CcUC10G192260 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC10G192260
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
LocationCicolChr10: 9140262 .. 9150119 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC10G192260
SyntenyCcUC10G192260
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGTTTGTTGGTCACCCATTAAATTGAAGCTTGGAATCCTCAAATCATTATGTGTAGGTGTAGTTCCGAGAGATGATGAAGGGAATTTGACGGCTATCCTACTGAAATTGTGGTAAATTGGTGAGTTGTCGATTTTATTTTTGGAAGCATTAGTGTGTTATCCAATGGTTGTGGGATTCGTTCTTGGTAAATTTTGGTTTGAATCATTGAGAAAAGTTCAGAATCGATCTTGGATCAACCTACATTTGTGGGTTGATTCAAGACTTTTTTATTTAAGATAGAAAGGATTTGGTTTCCTTATTACTCTTGGGCTTATTTGCGAGGTAAGTAACACTACTACTGGAATGCCTTCAAGCTAGACTCCCAAACTAAGATGATTATGTTAAACTGGATAAGTCTTATGAGCTTGCTATGGAATTGTTGGAATGTTTGACCTTTTTTCATGAATGAAAGGACTGATACAACCATGTTGACATGTATGAGCTATGATAATGTGATTATGATATGAGACTCATTGATTGTATTTTGTATTCTATATAAGTTAGCTATGATAATATGATTATGATATGAGACCCATTGAGTATATTTCCCATGCTAGATGCGTTAGTGATTGTTCACCTTTTTATTGGTAGCAATGTACATCCTATGTTCATGTTCTTTTGGGTTCACTACCTATGCCTATGACTATGTACCTGAGGGATCACTACCTATATATATGCCTATGTTTATGTTCCTCTGAGATCACTATCAGTGTTTGTGTGCCTTTGGATTCACTATCTATGCCTGTGTGTTCCTCCAGGATCACTATCTATGTTTATGTGCCTTCGGGTTCACTACCTATACTTATGTTAAGCTATGTACATCTATGCATATGATAGAAAGAGTTAACAAATTCACAGACGACCATCCAAAAATACCCCACTTCCAGTTTGCATTTATTGGACATAAATGCATAACCTAACCACAAAAGTGGGGTTACTGAGTATTTTATACTCATCTTTTATTGTGACATGTATTTCAAGTGAGGACAAAGACACACCAACGAATGACAAGAAGAATTAGTGACCGTGCCAATGGGAATAGTCAGACGCTTCGCACATGTTTTCTTATGTTATCCATGTTACAGTTGTTAGCAGTCAAATGTTTAGAGTTCTTAATTATTTTTCTTATTTTAAACATATGTTTTTGGGGGGACCTCGAGAAAGTGTTTTATGTTCTTTAAGACAAATGAATTTGTTTAGTTTATTCATTTTTAATAATTTTCTTTTTCATTTTGGGTCGAATAAAAAATGTGTTTAAGATCAGTATGCATGTAGCAACGGCCTATTAGTAGTCTTAGAAAGTCAAGTCGTTATAGTTTTAGTCCAAATTTAAGTTACTGGTCATGATCTCAAAGTTTCATACCCAACACATTTTAATCTCCATATCAATCAAGCTAAACCTAAGAAGATAGCATAAATCGATATAACACTATTTTAGACTATTTTTAAGGACTCTTTTGAGGCATTTTTCATTCTAATTTTTAGACCTAAAATCAACATTTTTTAGATCTAATTAGGGCTAAAACATCTAGATTTTCTAAGAACAATTCCTAAAGTAAACTGGAAGCTAGTTGTCCTTGTTGTTGGATGTGTTTTCCTCTCTACGGTAAGGATGGATGGAGAGAACTTTAGGTAATTGAGGAGCTTGAAATAATGTTGAAATATCTTAGAAAAGAGGTGAGAACATTCTTAGGATCTACAAAAATTAATAGGGAAAATTCTAAGATGAGTGTAGAAAATAAAAAGAGAAAATATTGTGGATTTTATTTCTTTATTGTGGATTTTATTTCTTTCCTTTTATGTTTTTCCAATATCTTTTTCTTGTATAGGTTTTCGATCTCTATTTTTTTTTCCATGTAATGTTTTGATTGTATCAAATTAATAAAAGAGAGAAAAGTGTATTGTGGTTTTTTCTCCCTAAATTAGGGTTTTCCATGTAAACCTTGTGTTGTTTCTTATTCCCTCTTTTATCAATATGGTATCAGAGCGTGGTGAAGAAACCCTAGAAACTCTAGCCGTCGTCGACAAAAATGAGCCTAGACATGATCTGCAGTCGCCATCTCTCTAGTCGCCGTCGCTGTTCGGATCTGCAGCTGCCGCTGGGTCTGCCATCCAAGAGGCTGTCGACATGTACCGCCGGTCTCTTAACCCTAATGCAGCCACCTCATTCCTTTAACCAACGAATCAGCTGCCACAGATGTATAGATCGAGTATTTTCGCTGCCATCCCGACATTGCCGACGTCGAATAACCCTTGGGTCCCAGATCTACTGCCACAGCTGTATAGATCAGATTTTTTCGCAGCCTCTGACTTCCAGACGCCGCTGATGGTTCAGAACATGTCAACGCCTATGAAGTCGTCCACCGTCGCTGCCCGGGTCAACCACCTTGCCGCCACTGCTATTTACCGTTCAACCCAGTCACCATTGATGAGATCTATGACTGCCGGCCCTCATATAATTGCTGGTTCTTCTTCACAAGAGATGAGGCTTCATGGTTCTTCCTCACAGGTTGTGGGTAATCAGTTCTTCCCTCCTACAGCCGCTGCTAGCATCGGGGTTCCTCGCCAAGGAGTTAGTAACCAATATGAACAGTATGGGCCAATGGGTCTTTCTCCAGCTACGGTTCAACAAAAACTTGCCAATCTTTAAGCAAGTTTTCAAAAACAAATTGCCACTCTTGGGGTAGCTCTTGGCGCGTCGACCTTCCTTGATCTAGGTGCAGGAAATTCAGGTATTCAATCAAGTTTACCGATGTATTCAGAGAACCCGGTAACTATCTTTCCTACCCTAACAACTACACCTTATATGTCTGGACCAATTGGTAACTCCACGGGGCTAATCGTTGGTAAAAAGTTAAATGGATAGAATTATTTCTCTTAGTCTCAGTCTGTAAAAATGGTTCTTGAAGGGTGCCACAAATTTAGGTATTTAACTAGTGAGATACCAAAACCAAAACTAGGAGACCTGCAGGAGCGCATTTGGAAAGGAGAGGACTCCTTACTCCGGTCTTTGTTAATTTACAGTATGAAACCTCAGATTGGAAAACCCTTACTATATGCTGCCATAGCTCGAGATATTTGGGATGTCGTTCAGAAATTATACTCCAAAAGACAGAACGCCTCCCGGCTTTACACTCTGCGGAAACAAATCCACGAATGCAAACAAGGTACTATGGATGTCACATCGTACTTTAACAAATTGTCTCTAATCTGGCAGGAAATGGATTTGTGTCGAGAAATTGTCTGGGATTGTCCGTGTGGAGGAGTTTAATACTATAAGCTTGAGGAAGTTGACCAAGTGTATAATTTCTTAGCCGGTTTAAATTCCAAATTTGATGTTGTGCGAAGTCGGATATTGAGAGAGAGACCAACACCGACCCTGATGGAAGTCTGTTCGAACGTTCGACTTGAGGAAGATTAAACAAGCGCTATGAATATTGTGGGTGCTCCGCTACTGACTCAGTCGTGTTTAGTGCAAAATCATCTAGTACAATTGGAGACAAGCAGAATTGGAAACTGCCTCCAGTTTGTGAACACTATAAGAAACCGTGACATACGAAAGATCAGTGCTGGAAGCTACATGGTCGGCCCCCGAATGGCAGACGCTGACCTCCAAACAACAAACCCAACCAGGCCCTGGTAAATGAGACTATGAGTGGCTCGCAGCCACAACATCAAGAGAACTGCCCAACTAATAACGATACTTCTTCTCTTGGGGCGATTGCACATTCAGGTATCTCTCAATCCTTAAGTCTACTCAGTATTACTGACCAAAAACCTTGGATTCTTGATTCATGAGCTACAGACCATTTGACTGGAACTTCTAACAATTTCCTCTCTTATCATCCGTGTGCTGGTAATGAAAAAATTCGAATAGCTGACGGGACACTTGCCCTTGTTGCCGAAAAGGGTCACATTTCTCCTTTCGATGGTTTGATATTACAAAATGTTCTGCATATCCTAAAAATCTCTTATAATTTACTGTCTGTGAGTAAAATAACCATAGATTTAAATTGTCGTGTGGCTTTCTCACCGGATGATGTTATTTTTCAGGACTTGAGCTCAGGGAGGATGATTGGCACTGCCCAGCACAATAGAGGACTCTATTTCCTTAATGGTGATACTTTCTCTGGGCATAGTTATAGGGCTAGTCTATTATCCTCCTATTATTCAACTTTTGAAACTGACTATATGTTATGGCACTTTCGTCTTGGTCATCCTAATTTCCAATAAATGAAATATTTATTCTCCCATTTATTTAATAAAGTTGACATCTCCTCTTTATCTTGCGATGTGTGTATTCGTGCAAAACAACATAGGGTCTCCCTTCCGTCCCAACCTTACGAATCCTCTCAACCATTCACTCTTATTCACAGTGATATTTGGGGTCCCTCAAGGATTACCACCTCTTCGGGTAAGCGTTGGTTTGTTACCTTCATCGATGACCATACTCACCTTACTTGGGTCTTCCTTTTAACAGATAAGTCTGAAATCTCATCCATTTTCCAACAGTTTTACACCACTATTGAAACTCAATTTAATGCTAAGATTGCCATCCTTCGGAGTGACAATGGTTGTGAATTCCTCACTAATACCCTTCGTTAGTTCTTATCCACTAAAGGTATTGTTCATCAGAGCTTATGTGCCTATACACCCCAACAAAATGGAGTGTCTAAAAGGAAAAACTGTCATCTCCTCGAAGTTGCTCGATCGCTCATGTTGTCAACCTCTCTTTTGTCTTACCTATGGGGGGATGCAGTATTGACTACAAGTCATCTTATAAATCGAATGCCTTCTCGCGTTCTCAACTTCCAAATTCCTCTTGACTGTCTCAAACTGTCTTATCCTACCACTCGCTTTATACCGGATGTCCCTCTCCGAGTATTTGGGTGTACAACATTTGTTCATAGCTTTCGTCCCAACCAGATTAAGTTCTCCCCTCGTGCCCAAAAATGTGTCTTCGTTGGATACCCTTTCCATTAGTGTGGTTATAAATGCTTCCATCCCACTTTCTGAAAATACTTCATCTCTATGGACGTCACCTTCCTAGAAGATAAACCTTTCTTTCTCGTTAGTCCTCTTCAGGGGGAGAGTAATAATGAAGAGACTAACTATCCTAATCCTCTTCCTAAACCTATCCTGACAACCCACGACACTGTTCTACCCACCAGACAGGTCCCATGGATAACGCACTACAGGAAGAATCTTAGAAAGGAAATAGTGGCCCCTACTGACATGCCGGCTCCGATCTAATCATCTGACACAAGCTCAAGGTACTATTGATCTTGATAATAATACTATTTGCGCTGAAAATGTTTGTGTTGAAAATGATGTTGTTGATCTGACAAAACTTTCAGTAGAAGATGGTAGAGATGATTTGACAGAAAATAACCAAGTTGCTGAAAGTGATGTAGTATCAACAACAGTTGAAGAGACTGAAAAAGAGATGATACCTCATAACCCTACAACTGGAGAAGAACTCAACAAACTAGGAGAGTATGATGGCACTCTTGACATGCCTATTGCTTTGAGAAATGGCACAAGATCCTACACCAGGTATCCCATGTATAGCTTCCTCTCTTATAATAATCTGTCCTGTAAGTTCAGAGCGTTTACTGCTAGTCTTGATACTGTAACCATACCGAAAAACATATATGTAGCTATGGAAATCCCTGAGTGGAAGATTGCTGTTATGGAAGAAATGAGAGCTTTTGAGAAAAATCATGCATGGGAACTCGTTGCTCTTTTAAAAGGACATAAAGCAGTTGGATGTAAATGGGTATTCATAACGAAGAATAAATCTGACGGAACTCTTGACAGATATAAAGACAGGCTTGTAGCAAAAGGGTTCACTCAGACTTTTGGGGTGGACTATTCTAAGACTTTTTCTCCTGTCGCAAAGTTGAACACAATCAGGGTCCTTTTGTCAGTTGCAGTCAATAGAGATTGGCCTCTTTATCAGCTAGATGTGAAAAACGCCTTTTTAAACGGTGATCTAGAAGAAGAAGTGTATATGAGCCATCCTCCTGGCTTTGAAACCCAATTTGACCGGTGTGTGAGCAAGCTTATAAAGGCCTTGTATGGATTAAAACAGTCACCGAAAGCATGGTTTGAAAGATTCACCACCTTTGTTAAGTCTTAAGACTTCACTCAGGGACACTCTGACCATACCTTATTTACAAAAAGGTCTGTCTCGGGTAAAGTTGCCGTTTTGATTGTGTACGTTGATGACATTGTCTTATCAGGAGATGATACTGCTGAAATCAACAAGTTAAAATAGAAAATGACAGACAAACTTGCAATCAAAGACCTAGGAAACCTGAAGTATTTTCTTGGGATGGAGGTGGCGAGATCAAGAGAAGGAATCTCAGTTTCTCAACGAAAATACACTCTTGATTTATTGAAAGAAACAGGTATGACTGGATGCAAGCTTGCTGACACTTCTATTGAGTCTAATGCCAAATTGGGAGTCTATTGCCAAAGTTCCTGTTAGTAAAGAGAGGTATCAATGTCTAGTTGGGAGACTAATTTACCTAGCACACACTAGACCAGATATCTCCTATGCTGTTAGCGTTGAGCCAGTTTATGTAGGCTCCCTACAAAGAACACATGGAAGTTGTAAACAGGATTCTGAGATATTTGAAAAGCACACCAAGAAAAGGGTTGATGTTCAGAAAATCCAACAGAAAATGCATAGAAGCCTATACAGATTCTGACTGGGCAGGATCAATGATTGACAGAAAATCTATGTCTAGGTATTGCACCTTTGTTTGGTAATCTTGTAACTTGGAGAAGTAAGAAGCAAAGTGTGGTTGCTAGAAGTAGTACTGAAGCTGAATACAGAGCTATGAGTCATGGAATCTGGGAAGAAATTTGGTGGAAGAAAGTTCTATCTGATCTTCATCAAAGCAATGAACTACCTATGAAACTCTATTGTGACAATATAGCTGCTATTGCGTTGTAAACAATCCGGTTCAGCATGATAGAACAAAACATGTGGAGATTGATAGGCACTTTATAAAGGAAAACTAGAAAATGGAAGTATTTGCATTCCTTATATTCCTTCCAACCAACAAGTTGCAGATATTCTTACCAAGGGGTTGCTTAAACAGAGCTTTGACGCATGTGTGAGCAAGATGAGTCTTATTGACATTTACGTCTCATCTTGAGGGGGAGTGTAAAAAATAAAAAGAGAAAATATTTGGGGAGATATTGTGAATTTTATTTCTTTCCTTTTATATTTTTCCAATATCTTTTCCTTGTATAGGTTTTTTATCTCTATTTATTTTTTCCCCATGTAATGTTTTGATTGTATCAAATTAATAAAAGAGAGAAAAGTGTATTGTGGTTTTTTCTCTCTGAATTAGGGTTTTCCACGTAAACCTTGTGTTGTTTCTTCTTCCCTATTTTTTCAATAATGAAATTATTGAAAAAGGAACCTTTCTTACCGATTTGACGCTACCTTGTTGAACAATTTTTTGAAATCCAAGAATAGCAGTTGAAACAACTTTGAAAATTCTCTATTCTCTTTAATGTGATTTACAGCACTAGGTTAGAGAAAGATTTTTTGGAATGTGAGCAACCTCTTTTTCTCTCTCCTCCATGCATGCACAATCAAGAAGTATTCAGATAGAGTTTTTGGCTTTTCAATTCACCCACCTAAACTCTTAATTACCTTTTAGTGGAAGCTCAAAAGGATGGGTTAAGAAACCTATATTATGGTTGAAATTAACTTACGTTGTGATTAAAATGCTTCCTATTTCCTTTTGAGCTCCAATTTATCAATTTCAATTCTTATATTTTTAATTCCTTAATGATTTTTGTTTTACACTCTTAATCATTTTGATTAAGAACTTGTGACAAAAGGTTACAAACTACAAAAATTAGAAATAATACGATCATACATCCATTTATATCACATTCTTACCAAGTTAATTATTATTGTATTTATATTCATTCTTCCCTTCTAATATTCAAGTAACTAAATATAAATATAACTAAAATTACTAATATTTATAGTGAATTTTTAGAATTTGTAATATTTATGTATAAACAAGTATTGAAATCGACTTTGATAAAAAAAAAATTATATCAATTAAGCTTAATAGCTCTCAATATTATCATAAATTAAGTTTCCAAACCAACGGATCCTAACCTAAATTTAAATAATTTATTACACTAGTTTATCTAAATTAATAAAAGCATAATGATATTATAAAATTACGAAAGTATCTAATAATTGTGTAGGTCATTACACATGCACTATATGTATTAAAGCATGACCAAGCAAGCAATGAAAATAGGTGACATCTCGATGCTCGGGATGGAATCGTGAAGCATTGCCTACTCTATAGTTTTTTATTGGCGAGGTATTTGCTCGGTATGACATAGTAAATATTGTGATTGAAAGTTTAGATTTAAGATTAACCAAAATAAGTGAAATAAAATTCCTTATAGAGTTTGTTGACAAAAAAATGTTGTATGGGATATGTAACAAGATTCTTAAAATGGGTTTAATACAGTTGTTGTTGTTATCTTCACAAATAAACTTTCTAACAAACAAGAAAATTGTAAGGGAGAGATTAAAAATGAGAACAACAAAAGAGTTTGTTAATTGCCCTCAATTGTTATGAAACTCTATGGTCTCTTATTTTCTTATCTTAAAAACAAAAACAAAAACAAAAACAAAATAAAATTAAAAAAAAAAAGAGAGAAAAGGAAAAAAAAAATGAAGAGGAACCAACAAGTTGTCAACCATGATTCGTCATCAAAACTCAAAAGTTTGTTTTTCTCTCCACTTTTTCCTTCATTTTCCCAGCATCCAAACAACACAAGTGATTGATTGATTCATTCATTCATCATTCAATCAGTAATTCCCCCCTCCACTCGAACTTTTTCCCTTCAAATCTCATGCCCGTAATCGTCATCTTTGGCTTTTTCTTGACAATTTTTGTATTCATCTCTTTCTTCGGCTTGTGCCTCTACATCTGTTTCCAATGTTACAACCAGGGGTTCCCAGAAGGCGAGCAACGTGGTAGTGGGAATGGAGAAACAGCAACGACAACAACAGCAACAACGACGACAATGGATCCTGAGGAGCGGAATCGTCAGACTCAAATGGCTATGGAGAAATTGACAAAACCATCAGCAGAGTATGATTACGAGGAAAATGATGAATCTCCATCAACGTTGAGTGAATGTGCAATTTGTTTGGAGGAATTTCAAGAAAGGGTCTCGTGTCGAGTTTTTCCTAATTGCAAACATATGTTTCATACTCATTGCATTATCAATTGGTTAGGGATTAATCAAACTTGTCCAATATGTCGAACTCAGTTGTAGCCTAACACTACCAATTCGAGCATAACTAACTGGTTAATACACATACATTTGATCCAAAGGTCATAAATTTGTATCTCCACTCCACATGTTGTTGAACTAAAAAAGAACAAAGAAATTGTAGGGCCACAACTGATGTTTATTAAGGCAATGTGTGGAAAGTTTTGTCTTTCGATTGGCTCACAAATTGAGGTTGTGTAATAATATTGAATTTAGTGTGTTTTGAATAGCTTTCAAAGATATAACTTTTTAAATAAAATTAATTTTATCATTAGAAGACTATTAATTTTAAATGCGTTTAGCATGCAACTTCTTTTCTTTTTAGATAAAAGGATTCATTCATTAGCAATTCAACATGCCTAATTAAAGGGTTACAACGGGAAACATCAGAAATAAATACCAAAGAAAGCAATTTAAGAACATGTTGTGTTCAAGTCCTTGTTTGTTAGTTAAATAAAGCTCAGCTAGTTAAATTATGA

