CcUC09G167870 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC09G167870
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr09: 4425704 .. 4430125 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC09G167870
SyntenyCcUC09G167870
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGATGTTATTGAAATATTGGTAATGGGATGCACATGGCAGCTCTCTCAGTGATGAGTGAAGGGCACATGGGGGAAAAAGAAAGGGTTGTGACTTGTGATGAGTTGGGCAGGCAGCAGGGGATTTCCCAATTATTGAACCCCTTCCTATTTTTGGATATACTTTCTCCTTTAGGCAACTGTTTTCTTATCATTGATAATTGTACTTTGGATAGGAATCCATCTCCATTTGCTTCTTCCTCTCTTTCTTTTCCTATTCATCAAACACTCCATCTTCTTCTTCACAATTCCCTCTAATTTTTAGGCTTTTTATTTTCAGCTTGCCTCTTCATCATCTCTCACCATATGTCGACGTAATCTTAACTATTTTTGTCTATGTTTTTCTGTTACCACAGTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTCAATCATCATGTGGAAACATAGTTAGAAGTAGAATAAATTCTAACTACATAAGGTTAATGGAACTGGAATCGATTACTTTATCAAAAGCTGACGATTCGATTTCTTATCTCACAATTGTTGAACTATAAAAAAAAACCATATTAATGAGTTAAATTTAGTGGGTTTAGTCCCAAAATTGATAATATCATATTACCGTTATGATAGCCCAAAAACACATGTCGACGTTTTTCGATATTTCTACGTACTTTCTTATGGATTCGATGTCAACATGAGAATTGAATCAACATTTTCATTATATTGTAAGTAAATGATAAAATATGATAAAATAAGCAACCAAATGTTATTACGTGTATATAATATAAATAATAAATATTATAAATTGTTTTAAAAATCGTAGAATATCTATTTACCAATTTAAATATTTTTGTCGACATCGATATTTTAATCTTTGATAACAACCGTAGAGATATAGAAAGACTTGTAGTGTTCATATTTATAACTAATATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTTGCATTCTTGTTTTGTATTGTTTTTCTTTAAGACAATATGTGCGCTGTAGAATCAAACTATTTGACTTCGAGGTTGATAGTACAAACACCATGCCAATTACACTATCCGCATTCTCGCTTTGCATTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTGTTAGTACTCTAAAGCTTTCATTTTAAGAACTATTCTGAAATTGAAAAAGTTTTTCAAAATTTCACTATGTCAACTGTTTTCTTACAAGTACAAACACTTCATTATTATTGAGTTTTTGGATGGAGTCTAGAAGCAATTTTATGTGAGGCTAGACTTAGAAGTTAAAACAGACACTATTATAAAATAATGTATAGATAATGAAAAAAAAAAACAAGTCTGTTATTCAATGAAGTCGAAGAACACCAAAGTTTTTGTTATTAATTCTCCTCTTTTAACCTTTTAGTTAAATAATTCCAAGCCATACAAAATAACTGAAGATCACTATTTGTATCAATTAATTTTAGGAAATATGATAAAAAAAAAAAATTTGAAATTTTATCAATGTTTGATGATTGGTGGGCCCTCATTTTCAGCCTAATTTTTCCTTTTATTTCTCACTATATGGAGAGGTTCAAGTGAATAGGCTTCTTAATGGGCCTTGTATTATATATCTTGCCCTTGTGGACCAACTATGATGAGGTATGGGTTTCCTTTGGGCTAATTTCCAACATCAATCAATTTAGAAAAGATTCTTAAGATTTTGGTGAACTGCAAACTCAAATTCTTTCTGTTTTGTTAGAATTATATATATTGTTTGTAAAAAGAACTTGGCTAACCAATGTGTAAATGCATCAATCATAAGCAATCCTTGTACTTTGGAGCATTGATATCAACAAATAGCAGTAACTTCAATAAAGTTTGGATAATGGAAGTAACTTTATAGCTATTTGAATAGATGGATTGGATTACACGTTTTGATGAAGACGAAGAGAGGAGAAGAAAAAAGTTTATTCCAACCTCTCCCACCAAAATGCCCTTTGGCATTGGTAAACGTAAACTAGTCTTTCTTTTAAGCCTAAATTTAACCCTCTCTTTTAGAGAGTCAAACCCATTATCAGTTTATTACCATCAACTTCTTCTAATATTCATAACAATACATCCTCCCTATATACTCCATACAACAACAACTATTGAGAATCATCAGCCACATTGTTTTAGCTTGTCAATATGATCTCTCCGTCTCTACGTCTTGATCACTCCCAATGTTGCAGCTTGAAGGGATATTGTATGCTTAACATCGCCGATATGAATTTCATGTTCTCCCAACGGAATTCGCCTCACCCCTGATTTATCCACAACACTCAAATACTTGCAAACATGGACGTGGACCTGCACGCGCTGTTGTGCCCCAGCAGCAAGATGCAACTTCTCAAAGGCCACCAACTGCTTGCGTGGTACCCACGTAGAGCCACCAGCAGGTGGGGTGGAAAACACGAGCACAGTGTGGGACCCGTCTCTGTCACCTTTGTTTGCCACATCAACATGGATGACTAGAGAGAGCTTTTGGCATTTAGCATGGGTGACTCGAATGGCCTTGCCAGACAGGGTAGAAGCAGAATGAGTCTTACGATGACCACAGAGAGGAATGGAGACGATGGTAGGGGCTTTGACGATTGTGTGGATGAAATTAGTGTAACTCAAACCATGGCCAAATTGGTATACCACCGGACCAGCGTAGAAACGATAGGTTCGTCCCGGGTATGATGAAGTTGATCTCATTGCCATGTTTGTCATCGGTAAGTTTGAGAGGTAAGATTGTGGGTACCATGTCATTGGCAACTTTCCACCTGTAAAATAACAAAACAAATTATGAATAGAACACGTCGTGGATGATCTCACATTAGAAAGATTCAGGAACCTCCCAATCCTTAAAAGCATATTAAGTTATTCCTCTCATGGCCAATTAATTAAGGCACAAAATCTTGAACTTATGTCATTTTCTTCCTCCATTGTTAAATCAGTACTCAATTGCTAAAATTTATACCTGGGTTGGTTGTTCCAAAGAGAACATCAGCAATGGCAGCTCCACCGGCTTGGCCAGGGTAGCCAACCCACAAGATGGCAGAAATTCGAGGATCATTCTTGGCAAAAGAGACATCAATGGGACCTCCGGACATTAAAATCAGCACTGTCGGCCCTCGAGAAGCTGCAGCAACTTTCGAAACAAGCTCTTGTTGCCGTCCCGGTAGTAAAAGTCCGACTCTGTCTTTAGTCTCTGCCTCCTCCGACTGGTCTAACCCCATCACCAGAACCGTCGCATCGGCGGTGCTTGCGGCTGCGATAGCATCGCTAAATGAATCCTCTCTTGTGCATGCCACGTCATCGCAGCCTTTCCGGTGGGCCACCCTCGTGTATCTCCCTATTCCTTCTAGTGGTGTTACATACCCACACGCTACACCTAAATGTCAACAACATATTTCAGCTTTAATTTTGATTTCAAGATTTACTTTTACTTGCTTTCGGTATTATTTACGTTAATCTCTATTAATTAACTTATAAATTAAAAGAATTATAATTAATTAAATGTCTATATTTTTCTGTTACTATTATTTTTAATTTTTAATTTTGTTTCATTAATTAATTTAAATTAATTATTTAGTAAAGAGTCTACGTTTAAAATATAAATTTTGAAATGTAGAGATTAATTTAAAATAAAATACAAAAAAGTATGAATTTTTAAAATAATATAAATTAAATTGAAATCAAATTCGAAATTTAAGGACTAAAAGTGTAACGTTTTAAAACTTAACAAACAAATAATTAAGATTTAACCAAAAGATCAATTTCATGTAGGTTGCTAACTTGAAAAAAGTCACTTGTTTTATTCTATTTTATTTTATTTAGTCATAAACTTTAATATAATCATCATAAACACACACGTCCTAAATAGAAATTGGTAAGTGAAAACAAGTGTCAATGCGCTTATAGCATAATGTTTTGTGAAGTTTGATTAAATCAAATTTTCATGAAGCTTTCAAAATTACAGAAATAAAATGAAATTATTTTTCGAAATAAATCATAGGCAAAATTTGAAATTTGGTAAAAAAATAAAACGTAGTTAATATATATATAAAAAAATTATAAGACACAAATTTAAAATTTTAGGTGGTTTAAAACTTTAAACACATGAATAGGAAACTTTTTAAAAATATCAGACAGGTTTTAAAATTTAAAGAGACATATGGTGTTTAAAATCATATAATTTAACCCATCAAAATAGGATAAGATCCAACGGTGTAGATTCACCCCTCAAAACTTACCAGCATAGTTGCCAATCATGGTGACATTGACATCGGAGTTCGGCCCCATAACGGCGACGGTACGGTGGTGATGGGCGGACAACGGCAGAGCGGAGCGGCGATTCTCGAGCAAAACGATGCCTTGTCGGGCGGCGTCGAGGGCGAGCTGTTGGTGGGGCGGAGAACAGACGTCTTTGGGGCCTAA

mRNA sequence

ATGATAGAACATCAGCAATGGCAGCTCCACCGGCTTGGCCAGGGTAGCCAACCCACAAGATGGCAGAAATTCGAGGATCATTCTTGGCAAAAGAGACATCAATGGGACCTCCGGACATTAAAATCAGCACTGTCGGCCCTCGAGAAGCTGCAGCAACTTTCGAAACAAGCTCTTGTTGCCGTCCCGATTCACCCCTCAAAACTTACCAGCATAGTTGCCAATCATGGTGACATTGACATCGGAGTTCGGCCCCATAACGGCGACGGTACGGTGGTGATGGGCGGACAACGGCAGAGCGGAGCGGCGATTCTCGAGCAAAACGATGCCTTGTCGGGCGGCGTCGAGGGCGAGCTGTTGGTGGGGCGGAGAACAGACGTCTTTGGGGCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGATAGAACATCAGCAATGGCAGCTCCACCGGCTTGGCCAGGGTAGCCAACCCACAAGATGGCAGAAATTCGAGGATCATTCTTGGCAAAAGAGACATCAATGGGACCTCCGGACATTAAAATCAGCACTGTCGGCCCTCGAGAAGCTGCAGCAACTTTCGAAACAAGCTCTTGTTGCCGTCCCGATTCACCCCTCAAAACTTACCAGCATAGTTGCCAATCATGGTGACATTGACATCGGAGTTCGGCCCCATAACGGCGACGGTACGGTGGTGATGGGCGGACAACGGCAGAGCGGAGCGGCGATTCTCGAGCAAAACGATGCCTTGTCGGGCGGCGTCGAGGGCGAGCTGTTGGTGGGGCGGAGAACAGACGTCTTTGGGGCCTAA

Protein sequence

MIEHQQWQLHRLGQGSQPTRWQKFEDHSWQKRHQWDLRTLKSALSALEKLQQLSKQALVAVPIHPSKLTSIVANHGDIDIGVRPHNGDGTVVMGGQRQSGAAILEQNDALSGGVEGELLVGRRTDVFGA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G167870.1CcUC09G167870.1mRNA