CcUC09G176950 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC09G176950
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionProtein TIC 214
LocationCicolChr09: 19913875 .. 19938856 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC09G176950
SyntenyCcUC09G176950
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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GTATATGGTTTGATAATATTATCTGAGCATGATTTGCCTGGATATGGAATAACGAATTATTATTGCTTATATATTATCATACTTTGAATACAGTTTTGATTTATGTATGAGTTAAAGAAGGGTTTTACTAAACATGTCACTCACTGGGCAACCTAGCTCATGTTTTCTCTGTTTTTCTGTTTTTCAGGTAGCGAGTGAGTCCGGGGTGCTTAGCCTACACAGCAACTCGTCTGGGCCACCATCAGTGTCTGGAATTTTGAGAATTGTAAATATTCGATCTTAAACCTGTGTTATACATATAGAGGATTAAAGGCAGAAGTTAGTGAACTTGTGTAAATTAAAGGTTGAATGTAAATCAATAGTTGGATGTTCAATAATTGTGTATATCTACTTATTAGGTTTTGGTCAAGGTATAAGGTTGGCAGTGGATGCCGTAAGAGGGTCTGTCCTCACACTTTTCCCTGAGTTAAGAGGGTATCTGGGAGGGGGTGCGATAGTGATGGTATGCGGACATTGATAGGGCCAGGCTGACAGTGCATGTGCCTCAGATGCCCGTACTACATTCTCTATATGAGCCACTTCCTCCGCACTGGCTACCAATCTAGTGGTAACTACGTTCAGTCCCTACACATCATGTAGAGTGGATTACATGGCTAAACTATGAATGAAGACATAATAAGAAAGAAAACATAACAAGAAGATGGTTAGTTTCCTTTCCTAGTTTGACTTAAAGATATCCTTGTAGAGGATGTTGTATGATGGGGAAGTATTGCACACCCAACTCAATAGACGTGGAATTGTCATCTCACTGGCACAAACGGCAACTCGGTTCATAAGGGACGAAATCGTCTCGTATGCCCACACCTAAAAAATAGTTAAATTTAATACATGAAGAAGAAAGAAAAAATATATATGAATCTTATGGACAAAAAGATTATCTAATCTGAAAGGCAATATGGAACCCACAAAACGTGTATCTCGCAGTCTTGGTGAGTAGCCACGGTTGATCGCATTTGTCAGCTCTCTTCAAGGTGTTGATCATCTTACTAAAAATGACCCCACTCCAGTCATAATTACAGAAGAGACCTCTCAATCATCCACCAACCCTAGGAGCTTCTGGTCAAATCTTTGTTTCTTCCTCCCCATCATCACGCAATCAATGAAGAATGCAAGTGCGACCTTCACTGCATTTTCATCACTCCTAAACTCTATGGTTAGGAACTCCTTTTCTGCTTCAAACTATTTCTTATTCGTTTGGTTCTCAAAGTACAACCTCCTAAGCCTACTCGAGTTTGCCACACTCTGTACATTCCTCGTCCTAACCCTAACCCAATTACAAGGTCAAACTCATTCTTACCAAATGACATTCTATTCTCGAAAAGGTTGAACAAAATTACATCTAGCCTCTCATCTAGGACCCCCCTAAGAAGTAGGAGGTGTATAAACTAACCATTAAAGACAAGGTTACAATCTAGGATGGGTCCAAAAATGGTTTGCCTAAGCATATCTAACTAGACCCTAGTTAACTTCCTCAAAATGACATATCGTGTGTGAACTAAATGACTATGAATGTCAACTGTGCCTTAAAGTAGTCATTAGGTGCCGTAAAGTAGTCATTAGGCGCCTTAAAGTAGTCGTTAGGCAAGATCATTGGCTCCATTAAATCCCTATATATCATACAATACAACAATTACTATGAGCATGGGAATTGGTACTAACATACATAAAGCCTTTAAGGATTCTATGATTTTTCCCATAAGTTCATGCTCGAAATCTTATAGGAAAAGTCATAGAATGTCCCAAATTTTCCAAAAGTTTTGAACCTACCAAGAAATTTGGGTTTTTTGTGACTTTTCCAGTAAGTTATCGGGAAAAATCACAGAATACTCGAATTTCCTGGTAGGTTCAAAACTTTTAGGAAATTTGCCATTTTATGACTTTTTTTGTAAGGTTTTGTTGGAAACCTTACGGGAAAAATCCTAGAATGCCCAAATTTCCTGAAAATTCAAGTGTAAACATGAAATTTGTCTGTCACTTTTCCCGTAAATTCATTCAACTTACGAGAAAAATGAACTTACGGGAAAAATGATAGATAGTAAAAATGCATACCAAAATTTTTTTATCTGATTTCAGACATTTCCTACACATATTAAACCTCGTCTACCAAAAAAATTCATTTTGTTTTTTTGTTTTTTACCAAGAACTATTCAAAAACTTAAATTTGTTTACTGTTTCAAAAATGAACTTCTTTGTGGATTTCTTTCCAAAAATCAGGTCAAATGGGGTGGGGTTTTACCACAAATGACAGAAACTAGAGAGTACTGTTAATGGACTCTAGACAAAGTACCTTTGTAAAAATTGAAGATACTTATGTAGAATCCAACAACGAATGGAGATCAAACCAAAATCGAGAAGATTCAATCATTTTCGAAAAGAAGACAAGAGTTTTCAAGGATTCAGAAGAAGGCAAGGATGGTTTCAGAGCTTAAGGAAGAAGACAATGGTTTGAGGAAGATGATTTGAGGAAGAAGACGATCATTTCGGGAATGTAAGGAAAATGGAAAACTTTCGGGAAACACTATATGAAAGGGGAAAAGTTGAACTTTAACCATTGGGATGGTGAACCGGCTTTCAGAAAACTCTATAAAAGGTAAATGATAAAGTGGTTAGAAAAGGAAGTTTTTAAAAAATGGTTAATTTTGTCTCATAAAAAAACATTTTAGGTTAGAAATAACAATTTTCCACCTTATTGATTTTCTTATTTTAGTTTGCAATCCACTCTTTAGTATTGTTTAATTTTAAAAACGAAGACAAATTTAAAAAACGAATAAAACAGAACAAAACAAAAATAGTTGTTTAGAACCTTGTTTTTGGTCTTAACAGTTGACTAAAAATTCAAATGTTAAAGATACGAGTATAATGATGAAATCCATGGGTGAGAAATTGTTTAAAGAAAAAAAATCAAAAGGAAAAAATGAAATGGTGAATCATGCAAGTGAGGAAGATTCATCAGGTGAACTAGTGAAGCTAAATATTGAAGTTTTTGCTATCGGTTTTGTATATTTCCTCTTCGATTTCTTTTTGGTTTTTTGGCCTAAATTAATTTTGTGTGGAGGATGAAACAAACACACCAAAATAAATAAATATTATTTTAGGTTTCTTCAATTTTAATCTCCCTACTTTCAATTAATTTTAAATTTAATCTCGGATCTTTTATCCTTGCCTTGAATCATTGGGTTTAAACATTACTTCGGTGATCTTTAATCGTTTCACCAAAATTATTTTTTACTGAAATTAGTTCAATAATGATAATGGTTTTCATGCAATTTGTAAATATAGATAGACTATAATTGAACAAACTTCAAAGTATAGAGACAAAAATATTTTAATATAAATATTAATTCATTTGTGGATATTAGTTTAGTGATTTTTACATTAAAGAATACTTTTTTAACGTTAAGATATGAATGGTACTTTAAAATTGGAAGTTTAAAAGTATAATTGCAACTACTATCATACTTAGTGGTTTTTGCAATTTGCTCTAACAAATATAAGTAAATTTGTTTGACTAATTAACTAATCGATGCCAACTTGCCCACTTGATATTATAATACTTCCCCCCTCAAGTTGGAGTGAAGAACTAAATTTAGTAAAACTGATTGCAAGGTGGAATAAAGGGAAGCACTAGTGGACACATCTGCTAATTGTAAATGTGAGCATACATGCATCAGTTTCAGAACTCTTTCAATGATCATAACTCTTTCAATGATCTTTCCCGGCACAAAATGACAATCAAATCTCAATATGTTTCGTACTTTTCTAAAAAAATAGGATTATTGGCAATAGTCACTATCACGACTGCTTGATTATTGCAATATACAAAACTGATAGCAAGACTTCGAATTTAGCTTCACTAATTCACCTGATGAATCTACACTAATTAACTTGTCACAGTTGCCAATTTACAATATTTAGCTTCTGCAGATGATTTAGATACAGTAGGTTGCTTCTTGGATTTCCAAGAAATCAAGGAATCTCCAAAAGATACACAAAAACCATGTGACAGACCGACCGGTGTCAATTCAAGCTCCCCAATCTTAGTCTACAAATGCATACAGCTGAAAATTGGGAGTTGGTTTTAAGAAGATTCCTTGTGCATTGAAAATTTTAACAAATGATGTGCAACCTTTAAATGAGCTTTTTGAAGAAATTGGCTTAGGCAATATATTGTGTAACAAATATCAGGTTTAGATATAGCAAGCAGTCGGCCATATTCAATAGCACTTTACTCAGATAAAAGGATCACCAACTTCTTTCGATAACTTCAAGCTGGGTCCATTGGCAATTTTACTTGTTTAGATTCTAAAAACTATTGTCTTAAGTATTTAAAAACAATTTTTCCTTTGTGACATGAATAGACCTATTTGATATCTTAAAATTTTCAATCCAAGAAAATGTCTGACTGCTTCCATATCTTGCAGCATGAAATGGGTCTTTAAAAATACAAACTAACACAGTTAAATTTTTCAATATTTGTTCACAAAACAAATACAAGTTAATTTGTTCAACTAACTAACTAATCAATGCCAACTTGCCTACTTGATATCATAAGGAAGTGTTTCTCTGGAATTCTTCAATAAAGTTTCAAAAACTTCGTCCTAGAAGACGTTCAGACTGGGCCTGTGAATGAAAATACTAGTGAAGACTAATCGTTTCGTGGTAATTGTGTGGGGCAATGTATGTTTAATTAAATAGTATATGTTGAGTTTTTAATTTTAAATTACCATGGCAAAAACTAAATTCATGAAAACCATCATTCTCATCCATCGTCCATTGCCTTTTTGCCCAAGGGCAATGCCATTCACTTGAAATTTTCAATGAGTTGCGATATTTTTAATTGAGACTTTTGTTGAAGGAGAAAGAAGAGACTTTTGTCAAATGGAGAAGAAAAAGGAAACGAAGAGGAAAAGTGGGTAGGATGA