mRNA sequence

ATGGGTGTAGTTCCGAGAGATGATGAAGGGAATTTGACGGCTATCCTACTGAAATTGTGGACTGATACAACCATGTTGACATGTATGAGCTATGATAATACGCCGCTGATGGTTCAGAACATGTCAACGCCTATGAAGTCGTCCACCGTCGCTGCCCGGGTCAACCACCTTGCCGCCACTGCTATTTACCGTTCAACCCAGTCACCATTGATGAGATCTATGACTGCCGGCCCTCATATAATTGCTGGTTCTTCTTCACAAGAGATGAGGCTTCATGGTTCTTCCTCACAGGTTGTGGGTAATCATAATTCCCCCCTCCACTCGAACTTTTTCCCTTCAAATCTCATGCCCGTAATCGTCATCTTTGGCTTTTTCTTGACAATTTTTGTATTCATCTCTTTCTTCGGCTTGTGCCTCTACATCTGTTTCCAATGTTACAACCAGGGGTTCCCAGAAGGCGAGCAACGTGGTAGTGGGAATGGAGAAACAGCAACGACAACAACAGCAACAACGACGACAATGGATCCTGAGGAGCGGAATCGTCAGACTCAAATGGCTATGGAGAAATTGACAAAACCATCAGCAGAGTATGATTACGAGGAAAATGATGAATCTCCATCAACGTTGAGTGAATGTGCAATTTGTTTGGAGGAATTTCAAGAAAGGGTCTCGTGTCGATTAAATAAAGCTCAGCTAGTTAAATTATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGTGTAGTTCCGAGAGATGATGAAGGGAATTTGACGGCTATCCTACTGAAATTGTGGACTGATACAACCATGTTGACATGTATGAGCTATGATAATACGCCGCTGATGGTTCAGAACATGTCAACGCCTATGAAGTCGTCCACCGTCGCTGCCCGGGTCAACCACCTTGCCGCCACTGCTATTTACCGTTCAACCCAGTCACCATTGATGAGATCTATGACTGCCGGCCCTCATATAATTGCTGGTTCTTCTTCACAAGAGATGAGGCTTCATGGTTCTTCCTCACAGGTTGTGGGTAATCATAATTCCCCCCTCCACTCGAACTTTTTCCCTTCAAATCTCATGCCCGTAATCGTCATCTTTGGCTTTTTCTTGACAATTTTTGTATTCATCTCTTTCTTCGGCTTGTGCCTCTACATCTGTTTCCAATGTTACAACCAGGGGTTCCCAGAAGGCGAGCAACGTGGTAGTGGGAATGGAGAAACAGCAACGACAACAACAGCAACAACGACGACAATGGATCCTGAGGAGCGGAATCGTCAGACTCAAATGGCTATGGAGAAATTGACAAAACCATCAGCAGAGTATGATTACGAGGAAAATGATGAATCTCCATCAACGTTGAGTGAATGTGCAATTTGTTTGGAGGAATTTCAAGAAAGGGTCTCGTGTCGATTAAATAAAGCTCAGCTAGTTAAATTATGA

