CcUC09G166040 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGGTTTCCTTATTTTCCAAATTGTCATCCGTATCTACCAAGCCGGTGGGATAGTGATAATGACACGTTTCCTCTTATTCTTTCAATGCTTGTAGGCCTTTTGGTTGAGTTATTAGATGGATTTATTGTCTGATTCATCTGAACGTGTTGGTTATCTAGCTTCCAGCGTAAAACTTAATTCCACCAGTTATCAAGTGTTAGGACACCGAAGAGGCCGTTTAAGATTCTTATTGCCGTGAATTTTTTCCCCCAAGCTGCAAACAGGATATGTAGCACCTTGTGTAGTTGTTTAGGTTCGAGCTTGCTCAGGAGTATTATGTAACCCATTTCAGTTGTTTTCTTAATTATGTTTTCTAAAGTAAGCTGTTGGTTAAGTCTCTGTAAGTCTTCATGTATATTGAGTCTGCAAACCCATCTCTTCATGGAATAAGACAGCACCGAGTATTTAAGTTTGTGAAATGTTCTCGTGCAGGCTCTCTGATTTTCTTTATCTTTTTCCACGGGTCTCTCCTTCTTCCATCCATGAATCTCCATAAGCTCTACAATGATGAGCTCTTCGACTGAGATAGATGCCCTTTCTCCAATTTTTATTCTCTCCAACATATGTAATCTGGTCTCTATAGGTCTCAATTCTTCAATCTTCGTACTCTAAAAGTTTCAACTTACTACTATCTTGAAGGCTCACAGGTTACTCAGTTGCATTGTTGGATCACAATCGAAAATTGTTGCAATGATTCACCCACCTGACTAGCGAATCTTCTTCGTCTTCTACTGATATGCAAAAGATGAAGCGCTTATGACGTTAATCAATCTATGCTCTCACTAGAGGCTCTCACCTATATTGTCAACACTACTTCTCAGCAAGGTTGGAAAACTTTGGAAAAACATTACTCTTCTGTGTCTGACACCGAATTGCAATTTGTTGCTGGTATATCTGGCAAAAAAATTGATGTTTATATTAAGCGAGTCAAGGAGATAAAGGATTGTTGGGCTAATTTTGGTGATTGTTCATGAAAGAGATCTTCTCATCTATGTCTTGGCTTGCTGAATTCAACACGTTTCGTACCTCAATGAGGACTCTATTACAGTCCATTTCTTTTGAGGAGTTACATGTGTTGCTCAAAGTACAAGAACTGACCCTTGCTGCTCAGACGAGATGTGATGAACTTGTGAAATACTCTCAAAGAGGAGGTGTTCACGTTTTTTACATTATTTAGGGTATTTTCCTTTAATAACTCTCCCCAAGTTATCAGTACATTTTCTATTTCAATTAGAGTTCCTATCAAAATCTAGTCTGCCAAATTATATGACCGGTCCAGAAGGATCCTAAATGTTCTCATTTATCATCTAAAAAAGAATAGATAGGCCAAAACACTGGCACATACAACTCCAAATTATGGAAGTGAAAGGGCACAACCATAAAATTATATTCAGATCCTCATCCTCCTCATCCTCTAACTCACTCCTAACTGGACACACTAGCTTGAGCCTGGAACATGAGGCTTTGTGTAGAACATCCGTAATGTTATTCTTTCCCAAGGTAATGTAACAAATAAAGAATCTTCTTGGGGATTTTGAGCTTGCACAAAGGATGGAAGAAAGAGCGAGAGATTGAGGAGACTAGAGATCAAGCCAAACGAGGATACAAAAATTTACAAAAGAAAGTTCCTGGCCAATCAAGGCCTTAGGGGATTGTAAATGTTTATGTCTGTGGCTAGGAGAAAGAACAACCAACCGATGTGAAGACAAGAGAGAGGCCAACTCCCAAGTCTCTTGATTAAGGAGGGCCTTCTACGGATGAGACTTTGAGACGAGTTGAATCAGATGAGCAAAACACGTAAAACCATGAGAAGACTTCCAGAATATCTAAACCAAGGCCTTTCAAACCAAAATGCCTAGAACATGGTCTATGAAAGATAAACCCAAAAGAAAAGTCATCTTCCAACAACTTCGTGCCAAGAGCAATTTAACAAACTTCCATATCTTCAATAAAAGCTTTACTGCTAAATGCATATGGTTGACCCCAAGACCTAGAGAAATCCAAAAAAAATTCAAGCCACATTAGAAAATCTTTTCACAATCAAACTAAAACTGATGTAGATTTGGGTGAAATAATTTTCAACTGGAGCCCACAAATGTTAATCAAATCAGAAAATTTGGATGAAATTTGAGAAGGGGATAGCTGGGGTCTTCCACCCTTGATTCTGTTAGACTCTGATTAGCTACATCTTCTATAAATAAATTTTCTCAAGCCTCCCCAAATAAATCCTCTGAAGAAAGCTTAGGGGCTTATGTCTCTGGAGGAATGAGCTTAGATTCTTCACTACTAACACTGATAACCGATTCTTCATCTAAATGTGAATCAATACTTAAATGCTGGTGCGATGGAGAAGTGGGCCTTCTGCAATCAAAAGTGAAAGAAGCAGATTGATTAAGACCAAAAACATTAGTGGTAGTCTCTCTACTTTATGTGTGATCATGGTACCTTTTTTATTGCCAACTACTGGAGTGGCTTAAAATCCTTTGGGTTTTGTCTGTCTTGTACCTTTCACACATAGCTTGGGAAAAAAAGTTTGTAAAAAATGGAAAAAAGAAAAAGAATTCACCATATGATTATTTTTACTAAAGAAGCCAAATGTTTCTCCATATCTGTCATAAATACTTTACTTGACAATGCAGGGGAGATGTTCATAGAGACGGGGACTACCATCGGGCTGTTCATGTGTGGATTTTTGCTGAAAGTACACAGGAATTACTTCTCCAACTACGTGCTGACTGCAAGGATTCATGGCCTGGATTGTGGGACATATCCAGTGCCGGCCACATATCTGCTGGCGATTCATCACTTGAGACAGCTAGGTAATATAATACTATTGATGATTAATTGACATCATTTTTCACTTCACTGATCTGTTACTGCTCCTCTTTTAGATTGTATGACTGCAGAAAAGCTTCTATAAAAGATACAAGCATGCTTTGTTGAATGCATATATATAATTTCATTCACATTATCATTTGAATTCATGTTTCCAACTTTGTCAATGGAGAAATAAGAATGTAGAAAATACCTTATGAAGCGTGTAAACAAAATCAAAGAGTTGACTGAATCCTGCAATGGTTAAATGAAGGTTTTATGCATGGTAAATTGATAATTATAAAGATAATTTTGACTTCCCTTAGTTCCAATAAATTCTTAGCATACAAGATAGCAAACTAAATACCTGGATTCCAATTCTGAGTATATTTTGGTTTGAATGTTTTGATCCTGCTTGGCTAAAGACTTCTCAATTGTGCTCGCTCCCCAGCTTATTTGATCATTATTCTTTAAGTGTTATTTCCACTAATTGGGATGCTTTTATTGATTCTTCAAAATTTATTTTGTTATGTTTTTTAATTTTCCTTCTCTTTGTTCTTTTCACTACTTTGAGAGATTGTGTCGTTGAACATTTTTGCTTCTTTTTATTAATCAACGAGGAATTAGTATCTTGTTAGAAAAGTATATCTGCCGGGTATTTTCTTCTCTACTTAAGCTATTAGATAAATACTATGGAAAGGCTTCATAGTTTTGGTCTTGAAATGACTGATTAGTCTTGTTTACCTGTTCCAAGGCCTTCAACTTTTCTTTTTAGTTGTTTCCCCTGGCTTGGGCCATATGGCATCATTTGTTAGTTCTGGATTGTGATCTCCTTGTGTTCCATTTTACTGCTTTCTGCATCATCTGTTACTGAAAGAATAACAAAGGAATCTACATGTATTTTTTCAGGAGGGAGCTTCAGGAAGAGCTTGGCGTTACTCTTCCAAAGGATGCATTTGAATTGATATTCATTTTTCTCCATGAGACGTGAGTGGATCGTTCCAAGTAACCATGATAAAATTTTGTAGACATTGCATATGATGTAGTTTATTATATCCTTTGTTTATTTTTCAAATAATCAATTTTGTAGCTCAATGCCGACATGTTGTTGTGTTTGTTTGTTTTTTATATTTTGTTTTTAAAAAATTACACCTTTGGTTCCTGTGGATTGAATTTGGTAGTATTTTGATCCATGAGTTTTCAAACTCGACATTTTAACCTATGAGGTTTAAGTTTAGTAACATTTTGGTCCTTGCAGTTAGTTTACCACTAATTTCTTAACAGAAAGTTTACGTGGCACTCTTTATTATTATTTTTTTAGATTAAAATACCTTTTTGATTCCTGGAAAAGACTAAAAGATATATGTATATATATATTCTTTTTTTAGAACTTTAAGATTGTATTTGGAACTTAAATGGATTTTTGCCTTAATCTTCATCATTTTTTTAAAAATTTATTATTATTATTATAATAAACTTTTTCTCTTAAAGGAAACAAACAAAACAATTTTATTTACAAAGTAGAGACAATATAACCTTAATCTTCGTCATCAACAATAAGCATCCACAACCTGCATTATTATTAGGTCTGAGCAATATCTAGAGATCATGAGATCAAGTCCACATTTCTTTCATGGTAGGAATAACATATAATATGGCATCTTGTAAAACGGTATTTTTCTAACATAGAGTTGATGCAATTTCTTTTTGTTTAGTTTGTTTGGTTTTTCTTGTTGTGGAAGTTCTCTTTTTGTTCTCTTTAGTAGTTCTTTTTGTGTTCTACGTTTCACTCCCTTGTGGATTTTTTATATTTGAGCATTAATTTCTTTTCATTTTGGGGGTTAAACACAATTTTGGTTCCATACTTTGAAGTTTGTTTAGTCTTAGTCCTTGTACTTTCAATTGTTTAATTTTAGTGCCTGTAGTTTCATCAAGTCTTAAATCTAGTCCCTCAAAGTTAATAATAGTAATAATATTTTTTATGCAAGAAAATTCAATATGTAAATATGTTTTCAAAATATATAGTAGAAACGCTAATGGATAACAAAATGTTTTTTAAAAGTCAACAATAGACTAACAGTGGAGAAAACATACTTTTATGCAAGGAAATTCAATATGTAAAATATGTTTGCATATGA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BLAST of CcUC09G166040 vs. NCBI nr
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BLAST of CcUC09G166040 vs. NCBI nr
Match: XP_038898539.1 (nudix hydrolase 3 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1277.3 bits (3304), Expect = 0.0e+00 Identity = 657/785 (83.69%), Postives = 686/785 (87.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. NCBI nr
Match: XP_038898542.1 (nudix hydrolase 3 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1275.4 bits (3299), Expect = 0.0e+00 Identity = 656/784 (83.67%), Postives = 685/784 (87.37%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. NCBI nr
Match: XP_004135882.2 (nudix hydrolase 3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1261.5 bits (3263), Expect = 0.0e+00 Identity = 647/768 (84.24%), Postives = 676/768 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. NCBI nr
Match: KAG7014192.1 (Nudix hydrolase 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1253.8 bits (3243), Expect = 0.0e+00 Identity = 634/761 (83.31%), Postives = 673/761 (88.44%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L831 (Nudix hydrolase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUDT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 980.3 bits (2533), Expect = 1.2e-284 Identity = 493/758 (65.04%), Postives = 596/758 (78.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8Y9Z9 (Uncharacterized Nudix hydrolase lmo0368 OS=Listeria monocytogenes serovar 1/2a (strain ATCC BAA-679 / EGD-e) OX=169963 GN=lmo0368 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 77.8 bits (190), Expect = 5.7e-13 Identity = 49/155 (31.61%), Postives = 75/155 (48.