CcUC09G185840 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC09G185840
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr09: 37043678 .. 37047720 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC09G185840
SyntenyCcUC09G185840
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGTTGTATTAGGTAACTTCGTTCATATTTGCTTCCTCCGTAGCTACCTTCAATTCTTTGTAGTCGTTTTAGAAAATCTACAAGTGTAATATTGGGCGTTCAACTAATTTCTTTTATGCATTTCCAAACTAAGATGTATTTGTTTTTTCTATTTATTATTCTTACGAGACAAAATGTTTAATTAAATTAAATATGATATTGCATTAAAATAATCTATATACTCCATAATTTTTTGGTGACTTAACACGATACCACTTTCCAAATCTAGAAGTCATATATATGTTCACTCTCATTATTGGGTCAATCTAGCTCAATCCGGCCCTAAAAGTTGAAGACCCAAATCCAAGGACATAAGACATTGTTGGGGCTTGGATTGGGCCAAATCCAACTTTTGATAGCAAAGGTCATGACCCAACCATTGCCCTTAGTTCATTGTTATGGACTATCTTTCGATGTTCCTTGAGGAAGCTCGAAAGAAAGATCTTATAACCGGTGCTAGCTACCATTATGGTCAATCCAAGGACATAAGACATTGTTGGGGCTTGGATTGGGCCAAATCCAACTTTTGATAGCAAAGGTCATGACCCAACCATTGCCCTTAGCTCATTGTTATGGACTATCTTTCGATGTTCCTTGAGGAAGCTCGAAAGAAAGATCTTATAACCGGTGCTAGCTACCATTATGGTCAAATTCATATCACTCACTTACTGTTTGCAAATGACTTACTTCTCTTTGCAAAAGCTAATCTTAATAAGTTCATGAATCTCAAGACATGGAGATATTTGGACAAAAAGGACAACATGTAGAGGAGATACATCAATTTTAAATATGCTCCCAGCAGCCCTAGCACCATTCTCACAATTTGTAATTACAGCAGCTCCAAATCTCCATGGTATCACATAGCCAAGCTCCAATCAAATGTGCTTAACCATATTGTTTGACATATCAATAATGGCAAACACACCTTATTCTAGTTCCACAACTAATCTCCCAACGGTGTTCTTTGCAAAAACGCCCCTCATATATTTGCCTTAACTAGCAATCTTCTATTGACTGTATTTGAGGCTTGGAACAGTGATCTCGCTACATGAGATATGCATTCGCGACGCCAAGCTAGATATCCTTCGTTACACCTTAACCTCAGCTGGTGTGTTTTGTGCAGGAATAGCGTGGAAATGATGGAGCATGCTCATTAACGGAAGTTTTTCTAAAACTATTTGGGATTGCCTCACTCATTTGGCTACAAACGATCTGATATCGACTCTGAGTACACTGCCAGAGCACTTGATCCATATCAAAATGACTTCAAAGGCCATAATTTTGTGGAGTAATATTATTGCAGCATCCTTGTGGTGTACTTGGAATGAAAGAAACAGAAGAATCTTCCAAGAGTTTGTTAAAACACAATCTCATGTGTGGGAAGATGTTATTTCATTGGCAACCACAATTAGAGTTCCAAATCTAACTAATTTTGTAATTATGATGTATCTTCCATCTCCCTAAACTGGAGGGCTTTTCTCTAGCCTCCTTTGATTTTATTTAAGCTACTCTCTAGCTGTCTCTGTATTGATACTGTCTCTTTTGTTGGAATGCATCATGACTCTAGGTATGATGAAGGTGCTAAGGAGGTGTCTGTTGGGTTTTATGTCTTAAAACTCGTGGTTTGTAAACTTTGAACATATTCTCAATAAAGTTGTTATCGAGGTTTATTCAGTAAAGATGTTATTGAATATGTGAGGGTCATTTATTAAATCCAATAAACTAAAAATCCCTGGCTATAGTTTGAATACTTAAACTTTATGTAGACATAAGAGTGGATCAAGTTTATAGGTAATAGACATAAGAGTGTATCAAGTTTAGGTAATAACCAAAACAGTCTATAGTATAAGGATAAGGTTGGGTACTTTATCTTAGGGACACTATGGATGCAACTCACTTTATATTTGATACAAACAATGTGATCTTATATCATTTATATAGAGACATGAGAGTGGGGACATCCTACGCAATGAGTTTGCATAAGATCGGACCATGAAATAATTATTTTTACTTTATAATGTCGTTTATTGTTAAGACTAATTATTTCAACAATGATGACCTAAGTAGCTCAATCTTAATCCTGAGTTAAATATGAATTCCTATTTATTTGAGATGATCCTTTAATCTGCATCGGTGAGAGTGGTTCGAGTTCCACGACTCAATAAATCTATCATTTCAGGGATAAGACCACATAGATAGCTGGGGACATAGTCCTACAAGATGCATTTACTCCTACCTAATTTAAGATTAGTAAAGAAGTTGTTCCCATAAGTACTAACTACAGGTCTTGAACAAGGGGCCCCACCCTCTCATTAGCCTGAGAGGGACTCGGTTTGATGGTTGGATCACAAACTAATTGTTCATTAGAGGATCAGTGAGACTTAATGAAGGAGATGTAATTACAGGGGTAAAATGATAATTTTGACCTAGCTGTAATTACGAGAACTTGTGAAGGATCGACTTACTAGTTGTGGTTATATCAAGTGAACGAAAATATATCTACAATGCGAAGAGTGCAGCTACTGGACTATAGTGAAGTGTCCTGGTAGTTAATGAATGTTAATTAACTAGGTTAAAGAGTTTAGCCGGTTAGTTTCGGATTGTTGGAGGTCATGATCTGTAGGTCTATTAAGTCCCATTGTTAGCTCATGGACTAAACCTTAGAACAGTGTGATGAAAGAATTTGAAAACGTTCAAATTCGTCTAAAATAGTAAATTTTACGGTTGTTCGTTTTAATTATAAATTGAACAAAATTGGAGAGTTAGAAATATTTAAATGTGATTTAAATATTAATCGGATAAATAAAGATTCATCAGATTGAAAATTGTTAGGAAAAATGGAAAAAAATATTAATTTAATATAATTAATTAGTGGAATTAATTTTAAATTAGAAAATGGAAACTCTTTTGTTTGAATTTTACAAAATCATTTTTGAATTTTCATGCATTTGTCCATTAATTGAACGTTGAAGGAGGAGGTGGGAGATTGCTAATCACTCTTTTTCCATCTTCATACACCTCCTAATTGAGTTAGATAACCAGCAAAATTGGTGTCAACTTGCATGTAAATCTAATTTGTATGGTTACTTCTTTAAATAGAAGAAAGAAATTAAGAAGAGAGGTTGATCTTCTTGGTGATTTTTGCTTAAAAACTCCACTTACTCAAAACTCTTCAAAACTGTCATTTTCTTACAAATTTGCTCCCAATTCATTACAAATTGGATCCTACAATCCATTCTAAGACTTGAGAATTACGAGGAAGATACTTATGATGGTCCATGAAGTGTTCGTGATCAAAAGAATTTGATTCAATTTTGAGCTATAACAAGTAAGCGTCATTGTTTCTGTTTTTCAGTTATAAGAACAATTATGTTTAATCCTTAAAATTGATGTAGTTAGGGTGCTTTAGATCCTAATTGTTTTTGCATTCATGTTTCTAACTCTTTCAGTGTCAACCTAGTTGAGATATCTCGGTGCACTTTCTCAACCCAAACTAGTATTATGTTAAAATATATATATATTTATTATTTAATAAATGAAAAATATATATGTATGTTTTAGAATTTATTAATGAAATGTTATTAAAATTTATGAAGCTTGTATTTTATTTTATTTATTCTATATTTTTATTAATTTTTAGATAAAATTATTGATATTATAAAATTTTATTTAATAATTAATCTATAATGTATTAAAAGGTGTGAAAGTAGGAAAAACTTTTTTTTAAAACATTTTTGTCCATTCTTTATTTTATTTATTTAGACAACTTAGGAATAAACTTTCACAATAGAGACAATTCTAGTTTTAACTTCTAAATAGAGTCACAGCAAGAAAAAATCTCTCCCAAAACCACACTTCCCGACACCAAAAACGGCGTCAGCCAAGAAAGCTTCATCCGACGAAAAAAAACAATTGGTAGTACAAAAGATCTCTCTCGAGACCATCGGTACAAGCGTGGGGATAAGCAGCCTCTCCCGACGGCATGTAGGTCGTCATCAGGATAA

mRNA sequence

ATGTTAAAATCTACAAGTGTAATATTGGGCGTTCAACTAATTTCTTTTATGCATTTCCAAACTAAGATGCTTGGAACAGTGATCTCGCTACATGAGATATGCATTCGCGACGCCAAGCTAGATATCCTTCGTTACACCTTAACCTCAGCTGAGTCACAGCAAGAAAAAATCTCTCCCAAAACCACACTTCCCGACACCAAAAACGGCGTCAGCCAAGAAAGCTTCATCCGACGAAAAAAAACAATTGGTAGTACAAAAGATCTCTCTCGAGACCATCGGTACAAGCGTGGGGATAAGCAGCCTCTCCCGACGGCATGTAGGTCGTCATCAGGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTAAAATCTACAAGTGTAATATTGGGCGTTCAACTAATTTCTTTTATGCATTTCCAAACTAAGATGCTTGGAACAGTGATCTCGCTACATGAGATATGCATTCGCGACGCCAAGCTAGATATCCTTCGTTACACCTTAACCTCAGCTGAGTCACAGCAAGAAAAAATCTCTCCCAAAACCACACTTCCCGACACCAAAAACGGCGTCAGCCAAGAAAGCTTCATCCGACGAAAAAAAACAATTGGTAGTACAAAAGATCTCTCTCGAGACCATCGGTACAAGCGTGGGGATAAGCAGCCTCTCCCGACGGCATGTAGGTCGTCATCAGGATAA

Protein sequence

MLKSTSVILGVQLISFMHFQTKMLGTVISLHEICIRDAKLDILRYTLTSAESQQEKISPKTTLPDTKNGVSQESFIRRKKTIGSTKDLSRDHRYKRGDKQPLPTACRSSSG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 54..111
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 54..78
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 79..100

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G185840.1CcUC09G185840.1mRNA