Protein sequence

MGVVPRDDEGNLTAILLKLWTDTTMLTCMSYDNTPLMVQNMSTPMKSSTVAARVNHLAATAIYRSTQSPLMRSMTAGPHIIAGSSSQEMRLHGSSSQVVGNHNSPLHSNFFPSNLMPVIVIFGFFLTIFVFISFFGLCLYICFQCYNQGFPEGEQRGSGNGETATTTTATTTTMDPEERNRQTQMAMEKLTKPSAEYDYEENDESPSTLSECAICLEEFQERVSCRLNKAQLVKL
Homology
[Close]
BLAST of CcUC10G192260 vs. NCBI nr
Match: KAG6577374.1 (RING-H2 finger protein ATL8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 127.1 bits (318), Expect = 2.0e-25
Identity = 68/113 (60.18%), Postives = 85/113 (75.22%), Query Frame = 0 

Query: 116 MPVIVIFGFFLTIFVFISFFGLCLYICFQCYNQGFPEGEQRGSGNGETATTTT-ATTTTM 175
           M +IVIFG FL I V ++FF LCLYICFQCYN GFPE +   + +GE+ TTTT AT+  +
Sbjct: 1   MHIIVIFGLFLIILVILTFFALCLYICFQCYNHGFPEDDSIITESGESTTTTTRATSVAV 60

Query: 176 DPEERNRQTQMAMEKLTKPSAEYDYEENDESPSTLSECAICLEEFQERVSCRL 228
           D  E NR  Q+AMEKLTKPS EYDYE+++E+ S LS+CAICLEEF+    CR+
Sbjct: 61  DSNEINRHIQIAMEKLTKPSTEYDYEKDNEAVSVLSQCAICLEEFENTDLCRV 113

[Close]
BLAST of CcUC10G192260 vs. NCBI nr
Match: XP_011652743.1 (uncharacterized protein LOC105435076 [Cucumis sativus] >KGN56259.2 hypothetical protein Csa_011552 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 108.2 bits (269), Expect = 9.6e-20
Identity = 61/86 (70.93%), Postives = 65/86 (75.58%), Query Frame = 0 

Query: 145 CYN-QGFPEGEQRGSGNGETATTTTATTTTM--DPEERNRQTQMAMEKLTKPSAEYDYEE 204
           C N  GF E EQRG+ N E   TTT   TTM  DPEERNRQ QMAMEKLTKPSA Y+ EE
Sbjct: 153 CQNFPGFSESEQRGNRNEEMTMTTTTVATTMVADPEERNRQLQMAMEKLTKPSAYYNCEE 212

Query: 205 NDESPSTLSECAICLEEFQERVSCRL 228
           NDESPSTLSEC ICLE+  ERVSCR+
Sbjct: 213 NDESPSTLSECTICLEDLGERVSCRV 238

[Close]
BLAST of CcUC10G192260 vs. NCBI nr
Match: KAG7031368.1 (RING-H2 finger protein ATL52, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 1.6e-19
Identity = 62/115 (53.91%), Postives = 74/115 (64.35%), Query Frame = 0 

Query: 116 MPVIVIFGFFLTIFVFISFFGLCLYICFQCYNQGFPEGEQRGSGNGETATTTTAT-TTTM 175
           MP+IV+FGF LT+ V  SFF LC+YICFQC+ QGF    Q    NG    T  AT   T+
Sbjct: 162 MPIIVLFGFVLTVLVLFSFFSLCIYICFQCHTQGFIGATQTHRDNGHGMATRAATRAATV 221