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92ES1 (Uncharacterized Nudix hydrolase lin0387 OS=Listeria innocua serovar 6a (strain ATCC BAA-680 / CLIP 11262) OX=272626 GN=lin0387 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 7.4e-13 Identity = 53/169 (31.36%), Postives = 81/169 (47.93%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q97LV8 (Uncharacterized Nudix hydrolase CA_C0446 OS=Clostridium acetobutylicum (strain ATCC 824 / DSM 792 / JCM 1419 / LMG 5710 / VKM B-1787) OX=272562 GN=CA_C0446 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 2.8e-12 Identity = 53/169 (31.36%), Postives = 88/169 (52.07%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8GDW2 (Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase OS=Serratia proteamaculans (strain 568) OX=399741 GN=idi PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 1.4e-08 Identity = 39/107 (36.45%), Postives = 53/107 (49.53%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KBN2 (Nudix hydrolase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G431380 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1261.5 bits (3263), Expect = 0.0e+00 Identity = 647/768 (84.24%), Postives = 676/768 (88.02%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CF49 (Nudix hydrolase 3-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold459G001530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1251.5 bits (3237), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/766 (84.07%), Postives = 673/766 (87.86%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E379 (nudix hydrolase 3-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499854 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1249.6 bits (3232), Expect = 0.0e+00 Identity = 643/766 (83.94%), Postives = 669/766 (87.34%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CEK9 (nudix hydrolase 3-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499854 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1249.2 bits (3231), Expect = 0.0e+00 Identity = 643/766 (83.94%), Postives = 669/766 (87.34%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GQD9 (nudix hydrolase 3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456142 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1247.3 bits (3226), Expect = 0.0e+00 Identity = 632/761 (83.05%), Postives = 671/761 (88.17%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. TAIR 10
Match: AT1G79690.1 (nudix hydrolase homolog 3 ) HSP 1 Score: 980.3 bits (2533), Expect = 8.3e-286 Identity = 493/758 (65.04%), Postives = 596/758 (78.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. TAIR 10
Match: AT3G02780.1 (isopentenyl pyrophosphate:dimethylallyl pyrophosphate isomerase 2 ) HSP 1 Score: 47.4 bits (111), Expect = 5.8e-05 Identity = 42/151 (27.81%), Postives = 72/151 (47.68%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G166040 vs. TAIR 10
Match: AT5G16440.1 (isopentenyl diphosphate isomerase 1 ) HSP 1 Score: 47.0 bits (110), Expect = 7.6e-05 Identity = 44/151 (29.14%), Postives = 70/151 (46.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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