CcUC09G176950 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCAGCGTAACGTAACAAAACGTATTGAAAGCTGTTCGCCTTTTGAATCAAACAACAAAGTCAAAAGTCAATAGTAGGGGCTTCATAGCGACTTTCATTCTAAAGGAAAGCGAAGAATCCACCTTTAGTCAATAGGAGCCCTACTTCCCTCTTTGCGACCACATCACTGAAATGAAAGCGCAAAGAAATTGCTTGATGAGTTGCCGGGCGTAGCGCACCGCAGGTTAATCTCTCGTTTTTTGGAGCTTGACTTTACTAAACGAAACAAATAAGGGCTCGCTGCTTGATAGTGACTTCTTTCGTTTGGTAGGATGACGAAAGGCTACTTCAATGACGGAAACTGCCGGAAACTCGAGAGGGTCGCCTTTGAAAGCGTTCGCCGGTAACCAAAGCATATCGTTCCCGCAACCACTTTGGTACTTTGCTTATCGCTTTTTTAGCTTATGCAATAGAAGGGGGCTTAGCTCTGGATCCCCCCTGCTTGCAGAAATGAATGGATTAGAAGGAGGCTGGGTTCGATTTCTGGGCCAGGCGGGAGGTGAAGGCCATAAGAGAAGATTCCCTAGTAAGGAAGAGAAGAAAAAGGTGTTGTCATCGAGATCGACCTGTTTCCTGAGGCATTGGAAATCTAGACCGGCTCAGAGAATCACTGGCGCTATTTAGCCCTTCGTTTCGCCAACAAAGAAGTCATCTTTGACGATTTCCCATTCCTTCTTTGCCGAGCCGCCTCTCTTCGCCATTCGAAGTACTACCTCTGCCTTCCCTTTCGAGAACATACCCAGGGACCCTACATGGTGAAGAGTTCGTAATATCCCCAACAATTTATACTCATCTAATTGTCTTCAATTTGCCTTAACTTATAAATTTACGTAACTTACATAACACAATATTTAGATCTACAACTTCAGTTAAACCTTAAATTTTTCATTTTCCATTTTGGTTTCACTTTCACTTTCACGAAAAAGGCTTATACTTGAGGGTCCCAATTTTAGAGAAGTTTAATTTCTTCCTTTTTAAGGGTTCCGTTGATACACTAGCCAGGTACGTGGGTTGTCTGACTTTTTTTTTTTTTTTTTCCATCCACGTGGGGTAGGGTACTTTGTAATTTGTTTTATATCTTTTCTGTTTTATGTAGTCAATTTTTGAAAAAAAAAAAAAAAGACATGGTTTTGTTGTGGAAGAGAGAAGTTTTTGTTCTTGAAATTATCAAAGTTCGTAGCCATCTACAAGAAGAAAGAACGAATATGTAATTTTTCTTCGAAAAAAAAAAAACAAAAGGATTTGTGATTTTAGGGGTTTGGAAGTAAGAGGTGATATCGTGTATGAGGAATTTTTGTTAGAGTTGTATAAACTTAGTGGGATTTGTTGGGTTTTATGTCCTAAAATTCGTTGTTTGTAATTTATGGATTTTTATTCTCAATAAAGTTGTAATTGAGGTTTATTCAGTAAATTTTTTATTGAATATGTGAATTGCATCTAAATCCAATAAACTAAGAACTCATGGCTTTATGGTGAATGCTTAGACTTTATATGATAAAAGTGGATCAAGTTTAAATAATAGCCAAAATGGTCTATAGTATATGGATAAACTTTGGGTACCTTATCTAGGGTGACTATGGATATGACCCACTTAGTATTTAATACGAACGATGTGATCCTAAATCGTCCATGTAGAGACATGTGAGTGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCGTAAGACTGGACTAAGAAATAATCACGTTTACTTTATAACACCATTTACTGTTAAAACTAATTATTTCAACCTCATGACCTAAGTAACTTGATCTTAATCCTGAGCTAACTTTAATCTACATGGGTGAGAGTGGCTAGTTTGCCAACTCAATATGCTTTCCATTTTAGGGATAAGATTAGGCAGGTAGTTAGGGATATAGTCCTGCAATATGGAATTCACTCCTACTTTATTAAAGGATAATGGATAAGTTGTTCCCTTAAGTACTAAATCCTGGTCTTAAACAAGGGGACCCACCTTTTCATTGGCCTGAGAGGGACTTGATTTGTTGGTTGGACCACAGACCAATTGTTTATTAGAAGATCAGTGGGACTTAAGGAACAAGAAGTAATTACAAGGGCAACCCAGCTGTAACTACAAACAACTTGTAAATGATCGACTTACTAATTATGGTTGTATGAAATGGACAAAAGTATATCTACAGCGAATAGAGTGTAGCTACTGGGCTTAAGTGGAGTGACCCGGTAGTTAACGAATGTTAATTAACTAGGTTAAAGAGTTTAACCGGTTAATTTCAGATCGATGGAGCCCATGATCTATAGGTCCATTAGATCCTCTTGTTAGCTCGTAGACTAAACCTTGGAATAGTATATTGAGACAATTTGAAGTGTTCAAATTCAGAAAAAGGAGCATTTTACGATTTGGTTCATTTAGTTGTGAATTAGACGAATTGAGATTTTAATAATATTTAAATGTGATTTAAATATTATACTGGTGAATAAAGATTCATCAAGTTTGAAATTTTCGAAAAATTTGAAAAGAATTAATTTAATATAATTAATTAATTATTATTTAAATTACTTATATTAAATTAAAAATTTGATTTATGAAATCAAAATTTATTTCTCAATTTTTCAATTGAGAATATTACTTTTCGGTTGCATGGTGAAGGAGGAGGTGGACACTTCTCCTTCACATACAATCTCAACTTTCTTTAAGCACCTTATTCACATTCTTGGTATCTTTCAGCATGTAATTAGTATCACATGAGTTTCTCTTTAAAAAAAGAAGAGGAAAGTTGAAGGAGTTTTTAGGCATTTGATAAACAAAAACTTTACGGGAAAGTTTTTCTAACCATAATCCAAGAGTGTGTTTTACACATTTTGCTCCACTTTTTCTGCTCAATTCGGATACCACCATCCATTCTAAGGCTTGAGAATAACGAGAAAACTCTAGTGGTGGTATGTAAATAGTTCGTGATCAGTTTTTGGAGGTTATCAGGGACAAATTTTGAGCTACAACAAGTAAGTGTTACTTCCTTTGTATCTCAATTCATCTAAGTATGTTTTTCCTTTAAATTGATGTCATTAGAGTGCTTTGCATCCGTTTTTCTTCTGCTGGATGCTTTCTAACTTCATCAGGATTGACCCGAACCATCATGACCTTAGTTTAAGATGTCTATACAATTTTGGATCGAGAGTTCCTACCTACTTGATAAGAAATGACCAAGAACTAAGTTTCTTTCTAAATAGGGAGGATGTATGTGGGTCTCCTATATATTTATCAACAAGTGGCAAGTATAGTGGTGGATTGGAAAGTGACATGAAAGCCCTAACTGCTTATACTATCCAAGCTTTTCGTATAACTTAGGGCAAGAATACCCACCCGCTTAATACCCCACACCACCTTCCGTTGCACCGGCTTTCGTTGAAAATATTTGCCATAACACGATAATTTATATGGTCGTGTATCTTCACTAACTCCCTTAACAAATAATGTAGCCCCATATGACCTAGCCAATGACAGTTTTTGCATTGACCCATATAATTTTTGAATAAGAGGGTTCGTTGTCTTCTAGATATGGTTCAAGGCAGGAAATTTTTTGTGTAAAAGGTGGCCTCAGTGAAAAGGATTATGGGGAGGAAAATGTAGGTGAAGATGTTGATGACGACAAATACTATGAACATGACGAACATCAAGTATCACTTGAGGATGGCCAGGGAGATGATATTGAAGAGTATGATTTTGAAATCGAGGAGGATGTTGATCAGGGATTTGTTAGTGATGAAGCACTATTGGTGAAAAGCACCTAAAACGTGCTTTTTGTCCACTTAAATTAGAGATGTTTTTATTAGATTTCATATTTTTGCTAGTGGTTTTCAGGTAATTATGGAGAAATTAAATGTCAAAGGCCAAATGAACCAAATTGATCCAAAACTGAGCGAAAATTGGAAGAAAAGATGAAAAAGCCCTAGAAACAGGGTAGTGTAACCAAGAGCGTAATTGTGTTGCCCTCGGCACTCTCGAGTCAAGAGCGTCACTAAGATGGAGCGTTGTTGCGCTGTGCGATGAGCATCGTTGCACTTGAAGATAGGAAATTATGACAGATTTGCAAATTTGGAAAATATTTTGGGCGATCACTTCTATAAATTGAAGGGTTTTCAGCAACCCAGAGACGAAAACTCAGAGAGAAAAGAGAGCCTAAAAGGGTGAATTTGCTATCACAAAGAGAGGAAAGTGTTGGGGAAGAGTTGAAGGCCGTTCGAGATCCCGAGGTGTCGGCCAAGAGAAAATTGAAGGAATTCAACGTCGGGAAGCAATTTGAGAGTCTATCTTCCCAAGTTTCTCTTTCCCTTTTACTCTTATGCTTGAGAACTCATATGAAAATGTGTATTTGATGGCTATGCGTGGCTGAACTCATTGTGTTAGGGTGTTGGATGATTTAATTATGGATTTAAAATTAATGATTCAGGGTTTTTCATGGATGTTGTTGAATGATATGTTTTTCAATGCGATTGTGCTTTATTCTCTATTGATTGATCATCAATAAGTGTGAGGTTAGATGTATGATTGAGTGGTTGTATGTCTAATTGGATCCATGACATTGAATCTCTACTAATCTTTCATGAAAATAGCTAGATTATTAGAGAGTTGATTATGACTATTTATGCTATGCCTCTTAATTTGGTTTCAAGAGATTAGTAATCAATTAAGTTGCATAAGAAAGAGTTGTTTGTTAGAGAAAATAATCCGAATATTAGTTTATAGACTTAAACATATTGTTTGCACATAACTTTATGAAAACCTAAAGAATGACCTAATGAAATAATTAATGACATCAACACCCTAGAACACTCTTATCCTTTGAATTTTCACTTGTTTTTATTTTCTTTGTTTTCAAAATACAAAATCCAACTTTCATTATCAACTCAATTCTTGAATAGATAGGTGAATATATCAAATTCAGTCCGTGGTTACGATACTCTAACTTAAACCATTTTA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BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
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BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
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BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
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BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
Match: YP_009738261.1 (Ycf1 [Siraitia siamensis] >QIB71654.1 Ycf1 [Siraitia siamensis]) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 3.4e-80 Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. NCBI nr
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Match: Q09WW0 (Protein TIC 214 OS=Morus indica OX=248361 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.5e-80 Identity = 154/161 (95.65%), Postives = 154/161 (95.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2MIC9 (Protein TIC 214 OS=Solanum bulbocastanum OX=147425 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.5e-80 Identity = 150/155 (96.77%), Postives = 152/155 (98.06%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2MI42 (Protein TIC 214 OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.5e-80 Identity = 150/155 (96.77%), Postives = 152/155 (98.06%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2VEC3 (Protein TIC 214 OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=TIC214 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 299.7 bits (766), Expect = 3.5e-80 Identity = 150/155 (96.77%), Postives = 152/155 (98.06%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3S424 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii OX=3677 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80 Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3RWE9 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii OX=3677 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80 Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1P8LE53 (Ycf1 OS=Citrullus mucosospermus OX=519315 GN=ycf1 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80 Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3RU58 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii var. japonica OX=61011 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80 Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6M3S6W7 (Protein TIC 214 OS=Trichosanthes kirilowii var. japonica OX=61011 GN=ycf1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 1.6e-80 Identity = 156/158 (98.73%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. TAIR 10
Match: ATCG01130.1 (Ycf1 protein ) HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 8.0e-80 Identity = 151/161 (93.79%), Postives = 151/161 (93.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. TAIR 10
Match: ATCG01000.1 (Ycf1 protein ) HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 8.0e-80 Identity = 151/161 (93.79%), Postives = 151/161 (93.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. TAIR 10
Match: ATMG00370.1 (Ycf1 protein ) HSP 1 Score: 281.2 bits (718), Expect = 9.2e-76 Identity = 147/162 (90.74%), Postives = 148/162 (91.36%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G176950 vs. TAIR 10
Match: AT2G07739.1 (Ycf1 protein ) HSP 1 Score: 278.9 bits (712), Expect = 4.6e-75 Identity = 146/162 (90.12%), Postives = 147/162 (90.74%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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