CcUC10G207560 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC10G207560
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr10: 34401464 .. 34409420 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC10G207560
SyntenyCcUC10G207560
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCTTCTTGTTTTTCAGGTGACTGGAGTCGAAATCCTGGCTTATAACATGTAGGTGCAGTTGCCTCATTGATGGAGCCTGCAAGAAAGTAAACATAACACTTTGCCAATCAGAATTTCTTGTATATGTTTGATCCTGGCACCGAAATGTGCCACCAACCTACCGAGTGGTATCCAAGGCGAAAAACTAATGATGCATCTTCATGAAAGAACTTATCGATCCACTTCAAACCCACAGCGTGCATTGTCCTCAACAATGGAAGGTGTTCTCTACATACATCAGTTAGTTGATCGAGGCCTTCATGCCGAGCCACTACTAGAAGATGCTTGCGTGCCTGCAAAACAAGTTCATGGTTAAATCTTTTATCATTCAAAGAACAAATGCAATAATAACTCAAGACAGTTATTGACTCCAACCCAGCAATCAAAGAACAAGGGCAGTAGTAGAAGTAGAACTAAGAATGAAAATACCTTTGGATAAATATCATTCAGTATTACAACATCATCTGATGTCTCCAGTACAGTATCGCTATGTTGCTCGGGATGCATTGCAGTGTTGTAAAGTGCTTGTGCCCATGAACCCCAGTGCTTACTCATTTTGGGGACAGTCTTATTGTTGTTTTGGTTTAATGCTTCAGTTGGATCTTGAGATCCTTTCCATTTTTTGCTTCTTTCAGGATTTTGCAAATTCTCTCTCTTAAACTTGTGATGGCTGTCCTCAGAGTGCTTTTGTGGTTCTGAAGGTACTGAGCCGAGGCGTTCGTGAATTTCCTTAACCGACTTAAATTTGTCTTCTACAATTGAAATAAAGGCTTGAAATAAGGAAGAGTAAGCATTGCGAAGAAGTTTGCAGCCTTCATCATAGTCATTTCTGAGATAATTCGGCCTCTGTGGATTCATGTTGGGTCCAAGAACATGTATAACATGGGTTACTCCTTCCCTATTGAACAAAGGAGAAGTTGAAGGCAACGGAACGGCCACGACATTGCCAGGTTGAAGGGAGTTTGCTTGTTGTTTAGTTGCCACTTCCAGACCAGGACCTGCAGCACTAAAAATTGCAGCATTGACACCACCCCCTCCTGGTTTCAGTCGCCTGTGCAGAATATCTTTATTAAGTATATTCTTTGAAGAGATTGTAAACAAACATATCGCATAATAGCATCAATTTACTTCAAGTTTGAATGAAAAATATCATATAGGCCGATAAATCTGTTACGACCTATCATGGTGAGGGTAAAATTCAAGATCAAAACCTTGAGCATGCACATGATAATATCAAGGTTAAGTCTTAAGAATATCCCTATTTCTGTAGATCATTTTCTCGGCCAGCCACCTGGTGACCCGATATAATAATAGTTCAGAACGTAGGGCAACTAGAGAAATTATCTTGACCAGTTTCAAGGAATTCTCCCATCAAATGCAGAGATGACAGATAATGAGAGTATCATGACTTTCCCATACAGTACTTAACAATAAATGAACAATTATAATTCTAAGCACTGGAATGGAGATAACGAACATAAGTATGCCACAAGCATACCAGTTTGCAGCATTGGCTATAACATTGCACCGCAATCCACCTTCTGAATTGAGTTTAGTTATATCACCTACAAATGTAAAAAACTTGGTGGAACTAATATTTTTCTTAGCTGCTTTAGCTTTAGCCAAAGACAAGATCTTTGATCCACGACTCAAGTCTACCAGTACAAGTCTGGCATTTCCAAGCTTATCCACGAATTCCTCAACCTTCTCAACAATAATTTCAGCAGCTTTTTCATGGCTAAACTTGAAATCTGAAGTTGAAATAGATGGAAATGCAAGAGTTGGAGAATTGCTTTGAGAAATATCGTCTTCTAAGGATCTAATGCCTGGACATTCACCTTTCTCTGACTCTATATCTACATTTTTCGACATTGTGCAGGCAGACTCTTCCTTTTTATCACAAGAGTCGCTATTTTCCTGGGTAGTTTGTGGAGTTGGAGAATCCTTAACAGTATTGGCACTAGAACGCGTCTCAGAAGGTTTTTCTGCTTTCTTCAAGAACTTCATTATGCCAAGTTGTACTTTCTTGTTTGGATTCTTCTGTCCAAAACATCCATGTGGAAGCAAATTATGTAAATCAAGCGATTTGTACATATCTATAGCGGATTGAACATCAGTCTCATTGTGGCAAAAGGTTATGCGAGTGAACCCTTCATTTAGTTTGGGCAATTCTATCTTTTGCAGCATTTTATTCACAACAGCAGCAGCTTTTCCACCTGATAAGTTCCCTTCATGACCAGTCCGCTTCACAGAACGAGAAATACAGAGCTGTGCAGGAAGATCTAATACAACGGCATGTACATCTACTTGAGGGCCACCGAGCTTCACAAAATCAGCGCGCTGCTCTATTTCAAGATTGCACCTGTCCACAAATACACTCTTTCCATTATTCAGTGCACTGGCTGCACTCTTTAAGCACTGGGCTTTGGTTCCAGACTTTCCATTTCCAATGGTATCCTGAAAAAATATAAAATCAACCTTCTTTTATGATATTTCAGAAGTGAAAGAACATGTCAAAACACTACCAACTCAAACTCATCATATTTGAAAATGATTTAGAGTGGTTTTAGAAAAAGTCAAAAGACTTTAAAGTGTTTGGTAACGAAGCACTTGTAGAATGACCCAAGTGAATTAAGAAAGCACTTAAAAATACTTTTAATCAGAGTGTAAAACCAAGACGCCTGCCGGTAAAAAATTGCAAGAATTGACGCAACTAAATCACTTCAAGTGTGCCAATCTCCGTATTCTAAAGTATGAAACTGGAAACGAGCTACAGTGTTCTTGAAGTCTAAAGAAGCATTTCATCAAACAGATAGCATTCATTGTTAGAGAAAAACCTGACAGATTCGAACCCAAGGGCGAGAAGAGGAACCCATTACAAGCTCGCAGAAGGTGGATTTGCCGCTTCCAGGTGCGCCCACTAATATTACCATTATGAGCTTCCCTTGCCCTTCCTTTCCTTTAAAACACAGACACTCTTCGTTACGAAAATCGCAAAAGAAAGAATCTCAATAGTTTACGACCAATCTGAAAATCCGAAAAAGTACAGAATAGAAATAGCCTTACACCTTTGGCATTCGAATTTTCGTCGGTATCCACGTCCATTTCTTGATTAGATTTAGGTCTTCCTTTTAGACCCTATCAATCGCCATTTCAGACGTTCGCGCTGCCAAGGAGTGAAGCTTGAAGAATACGCCACGGTCAGTTCCCTCCCCAAATTTCCTGCTACGAGAGTGTTTGGTTACGCATTTAGCACGTCCTTGTATCGGATAAAATCGTCAGGGTTCAGGGTTTCTTTTCAATTTTCAATTGTTAAATTATAAAAAAATATGGGATTGTTTTTTAATATAAAAAAATGAATTAAAATATTTATCAATATAGCAAAATTATATTAGATAGATTGTGATATTTTGATGTTACTTGTAAATATTATTCAACAGTTTTTATCATTTAAAATAAATTTTCTTATTGTTTATTCTTTTTTTATAGAAAAAATGCTTCTAATTTATGAGGCATGTACGAGTGTATAAGAGATCAAGAAGTCTGTAATTTCAATCTCCTATTTTTAATGTACTAAATAAAAAATTTAATTATATTTTAGAACTTTACAAAATTTTATAAAAGAAAAGCAATTCAAAAAAATTTTGTTCTTTTTCAAAATAATCCTGGTAGACTTTTGTCATTAAATTGAGAACCTAAAGTTGAAAGGATGAAGAAGATAAAGTATGACTTCCAATTTATGTATCTTCATTTAGTTTTATGTGTTGATGTCAAAATTTGGATAAGAGAAAACACACGTTCAATAAATTTGTAATTTGGGGGGAAAAAATTATGACCTAAAGTTTGAATATTAGAATGAACTTACTTCTCCAGGCGCATGAATTAGGTCTTTCCCCATAGAATTTCAAAGTTGTATAGGGTTATCCTTTGACTCATTAGGTTGAGACGGGTATGGTTTGTGTTTTATTAGGGTTGGCCTTGACATGTGAGGCATACTCCATTGGGTATTTGGTGGTTAAGGTTGAGCATGCTAGTTTGGTCCTAAGTTGCTACTTCTGGCCCCAATCTTGTTATCTCCTTGATTTTGTCATTTTTGTTTTTGTTTGAATCACCCATAATATGACATATGTAGTTAGATTTGTTCACATATCGGTAAATTTAAGAGATAGAATGTAGGAACAAATGTAGGAACCAATGTTGATTGTTGTTGTGTCGTAGAAAAACAACTGCCTTGAAAGCAAAATTCGAGCCGACCTTCGCGTATGCTGGTTGCTCATCAAGATTAACACAACCTCTCAATTCAAGCATGCACTCGTGGGAGAAAAGAATGAAATCAAGGGAAAATATGTCTAGAAAAGAGAGATATATAGAAAAATTTGGGGGAAGAAGAAAGAAAAATATTTAAATATATTCTTCCAAAAAGCTAAGAAAACTGTTTAAAGAAAATCAATTAAAGAATAAAAATAGGAACTGTCGAATTAATTGAGATTAATTTTTGACCAACAATTAACTATTGGAATTAATTTAAAAAGTTAACACAATATTTTTCCGTTTATTTAGAAACAAATTTCATATCACGAAAGTTGAAATAAAAATTTTCGGAAATATGAGATATGATTGAATCAAACCAATTAGTTCAGTTCAGTATATTTTTGCTAATTTAAAAGCATGTTTGGCTCACTCTAGTGCCAAGCCAACTGCCAACCAAACTAGGCAACAGAACGCACGTTTTACAATGGATCCCTATCCCGCACCAAAAATTTATTCGTTTCGATGTTTTTTTATCTGGACCGTCGGATAACGAAAGTTTATACCATCGAAAGCATATTAATGGAACACGTGGCAATCTTATTGTTCCATACCCAAAACACGAAACACCTGACCGCAGCTGATCCAGCGTCGCTGTTAAGCTAAGAAGACCGTTATAAAAGGAACGTCGCACTCTTTCCCGGTAATAAA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mRNA sequence

ATGCTTCTTGCAGACTCTTCCTTTTTATCACAAGAGTCGCTATTTTCCTGGGTAGTTTGTGGAGTTGGAGAATCCTTAACAGTATTGGCACTAGAACGCGTCTCAGAAGCATTTTATTCACAACAGCAGCAGCTTTTCCACCTGATAAGTTCCCTTCATGACCAGTCCGCTTCACAGAACGAGAAATACAGAGCTGTGCAGGAAGATCTAATACAACGGCATATTCGAACCCAAGGGCGAGAAGAGGAACCCATTACAAGCTCGCAGAAGGTGGATTTGCCGCTTCCAGAAGAAAGAGATAGAAGAAAGTTGAAGAGAACTCTGTCTGAATCCATCGCTGTGAGAATTTACCTTGTTCCGACGGTGAGGTTTCATCGGAATCAATCGCCAAAGAACGAGCATGGTCCAAAAACATCAGGTTCCACTTCAATGCGGAGGGTCCTATTCTTCATAACGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTTCTTGCAGACTCTTCCTTTTTATCACAAGAGTCGCTATTTTCCTGGGTAGTTTGTGGAGTTGGAGAATCCTTAACAGTATTGGCACTAGAACGCGTCTCAGAAGCATTTTATTCACAACAGCAGCAGCTTTTCCACCTGATAAGTTCCCTTCATGACCAGTCCGCTTCACAGAACGAGAAATACAGAGCTGTGCAGGAAGATCTAATACAACGGCATATTCGAACCCAAGGGCGAGAAGAGGAACCCATTACAAGCTCGCAGAAGGTGGATTTGCCGCTTCCAGAAGAAAGAGATAGAAGAAAGTTGAAGAGAACTCTGTCTGAATCCATCGCTGTGAGAATTTACCTTGTTCCGACGGTGAGGTTTCATCGGAATCAATCGCCAAAGAACGAGCATGGTCCAAAAACATCAGGTTCCACTTCAATGCGGAGGGTCCTATTCTTCATAACGTGA

Protein sequence

MLLADSSFLSQESLFSWVVCGVGESLTVLALERVSEAFYSQQQQLFHLISSLHDQSASQNEKYRAVQEDLIQRHIRTQGREEEPITSSQKVDLPLPEERDRRKLKRTLSESIAVRIYLVPTVRFHRNQSPKNEHGPKTSGSTSMRRVLFFIT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 125..144

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC10G207560.1CcUC10G207560.1mRNA