CcUC09G178920 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGTTTCTCAATATTTACTTCATTTAATTGCAATGAAATGAACTTATGTTATTTTAGTTAATTAAATATGTCAATTGATTATGCTTCAGTCGTTCAAGCTTTTATTAACTTAATGCTTGTGATCTTCCAGCTAAGGATTATTTATCCTGTTGGTTTAAATTGTGTATGCTTGGAAAAGTAGGATTTAGACTTTTAGACTAGAAAAATAATTGTTGGACTAAGGACGGTTCAAATTGAGAATGATTAGGGATCCTTTAGAGGTATTTAAAAGAAGTTGTTTCGTTTCTTATTTTCTGTTTTTGATTCATATTTTTTAAGAAACAAACTTGTTTGATAACTGTTCCCGTTTCTTATTTTTAAATTTTAAAAAATATTTCTCAAAATTGGGCCAAATTTGAGAAACTACTTCCGTATTACGCTATGTTTCTATTTTATTGTATGCTGGTCCAAAATGTTCCAAAACAATTATCCTTGGTTCATTCCTCTAAAGTCATTATTCTTTCTTTCAATTGTGTGCTCAAGTCCCAAGTATGACATTTTTATTTCATTTTATCATATCTCTTTTATTTTATTCTCATCTTTTATATATTCATTTTCTTTATTAATTTTTTTTATTTAAAGATATAGATTTTGCTATATTTATATTTTATTTTAATTTTGAGTTTTAAAAATTTCGAAATATTTATATTTGATAGCTTTCGAAAAGAGCTATTATATGCCTTTAATCTCAATTGCTTGTTGTGTTTAATGTGCTTAAATGATTGAAATTGTGGATTCTAGAGCAAAACATGCATTTCGGAGTGTTACGTGTCGTTCAGGGTTGATTTGGAGCTATTAGGAGTCGTAACGAGAACCTAAGGCTTCAAAGGGTGAAATGACAAAAAAAAATACCCCCAGAAGAGCGCCCAGGCACTAGTAGACGCTCATTTATGTGCCTAACACCCGAGAGTAGCATTTTGGGCAGCGCGTACTAGCATTGAAGAGCTACGTGAGACTATAAAATTTGCACTTCTGTTTTTAGGTCATATCTTTTGATTCGGCTAGCCGTCTTGGGCGAATAACCACTCATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTACCTTTATCCATCTACAGCGTTAGTTTTTAGGTTTTAAATTTTTTTTTTCTGTAATCATGAATTGGAAGCTCTTCCCTCTCCTTATTTTTTCTGTGAAGATGTTTAGGTAAGTGATTTCTATTTCTTGGGAGCAAACCCTATGTAAATGTATTAAGATTTATCTTAATGAACATTATATTGTGATTTTTACTTCTTTGAATACGTTTCAAGTTCTAGATGTCTGTTTCTTGGATGGATTGACGCCCCTACCTTAGATGTATGTCCATGGTAAGTGTTTTGTAGCTTGCGTGATGTGTCTTCCCCTTCATCTAGCTATAATCACATATGTAGCAAATAATTGAATTTTGTATGCTTTGGGTTTAAGCTTTTTTTGGATCTTAGGATGCATGTTTCAATTAGGTTCAAAGATTAATTGATAAATTAAGTTAGGGCTTTCCATTAATTAATCACACAATGTAATCTTAGGACTTAATGCACACGACCTTAATGTTATTTAACCGCTTATCGAACCTAATAAGACCTTGTTGGATTTTATGTCCTAAAACTCGTAGTTTGTAAATATTGAATATATTCTCAATAAAGTTGTTCTCAAAGTTTATTTAATAAAGATATTATTGAATATATGAATTGCTTATATCACTCTTCTAAATCCAATAAACTAAGAACCTTTGGCTATATTATGAATATTTAAACTTTATGTGTAAACATAAGAGTGGATCAAATTTAAGTAAATAGTCAAATGGTCTATAGTATAGGGATAAGGCTGAGTACCTTATCCTGGAGACACCATGGATGTGACCCATTTTGTATTTGATACAAACGATGTGATCCTATATTATTCATGTAGAGATATGAGAGTGGAGGCATCCTATGGAATGAGTTTGTATAAGACCGGACTAGGAAATATTCACTTTTAATTTACAACACCATTTACTATTAAAAGTGATTATTTCAACCTGATAACCTAGGTAACTTGACCTTAATCCTAAGCTAACTATGAACTCCTATTTGTCCGAGATTATCCTTTAATCTGCATGAGTGAGAGTGGCCTGAGTTAAAAGAGTTTGAAAGTGTTCAAATTCGGTTAGGAAGCAAATTATATCGGTTTATTCGTATAATTGTGAATTCGACGAAATTTGAGAGTTGGAGATATTTAAGTATGCTTTAAATATCGATCGGATGAATAGAGATTCACCGGGTCAAAAATTGTCGGGACAAGTGGAAAATTATTAATTTAATATTTTAATATTTTTAATTTAATATAATTAAGGGAAAATTATCTTAAATGGCAAAACTGCAGAAAATATTTACAACTAATAGCAAAATACATAGTCTATTTGCGATAGACCGAATAGATCGCAATAGATAGTGAAATTTTGCTATATTTGTAAATATTTTGGTTCACTTTGCTATATTTGAAAAGAGCCCTATAAGAATTAAATTGTTTAATTAATTATTATTTAAATTAATTATATAGTAAATTAATATTATTTAATTAATTTATGAAATTAATTAAATAGAAATTGAGAATTTCATTTTGCATGAGAAAGCATGAGGTGTTGGTTTGAAAACTCTCATCTACTTCTTCATGCTCCACTTCCTTCTTTTTGCCTTAATCACTAATGTTGAAGAGTCAATTTCTTAGCTAAGAAGTTTAACTAAACTTCTTCTATAAATTGGAGGAGAATTGATTGGAATTGAGTAAGGTTTTGGGTTCAATTTTGTTGAAAATTGAAGAAAATCCATAACTCTCATAATTGTGTTCTCTTAAATTTGCTCCAATTTCATCAAAATTTGGATCCCACAATCCATTATAAGGCTAGAGAATAACGAGGAAGACTCTTGTGGTAGTTCACCAAGCATTCGTGATCAAAATCTTGGAGAAGACAGCTTCAATTTTGAGCTACAAGAAGTAAGATTCTATGCCTCTCTTTTCGGTTCTTAGAAATTGCATGTTTAATCCTCAAAATTAATGAAATTAGAGTTCTTTAGATCCAAATTTCTTCCGCTAGACATGCAAATTAATTAGGGCTAAATGCTTTAATTGATAGTTGGTCTCTTGCTCGGTTTAGCCCAATTGATTTGGCTACCTATAACGTCGTTGAATTTGGATGAATTGGGTAAGTCGGTGTGAATGCATAATCAAATATATGTTTATCAAGATATTTCAATGATAGAAGTTACATAGGAACCCAATTTCCTCCTAATCACTTGTAGAAATACAAGTTATCATAGTTCTTTTCTTAGAATAGTTGAGAGAGTTTAATAAACCATGCGTCAATATTGATAGAATTTATTGATTAATATATTCTCTGTGTTCAGCATGTTGAATTACTTAAGAATTATTTTATTGATGTATATCCATTCTAAACGCCTTATTTTTGCAGAAAAAGTGGTAAGATTAAACTCATGCGTTGAACAAACATTTTTTGAGACAAAACCAAGAAACCTAAGATGCATGCTTTGGAATCTCTAGCATTTGCAACCTGATCCTTAAAAGATATTCTGCCTCAACTCAGTGCTGACCCTAATAGCAGCATTGCAATCAATCACCTACTAGTCAGAGGATGGACGAGAGGTAGATGCATAGCCTGGAGAACATCAACAATGAAACATCAACATCCCAAAGTACAATGCAGGCTCTATAAATAGACAACTCTAAAGGCAAAAAGAATGTTGTTGAAACGTTGAAAGTTCGGCCATCTTTGTGGAGTTAGTCACTTCCATCAGAGAAGACAACCAGAGATGGAGAGCTCAGGAGAGCAATCTTCTTAACTTGTCGTCCAACCACCACTATTGCACATAGTGAAGTACACGTCCAACATGTCGCTAGAAGCAAGACATTGTTGCCGCCAACTTTACTCCCTGCTTTCTTATCTTTATGCTTATCTTTCATTGCTGTTTATAGTTTTTATTTCAAGACATTGAGTAACTTTTGTAACAACTTTTCCAATCTAATATATTCATCTATCATGAACTCCATCTCTTTCTTCTGTCATTTTCTTTGTTAAGACCATGAGTAACTAAATCTTTCAAAGGTTGGGGTAAAGTTATCATCTTTCCAGTGAACAAAGCTTAGAAGTTAGTCCGTTTTGCTTAATGTATTTAAACTCATTGCTTGTTTCCATTTAGCTAATTGAAATAAGTAGCTATAATCAACTGCACGAGAGAATAAGTGCTTGTGGATCTCATTAAACAAATTAAGTAGTGTTTCTAGAAATAGAAATAATCTCTTGTGGATCTCATTAGGCAAAGTAAGTAGTGTTTCTAGAAATAGAAATAATCTCGTGTAGATCTCATTAAGCAAAGTAAGTAGTGTTTCTAGAAATAGAAATAACCTTAAGTTCAACGAATCTTTAAGCATGCATCATAGAGATATGGTTTCACTACAAGATCTTTTGTCTCTGCCCACGCAAAAAAAACGTCGGCAGATCTTCTGGGCAAAGCTTCTGTGGACATTTTTTTTTCTGCGTGGGTAGACAATGTCGGCAGAAGGCCGTGGGCAGAGCTTCTGCCCATGCATCAACATTCGTGGGCAGAAATTGATTTTTGGCCATGCATCAACATTTGTGGGCAAAAATTGCATTTTTGCCTACGTTTTATGCGTGGGCAGAAATCACGCAGTATCACTTCCGTTGGCAAAACTTGATTTCTACTAACGCATAATATGTCGGTAGATAGTGTTTTGTCTACACAGGTAAACATGGCAAAAAGCTTCATTTTTGCCCATGCACAAAACGTCGCCATAGCTCTATAACTGCCAACACATTTATTGTTATTATATTATATGCTTGGGGATCGATATTTAAAATAAAAATAATTTCAATTTCTTGTAACAAAATATGTTCAACATCATAACAAGTTTAGACAATGTATTCAACTTTTAATTCCTTGACC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BLAST of CcUC09G178920 vs. NCBI nr
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BLAST of CcUC09G178920 vs. NCBI nr
Match: YP_009940669.1 (NADH dehydrogenase subunit 4 [Passiflora edulis] >QNZ92486.1 NADH dehydrogenase subunit 4 [Passiflora edulis]) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.5e-07 Identity = 37/49 (75.51%), Postives = 40/49 (81.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. NCBI nr
Match: QNP08665.1 (NADH dehydrogenase subunit 4 [Rosa sp. JP-2020]) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.5e-07 Identity = 37/49 (75.51%), Postives = 40/49 (81.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. NCBI nr
Match: KYP78095.1 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, partial [Cajanus cajan]) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 1.5e-07 Identity = 36/44 (81.82%), Postives = 38/44 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. NCBI nr
