CcUC11G208460 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAATTTAATTTTTGAGAAACACACAAAGACGAGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAACCTCTACAGTCGCCAACTTTTGTCATCGCCTTTTCTCGTCGCAATGAGGCTCTTTAGCTGAATACAGCCATTAAACGACCGTTGTTTTCAAATTGGTCAGTAGCCAACTGCAGTTTGCGAACAAACCCTAACCAAGCAATTGGAATTCGGAAAGGCAGCAGGATGATTGTCAGGACTCCTCCACCGAAGAAGCAGCGATCCGATGTTACGTCTGTGCCCGATTCCTCATTGGCAGGTGCCTCAGATTTACCGCTCGTTATCTATGAAGATCCTCTTCCCTTGGTGCCAGCAACAACACAGCCAGGCTTGTCGCACGAGCCCTCTGAGCACATGCTTTGCACTTACCAATGTCGCCAAATGGTTCGGAATATTACTTCCCTTTGTTCTTCTCAAATCTGTGTATTGTTATTGATACATCATTTCGTAGTCCTGTTATTTAGTGAAGTTCATTAGTTGTTCAAAATGTTTGATGTTTCTGAACTCTATTGGAGGCATACATGCGTAGATGTTAACCTGTCTAAACCCAATAACTATTCTGTCGAGATAGTGCTTTGAACAAACTCTTGAGTATCATGGTCTTCTTCTAGCAGGTAGTCTGATAGCCATGTGCTTCTAAATCGTGTTGAGGAATAAGGTCGCAAGAAAACTCCCAAAATAGGAGGTGTTCATCTTAAAGGAAGGCGAACTCCAACTAGGTTGTCCAATTTGACATTTCCACCCATTGCGTATGTTAGCTAAGTTACATTTTAAATCAGCCCTGGAATTTGAGCAGATCATGAGATATTTTGGGTAATTTAGAGGGAGCAAACAGCTGCCTCTTTCCCGATAGTTGTTGAGGTTTTTATTTGGAATTTGATACTTTGTGGCATGGCTATCTCTAACAAGTACGGTATTGATCGGATTGGTTGGTCCAGTGACTCTTCTTCTCTTGGTAGTAGTAGATCATATATCATTATTCTTTTGGTAGTAAAGCCTAGATTCTCTAGCTTATTGCAAGAAAGCCATCGAAGAAAGAACTTGATTTGAAGATTTGGTAAGAAATTGAGGGGACTAATGCTCAAAATACAATAACAAAAATAAGAAGACAAAAAGCAATCCTTCTACCATAATACACAAGAATTAAGTAGGAAAAACAAAGGCATTCTGATTTAAACATATATCTTGAATAGAGAATTTTGCAAAAGACTTGGAGAATCCAACCTCAACCTTTTTTCAACATATTCAACATACTCCAATTGTTTTATCCTCCATGGAGTAGTTGATATGGTATGATTTATGCCACCTTCTAGAAATCTATGCCGTGTCAAAGTATGTTTGGCCACTGGCAATCCTTGTTACCTATTTCACAACATTTATTATTTTATTATATTTTAGAAGTCGAATGTCTTTGTTCTTTGACACATTAAACTTTAGTTTTAGAACTCACATATGAACCTTACAAAATAAGCTTTCCAACACTTTCATATTTTGTCCCATGAACTTTTAATCTTGTTTATTTTTCAGGTGAAGTCAGACTTCTTAGATGCATTAAGCAATGCAGAGAAGCAAGTTCATGATTATGAATTGAAGCTGCGCGTGCTAAATGAGAACCTCTCCAAAGTTGGTGAGTAGTCACTGGTCAGCATATAAGTTTATCTTAGTTGCTGGTAGATGAAGTGTATGTAGTTTTATATATTTTTTAGAGAGTTAGAGACAAATGCTCAAAGATATGAACTTCTAAAAAGGGAGGACCGAAAAAGAAAGTGAAAAATACTCGGGAAATATAAAATCAACCTAATTTAAGCAAATATCTTGCATGGAAAAAATCATAAAAGAGCTTGGAATAAAAACACGAAAGAGAAACCTCGAATTTTGCTGCCTCAAAAGGATCTAGCCAATGCCTCTTATCCAAAAATAAAAAAAAGGTTCTAGCCAATGCCTACTATTGCTTTGCTTTCAAAAGATGATTACGCTTCAACTAAAATTTTGAAATAATAGCTTTAACTGCATGAACACATAACAAATGAAGCTGTGGAGGCAGACCTGGACCATTGAGCAATTGAAGAGTGTGCCTGGAATCATTTGAGAAGAAGTGAATGAGCAAAGACTACTAAATTATGGAAGTAAGGAACTGTTGTGTACTGAATAAGTTTTTCCACATTTGGTTCAACAATGCAATGTTTTTTGTTGAAGATACTAAGAAAAAGTTGGTGATTCCTCTTTCGATCTCTTATTTGCATTGGTTTGAAGATTCCTTGGTTGAATTGTTGCAACTCACCGTGGATTTTCAAATTTTAAAGCAAAATAGAGATGATTTTGGTACAACTCGATTGTTGAAGTGTTGGTTAGAAGGCAAAGACAAAGAAGAGTGCAAAGAAATCTTCTCAGTTGATGAAGAAGGAAAAACTCCTTTAATAATAGCCATTCCCGAATCCTTTGAGAAAGCAATGACTGATCACAACTATGCTTAGAAGGCAAAAGATCATTTGGAGATTGTTGACGATCTTCAAACAAATTTGGGAAAGAAATAAAGAGACAAGCAAAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTAAATTTATTATTATTTCAATTTTTGTAAACATAAAATTAGAATCACGAGAGAATTTGTTACTTGGAAAAAAATGACTCTGCAACTCCTCTTTTCCGAATGTCAAGGCCAAGGGGAGGAGTCTTAATTAAATGATAAGCTTTTGCATTAATGGGAGCTCATTGATTATTAGTTAGAATAAATCCTTCAACATTAGAGTCCTTGGCAATGTTTGGACTTCCACCGTTTACCCCATTGGCTGTGGCAATGTTTGAACTTCCTCTAATGACCCTCTCTTAAAGGTCGACAATTAAATTTCTTTTTGTTGAAATGTGTATTAATTTACTGGGTATGGCAACTGAGGCTGCTTTAATTCCTTTAGTGGGCTGGCTAACTGAATTTGACACTGAAATCTCATTCTGTTTGCAAGTTTGATCAGTGTTTTATCAGCAAGGAGGGTTTATGAACACTTTCGTCTTGAAACGAGATTCCAAAATCATAGCAATCTTCTTCCAGTCATCTAGTCATTGTACACAAATAATCTTGATATCACCCATAGCTCGTTGAAATCCTCGTAATACATTTCATGTTTTTTCTGGTTCCAATAAGAATATTGAGGATTAGAGGAGGCAACTAACTTCTCAACGAAAATAGAGGACTGAAGGCTTTGCTTTTCCTTCAAATTTTGGTCAACCAAAACAGGAAAATGAGGACTTTGTTTTTCTCTCAAAACTTTTGTCATTACTTTTCATTACCAAATATAAATATACTGACAAAGAAGAAAATTGTTCCATAAGTTTCACATTCTCAACATTCTTAAAGAAACTATTAATCATCCCCAAAAAAGAAGGTCAACCTTTTTTCAATTCCTGTATCACCAATGAACAAACTTACTCCCACCTGTGGGAGGCCACGCGACACACCTCATAATCCAACTAGAAGAATACCAAAATTTCATCAATCGAGTTATACTTAATCCACAATTGCCTCTTGAAAAAATGACGACTCGTAGAATGTAGAAGATTAGAAATAGTCTTTTGATCCACTGGAATGTGACTCAGGAAGATGACATATTTGCTTGTGTTATTTTTGGAGAAATAATAATTTTTCTCTTATTTTCCAAAAGGGACCCAATTATGGGTTAAAATAATACCAGAGAAATTCTAACAAAAAAACTAATTATAAAAGGAAAGAAGCTAAAGACAAGTCTTAGAGGGAAGTTAATTTTGAAGACGGAGATCTTGTTATGATACATTTATGCAAAACTAGATTCCCTACAGGCACTTACAACAAATTGAAGGATAGACAACTGGGACCTTTCGAAGTGTTACAGAAGTATGGTACTAATGCATACCACATTGAGTTACCTAGCGACCAACATATTAATTTGGTGTTCAATGTTGCTGACCTTAAACCATACTTTGCTCCCGATGATTTCTAGCTGGCTTCCTAATCTCCTCGAAGTCGAGTCTCACTTTGGGGGGTGGAATATGGTGGACCAAGAAGCCTTTTATTGTAAACTAACTAAAAGTTAGTTATTTGATAATAAGTTTGTTTGTTATTTTGATTTGTTAGCATTCTTTACAAACTTATAATCACATTTTCCCGGTAAATAAAGACCATCTCCCCTCATTATGAATTGTAGATTCATATACATTTAAATTAGACTTTGGTTTACACCAAGGATCCCCTCTCTCTCATTCTTTTCCTCTTGGTTAGTGAACTAACTAATTCATGAGAAAGGTGTTTACGATGGCCTCATTGTCGGTAAGAATGAAGTCCATGTCTCAATCCTTGAATATGCCGATAATATATTGCTGTTTTGTAAAGATGATGATGAACGTTTGAAAGCTCTAAGTAGTATCATTGAGCTCTTCCAATGGTGTTCAGGGCAAAAGGTTAATTGAGAATAATCTACACTATGTGGAATAATCTGCTGGCCGCTACATCAAGGTTGAACAGTAAAATGGAATCATTAACATTTTTGTATCTTGGGGTTCCTCTTGTAGGATACGCAAGAAAGGTATCCTTTTGGCAATGAGTCATTGATAAAATCCAAAAGAAATTGGATAGATGGAGGCGATCTAATCTAAGAGTCTTTCATGAAAAATCCTTAGTGTGGATTAATCGATTTGAAGTTGCAAGATTTAATGCATCCACTTCGTGCTCTTTCCAAGCCATTTTCAAGCTTTTCGGTGCTAGACATCTATTTAAATTGGAGAGCTTTCATCTTGCTAGATTAGAGTCATCTTTTTTATCTTATTTGGTTCATGATTTCCGTTTGTACTTTATTATGTATCTTCTTATGTTGAGAGTTGTCCCTTTAAATTACTTCAATATTGAGATATGATGAGGGCGCTAGAGATGTGTCAACCTAGTTGAGATATCTGGGTGTGCCTGCTGAT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ATGATTGTCAGGACTCCTCCACCGAAGAAGCAGCGATCCGATGTTACGTCTGTGCCCGATTCCTCATTGGCAGGTGCCTCAGATTTACCGCTCGTTATCTATGAAGATCCTCTTCCCTTGGTGCCAGCAACAACACAGCCAGGCTTGTCGCACGAGCCCTCTGAGCACATGCTTTGCACTTACCAATGTCGCCAAATGGTGAAGTCAGACTTCTTAGATGCATTAAGCAATGCAGAGAAGCAAGTTCATGATTATGAATTGAAGCTGCGCGTGCTAAATGAGAACCTCTCCAAAGTTGAATCAGAGAGAAAAAAATTTCTGGATCGGTTATTATATACAGAGCAAGAACTTGCAGCTGCAAGGGGACGTGAAAAAAGTTTGCAAGAGCAATTAATAAAAGAAATTAATGGTTCTGGGGAACGATTGAAGAAGCAAATGCAAATATGCAGTGAACTGGAGGTAAAGTTGCAAAATGAATCAAATCTTCGGATGAAAGCTGAGTCTTCAATTGCATTGTCGGAAGAGAAAGCTAGACTCTTGGAAGATAAATTAAACCATCTTTCTGAAAGCATAGAAAGAGAAAGGAAACGTCTCCATAGTGAGCTTGCACAGTTAAAAGGAGAATCAAAACTTTCTGTTTCAAGGATAAATGCAGATCTGGAAAAGATGGTTTGCAGAGCTAGTAATGCTGAGAAGGAATCTGAGCTACTAAAAGAGCAGTTGGAAGACTTGAAGAAACAACTCAATGAGTGTTTAAGCCAGAAGACTGAACTAGAGAAGAAATTAGCATCTTTCACAGTCAACGAAGGTACTGGCAAGGAAAGCAATATTTTGATTAAGCATCTGCAAGAAGAGCTTAGGAACTATGTAGGGTTTTCTTCTTCTTCTTTGATACTTAATCTTAATGAATCTGAAGTGAGAGAAGCTAGGAAGTTGAAATCATCACTTGGTGATATTGGATTATTGAAGGAGAAGCTATTAGAAGAAAAGGCCAGAAGGGAGAGAGCAGAATCAGAGTTGTCTAAATTACAAGACATTCAATTGAGTGTAAAGAATCTAGAGGATGAATTGACACGCAGAGAATTGTTGATTAAGGACATTCCTGGCATTACAACTTATGAAGATATACCAACTAAGATTTCTTCTCTCCAAAAGGAGGTAATTGATAACACAATAAAGATGGGTGAGGTGAATGCTCGCTTGAAACAATTGGAAGTAGCACTGGATGCAGCTCAAATTGATAAACAAAAGGCAGAAACTGAGGCTACACTTGTAAAGGAAAAGATTGAAGCATTACAGTTGGAAGTTAAGCAGAATGGATTGCTTCTCTCCGTGGCTACTGAAGAAAGGGATAAATTGAAAAGTCTTGTAAATGAGTTGAAGAGCCTGAAAAATGATGATGCAGAGGCTAAGCCAACAAGTGAAACTCTTTCTCAGGAACTAGATGCGACCCTTGCAAAGAAAGATTGGTATATTAAAGAATTAGAAAGTAATTTACATGAGCAGAAAGAGGTTAATAGCCGTCAACACGATGAGTTAATGTTGTTGAATGAGAGATTAAATAATGAAGCTAAAAGAATAAAGTCGTTAGAGAGGGATTGTGATCGGCTTCGTTCTGAAATTTCTCTGTTGGAGTCAAAGTTAGGACATGGTGATTTTTCCTCAACAAATACAAAGGTTCTACGAATGGTAAATACCCTTGCTGTCGATAATGAGGCAAAACAGACTATAGAGGCCTTAAAATCTGAATTGCAGAAGACGAAAGAGAAGTTACAAGCTGTCGAAGAATTAAAGACTCCGTCAGGTGATGCTGGGAAGCTCGTGGATTCGTACATATCAGGAAAAATAATGCAGCTCAAAGAACAGATTGCAACACTTGAAAAGCGTGAAGAGAGGTATAAGACTGTTTTTGCTGATAGAATTTCAGTGTTTAGAAGGGCTTGCTGCGAACTTTTTGGCTACAAGATTGTGATGGATGAACATCAGCGAGCTGACGGTATTCCAGTTACACGGTTTACCCTCCTATCAATATATGCACAAAGTGATGATGAGAAACTGCAATTTGAGTATGAATCTGGGAATACAAACATTTTGGTTGAGATATTTATTCGGAAGATGAATTCGATACCAGCTTTTACTGCGAACTTAACTGTGGAGTCCTTCAATAGGCGAACGCTTTCATAA