGTTGGATTCTTAGCTTAATTCTAGAAAAAACACAAGTTTTTAAAAACTTTAAAATTTCAAACTTTTACTTGGTTTTAAAAATACTCCAACAATATTATCAACACTAATGGATGAAATTAGAATTGTGAGCATAATTTCCCAAAACCAGAAATAAAAAACTAAATAATTTCCAAAAACCGTACATAGTTATTAAAAACTTGTTTTTACAAAAATTCTTACTTTTTGACTAATTTCATTTAAAGTATATATCTATCTGCTTTCGGCCTTTATTTTAATAAACTACCTTCGTTTTGTTCATGATGAAATTCTTTAAATTATAAAAAGTCAGTTTTTGAACTGATTTGGGAATTAAATTGACGTTTCAGTTATGCTTATTAACTTATAAAAAGAATCACTTTTATTCTCAAATCTTGAAAATAATAATTTACAACAAATATATATATATAATGAGATGAGATAGAAATTAATACACCATGGTTAGTTCTTATGTATTAAAGGTCTTAATTAGTATCAATTACAACATCATTCATGTACATTACCTTGACAACTAACGAATAATTGACTTTAAAGTGATTTTAGCTATGCATTCTTTTAGATAAAATAAATGTTAAAACTATTCTTAATCTTCTATGAGAGATAATGAAAATAGTATTTTGAGAGACTAATATATAATTGTATAAAATAATGAACAATTGAATTGGTCTGCACAAATGATTTTATGTAATGGTAACGAATTGTCTAAACTGATTTACTATAAACCTCATGCTGATTTCCTGTCCCTCTGTTATCCACTCGTCCCCGGTCTCTGCTGTCATCCGCACTGCCACTTCCACTTCCACCGCCGTCGTCACCACTGCGTCTGTCACCTCCAGTACTTCCACTTGCACCCACACCTCCACCTCCACCATCACCATCATCTCTGCCGCCACTTCCTCCTCCACCTCCATCTTATGAAAGGGGCAGTAGAAGAGGGTAAACGAGTACAGAAAGTTTGGTAATCTTAGATGAATTGTTCTTGATTGATTTATTTAGGTAGAGAACATTTTCTTTTATAATGGGAAATGATTTGAACAGAAAAACTTCTATCTTTAACCGTAAAACTGTATAACAACTAAACTGAATCTTTAACAACTAAACTGTTCAAGAAGGCTTTCTTAGTGAGCTCTCTTAGTACATCTGATCTACGCATTATT

Coding sequence (CDS)

TTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGTTTTTTAAATATTTACTAAAGTGGCCTCAATGGAGTAGAAAAGTTGGATTCTTAGCTTAATTCTAGAAAAAACACAAGTTTTTAAAAACTTTAAAATTTCAAACTTTTACTTGGTTTTAAAAATACTCCAACAATATTATCAACACTAATGGATGAAATTAGAATTGTGAGCATAATTTCCCAAAACCAGAAATAAAAAACTAAATAATTTCCAAAAACCGTACATAGTTATTAAAAACTTGTTTTTACAAAAATTCTTACTTTTTGACTAATTTCATTTAAAGTATATATCTATCTGCTTTCGGCCTTTATTTTAATAAACTACCTTCGTTTTGTTCATGATGAAATTCTTTAAATTATAAAAAGTCAGTTTTTGAACTGATTTGGGAATTAAATTGACGTTTCAGTTATGCTTATTAACTTATAAAAAGAATCACTTTTATTCTCAAATCTTGAAAATAATAATTTACAACAAATATATATATATAATGAGATGAGATAGAAATTAATACACCATGGTTAGTTCTTATGTATTAAAGGTCTTAATTAGTATCAATTACAACATCATTCATGTACATTACCTTGACAACTAACGAATAATTGACTTTAAAGTGATTTTAGCTATGCATTCTTTTAGATAAAATAAATGTTAAAACTATTCTTAATCTTCTATGAGAGATAATGAAAATAGTATTTTGAGAGACTAATATATAATTGTATAAAATAATGAACAATTGAATTGGTCTGCACAAATGATTTTATGTAATGGTAACGAATTGTCTAAACTGATTTACTATAAACCTCATGCTGATTTCCTGTCCCTCTGTTATCCACTCGTCCCCGGTCTCTGCTGTCATCCGCACTGCCACTTCCACTTCCACCGCCGTCGTCACCACTGCGTCTGTCACCTCCAGTACTTCCACTTGCACCCACACCTCCACCTCCACCATCACCATCATCTCTGCCGCCACTTCCTCCTCCACCTCCATCTTATGAAAGGGGCAGTAGAAGAGGGTAAACGAGTACAGAAAGTTTGGTAATCTTAGATGAATTGTTCTTGATTGATTTATTTAGGTAGAGAACATTTTCTTTTATAATGGGAAATGATTTGAACAGAAAAACTTCTATCTTTAACCGTAAAACTGTATAACAACTAAACTGAATCTTTAACAACTAAACTGTTCAAGAAGGCTTTCTTAGTGAGCTCTCTTAGTACATCTGATCTACGCATTATT