Query: 176 DPEERNRQTQMAMEKLTKPSAEYDYEEND--ESPSTLSECAICLEEFQERVSCRL 228
           +PEE N QT   MEKLT P  +Y  +END   + S L+ECAICLE F  RVSCR+
Sbjct: 222 NPEELNHQTHRVMEKLTMPLVDYGCKENDGEVASSELNECAICLEAFGNRVSCRV 276

[Close]
BLAST of CcUC10G192260 vs. NCBI nr
Match: KAG6600728.1 (putative RING-H2 finger protein ATL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 1.6e-19
Identity = 62/115 (53.91%), Postives = 74/115 (64.35%), Query Frame = 0 

Query: 116 MPVIVIFGFFLTIFVFISFFGLCLYICFQCYNQGFPEGEQRGSGNGETATTTTAT-TTTM 175
           MP+IV+FGF LT+ V  SFF LC+YICFQC+ QGF    Q    NG    T  AT   T+
Sbjct: 1   MPIIVLFGFVLTVLVLFSFFSLCIYICFQCHTQGFIGATQTHRDNGHGMATRAATRAATV 60

Query: 176 DPEERNRQTQMAMEKLTKPSAEYDYEEND--ESPSTLSECAICLEEFQERVSCRL 228
           +PEE N QT   MEKLT P  +Y  +END   + S L+ECAICLE F  RVSCR+
Sbjct: 61  NPEELNHQTHRVMEKLTMPLVDYGCKENDGEVASSELNECAICLEAFGNRVSCRV 115

[Close]
BLAST of CcUC10G192260 vs. NCBI nr
Match: XP_023545744.1 (RING-H2 finger protein ATL52-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 3.0e-05
Identity = 40/82 (48.78%), Postives = 47/82 (57.32%), Query Frame = 0 

Query: 149 GFPEGEQRGSGNGETATTTTAT-TTTMDPEERNRQTQMAMEKLTKPSAEYDYEEND--ES 208
           GF    Q    NG    T  AT   T++PEE N Q   AMEKLT P  +Y  +END   +
Sbjct: 51  GFIGATQTHRDNGHGMATRAATRVATVNPEELNHQIHRAMEKLTMPLVDYGCKENDGEVA 110

Query: 209 PSTLSECAICLEEFQERVSCRL 228
            S L+ECAICLE F  RVSCR+
Sbjct: 111 GSELNECAICLEAFGNRVSCRV 132

[Close]
BLAST of CcUC10G192260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L7Y8 (RING-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G104940 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 1.2e-12
Identity = 42/54 (77.78%), Postives = 46/54 (85.19%), Query Frame = 0 

Query: 174 MDPEERNRQTQMAMEKLTKPSAEYDYEENDESPSTLSECAICLEEFQERVSCRL 228
           + P ERNRQ QMAMEKLTKPSA Y+ EENDESPSTLSEC ICLE+  ERVSCR+
Sbjct: 3   LQPGERNRQLQMAMEKLTKPSAYYNCEENDESPSTLSECTICLEDLGERVSCRV 56

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC10G192260 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6577374.12.0e-2560.18RING-H2 finger protein ATL8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia][more]
XP_011652743.19.6e-2070.93uncharacterized protein LOC105435076 [Cucumis sativus] >KGN56259.2 hypothetical ... [more]
KAG7031368.11.6e-1953.91RING-H2 finger protein ATL52, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperm... [more]
KAG6600728.11.6e-1953.91putative RING-H2 finger protein ATL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. so... [more]
XP_023545744.13.0e-0548.78RING-H2 finger protein ATL52-like [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
BLAST of CcUC10G192260 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC10G192260 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0L7Y81.2e-1277.78RING-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G104940 P... [more]
BLAST of CcUC10G192260 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 153..183
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 153..180

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC10G192260.1CcUC10G192260.1mRNA