Chy10G173520 (gene) Cucumber (hystrix) v1
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Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATAGGGGATAATCCCGAAGGACACCCGCAGGGTAACTATCCACTAGGAAAACTAATAATTTATCCCCTCAGTCCATTCTATACTTCTTAACAGTCAATTTACAACTCAATCAAACGTCCTAATCACGTGAACTTTCCCCTTAACCTCAAACAACCATTTTTATTCCAATTTAACCCAAGGACAGTCGACACATATCGCTACATCAGTCAGCCACATAAATAGCCCAGCAATCACAACATACGTTAGACAACAAGTTCGCATCAATCCAAACATTTATATAAAATCGTATTCAGTCAACACAATATACAGTAACCTTCAGTCCACACCCAAACACGTAACATAAACATCATCCAAATTCAGTCAGCACAATATACATTAACTTCCAGTCCACATTCAAACATACACCTCATGATCGTTATTCCTCCTCAGTATATCAGTACAAATCATACAGTCAATACATCCAAATAATATTTATTGAGTCCAGTAGAAAGTCCCTTACCTCGGCGTTAGGTAAGCTCCTTAACCTCACCAAGATCCCACTCGAATGAAACCAAACTTCCAATGAAGCTTGCTTCGAAACTTGGATATCCAAGCACCACCTTAATCAAACAACACCCGAACAACGGTTAATAATTAATCCAACCAACAACTCGAATTTGCTTTGAAACAACTAAAATTCATAACTTAAATTTGTTACCCGAGGCACCACTTCGACGATTTACTGTAAAACAATTGCAATGACACTCCACGGCACGCGGCCGCCAGTTCGCGGAACCTTACGTATGGGTCGGTCGACGGTCGGTTTCAAATCCGCGGCTGGAAAAATGGGTGACGTGGCTGGAAGTCACGGCGGCGGCGCGTGGAGTCACGGTGGCGGCACGTGGAGTCACGGTGGCGGCGCGTGGAGGCGCGGTGGCGGCGCGTGGAGACGCCGGGAGGTAGATCTGAGCAGGGGGAGGGGTTTGGCGTTTCGGCTGGGCTCGGTTGGACGGAAACGGAAAGAAAAGGGGCGCGTGGTGGTGGTCTCACGAACGGAACCCGGCGGCCACGGGTTGCTTCCGCGGAGGCCGAACGGCGCGGACGGTTGAGGATGGTTGGATGATGGTGCGGCTGGGTTCGTCGGACGTTGGAACCGAGCGGATCTGGGCAGACGGCGGCTGAGCTTCACCGGTCGGACGAATGGAAGAAAAGAAGGCAGATCTGAGATAAATGGGGGGGGTTTTCGGCTGGTTTCGCGGAGGCCGAAAGGCGCGGACGGCTGAGGATGGTGAGGTTGCTGGACGGCGGCGTGCGGCTACCTGGGCACACGGACGGCTAGAACGTAAGGGAGGAGAGGAAAGGGGTGGCGGCCGGCTGGGAGAAGAGGAAGAAGAAAAAGAAGAAAAATGGAGGGGGGGGGGGGCTGCGTACGGGGGAAGAAGAAAGGGAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAGGAAAAAAAAATATATTTATTAAATAATAATATTTAATAATCCTAATAATAATAATAATAATAATATTTAAAATAATATTATTTTATTATTACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGGCGTTACACATATGTTTCACCACCTTCGTCAATATCACATGTTGTGTGGTAAGAAGAGAGTGGGGGATAGTGAGGTAACATGTCGCCTATCTCATCATCAACACATTTGTAGGGAAAGTCCATCTCGGGTAGCATCACAACAACGAACCACCTTGCATCAACAGGATCTGTGACATAGAATACTTGTCTTCCGTGCGTGTGGCAATAATGAAGGAATCTGAAGAGTGGCCAATTCGGGTAAGGTCCACCAGTGTGTAATTAAGATCGTTCTTCCGAACACCAGCATTATTTTCAACCCAATTGCATTTGAAAAGAACAACATTAAACGTATTGTAGTTGACTTCCCAAATCTCTTGAATGGTGCCATAGAAAGACATGTCACAAACGACCGGGTTTTTGTCCTTCGCACTAGACACTTGCATTGTTGTTGCGAGTAACATAATCCCACTGTTTTGAACCGTTCGATGGTCATCACGAGACTTTGTGTGGTAAGACGTTCCATTAATTATGTACCTGTTGTACGTCATTAAAGCAGTGTGGGGTCCATGTGCAAGCCAACGTATGGTGTTCCAGAGAACCTTTCCTTCCTGTAGTTCACTCATCACCTATTGAATAGAATAGTTAGTCGTTCTAAATATTGAAAAATTAGATGAAACGAAAATGAATTTTGATTGTTCAAGTACCTGATCCCTAAACCATGCACAAAATGATCGATTATGTTCAACTTGTAACCATTGTTCATTTTTGGCTCTTCTGCGATTTTTCATCTTTAATTGATTGAAATGTTGTCTACAAAATGTTTCATAGATTAAAATGGTCCCTTGTGGGTAAGTTAATGGCAGTATATAATCATACGAATGCTTACTCAACGTATGGGTGCACTTCTCCAGTGTTCTGTAAGACATGAAGATGTGCTTGCTTCAGTTGTTGGACATCGGGTCGAACGTATGTTCCTGCTGACAGTTGTCGATCGCTTTGTATGTCTGTCGTTGAATTAATTGACCCAAGTCCAATAGGATCTAATCCAGAAAGAAAATCTGAACAGAATTCAACTGCCTCCTCACATATGCTTGCTTCTGCAATGCATCCTTCCGGTCGAGTTCTATTGCGAACATAACTTTTCAACACTTTCATGCATCGTTCAAATGGGTACATCCACTGAAAATATACAAGTCCACAAAGCTTTACTTCTCTAACGAGATGAACGACAAGGTGAACCATGATTGTAAAGAACGAGGGTGGGAAATACTTCTCAAGATTGCATAAAGTCAGAACTATATCTTCTTGCAATGCATCAAGATCTGAGACGGATAAACTTTTGGCCCAAATCACGTTGAAGAAAAAGCACAATCTACTGATAGAGTACCTCACATTCTTCAGTAGGATTGAACGTATTGCAATTGGAAGCAGTTGCTGCATTAAAACATGATAGTCGTGCGACTTAAGGCCGATCAGTTTTAAGTCATCCAAAGAGACACGACTGCTTATTTGATGAATAACCTTCTGGAACTTTAATTTCTGACAAAGTCTTACAAAACCGATACTTCTCTTCTCTTGACAGTGTATAACATGCTGCAGGGATGTAAATTCTATTACCGGTAAACGTTGGTTCCAATTCTAGTCTAATTTTCATTTCAACCAAGTCCAGTCTAGTATTCATCCCATCCTTACTTTTTCCTGGTATATCAAGCAAGGTGCCCACTATGTTCATGCATACATTTTTTTTCAATATGCATTACGTCTAAACAGTGTCGAACATGCAAGTGTTTCCAATATGGTAGTTGAAAAAATTCTGGTCTTCTTTTCCAATAATCATTGCCACCTTCATTATGCACGGTCTTCCCACGGTCTTCTCACACTTCTTCCCACATGAAAATATCATGTCTTTCAGCTTAAGGTACATGGCCTCCCCTGACAAGGGTTGTGGAGGAATTCCATGCTCTTGCTTTCCATTAATTTTTTTTTTTTTTGTAATCTGTATGGATGATGTCTTGGCAAATACTTCCTATGTCCCATGTATGACATTTTTTTTTCCATGTTGCAATCTTATTGAAGTAGTCTCCTCTCCACATATTGGACAAGCCTTATATCCTTTGACACTAAAATCGCATAGATTATCGTATGTTGGAAAATCGTTGATGGTCCACAATAAGACAGCCCGCAGTGTGAAGTATTCTTCCTTATATGCATCGAAACAACGAACTCCATCTTCCCACAACATTTGTAGGTCATCAATTAAGGGTGCTAAGTACGTATTGATATCGTATCTCGGTTGCTTTGGACCTGATATTAACATTGTCAACATCAAATATTTTCTTCTCATTCATAGCCATGGTGGAAGGTTGTATATTGTAGTGATAATAGGCCAACAACTGTACGTCGTCGACATATCTCCAAATGGGTTAATTTCATCAGTAGACAAACCTAAACGGAGATTTCTCAGTTCTGACCCAAAGGTTGGCCACATGTGGTCAATCAACCTCCATGATGGAGTGTCAGCCGGGTGTCTCAAAATACCATCAACTTTTCTATGTACCGCATGCCAATGCAAGTTCTTAGCATTTTCGAATCGCTTGAACAGTCTTATAAATCTTGGAACTATTGGAAAGTACCACATCTGCTTGGCAGGCACACCACATTTTTCCTTGTTTGAGTTCTTAGCGATCTTCCACCTTGACAAACCACACTTAGGGCACTTGGTCATGCTTTCATATTCTTTTCTGTACAAACAACAATCATTAGGACATGCATCAATTTTTTGGTAACTTAGTCCTAAGGCACCTAGTGTTTTCTTCGCTTCGTATAAGGAAGATGGAATTTCGTTGTTATCAGGTAATAAATCACTTATTATGGACAGTAATTCAGAGAAGCTAGTGTTACTCCAACCATACCTAACCTTCAGGTTATACAATCTCACGAGGGCTGACAACTTTGTGCATTTCTTACATCTTGGGTATAAGGGTTTCTTCGCATCATCAAACATAGTGTCAAAGGTATTGGATGCATTAGAAGATTGTTCTTGAATGGATTGAACCATATTAACTGTATTAAATAAATCGTCGTTTTCATCCGTTTCATCCACTGTATTTTCCATCGTGTTGGTAACGTAATCTGAGTTCAATTGCTCACCATGCCAGAACCATACCTTGTAACTTTTATCAATTCCATTGGCATACAAATGATACCGAACTGTTGAGACATTCTTAAGTAAACGATTGCCTCAATTCAAACATGGACATCTAATTGAATTAGAACCTTTGGCATTACTCAAACCAAATTGAATGAACCTTTCGACTCCTAAATCATATTCTCTTGACATTCTATTTTTCATCATCCATGACTTGTCCAT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CTTTTTGTCATAAATGACATAGCAATTTGTGATTGATTCAAAATTTCTTACTCAACAATCATAGTTGTTGTTGTGATATTTTCAATTCATATTTAGACTCAACTATTATTAAGGTTTTATCTTAATATGATAACTTAGAATCAACTAAAATAAAATGTTAGAAAGATATTTTTAGCAAATCAAATCTTTTGGTTAATACAAATAAATCTTTTGATATTTTAGATAAATTAAAATAAATCAAACATTTTAATATTTTCATAAAATCAAAATAAATCAAAATCTTTACCATTCTCCAAATAGTGAATCTTGGTTTGCAACATAAACATTAGAATAATTTTGATTATAAAAAAAAATTAAGAGGGTGTCTGGGACATAGAGTGGGTTATAATAGTTTGTGATTATAATAGTTTAGTGATTATAATATTCTGTGATTTGTTATAGTTTGCATTTTCATGCAGAAAATTATAGTATGAATTATTATAGTATGTATTTGGGATGCAAAGTATAATAGAAGTGTTATTATAATTTGTATTTGAAGTGTAGATTATTATAGTATGTATTTGAGGTGTAGATTATTATAGTCTGTGTTATTATAATTTCTGTTTGAGGTGAAAATTATTATAATCTGAGTTTCTCACTATTCTTCCTTAGCATACATATATACGGAGGTTTAATTTAAATGTTGTAAATGAAATAAATATTTAGAAATTTATTATACTTTTAAAAAAATTTATTATAATATTGTAGTTTTTAATAATTTTTCTTCTCTCTCCAATTTAGTTATTTTGTAAAAAATTTAAACTAAATTTGATTATTTTGCTTTTTCTACCTTCTCTTTTAAATATTTTGTCAAAATTTAAATTTGGTTATTGCTCCTCCCTTCTTTTTTTTAATACTTTTGTGAAAATTTAAATTTTGCTATTGTCTTCCTCCTTTGAATATGACAAATTTACATGGATATTTTTAAATAATTAAATAATTATAAATTTTTGCCTTTTAAATCAAACCATATTGAAATTTCAATTCTTTTATACGTTATGTATTTTATCTTTTATTCATTTGTCACTAATTTTATGAAATTTATAATTGTATTTTTTAATTATTAAAAATATGATGCATTTTTTTAATTATTAATAATGACACGTAATGAAAAAAATTAAATGTAAATTAAAATAATTTTTAATAACCAAATTACATTAATTTAAAAGATAAAAGAAATATTTAGTTATTTAAATATTATAGTCGGAGATTTATTGTAGTTAAAAAAATATTTAATTAATATTGTATATATTTAAATAGGTCAGATGTTGAAGACCCGACCACTATTAAAAAAAATAGATGTTTGGTGTTCAAAACCAAACATAGGCCCCAACAAATAAGTATATCTTCTTCCTCATCCTTTGATCTCTCTCTTCTTTTTTAATAATAAAATAATAAAAAATTTCTGTTACTTGAAAATAATTTAAATCAATCCTTCATTTTTCTTTTACCTACATATTTGAGATGAAAAATGAAGAATAAAATAATAAATATGTTTAAAAAAATTTTAAAATAGTTTTGAAGACTTTCTCTTTTGGTAAAGATTAAAATAATAAATTTGTTTTAATACTTTAATTTCTCTTCAAGTAAAGATTAACAAGGGAAAGTGAAAAATGAAGCTCCACAGCTTGGGAACGATTTCCCACAATAGCTCCACAGCTTAGACATGCAAACGATCATCTAATAACTAGACGAGCATACGGTTCACGATATAATATTTTATTTGAATTTATATCAAACAATAGTTTAATACTAGATGGATGATATAATTAATTCAAAATCTATAATATTACTTTATTAATATAGATGGAGAGACCAATTTTGTGTAACCAGATTAGCTACTCATGTAGTTAGTCAATATAGGTACATGTTCGACCTTCTTCAACGTGATCATGTACGTCGATACTGAAATTTTAGTTTCTTTATACACTAGTAAACATATATTTATTTATTTCTAATGTAATGTGTGATGTTTCAGATTATTTGGAAGTGTAATGACCCAACTTTCCTATAAGTTGAAGTCATTAATATTTAAATAAGTTTAGTTTTTTGTTTTTTTTTAAGACATTTAAAAGGGAAATTAATTTATAAGTTTGAGGAAAAACTTTAAATAAGAAAAATAAATAAGTAATTAAAGTGATAAATCAAAATATTAGTTCGGGCCCATAAAATAAAAGAAATACATAAAATATTTATACCAAAGTTTTGAAATAAACCAAAAATAATTACTGAAACATAAATGCGGAAAAGCTGAACTATCCCCCATGGCGATCCACGGTCACTTCTTATCATTCGCCAGCTTGCCCTTGCCTCTACCCTTACCTGAAAATTAAACATTTAAAAGAATGAGTATAAATTTATACTCAGTAAGAGTCCCATATTTAGTTTCACTATGTGTTGTTAGTCTCTTTGTTAGAGTCCTGTAATAAAGTACCATGCGCTATGGTGCTCCCGAACGCGCACTATCCAGTAATCCCACCGGGACTGAACTGGGCTCTCGGTGAACCCGAAGGAATCACCCTAAAGGAGAGTCGGGCTATAAGTGATCCCGTCGAATCATGTCTCAATAACTATTCAGACATATATAGGGGAGGACCTTGATGGACCCCTCGTGGTACGACTCTAACCAGCAGACCAACAGAACACTATAGGCTATACATGCTCAACATAATATCAACATCTCAGCTCAACACACATAACTAAAAAATACATATAATCACATCATGCACCAATGGTGCTGCATCTCAATCAAAAGGGGGAAAAAAATCTCTTACCTGGAGATCTGCTAAAATAATTCACTGGTTGACAATCAATTCCTCTCAATACTCAGTCCTAAACATAACAAAATTAACATTAATAATTTTGTCAACCATCACCCTACTGTTTAATTTAAGCAACCAAACTTATCCAAGCTTACCCCAAGATTAGGGTTGAATCCAACACCACCTTAGATGGAAAATCACAGTCCTATTTCCACCAATTTCACGTGAACCTTCAAGCAACCATAGATCAACTTATTCCAAATACCATTTCATTTAAGATAAAAAAAAATATTTAATTGGGTGTACCAAACCCATACAAACTCACCCAAATGGCTCAAAAGGTCGCAAGAGGCTAAACTTGAAGATGGCTCGACTAGAAGAGGCTTCGGCTCGAACGCGGCTATATGGAGACAGACGCGTGCGGCTGGACGCGTGCAGCTGGACGACTGACTTGCAGACGTGTGCGGCTGGACGCGAGCGGCTGGAGGAACGCGACGCAACGACTTCGTTCGGCTCGGTGAAGACGGACGCGTGGAGGAGTTGGTCGGTTGTAGGATTCACGACGGTCGTCGTCGTGCGGAGGAGTTGCGTCGGTTATAAACTGAGGCTTTGTCTGAACACACAGCAGCCGAACGGAGACAACAAACGACGGTGGCCTTTGGGCGGCGGCTAGGGCAACTTGAAGGAAGAAGAAGATGAATAGTAGATAGGGCACGCATCACGAGTGGTATTAAATATATATACAACACTAATAATAATATAATAATACTATTATTATTATTATTATTAAATTCCCCAAATAACTTATCTTTTCCTCCTTCTCTCTCTATTCCAATTAATTTTTCCCTCTCTCTTCATTAATAACCCATTCCATCACCTCTTTTACATTTTTCCTTAATAATTATCTCATTCCATAATATAATTATTCTTACTCCTCCACAAATTAAAACAATTTCACAAATAACACCCAAAATTAAACAAAATAAAATGATAACAAAAATAACCTAATAGTTTTGGGGTGTTACAGGAAGCCTTACAAAAATGTGATTGATAATTTGTCAAATTTTTGTAACAACGGTCAAGATATATGGCAGACCATCAGTTCTCTCATATGTTTTCATGTTGGTGTGTGGTGTTAACCTGATAGGGTGCTCAGACAGTTCGGTCTTAAAAAAAATATCCCAGTAGAATGCAATACTAAGCCACTTCTACATAACATTGACTTGAGATTTACATATCTGTGGTTGCACATTTAGTAGTGCGATGACAGTCTCGTAGAAGATTTAAGGCAAGAGGAGTTTTGATTAAGCAATTTGATATGAATGTGACTCAAGAATATATCCACTGGTATAATAATATAACGAGACTCTACATCACTCGACCAGGAGTAGCCGTGGGTGATCTGGTTCGTACATATTTAAATATTGAATAATTACTTAAATTATTTACTCAATTAAATATTTCTATTTTTGTTTACAATTTATAGAGATCGAACAACACAAGACTTCGTGATGTTGCAGATGATCCACAAAAAATCCTTGATATATGTAATAATAATGAGAGGTACATGGAGCAGATACATAATATGTACGATCTACCTATTGTACCTCTACCAGTTCATAGGGGACGTGTTCGAGTGGAAGAAGCTGAACTCGATGAAGTTTTCCATAATGTGGAAGAAGTGCCTTCTATGACATAGACACAGAGCCAAACTGGTTATGGTACTCCAATGATGATGATGCCAACATTTGGAGCAGGATATTGTGATTCTAAGGTCGGCAGGAAATTATGATTCAAGGTCGGTCCATCATCTTCATACATGGATGTCGGTCCATCAACTTCTTACTTGCATGGACACAGACGTGGCCATGGAGAACATAACAAATATATGTATTATGAAGCAGTACTTGTAGAGGTATTAGATCGACAAGAGTACCAACAAGAACCAGAGAACCAAGAGGAGTCAGAACAACATAGAGTTCAGAGTCGACGACGACAACCAGCTCGAAATCGACGACGTCTGGGTTGTGGAACACATTGATATTTTTTAATCTTCTAAATAAATGTAATTTGGTTATTAAAAAATATTTTAATTTACACTTAATTTTTATTAATTATAGGTCATTATTAAAAAACGATTTAAAAATCCCGAAGGATTGATTATAATATTCTATGGAGAGACCAATTTTGTGTAACCAG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