Chy10G173930 (gene) Cucumber (hystrix) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGGCTGTCTTCTTCTACCCTATTTGCATCCCAAAAAGCCAGGGGTTTCAGCTTTTGGAGACCTGGTATGGCCAAAAGGCCATGTGTCAGTCAAATGAATGACATGTAGTTCCACTGGTTGGGTAGTGGAAGTCAAACCATTAGAAAGCCAAACTTGTCTCAACCGTTTAAATGTCTTCTTCCAGATTTTGTCCATCTTTAGTCTCTCCGGGTTTTTCTCTTCACGAGGGAGGCAGGTAAATCCACTTTGCTGATACTGATATTTTGAAAGATTTTTTCAAGCCTCTTCTGAGTTTTGGACTACGTTGGCCTGATAGCTTTGAGATTGCCGGTTGCATCTTCTTGCTAGTCTCTAAATTCGAATGTTTTCCTTTTGAGAGAGATATTTCGTTATGCTTTGTATTCAGATCTCTTCATTTTGGTTCCGTTTAGTTTCAATTTTTCTGTTGGATTTCGCTTTATTAGCTTGTTCTTTGTGATTGCTTGTTTTTGTCGTTTTCCCTTTTGTATTGTTGGTCGAGTTCATCTTTGGGTAGTTTGTTTGGACGATATTGTCTTTTTCTTATTTTTCTCTTAGTATAATACTCTTGTACTTTAAGCATCAGTCTCATTTACTATTATTAATAAATAGGCTTGTTTTCGTTTCAAAAGAAAATTGTTGGCCATCTGGTTTTATCTTCTGAAATTTTCATATTATTCTTTGTGGTAGTTCCATTTAGTGAATTTTATTCTTGAACAAATCATAACTGATAATCATGTGATTGAAACAAAACTATGAAGTGTATGTTCTCACTGTATCATAGATCATTTCCATCCAATCAGACTAAAATTCAATGCTGTTGTGGTCTTGATGGATAGTGGACCTATCTTATATGTTGGTTTGATGTTATCTATTGCTGTGATCAATCAGACAATCAAAATTTGAAAATTTGAAAAATTTACCCAAATTTGGTTGTGATGACATTGTTTGAATTATGTTACTGATGATAATGACATTGTTTGTAGAATTTAATTCATTAGATGGCTGTTTTGATGTAAATACTTATGAGGTGCATCCTATCATGTTCCCAGGGTGAGACGACACACAATTTCTGTGTTCGTTGGTGATGAAAGTGGAATGATTAATCGTATAGCTGGAGTTTTTGCTAGAAGGGGATATAACATCGAATCACTTGCGGTTGGCCTGAACAAGGACAAGGCTCTTTTAACTATAGTTGTCTCCGGGACTGAAAAGGTGTTAGAACAAGTTATCGAGCAGCTCCACAAGCTTGTAAATGTTCTGAAGGTTACAGTCTTATCTTTTTGGATCGTTTTTAATTATGATTCGTTTGCATCTATTTAGGCCTTCCATTCTTGTAGCAACCATATTAGTAACTACCTCATGGATACTAATCTTTTGATCAGGTTGAAGATCTCTCCAGTGTGCAACAGGTGGAACGTGAACTGATGCTTATAAAAATAAATGCTGAGCCTACATATCGTGCTGAGGTAGTTTATAGGCAATTTATGTCTTCAGGATTTCCCTTATCAAAGTGCACAAAGCCTTGTCATTTGCTTTATTTCTGCTACACTCAGTTTACATTCTTTAATCTTTCGTGATTTTGTTTTGGTTTGCCTTTTAGATTAAGAGACTAGTGGATGTCTTCAGAGCAAAAATTGTAGATATCTCAGATGATTCTGTAACAATTGAGGTGAGAATACAATTTTGTTTTTGACAATTGTGAAATTTGACTTTAATCTGTTGCTAGGTTTGGCTTGTTAAATTGCTTGGGTTTCAAGTGTTTAAACTGCTGTAGTGATTTGGTATGGATAATAATTAAAAAACTTAGGTTGTCAGACACAACAATTACATGGAGATGATCAAGGAGTTCCTTCTCCATTTGGCATTTTTGAGAGAAGGGGAGATTTTGTGGTAAGTTGGGGTTTGTTTGATGTTATTGGGTTCGTGGAAGGACATGAACCATAGAACCTTCTAAGGAGTGGAGTGGGGCCCTTGTGATGTTCGTTTCTTCACTAAGTTCTATGTTTATGTTTTTCTTTGGGTGTTGGTGGTATAATTATTTTGTAAGTAATTGTTAGGTCTTATTTACTTGATTTGAGTCTCTTTCTTTTGCAGTACTTTCTTTTTGTGGGATTGTTTTTCTTGGATGCCCTTGTCTTCTTTCATCTTTCTCAATAAATTTTGGTTCTTTGGAGAGGGGGAAATGAGAAAAAGAAAGAAAGAAACTTTATGTAATCCTAGATATTCAAATATTATTATGCAGTGTGTAAAATGTATCTTCTCTCTCTTATTTTTCTTATAGGGAAAGGGTTCTTTTAAATAGAAGAAAGACCCAATGCAAAGTAGGGAAATACAAATAAGAAAAATATAATTGTTAGAATTTATGAGTTTGTTGTGTGTTGAAAGCCGAAGGACATTTATTTAAGTTGTTTTCCTAGTTATTCTTTCCTTTTTTTTGTTTAGGCTCTAGTTGCCTATTAATTCTTCCCCTTTGTATTTTTCTGTTTCATAAGAAAAGTCTACATCGTGGTTTTTCTCCTTTACTAGGGTTTCTACGTATATCGGTGTGTTTTATCTTTTCATCTCTTTCAATAATAATACATAAATATATCTTAAATACAATGAAAATATCAACAATAAAGGAAATGATCAACACTTTCCCTCTAGCTAGCTTGATATCATCCATAGCCAGCTTGTCAATTAACTTATTGAATTGGCACTTTGGAAGACCTTAGTTAATACATCTGCAAATTGTTCCCCGGAAGATTAGGGATGCATATTATTCTTTGATTAATGCTTAAAATATTTCTTTTTCTCATGTTTTATTTGAGGGGGAAGGGGTTTCTTTCTCACACAAATAAGGAAAAATTCAAAAATAGCAAAAATAATTACAATAAATACAATAAATATATTTAACATAAAAGGAAATAATCAACACTCCTAGTTAAGCTTGTGTGAAGTATCATTCAATGCCTGCTTGTCAATTAAGCTGTTGAACTGCCACTTTGGGAGACCTTTAGTTAACACATTGGCAATTTGTTCAGCTGTGGGAAGGTAGGGAATGCAGATTACTCCAGCATCAATCTTCTCTTTTATGAAGTGTCAATCAACTTCAATATGTTTCGTATTATCATGAAGGGCTGGATTGTGAGCAATGGAGATGACTGCCTTGTCACAATAATTATGTATTGGCATTGTTTGAGAGAATTTTAGTTCTTCTAACAATCTTCTTATCCATATACCCTCACAAATACCATGGGATAATGCCCTAAATTATGCTTCTGCACTACTTCTAGCCACCACACTTTGTTTTTTTACTTTTCCATGTTGTTAGATTCCCCCTCTAACAAAGGAACAGTAGCTTGACGGAGATCTATAAGTGGTGCTACCAACCCAATCGGCGTTAGTGTAAACTTCAACATGTAGGTGACCGTGTTTCTTAAATAATATGCCCTTGCCTGGAGTAACTTTCAAATATCCGAGGATCCTTTAAACTGCTTCAAAGTGAGCTAATCAAGGAGCATGCATGAATTGACTTACCATACTAACTGCAAAGGTAGTATCTGTGCAAGCTTGAGAGAGGTATATAAGTCTTCCCACAAGTCTTTGGTATTTTTCTTTGTTGTTTACCTCCTTCATTGTTGCAACTTGCAATTTTCAATTTTGCTCAATAGGAGTTTCTGTTGTTCTGCACCCTAGTAATTCCCATCTCTTCAAGTAGATCCAGAATATACTTCCTCTCTCTGGTTGACCATGATGCCATTTTGGACCTAGCAAATTCCATCTCTAGGAAATGCTTCAAACTTCCTAAGTTTTTAGTTTGGAAATCATTAGCTAGGTATTTTTCACGATAGTTAGCCTTGTTTCACCATTTCTTATAAGAATAATATCAACATACATTATCAAAACAAATACTTTGTCATTACCAGTATGTTTATAGAACATTGTATGATCAGCTTGACTTTGAATGAATCCATAACTTGTGACTGGTTTTCCAAGTTGTTCAAACCAGACTCGAGGTGATTACTTAAAGCCATATAACGATTTCTTTAACTTGCAAACTTTACCAATTTCGAGTTCCACTTCAAAGCCAGGTGGTAGGTCCATAATTACCTCTTCTTCAAGATCTCCATTAAGAAAGACATGCTTAACATCAAGCTAATAATTGGGCCAATCAAAATTAACTGCAATAGATAGGAGGATTCTAATGGAGTTAATTTTAGTAACGAGGGCAAACGTTTCTTCATAATTAATTCCATAGGTTTGAGTGAATCCCTTAGCAAAAAGTCTGGCTTTATGTCTTTCAACACTACCGTCGGATTTACATTTTATAGTGAAGACATGCATCCCATTATTTTCTTATCCTTTGGTAATTCAACAATATCCCACGTACAATTTTGTTTCAAAGCATTCATCTCTTTCATCACTGCTAATTTCCAATTCAAATCATTTTAGAGCCTTTTGTACGTTCTTGGAACCAATAAGTTAGTTATCTTAGAGGTGAAGGCTTTACAACTATTAGACAACCTATGGTAGGAACGATAGTTTGCAATAGGGTATTTGGTGCAATTACGAGTACCTTTCCTATGGGCAATTGGAATATCAAGATCATCGATAGTGGGTATATTAGGCTGAAGAGATGAAGGAACAAAAGAAACAGGAGATGAAGGAACATGAGAAATAGGAATAGAGGATATGTTACCTGGATCTTTAGAATCATTCGTCGGAGCATTAGATTGGTTGATGTAGTAGGAATCCCGATCAAGTCCTTGATCTATTAGGATTAGAATTAGTTTCTTTTATTTATTAGGATTAGGATTAGTTTCTTTTATTAGTTAGGATTAAGAATAGTTTCTTTTATTAATTAGGATTAAGATTAGTTTCTTTTATTAATTAGGATTAGGATTAGTTTGCTTTTTAATTATAAATAGAGTATTTTGTCTTCTTGTATTCACAACTTTTAAACATTAATAAAATTCTCTCATTTGGAA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Match: Q9FFF4 (Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VAT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 573.9 bits (1478), Expect = 1.5e-162 Identity = 299/409 (73.11%), Postives = 348/409 (85.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SMC2 (Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic OS=Nicotiana plumbaginifolia OX=4092 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 567.0 bits (1460), Expect = 1.9e-160 Identity = 296/369 (80.22%), Postives = 322/369 (87.26%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55141 (Acetolactate synthase small subunit OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=ilvH PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 188.3 bits (477), Expect = 1.8e-46 Identity = 92/164 (56.10%), Postives = 129/164 (78.66%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9MS98 (Acetolactate synthase small subunit OS=Galdieria sulphuraria OX=130081 GN=ilvH PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 184.5 bits (467), Expect = 2.6e-45 Identity = 90/164 (54.88%), Postives = 126/164 (76.83%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KL76 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G013280 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 782.3 bits (2019), Expect = 1.0e-222 Identity = 404/407 (99.26%), Postives = 406/407 (99.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPI4 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491925 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 777.7 bits (2007), Expect = 2.6e-221 Identity = 402/407 (98.77%), Postives = 405/407 (99.