mRNA sequence

ATGGCAGCGATGACGAAAGGCTACTTCAATGACGGAAACTGCCGGAAACTCGAGAGGGTCGCCTTTGAAAGCGTTCGCCGCTTATGCAATAGAAGGGGGCTTAGCTCTGGATCCCCCCTGCTTGCAGAAATGAATGGATTAGAAGGAGGCTGGGTTCGATTTCTGGGCCAGGCGGGAGGTGAAGGCCATAAGAGAAGATTCCCTAGTAAGGAAGAGAAGAAAAAGCCCTTCGTTTCGCCAACAAAGAAGTCATCTTTGACGATTTCCCATTCCTTCTTTGCCGAGCCGCCTCTCTTCGCCATTCGAAGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACCAGAAACTCAATGCGTAATCTTAGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAGTCAACATTTCTATGTTTCGATGCAACAACAAGATGAGAAAGAAGAGACTTTTGTCAAATGGAGAAGAAAAAGGAAACGAAGAGGAAAAGTGGGTAGGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCAGCGATGACGAAAGGCTACTTCAATGACGGAAACTGCCGGAAACTCGAGAGGGTCGCCTTTGAAAGCGTTCGCCGCTTATGCAATAGAAGGGGGCTTAGCTCTGGATCCCCCCTGCTTGCAGAAATGAATGGATTAGAAGGAGGCTGGGTTCGATTTCTGGGCCAGGCGGGAGGTGAAGGCCATAAGAGAAGATTCCCTAGTAAGGAAGAGAAGAAAAAGCCCTTCGTTTCGCCAACAAAGAAGTCATCTTTGACGATTTCCCATTCCTTCTTTGCCGAGCCGCCTCTCTTCGCCATTCGAAGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGAGAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACCAGAAACTCAATGCGTAATCTTAGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGTCAGATTAGTCAACATTTCTATGTTTCGATGCAACAACAAGATGAGAAAGAAGAGACTTTTGTCAAATGGAGAAGAAAAAGGAAACGAAGAGGAAAAGTGGGTAGGATGA

Protein sequence

MAAMTKGYFNDGNCRKLERVAFESVRRLCNRRGLSSGSPLLAEMNGLEGGWVRFLGQAGGEGHKRRFPSKEEKKKPFVSPTKKSSLTISHSFFAEPPLFAIRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKMRKKRLLSNGEEKGNEEEKWVG
Homology
BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
Match: YP_009753666.1 (Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana] >QIT04685.1 Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana])

