CcUC11G213750 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC11G213750
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr11: 5787838 .. 5796135 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC11G213750
SyntenyCcUC11G213750
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAAGGTACTTAACACACCTTTCTTAGCACCCATACAGAGTGCTGGGCATTCAATAAATAATATTGTCTGCAACATTGAAGAAGGGTCGGATTTCAAATCTTATTTCCTAGACTTTGGGGGGTTTCTTTCACGTCCGCCTTGTTAAACGAAGAAGACGAAATGAACCCTTCTCCCTCCCTCTCCTTTCTTCTCACTTTTTCTCTTTCTTCATGGAAAATATCACGGCAATGATTGACGCTACATCTGTTTCCCTTCAAGCTGCCGCAGCTGAAGCAGCCAATCAGGCTAAGGCTTCTGCTTTAGCCACCTAATGTCCTCGCCACCTTGCCGGACACCGATCCTATCACGACGCTGCAGCTGCCGCACCCGACCTCGCTATAGCCGCTGCCATGGCTGGCTGCCACCGCAACTGCAAATCTTGCTAATGTTGGTTTGTGATTACAGTTTTTATAAAAGTTTTATCCTAATTGTTTTCAAGTTGGCATTCTTTATAGCTACCTACTTGAAAAGTAAACATTCAGAAGATGATTAAAAAAATTAAAATTAAAAAAAAGACTTAACTGATTTTGTGATGCTGTGGATGAGATGATCCCTGGAATTAATGAATACTTCTTACTTCTTGAGAAGATATGATTTACAGATTATATAGCTTTCTTGTTTATAAAATACTTATACTGAAAAGCTATATGATTTACATTTTCATGGTTTAATACTTTAATTTCAAAAAATTTAACACATTCTTCTTTATGCTTTGAAAATTTGCTTTCAACTTCTCAAACTAATATCAAATGAATATGGCTAAATCCTCACAAATTTAGTCAAAATAAATCTTAATCTTTGAAGTAAGTGTAACTGATAGTCCGCACACCCTTAGTTTGGGATTGCTTTAATAAAATTTAATTTTAAATTAAAAAAAATAATAATAATTACTATGTATTAAAATTAATACTAAATTTGTGTAATATAGGTATATGCTAAAAGCAGATTATCATTTAAATTATTGTTTATTTTTGTATTTAATTTATAATTATTTGAAAATATATATGATTTGCATAATAATGTTTAATCTAAATTCTTTTAAGAAACCTACTGAAAATTTCTTTAAGGAGCTGTTAAATAAACTAATGTGAGAAAATAAACTAATGGAATAATAAATTTATAAGGAGCTGTTTGGCATGCTAGGTTGAATTCATATGTCTGTAAAATTTAAATATCTATAGAGTTCACGTCTGAATTTGGGATATCAGTGAAATATCAACCTTATCATCCAAATCAGAATCCCATTTCTTTAGATATCAAGAATGTTTTTCTACATGGTGATCTCTATGAAGAGGTGTATATGGAGCAAGCGCTTGGCTTTGTTGCTCAGGAGTCGTCTAGTTTGGTATGTCGATTACGGCGTCACTTTATGGTCTGAAACAATCTCCTCATGCCTGGTTTAGAAGTTTAGTACTATTGTACTACTGCTGTTTTGGCATGAAAAGGAGTGAGTCCGATCACTCTGTGTTCTATCGTCGTGAGTTTGGACGATTACTTAGTGTTTGGATGTTATATTCATATGTTATGGGTATCTTGAGTTTTTTTTACATAAATAATATGTTTGTATGATGATTATTTTTGTTTGAAATTTTTTTTATTCAATAATTCTACTTATATATATTTTTTAATAAACTATAGATTGCACTTTTTTTTAAGCACACATATTGTTGGGAATTTTGAGAAATGGGGTTTAGGGTTTACTTTTAGATCATGTATTTCAATTTTTTTTAAAAAAAAAATTTAAGCAATGATTTTACAAATTTGTGCATGATGTAACATTTCTAATTAAGTCATTTTTATTTTAACACTTTTGATAAAAACTTTTTAAAATAAAACACTCATGTGTTTAATAATTTTTTTCTCAGAAGCGTTTTTACATACAATCAAGGATGGATCAATGAAGAGGCCAAGGGGAGCACATGGCCCCCTCAAATTGTGACATTTTACATATTCGTATATTGATTTTCATTGAATATTAAAATTTTGTAATTAGGGTTAATATGATTTTTTGTTTGATAAAATTCATCAATTGGACTTTGCTTTGGTGGTGGAAGAAGCATAGATTTTTACTCACTTGAAAATATTTGAAAAACTTAATTCCATTTTAATTTTCTCGCATATGCATATATAAATATATAAATATTTTTTAATTTTTATAAAATTACTTTAAAAAATTGATTGAATAATTTTTGCTTAAATTTAAATAAAGGTTAAAATACAAGTTTGAATTTTAAAAAATTGTTACTAATAAATCCCCAAACTTTCAATTTGACCATAGTCCCTTCAAATGTCTTATAAATCTATAAACTCCAGTTTTATATCTAATACACTTATATATATTAAAAATTAATTGTTTTATAAGACAAAAGAAATAGTTTGTGTTTTAGTTATATATATATATATAGTTTGTGTCTAATAGTATTTTAAGCCTCAAATTTTGTAGTTAAATGATAAAATAGTTTTTAAAAAATGTGTAGCACAAATTTAAATTTAATGTCTAATATAACATTTAATTTTTAACATTTTCAAATATGTAAGAGACCTATTAGATGCAAATTAATATTTTAGAAATTCGCTAAACACAAAAATCAAGAATTTAGGAACCTATTAAACATTTTTTAAAGTTTAGAAACTATATATATAAACGAAAAATTTAGAAGTTTATAGACTATACTAACTTTATATATACATTCGTGCCCCCGTAAATATAAATATTTAGAAGTTTACGGAACTTACGTACTTTTGTGTCAACAAAGTTATTTTTATTGACAACTTTGTGTGTCAACTTAAATATAAATATTTATTGATGTTTTATATGTATTTTTAAATGAATAGTTATTTTTAGAGTTTAAATCAAGGTTTGATTGACGGTTTTATATCACGAGCGTCAATGAAACAAAAAAACTCATTTGTCAACAAAACTTAACTTTGTAGTAGCCACAATTTAAAATAATGCTCATCGTAGTTGATGGAGTGCCACCGTCGAAGGTCGCTGGAGTTGGCCATCAACAGTAGTGGTTGGATGTTGCTAGAATTGATCGCAGGTAGTGGCGTCGAAGTTAGTTGTCGAAGGTGGTTGCTCTGTCAGAGGTAGTCGTCAGAGTTGGTCATTGGAGGTGGTTGTCGAATTGACCCTCGGAGGTAGTCGCCAGAGTTGGTCGTCACAAGTGGTCGTTGGAGTTGAGCAACAAAGCATCGATGGTGATGAGAGGTGATTGCATTAGCAGTGGACATGATATAAAATATCAGTGACATACAAAGTCGACTGCAAAACAATGAATTGAGTTCATATCTCAATTCATCTCATCTCATATCTCACTTTCTTAGCACAAAATTTTATTTAAAAAAAGGTTGCATTATTCTTGACAGATATTTGCTGTTATTTTCCTTATTCGCACTGAATGAGTTGGCAACTAGATCAAAAGTGTGGGCAAATATGAACGGTTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTAACATATACATTTTATAAATGAATAAATATTTTAAAACTTAAAAACTTCTGAAGAAATATGGAAAAGACTTTGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGGGATATACAAACCAAGGCATTCTATCTTCTTGGGAATGAGATATATCTTTTTATTATAAACATCTAGATTTGTATAAAAAAAAAAAAAAAAGGGATATACAAACCAAGGCATTCTATCTTCTTGGGAATGAGATATATCTTTTTATTATAAACATCTAGATTTGTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTTATACAAACCAAGGCATTCTATCTTCTTGGGAATGAGATATATTGCCTTATATAGTTTGTAATAGTTTTTTATACAAATAACTTTTCCTTGTTTGCGTTCTTGTTTTCTTACCCCCTCAAAAGTATGATATTTAACTTTTTGCTGACGTTATGGGGCAATTTCCACCTCCAAAGGCTCATTGCAGTCTGGTTGAACTTTCCAGTACAACGGTGGATGGTCCCTAACCCGATGACACATCGTAGTCTGAACTTCACCTTTTAGCGGTTGTTGCCACAAACCGTCACTCACGATAGGGAGGGTTAACTCAGGCCAATGCATTTAGTAAAGTCTTGTCCTGATTTCACTACCAGAGCTCAATGTTTACATTTGTTCACCGTTGACGCACCTTCCGATCCCGATAGGGATACCCCACCTAGCTAGATCAAACCTGCAAAGTCCAATCTCGATTTTAAAAAGAAAGTGTGATATTAAAAATTGAACTTAGTGTGTAAGGAGAAGTTTGATTTAACAAAGGATCTCACTATGGGTACGCTTATTACCTCTATCCCCGTTGTTCACTATTTCGATTATAAGTTAAAGGTTGGCTACACGTTGACTTGTTGTGTCCTGGCTGCCCACACCTACTGCACTTTTGGATTGGACAGTGTCCTCGGGCAAATTGAGACGTGGACTGCGATCTTTGGTGGTAGGATAAAAATTCCATGTACCCTGGTGGTTTCTTTCATTTAAAGACATGTCCCATCATGAATATTGGTTCTACATAGGATAGGACGAGGGACTCCACCCTATACTCTATACTCTCTACTTTACTTTACTTTACTTTACTGCAAAGAGTATATGGGTTAATGTTCTTTGATCTTGAAGCGACTATCACATTAGAGTATAAAATTTCAAAATAGTTAGAACTCTTTGCATGTGCACTGATAGGTGTGCATGTCGACGATACCATCCAAGTAATTGTCTTTCACGATGTACGTATGACAGTAAATTGGGCTTACGTGGTACTATCTACCCTTCTCGAACTCCTCAGATACACAAGTTTTCGCGTCTTTCGAATGAGAAACGTATAGGAGGACCATTTGTTTCTCCGTTCAAAGAACCAATGCTGAAGTTCTTCCCTGACAAATTCAAGTAGTGGTATAATTGGAATCCTTCTCGCTTCAGCTGTAATGGAGTTGAATGCATTTCGCACCATTGCTTGTCATATTGTCGTATCGTTTTGTACGCTGATAAACCCGAGTCCATTTGTCCAAGCCAACGCTCTCCAGATAGCGTGTAACAGCCCCATTCTTGAATCCACATATATAATTCTTCCCAATACATATTGAATTGTAATTCTCTGGACGTTCTTGCTGCATTGTTGAAAAACCTTGAGGATTCCACTATCAATCCTTGGTGTCCTTTTTGTAGGAAGAAGGAAGAATTTGTGTGTCATGCTTTGTTTGGTTGCGGTCGTGCTAAAATTATTTGGTCCTATATTTTTCCTGACTTCAACAGAGGTTTGAGCTGAAACATAAAGAGATTATGTTGATATCTGGGTGGAGCTTGCAAAGGTGTTTGGATGCTCAGGAGCTGGCTCGGACTTGTATTTCGACATGGGCGATCTGGGGGGATAGAAATAAAATTTGTTGTGGATTATGAAATATGTTGTTGCCGGTCATTTGGCTTTGTAATTGTATTTTTTGGTTTAAAAAAAAAAAAAAAACCATTCCTTCTTTCTCTGTTTTGCTCTTTCCTATTATTAGTATTTTATTTTTTTTATTTTTTTTTCAAACCACCAAATATGAAATGACAATTATACCCTTCAGATGTCACTGATTTTCCTTTTCGCCCTTATTATCCGTTATGAAAAATTAAATTAGTAAATAAACATTCTATGTTCTTTTAAACAAGTTAAAAGTTTATTAATTATTTTATATTTATATTCATATTATATACATTTTGTTGCTTATTTTTTTTCCGTGTTTCATGAACTTTTTTTACACTATGAGAGAAATGTTGATGTACCTCTTATTTTCCAACTAAAGAATAAGAATATGTTTGCTTCTCAACTTATAAAGTGATCTCTAAGTTAAGGATGACTCAAGAGTCTCAAGTAAGAATAAAGGCAACCAATAAAGTGATCTCTAAGTTAAGGATGAATCAACAGTCCCATTAAGAATAAAGGCAAGTTTGATTTTGATCAATTGATATGCTTAGAATAAGAAAGATCTGCCGCGCTTTAAGTCCATAAAGAGTACAAATACTTGTTCCATTTCAAGTATGAAGCAGCACCATGTTTTCATCCTATTCTGCTAGTCCTCTGTTAACATCACCTTTGGCGTTCGACGGACCGATAACCGCCAGAATCACGAGGCCACCCAAGAGAACAATGAGGACACCCAATGAATTTATCAGCAAGGCCTCATTCGAATAGCGCAATATTACCTTGCTGGTTTGAAGGAATGTAGCTTTTTCTAACAATCCAGTAACAGTTGTAGCAATTGAAAGGCCATATATGTAAATGCCAAAGAAAACGTGCCATGGCAACAGAGTAGCTCTGCTGTTTCTAGAGCCACCTGGGTACCAAAAGGTTACAAAACCTGCAGACCACTGTTCAAATGGAGTCGTCCTAATGAATTAGAATCACGTAGCTCAACAGGCGGGCCAGAAAGTAAATCATACGAGTGGATATTACGATTTACGAACCTGGATGCCAAACAGAAAGATAGAAACTAAGCCCAACCATGAATGTAGACTGTAAAAGTTGTCGATTCCTTTGTCATTGTGGAACTTCAGGGCAGCCCATATGCCAATCAGGCTTAAAAAGAATGCAATAAATTGGAGTGCAAGATGAACTAGTTTTCTAAAGTTCTTGGTTCCTGAAACTGTCTTGTATGCTAACATTGCTGCATCAATACATCTAAGAATGGTGAACAAAATCATTGAAAGCACCAGCATTGTAGGAGAATAACTCAAAATTAAGTTTGCAAATGATATCAGAATACATATTTCATAAATGATTCAAAACCATACCTTTAGCTGATATTGTATAAGACCATATTTCCTGGACAAAACCTAAAACCTACACGATGAATGCCAGGAAATGTTTCGTACTGTTAAAGAAAACCTTGCCCACTATCCTAGTTTTCTTAAAAATTGTAAACCCCAAATATTAAATGCAGCTGCATTCTCCCTCTTTTGTTTCCATTATCATCAACTTATAGTTTTTTGTTTTTTAAGTATAATAGGGGTGCGAGGATGATCACTAAAACATACTATATATCAGTTGAGTTATGCTCACTTTACCATCAATATATGGTCTTTGTTTACTATAAAAATAAATATTATATATATATAAACCCCACTCAATATTATAGTAACTAGTGGGCAATAGTTCCAATCTCCTTCGTACACTAAGGAAAGAAAAAATAGAAATGTGAACAGATTTAAAACTACTAATTCCAACTCTGCAATTTTTGTGATTTCTATTTAGCAGAAGGCAAAATAATGCTTTGTTCTTTTGTGAAAGCCTTTCACACCCCATCTTTGTGCCAATTAGAAGAGGTTCTTATAACTTCCTAAGTTCGGGGTTCCCCCCCCCCCGCAAATGTAATTTCATTTATTCTATATGCATTTTGTTTCCCATAAAAAAGAATTTGTGGTTTTTAGCTTTAACAAAGCAGTATTATATTTTCACATAGTCTACACATGTATTCAAATTGTCAATATAGTCAAACCACCCTCGAGGAAGAATGCAAAACTGAGTAAACTAATGCTTCAAACTATAAGTTAAATCCAAAAAGAACATATAATTACCTTCACCATTAAGAAGAATAAGTCCAATCACCATAAGAACAGGATGGACCTACAAAGCAGGAGCAATTTCACCAAATAAACAGGAAAACAAAAGGAAAAAATAGAATTAAAGGCAATGTTTCTATCTAAAAATACAAGATCATCAGGTATGTTGTATTTAAGTTTAGCCCAATTCTGAGACAAACAAACAAACTCCACTGAGATTGCCATCATATAGAAACTAAAACAACACTAAATTAATTTCAAACACGTAAATTCAAAGTCCAAAGCAGAATGAAATGGAAAACTGAATTAGTAGATCCAGTGAAGACTCATGATCATCAACGAACTCAAGTCCTATCAAACAAGCGTATCAATTTAAAAAAAATGGTAAAATGAGAAGAAGAAAAAACAGACAATAGCAGAACAATTTGTGAATATAGAGGAAGTAGGTAATTACATTGAAGATGTGATCCTTGTTTTCTGAGATAAGTGCTAATCCTCCACGGAAGTGCAAAGTCCAAATGAACAGAAGAGCTGCCACAAGCATCCCGAGGACTCTGACAGCCATGAAGATCGGGAACTGAACCAGGGGAACCGCCATTGGTTCTTCAGCGGAAGAGAGGGTGGAGGAAAGAATAGGAGTATTAGGATCTTCAATGGTGGAAATTGTGGCCAAATTGGAGATGAATTTGAGGTGCGTTAA

mRNA sequence

ATGGAAGTGCAAAGTCCAAATGAACAGAAGAGCTGCCACAAGCATCCCGAGGACTCTGACAGCCATGAAGATCGGGAACTGAACCAGGGGAACCGCCATTGGTTCTTCAGCGGAAGAGAGGGTGGAGGAAAGAATAGGAGTATTAGGATCTTCAATGGTGGAAATTGTGGCCAAATTGGAGATGAATTTGAGGTGCGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGTGCAAAGTCCAAATGAACAGAAGAGCTGCCACAAGCATCCCGAGGACTCTGACAGCCATGAAGATCGGGAACTGAACCAGGGGAACCGCCATTGGTTCTTCAGCGGAAGAGAGGGTGGAGGAAAGAATAGGAGTATTAGGATCTTCAATGGTGGAAATTGTGGCCAAATTGGAGATGAATTTGAGGTGCGTTAA

Protein sequence

MEVQSPNEQKSCHKHPEDSDSHEDRELNQGNRHWFFSGREGGGKNRSIRIFNGGNCGQIGDEFEVR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 7..30
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..46

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC11G213750.1CcUC11G213750.1mRNA