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EY73 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439566 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 758.1 bits (1956), Expect = 2.1e-215 Identity = 388/418 (92.82%), Postives = 402/418 (96.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I8P8 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472463 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 756.9 bits (1953), Expect = 4.7e-215 Identity = 387/418 (92.58%), Postives = 401/418 (95.93%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D5Y0 (Acetohydroxy-acid synthase small subunit OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017604 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 730.3 bits (1884), Expect = 4.7e-207 Identity = 378/414 (91.30%), Postives = 392/414 (94.69%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. NCBI nr
Match: XP_004149627.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic [Cucumis sativus] >KAE8648164.1 hypothetical protein Csa_018396 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 776 bits (2004), Expect = 1.89e-280 Identity = 404/407 (99.26%), Postives = 406/407 (99.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. NCBI nr
Match: XP_008450269.1 (PREDICTED: acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 771 bits (1992), Expect = 1.58e-278 Identity = 402/407 (98.77%), Postives = 405/407 (99.51%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. NCBI nr
Match: XP_038886845.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 760 bits (1962), Expect = 4.20e-274 Identity = 403/434 (92.86%), Postives = 412/434 (94.93%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. NCBI nr
Match: XP_023554791.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 752 bits (1941), Expect = 7.12e-271 Identity = 389/418 (93.06%), Postives = 403/418 (96.41%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. NCBI nr
Match: XP_022932952.1 (acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] >KAG6571736.1 Acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 751 bits (1940), Expect = 1.01e-270 Identity = 388/418 (92.82%), Postives = 402/418 (96.17%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.1 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 1.2e-175 Identity = 314/407 (77.15%), Postives = 353/407 (86.73%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. TAIR 10
Match: AT5G16290.1 (VALINE-TOLERANT 1 ) HSP 1 Score: 573.9 bits (1478), Expect = 1.1e-163 Identity = 299/409 (73.11%), Postives = 348/409 (85.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. TAIR 10
Match: AT5G16290.2 (VALINE-TOLERANT 1 ) HSP 1 Score: 573.9 bits (1478), Expect = 1.1e-163 Identity = 299/409 (73.11%), Postives = 348/409 (85.09%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.2 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 2.3e-161 Identity = 292/386 (75.65%), Postives = 331/386 (85.75%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173930 vs. TAIR 10
Match: AT2G31810.3 (ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein ) HSP 1 Score: 558.9 bits (1439), Expect = 3.6e-159 Identity = 293/407 (71.99%), Postives = 332/407 (81.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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