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 3.4e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 8   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 67

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 68  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 127

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 128 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 165

BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
Match: QJD26342.1 (Ycf1 [Trichosanthes kirilowii] >QJD26429.1 Ycf1 [Trichosanthes kirilowii])

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 3.4e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
Match: YP_009430686.1 (photosystem I assembly protein Ycf1 [Gynostemma cardiospermum] >ART65049.1 photosystem I assembly protein Ycf1 [Gynostemma cardiospermum])

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 3.4e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
Match: YP_009738261.1 (Ycf1 [Siraitia siamensis] >QIB71654.1 Ycf1 [Siraitia siamensis])

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 3.4e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
Match: YP_009440204.1 (hypothetical chloroplast RF19-like protein [Gynostemma longipes] >ATG86915.1 hypothetical chloroplast RF19-like protein [Gynostemma longipes])

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 3.4e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A6MM95 (Protein TIC 214 OS=Buxus microphylla OX=153571 GN=TIC214 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 301.6 bits (771), Expect = 9.2e-81
Identity = 151/155 (97.42%), Postives = 152/155 (98.06%), Query Frame = 0

Query: 104 NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQL 163
           NL+SLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQL
Sbjct: 10  NLLSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQL 69

Query: 164 MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV 223
           MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV
Sbjct: 70  MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV 129

Query: 224 FLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           FLNNLIFQLFNHFILPSS L RLVNI MFRCNNKM
Sbjct: 130 FLNNLIFQLFNHFILPSSTLARLVNIYMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q09WW0 (Protein TIC 214 OS=Morus indica OX=248361 GN=TIC214 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.5e-80
Identity = 154/161 (95.65%), Postives = 154/161 (95.65%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM---EEGTEKKVSATTG 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTG
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGEEGTEKKVSATTG 66

Query: 161 FITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRN 220
           FITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGST RNSMRN
Sbjct: 67  FITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTNRNSMRN 126

Query: 221 LSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           LSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNI MFRCNNKM
Sbjct: 127 LSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNIYMFRCNNKM 167

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2MIC9 (Protein TIC 214 OS=Solanum bulbocastanum OX=147425 GN=TIC214 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.5e-80
Identity = 150/155 (96.77%), Postives = 152/155 (98.06%), Query Frame = 0

Query: 104 NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQL 163
           NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQL
Sbjct: 10  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRALVMEEGTEKKVSATTGFITGQL 69

Query: 164 MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV 223
           MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV
Sbjct: 70  MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV 129

Query: 224 FLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           FLNNLIFQLFNHFILPSSML RLVNI +FRCNNK+
Sbjct: 130 FLNNLIFQLFNHFILPSSMLARLVNIYLFRCNNKI 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2MI42 (Protein TIC 214 OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=TIC214 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.5e-80
Identity = 150/155 (96.77%), Postives = 152/155 (98.06%), Query Frame = 0

Query: 104 NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQL 163
           NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQL
Sbjct: 10  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRALVMEEGTEKKVSATTGFITGQL 69

Query: 164 MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV 223
           MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV
Sbjct: 70  MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV 129

Query: 224 FLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           FLNNLIFQLFNHFILPSSML RLVNI +FRCNNK+
Sbjct: 130 FLNNLIFQLFNHFILPSSMLARLVNIYLFRCNNKI 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2VEC3 (Protein TIC 214 OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=TIC214 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.5e-80
Identity = 150/155 (96.77%), Postives = 152/155 (98.06%), Query Frame = 0

Query: 104 NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFITGQL 163
           NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRA VMEEGTEKKVSATTGFITGQL
Sbjct: 10  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRALVMEEGTEKKVSATTGFITGQL 69

Query: 164 MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV 223
           MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV
Sbjct: 70  MMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSIQCV 129

Query: 224 FLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           FLNNLIFQLFNHFILPSSML RLVNI +FRCNNK+
Sbjct: 130 FLNNLIFQLFNHFILPSSMLARLVNIYLFRCNNKI 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3S424 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii OX=3677 GN=ycf1 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3RWE9 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii OX=3677 GN=ycf1 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1P8LE53 (Ycf1 OS=Citrullus mucosospermus OX=519315 GN=ycf1 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3RU58 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii var. japonica OX=61011 GN=ycf1 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3S6W7 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii var. japonica OX=61011 GN=ycf1 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80
Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT
Sbjct: 7   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMEEGTEKKVSATTGFIT 66

Query: 161 GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 220
           GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI
Sbjct: 67  GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRNLSI 126

Query: 221 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM
Sbjct: 127 QCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 164

BLAST of CcUC09G176950 vs. TAIR 10
Match: ATCG01130.1 (Ycf1 protein )

HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 8.0e-80
Identity = 151/161 (93.79%), Postives = 151/161 (93.79%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM---EEGTEKKVSATTG 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTG
Sbjct: 8   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMDEGEEGTEKKVSATTG 67

Query: 161 FITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRN 220
           FI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRN MRN
Sbjct: 68  FIAGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNEMRN 127

Query: 221 LSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           L IQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSML RLVNI MFRCNNKM
Sbjct: 128 LRIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLARLVNIYMFRCNNKM 168

BLAST of CcUC09G176950 vs. TAIR 10
Match: ATCG01000.1 (Ycf1 protein )

HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 8.0e-80
Identity = 151/161 (93.79%), Postives = 151/161 (93.79%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM---EEGTEKKVSATTG 160
           I  NLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTG
Sbjct: 8   ILGNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMDEGEEGTEKKVSATTG 67

Query: 161 FITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNSMRN 220
           FI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRN MRN
Sbjct: 68  FIAGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFWNNHKHFFDYGSTTRNEMRN 127

Query: 221 LSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           L IQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSML RLVNI MFRCNNKM
Sbjct: 128 LRIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLARLVNIYMFRCNNKM 168

BLAST of CcUC09G176950 vs. TAIR 10
Match: ATMG00370.1 (Ycf1 protein )

HSP 1 Score: 281.2 bits (718), Expect = 9.2e-76
Identity = 147/162 (90.74%), Postives = 148/162 (91.36%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM---EEGTEKKVSATTG 160
           I  NLV LCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTG
Sbjct: 7   ILGNLVYLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVMDEGEEGTEKKVSATTG 66

Query: 161 FITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFH-FFWNNHKHFFDYGSTTRNSMR 220
           FI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFH FFWNNHKHFFDYGSTTRN MR
Sbjct: 67  FIAGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFFWNNHKHFFDYGSTTRNEMR 126

Query: 221 NLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           NL IQCVF NNLIF+LFNH ILPSSML RLVNI MFRCNNKM
Sbjct: 127 NLRIQCVFPNNLIFKLFNHLILPSSMLARLVNIYMFRCNNKM 168

BLAST of CcUC09G176950 vs. TAIR 10
Match: AT2G07739.1 (Ycf1 protein )

HSP 1 Score: 278.9 bits (712), Expect = 4.6e-75
Identity = 146/162 (90.12%), Postives = 147/162 (90.74%), Query Frame = 0

Query: 101 IRSNLVSLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLLRARVM---EEGTEKKVSATTG 160
           I  NLV LCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGP YLFLLRARVM   EEGTEKKVSATTG
Sbjct: 7   ILGNLVYLCMKIINSVVVVGLYYGFLTTFSIGPFYLFLLRARVMDEGEEGTEKKVSATTG 66

Query: 161 FITGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFH-FFWNNHKHFFDYGSTTRNSMR 220
           FI GQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFH FFWNNHKHFFDYGSTTRN MR
Sbjct: 67  FIAGQLMMFISIYYAPLHLALGRPHTITVLALPYLLFHFFFWNNHKHFFDYGSTTRNEMR 126

Query: 221 NLSIQCVFLNNLIFQLFNHFILPSSMLVRLVNISMFRCNNKM 259
           NL IQCVF NNLIF+LFNH ILPSSML RLVNI MFRCNNKM
Sbjct: 127 NLRIQCVFPNNLIFKLFNHLILPSSMLARLVNIYMFRCNNKM 168

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
YP_009753666.13.4e-8098.73Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana] >QIT04685.1 Ycf1 protein [Trichosanthes... [more]
QJD26342.13.4e-8098.73Ycf1 [Trichosanthes kirilowii] >QJD26429.1 Ycf1 [Trichosanthes kirilowii][more]
YP_009430686.13.4e-8098.73photosystem I assembly protein Ycf1 [Gynostemma cardiospermum] >ART65049.1 photo... [more]
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
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Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G176950.1CcUC09G176950.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
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cellular_component GO:0009706 chloroplast inner membrane
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane