CcUC09G180220 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC09G180220
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr09: 31232252 .. 31240494 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC09G180220
SyntenyCcUC09G180220
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAGGTTTAACTTAGAGTTTGAATGCTTTCTGGTAAAAAAAAATCCTGGTAAATAATCTATCCATTCTCTCGTAATGGAAGCGACCATATTCTTATAGGAAAAGTGATAGAATGCTCAAATTTCCTTGTCAATTCCAAATGTATCAGGAAGTTGAGCACTCTGTCCATTTTCGATAAGGAATTGACCGTGACCTTAAGGGAAAAATGACAGAATGCCAAAATTTCTTAGTTAGTTCAAATTTACCAAGAAATTGAGCATTCTCTCATTTTTTCCGTAAGTAAGCGATCATGATCTTACGGAAAAAATGACAGAATGCTCAAATTTCCTGGTTAGTTCAAATTAACTAAGAAGTTGAGCATCCTGTTATTTTTCTCATAAGGAATCGACCATAACCTTACAACAAAAATGACAGAATGCAAAAAAAAAATTAGGTATTGTCATTTAGCTTACAAATCCCATGTTTTTATACCCTATTATTTGTTGTATAATTTGATATATAGAGGTATATAGAATGGAGTTGAGGATCTTGCCCAAGGAGTACTTTAAGGCATAGTTGATCTCTTGTAGTCATCTAGTTCACACCTATGATGTCATTATGTAGAAGTTAAGTAGGGTCCAATTTGATATGTTTAGGCAAACTATTTTTGGACATATCCTAGATTGTAACCTTGCCCATAATGGCCAACTTATACACCACTTGCTTCTTAGGGAGGCCATAGATGAGATATGAGACGTCATTTCTTTTAATCTGTTTGGGAATAGAGTGTCGTTTAGTAAGTATGAGTTTGATTTCATCACTGGGTTTAGATTAAGGATGAGGGATGTATGTAGGCCTGTGAACTCCAATAGGCTTAAGAGCATGTACTTTGATGTAAGAATGAATAAGAAGCAGTCTAAAGTGAAGAGTCAGTTCCTAGCACTAGACTTTTAAGAGTGATGAGGATGCAATAATAGTTTCACTTGCATACTTCACTGACTTTGTGATGATGAAGAGGGAGAAGAAATAAAAGTTTGACCAAAGTCTCGTGGGGGTCATGGACGATTGGGAGGTCTTCTGCAAGTACGATTGGACCAAGGTCATTTTCAGTAAAACAATCAACAACCTGAAGAGAGCTCTATCCCATATGATTAACCATGGCGACCCTAAGAAGACCGTGAGATACACCTTGTATAGATTCCTATTGGCTTCTAAGTTACCTAACATTTTCATTTAACCCATATTTTTCACTTTTTATTCTTTCTTTTCTTCTAAATATGATTACTTTTTTAGGTGTGGGTGTATGAGATGATTTTGTCTCTTATTAACCGAGTTTCCATTCATGCTAGTGAGACGATGATTCCACGTTTGTCTTGATGGTTGTGCACCTCTTCCCCGTCGTAAAACACACTAATTAGGTTTTCAAAGGTATGTCTTAAGTTTGCTAATTCATTCAATGTGATTGGTGTAGGAAAGGAATACAATTACCTCGAGATTGGTAGCCAATGTCAAGGAGGTGGCTTATATGGAGCGTACAACTGGACCTCCTAAGGCACGTGCACTATTTCTTTACTTGATCAATGTAGTTATACCAACAAAATTTTCACTTCGAGACGTGATTGGTAATCATGATGACTCTGAATGTCATAAGGAGGAGTCTGTCGATGAGGAGGGCTGTAACACCCTAGTCTTTGAGCTAGTTGCTTAAAACATATAAAGAAAGAGAACTAAGACAAAGGGTGTAAAACTTGGATCACAAGCTTGTGGAGTTAGAAAATCTTTTAGCCAGAAAATTGGGCTTCTGGAGTTAGCCAAATTTATAAGCACCATGCGTTGAGATGTAGGAAGGAAGAAAAGTGTTTGTGCCAACTTGAATTTTGGATTAAGAATAAGCCATAGATGAGTTTGGAAGAAAACCACGTTAGGCAATTTCGAGTCTTGGACAACAAAGTGACCTATGAGCTTAGGAAATCTTCTAAGTATCACAACTATGCTTTGAGAACTCAACTATTCTATGAAAAGTCTATAGTGGACACATAGTTGAAGGAAAATAGAAGAATTTTCACTAAGTGTTTAAAGAAGAAGAGTTGGAAGCATAGTTGGAAGCTAGTAGGAAGTTGGACACACACTTTGGAGGGGAACTACTATGTTGGATGCATAGTAGGTAATGTAGACGCATGGTGAGTTTTACTTAGAGGAAAATTGGTTAAGTGTTGAAGCGTTGAAAGTAAAACCTAGGTCTTGGAAAATAAGGTTAAACGCATAGGGCAAAGTTGAAGGAAAAACATCATTATACCTAGGGTAAACGCATAGGCTCTTCTCCAAAAGGATTTTGGTTAAGTCTTGAATTATTTGGAGAGTTGAGAAGCAATCCTAAAGAAGGAAAGTAAGGGTTGGGCGCATAGTTGATGGATTTTTGGGAAAAATGAGCTAAGTATGGGAGGCATAGAAGAGAAAAGTTGGAAGCATAGCATCGGAAGACACCCCATGGACACATGAGTGAGCAACCAAAGAGTCCATGAGGCCATGTAAGGAGCCTTGGACGCATGGACCCTAGGGAGGAAGGAAGTGGACGCATACCCAAGAGATTTCAGAAGAAACCACATGCATAGTGGAGCTTTATAAGTAGAAATTTGAGTAAATGTGGGAACCCCGGGTCTTGGTGGACGCATACCCCTAAAAAGAGGAAATTTTGGCTAAGTGTTGGACTCGAAAAAGAGAGTTGGACGCATAGTAGGGGATGTTGGACACATAGGAAAGTGTTGGAAATGAAATTTGGCTAAGTATAGAAAGACCGAGAGAAGAAAAGAGTGCAAAAGAAGCCAAACCCTAAGAGACAACATCTTGGACGCATGGTGTGAGGAAGTTGGATGCATGATCCTATCCCGGTACAAGGTTGGACGCATGGTTGGAAAATTTTGGTGATAAGTGGCTTCATTTGGGCTTAACACTTCATAAGAAAGAGGTGTCGGGATACATGGAAAGTTAACATGCAAGGAAACAAATGTGTGGTTGCATGTTAAGCTTACATGCATTGTGCCATGGGGAAACTAAGTGTCAACCTTAGAAGCAAAGAAGAGATGAGCAAGCATGTCTTCCAAACTTTATAAATAGGACCAAGGGGGAGAAGGAACTCTTATTCTACCAAAGGCACCGTAAGTTCTTTGAGAGAAAAGAGAGAGAGGAAGGTTGGAAGAGAGAGTTGGTGACCAAAGAAGGCTACTAGGCGTCCAAGAGTGTTGTTTTCTTTCTGTCAAAGTATCATCTTGCATCCACTAGGTAACCAAGCATCCAGAACTTCAAGGTAGGCGTTCAACTGAGCTGTTTGAGGAGGCAAGGTACTGCCCTATGTCCAAATCTATCAACCCTGCGTTCAGAATTGCTCTCTACGTCCAAGGAGGAAGTGTTAGGCATTCAGAAGGCTGTTTTAAGGTTTCTAAAGTTTTCAAGTTGCTCTATCTTAGATTCTAGAAGCTCGGGAAAAGCTAGAAGTTTTGGAAACTAAAACAGGAGGAGGAAACCATAGAGTTTGGAAACATACATTGTGAGTGGTTGATTTCTTTCCGTGAGAAAACTAAATTATAATACTTGTGAATAATTAAAGATAGCACGAGCTTATATTTAAGCATTATGTTGTGATATTATTATACATGCTATCGTAAGGTGTTGGATAATATGTTGAATGTGATAGCATGAGGTTATATGCATACTAAAAGATAATATATTGCGTATCAAGCCTGTTGGATATTAGGTCGTAGTTTCTGATGCTCGAGGGTTGCTCGAAGGCATCGAGAAACATGATATTCCAATGCCGAGGGACTTTTTGAGAAGGCATTGCTGATGGTCATGACTGGGACCTGGATTCATTACCGCATAGGATGGTCAGAGGGTGGAAGGACCTAGTTTCTGAGCCTATAGCGAGGATTTCCTCGTGGGATGGAGAGGGCCACCGAAGCCTAGTTTCTGAGTCCACGAGAAGTAGCCGAGGGGATGGTCAGAGGGTCGACGGGCCTAGCTCCTGAGCCTCGAAGGTAAGACTATATGCACATAGGGGAAACGTAAGGTTGGATACAGGAATGATGAGATTAGCTGAGCCAAGTGAGCCAACGGAGAAAAACCAGTCAGATTGCTAAGTCGTGGGAGTCAGCAGGATAAACAAAAGAGTTGTTGTGTCGGTGTTGCCAGCGGGAAAAGATGTTTCTAATAATAACCCTACGGAGGAAGTTGAGCATAAACTTGATATAGTTATGATTGTATTTGCTACCATTTGCTATCGCAATATTTATATATTGTTTGTGTGAAGGGTTGTTTGAACCCTAGTTTATTCAATCAGTCACCGGGCTTCGAAGAAGCTCATTCTTTTCTTATTTTCTTATGCTTTCTTTCAGGTAGCAGTCGAGTTCTCGTTGCTAAGCGAAGTCAAGGTTTGTCGAGATATCATGTGCTTTTGGTTATAGGCATAAGAATTTTTGTATTATGAGTCAAGGTCTGCTGAGAAATTATGTATATTTAGCCTTAGGCAGCAGACTAAAATATGAACTAGAATCATGTTTTCTGTAAACAAATTTGTTAAACAGTTATAATAATAAATTATGCCCTTGATTAATGAATTAGTTTATTTCTGCCTGTATAAATTGCATATGATAGTTCCGAAAAAGGTAAAGTTTTGACTGTAGGCATTGCAAGAGGGTCGGTGTCTGCTGTCCTCACGCTACGTCTCGAGCGGCTAGGGAGTGGCTCGAGGCAGGGTGTGACAAGGGCAATCAGGAGAATGTTCATGACGAGGGTCTCCCTAATTACAACCACAAGTCTTTACAATTTACCAAGATGTTTATGTGGTCGTTGAGGCAGAGAAAAGAAAGTTGGAGGAAGCTTAGGAAAGAACAAATTGGCTATGAAGAAAGAGATTGAGAAGTTGGAAGATATTCTAGTTCCAACTACATTACAACGCATACTTCTTACGGATCTCGTTAAGGAACCCAATGTCAAGCGAAAAGTGATGACAGCCATGGAAGCGAGGT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mRNA sequence

ATGAGGTTTAACTTAGAGTTTGAATGCTTTCTGTTTCGGGGATCTCAAGATGGTAATGAGGATATCAGAACTAATGGGATGTGTTCTGACACTGATACATCCTCGAGAGATGAGGGCAGTAGTGATCATGTCATTGCACTCGGGCATATAGGGTTAGGTTTTAATTCTTCTATACCAAATGGGGATAAAGCTGCTCAGACTGAACTTCATGCAAAGAAGGATCCTGATCAAGTTGGTGCCGAGATCAAGGTTAATGCCCAGGCTAACATTCCTCCAGTGAAGGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGGTTTAACTTAGAGTTTGAATGCTTTCTGTTTCGGGGATCTCAAGATGGTAATGAGGATATCAGAACTAATGGGATGTGTTCTGACACTGATACATCCTCGAGAGATGAGGGCAGTAGTGATCATGTCATTGCACTCGGGCATATAGGGTTAGGTTTTAATTCTTCTATACCAAATGGGGATAAAGCTGCTCAGACTGAACTTCATGCAAAGAAGGATCCTGATCAAGTTGGTGCCGAGATCAAGGTTAATGCCCAGGCTAACATTCCTCCAGTGAAGGATTAG

Protein sequence

MRFNLEFECFLFRGSQDGNEDIRTNGMCSDTDTSSRDEGSSDHVIALGHIGLGFNSSIPNGDKAAQTELHAKKDPDQVGAEIKVNAQANIPPVKD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 16..40
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 18..34
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 73..95

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G180220.1CcUC09G180220.1mRNA