Protein sequence

FFFFFLNVF*IFTKVASME*KSWILSLILEKTQVFKNFKISNFYLVLKILQQYYQH*WMKLEL*A*FPKTRNKKLNNFQKPYIVIKNLFLQKFLLFD*FHLKYISICFRPLF**TTFVLFMMKFFKL*KVSF*TDLGIKLTFQLCLLTYKKNHFYSQILKIIIYNKYIYIMR*DRN*YTMVSSYVLKVLISINYNIIHVHYLDN*RIIDFKVILAMHSFR*NKC*NYS*SSMRDNENSILRD*YIIV*NNEQLNWSAQMILCNGNELSKLIYYKPHADFLSLCYPLVPGLCCHPHCHFHFHRRRHHCVCHLQYFHLHPHLHLHHHHHLCRHFLLHLHLMKGAVEEGKRVQKVW*S*MNCS*LIYLGREHFLL*WEMI*TEKLLSLTVKLYNN*TESLTTKLFKKAFLVSSLSTSDLRII
Homology
[Close]
BLAST of Chy10G184320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KRE7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G613610 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 71.2 bits (173), Expect = 1.1e-08
Identity = 37/44 (84.09%), Postives = 38/44 (86.36%), Query Frame = 0 

Query: 312 QYFHL--HPHLHLHHHHHLCRHFLLHLHLMKGAVEEGKRVQKVW 354
           +YFHL  HPHLHLHHH HL RH  LHLHLMKGAVEEGKRVQKVW
Sbjct: 42  RYFHLYPHPHLHLHHHRHLRRHVPLHLHLMKGAVEEGKRVQKVW 85

[Close]
BLAST of Chy10G184320 vs. NCBI nr
Match: KGN52183.1 (hypothetical protein Csa_008538 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 4.07e-11
Identity = 37/44 (84.09%), Postives = 38/44 (86.36%), Query Frame = 0 

Query: 312 QYFHL--HPHLHLHHHHHLCRHFLLHLHLMKGAVEEGKRVQKVW 353
           +YFHL  HPHLHLHHH HL RH  LHLHLMKGAVEEGKRVQKVW
Sbjct: 42  RYFHLYPHPHLHLHHHRHLRRHVPLHLHLMKGAVEEGKRVQKVW 85

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Chy10G184320 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Chy10G184320 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KRE71.1e-0884.09Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G613610 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Chy10G184320 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KGN52183.14.07e-1184.09hypothetical protein Csa_008538 [Cucumis sativus][more]
BLAST of Chy10G184320 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Chy10G184320.1Chy10G184320.1mRNA