Match: QIS40634.1 (NADH dehydrogenase subunit 4 [Quercus variabilis]) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 2.0e-07 Identity = 37/45 (82.22%), Postives = 37/45 (82.22%), Query Frame = 0
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Match: Q04050 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Brassica campestris OX=3711 GN=ND4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 1.0e-09 Identity = 34/34 (100.00%), Postives = 34/34 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P93313 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ND4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 5.0e-09 Identity = 33/34 (97.06%), Postives = 33/34 (97.06%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P27572 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Triticum aestivum OX=4565 GN=ND4 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 5.0e-09 Identity = 33/34 (97.06%), Postives = 33/34 (97.06%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P26848 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Marchantia polymorpha OX=3197 GN=ND4 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 5.5e-08 Identity = 31/33 (93.94%), Postives = 31/33 (93.94%), Query Frame = 0
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Match: Q37617 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Prototheca wickerhamii OX=3111 GN=ND4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.2e-07 Identity = 30/36 (83.33%), Postives = 31/36 (86.11%), Query Frame = 0
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Match: A0A151UFL3 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (Fragment) OS=Cajanus cajan OX=3821 GN=KK1_048933 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 7.4e-08 Identity = 36/44 (81.82%), Postives = 38/44 (86.36%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7H0DH55 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Rosa sp. JP-2020 OX=2761897 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 7.4e-08 Identity = 37/49 (75.51%), Postives = 40/49 (81.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7M3TY68 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Passiflora edulis OX=78168 GN=nad4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 7.4e-08 Identity = 37/49 (75.51%), Postives = 40/49 (81.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6H0AM55 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Quercus variabilis OX=103481 GN=nad4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 9.7e-08 Identity = 37/45 (82.22%), Postives = 37/45 (82.22%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6B9CW97 (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 OS=Peganum harmala OX=43879 GN=nad4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 9.7e-08 Identity = 37/45 (82.22%), Postives = 37/45 (82.22%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G178920 vs. TAIR 10
Match: ATMG00580.1 (NADH dehydrogenase subunit 4 ) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 7.1e-11 Identity = 34/34 (100.00%), Postives = 34/34 (100.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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