CCGAAGGATTGATTATAATATTCTATGGAGAGACCAATTTTGTGTAACCAGATTAGCTACTCATGTAGTTAGTCAATATAGGTACATGTTCGACCTTCTTCAACGTGATCATCAATTTGATATGAATGTGACTCAAGAATATATCCACTGGTATAATAATATAACGAGACTCTACATCACTCGACCAGGAGTAGCCGTGGGTGATCTGAGATCGAACAACACAAGACTTCGTGATGTTGCAGATGATCCACAAAAAATCCTTGATATATGTAATAATAATGAGAGGTACATGGAGCAGATACATAATATGTACGATCTACCTATTGTACCTCTACCAGTTCATAGGGGACGTGTTCGAGTGGAAGAAGCTGAACTCGATGAAGTTTTCCATAATGTGGAAGAAGTGCCTTCTATGACATAGACACAGAGCCAAACTGGTTATGGTACTCCAATGATGATGATGCCAACATTTGGAGCAGGATATTGTGATTCTAAGGTCGGCAGGAAATTATGATTCAAGGTCGGTCCATCATCTTCATACATGGATGTCGGTCCATCAACTTCTTACTTGCATGGACACAGACGTGGCCATGGAGAACATAACAAATATATGTATTATGAAGCAGTACTTGTAGAGGTATTAGATCGACAAGAGTACCAACAAGAACCAGAGAACCAAGAGGAGTCAGAACAACATAGAGTTCAGAGTCGACGACGACAACCAGCTCGAAATCGACGACGTCTGGGTTGTGGAACACATTGATATTTTTTAATCTTCTAAATAAATGTAATTTGGTTATTAAAAAATATTTTAATTTACACTTAATTTTTATTAATTATAGGTCATTATTAAAAAACGATTTAAAAATC PKD*L*YSMERPILCNQISYSCS*SI*VHVRPSST*SSI*YECDSRIYPLV**YNETLHHSTRSSRG*SEIEQHKTS*CCR*STKNP*YM****EVHGADT*YVRSTYCTSTSS*GTCSSGRS*TR*SFP*CGRSAFYDIDTEPNWLWYSNDDDANIWSRIL*F*GRQEIMIQGRSIIFIHGCRSINFLLAWTQTWPWRT*QIYVL*SSTCRGIRSTRVPTRTREPRGVRTT*SSESTTTTSSKSTTSGLWNTLIFFNLLNKCNLVIKKYFNLHLIFINYRSLLKNDLKI Homology
BLAST of Chy10G173520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BGC8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold222G00100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 4.7e-06 Identity = 30/66 (45.45%), Postives = 33/66 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173520 vs. NCBI nr
Match: TYJ98099.1 (hypothetical protein E5676_scaffold222G00100 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 4.02e-09 Identity = 30/67 (44.78%), Postives = 33/67 (49.25%), Query Frame = 0
BLAST of Chy10G173520 vs. NCBI nr
Match: KAA0054576.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27540.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 50.8 bits (120), Expect = 5.39e-04 Identity = 19/22 (86.36%), Postives = 20/22 (90.91%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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