MIVRTPPPKKQRSDVTSVPDSSLAGASDLPLVIYEDPLPLVPATTQPGLSHEPSEHMLCTYQCRQMVKSDFLDALSNAEKQVHDYELKLRVLNENLSKVESERKKFLDRLLYTEQELAAARGREKSLQEQLIKEINGSGERLKKQMQICSELEVKLQNESNLRMKAESSIALSEEKARLLEDKLNHLSESIERERKRLHSELAQLKGESKLSVSRINADLEKMVCRASNAEKESELLKEQLEDLKKQLNECLSQKTELEKKLASFTVNEGTGKESNILIKHLQEELRNYVGFSSSSLILNLNESEVREARKLKSSLGDIGLLKEKLLEEKARRERAESELSKLQDIQLSVKNLEDELTRRELLIKDIPGITTYEDIPTKISSLQKEVIDNTIKMGEVNARLKQLEVALDAAQIDKQKAETEATLVKEKIEALQLEVKQNGLLLSVATEERDKLKSLVNELKSLKNDDAEAKPTSETLSQELDATLAKKDWYIKELESNLHEQKEVNSRQHDELMLLNERLNNEAKRIKSLERDCDRLRSEISLLESKLGHGDFSSTNTKVLRMVNTLAVDNEAKQTIEALKSELQKTKEKLQAVEELKTPSGDAGKLVDSYISGKIMQLKEQIATLEKREERYKTVFADRISVFRRACCELFGYKIVMDEHQRADGIPVTRFTLLSIYAQSDDEKLQFEYESGNTNILVEIFIRKMNSIPAFTANLTVESFNRRTLS Homology
BLAST of CcUC11G208460 vs. NCBI nr
Match: XP_038876538.1 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1219.5 bits (3154), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/740 (91.22%), Postives = 692/740 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. NCBI nr
Match: KAG6601670.1 (Mitotic spindle checkpoint protein MAD1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7032439.1 Mitotic spindle checkpoint protein MAD1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1214.1 bits (3140), Expect = 0.0e+00 Identity = 674/740 (91.08%), Postives = 688/740 (92.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. NCBI nr
Match: XP_008460594.1 (PREDICTED: mitotic spindle checkpoint protein MAD1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1209.9 bits (3129), Expect = 0.0e+00 Identity = 670/740 (90.54%), Postives = 692/740 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. NCBI nr
Match: XP_004142360.1 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648888.1 hypothetical protein Csa_008623 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1209.1 bits (3127), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/740 (90.68%), Postives = 690/740 (93.24%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. NCBI nr
Match: XP_022933081.1 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1206.8 bits (3121), Expect = 0.0e+00 Identity = 668/740 (90.27%), Postives = 688/740 (92.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTY1 (Mitotic spindle checkpoint protein MAD1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MAD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 798.5 bits (2061), Expect = 6.3e-230 Identity = 456/740 (61.62%), Postives = 570/740 (77.03%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y6D9 (Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAD1L1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 7.6e-18 Identity = 170/703 (24.18%), Postives = 311/703 (44.24%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80YF0 (Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 OS=Cricetulus griseus OX=10029 GN=MAD1L1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 78.6 bits (192), Expect = 3.3e-13 Identity = 151/665 (22.71%), Postives = 293/665 (44.06%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9WTX8 (Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Mad1l1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 8.2e-12 Identity = 153/713 (21.46%), Postives = 304/713 (42.64%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P10587 (Myosin-11 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=MYH11 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 9.3e-08 Identity = 140/600 (23.33%), Postives = 262/600 (43.67%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCD1 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499375 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1209.9 bits (3129), Expect = 0.0e+00 Identity = 670/740 (90.54%), Postives = 692/740 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EY58 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439783 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1206.8 bits (3121), Expect = 0.0e+00 Identity = 668/740 (90.27%), Postives = 688/740 (92.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KBD3 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492363 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1204.5 bits (3115), Expect = 0.0e+00 Identity = 669/740 (90.41%), Postives = 684/740 (92.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KV95 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G630750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1167.1 bits (3018), Expect = 0.0e+00 Identity = 643/699 (91.99%), Postives = 662/699 (94.71%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLL9 (mitotic spindle checkpoint protein MAD1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022291 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1125.5 bits (2910), Expect = 0.0e+00 Identity = 623/740 (84.19%), Postives = 666/740 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC11G208460 vs. TAIR 10
Match: AT5G49880.1 (mitotic checkpoint family protein ) HSP 1 Score: 798.5 bits (2061), Expect = 4.5e-231 Identity = 456/740 (61.62%), Postives = 570/740 (77.03%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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