CcUC09G164140 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC09G164140
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr09: 1408700 .. 1413663 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC09G164140
SyntenyCcUC09G164140
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCCCAGTAGGATTATGTGCCTCGATATCAACATGCCGAATACCAGGAACGAGCTCCTGGATCTCTTTCTCTAGCCTATCAACTTCACTTCCTAAAGCAGTTACCACTTCTTCACCTGCAACAAGAATTTGTGAACGAAACATGTCAAGATCCCAATTTTGTTAGATATTGAAGGTTCATTTCATACATACCGTAGTTTGACATCACTTTGAGCAAAGTTGAATCATCCTCGCTCTTTGCAGCTTGACGAAACTGTAAGACGTGGATGTAGTTCAGACATCATCTTAAGCAAACTACCATTCGACGTGAATGTTACTAGACTGAAGAATAATCAAAATAGATAATGTGATGGCGATTTCAAAATCCCTTCTCTTTTACGAGGAAAACTTGTCCAACATTGACAGGCATTCTAAGATTGAGTGATATGTTCACAAAAATGATTTTCTAGTAACATAAAAAAAATATGGCTGAAGAGTCCAAGGTATATTTTCTTGGACGAGATCGCATCCAGAAGTCATATTGAAGTGATTTCCTTGCCTATGATTGAGTTTAAAAAATCAAATCAAACAGAAACAAACACTAGTGAGCACGCTGAAGGTAAAGAAAAAGTATCAACCTCTCTAGCCCACTCTTCACGTCCAGTCCTATTTAGATAATTTTGCACCACTATGACTCCATTGAAATCTGCTTCATATAACCAGCTAAAATCAAAATATATCGATGATACATAATTTCATAAACTGCCTGAAATATAGAATCATTGGAGATAAAACTGACACTGCAGGGTGAGTTTCGGCATGTTGAAAAAAATATGGGTTGATTGTGCTTTAGTTAAAATCAATCTACTTCATCCCACAATTAGAATACAACAAAACAGCTTTTCTCGTTTGCAACCAATTATCGTCTGAAAATTCTGATCTTTGAACAACACAAGTGATAAGACGACATGATGAGGCAGCTATAGAAGTTGAAACAATTTACAGCTGATGTAGGATGTCAAGAGCCACGTACCATATAAGGCATAAAATATACAGAAACAAGGCGTAGGCATAACATATTCGATGAAAGTAACCGGTAGTTGATTCATCTTTTAAGGTGGCTAAACTTTATGAAAAATCCTAAGCATTAGAGACTCTATGCAACATTGGAGTATTAAAGAAAAAACTGGAGGGGATAAATATAAGTTAAAAACAAAAACCCCACCTATTTCTGCCTTGAATCTATAAAATCCTGGTCCAATCACCTCGCTTTTGCAATCATATAAAGCATCAACAACCTAGATGAGAAGACTTCAAAATTTGAACTCATGAAGTATAATATTAAAGCAAGGATCCAAAGAGAGACTTATCAAGCATCATACTGGATCATTCTTCAAGAATTGGAGAACTTTCTGCATATCATTTTCATCCATTGCTCTACCGATCAAAGCATGCCGATTACGTTGGATGAGGAATATGGCCACCTGCAAAAAGTTTTTTAATAACTCTTAGACTACTACATTGTTTATTATTCATGTACCTTTTAGCTCAGCCCTTTTTCAATATTCTTGTGCTTGTTGACATCGTAACTACAGAGAAAACAATGGTATTCCAATGGGTGAAATTGTAAACTACAGAGAAAACAATGGTATTCCAACGGTGACTAATCTACCGTATAATACATCTCCTTTGCCACTCCATTAGTGGCCTGGCATTGTTCTAGAAGCTATTCTGCTTCACTTCACTATCACTGATTCGTATTACGGAACATGTTATAAGAGAGTTTGGTTGTGGCTATTCTTGTGATTCCAAGAGTTGGCTGGTGGGTATTCAAAGCAAAAGCTAGCTAAGGTTGACTCCTTTAGAGAGGAAGTCTTTTGTATTGCATTTCCTTTCATTATTTTCAACTAAAGATTTCTTTTCACGATCAATGATATGTCCCCCGGAATAGAATTTTTGGATGGAAACCTTAGATACTTTTAGTATGCTAGTAAAGATTATATAGCACAACTATGTGAGAGTATGCAGGTCTAGACATCCCAAGGAAGACCTAGTACATACGAAGGTATTGAATTTATTTTAATCAAATAAAATAAGTCCATGTCATGCATGTTTCAAAATTTCCGTGACCGAACTTTGAGCTCATATATTTACTTAACAAAATTAAGCAAGCCTATATGCTTACTTTACTCACATAAACAAACTAAAACAATATATTAAAACAGAAGATAATAGTAAGTCTTCTTTCCAAATACATTTGGCGGTATTTGTCGCGCTAAGTTGAGCTGAGTTGAGTTGGTAATAATTATGTGGAGAGTTAGATTGTATGTGGAGTTAGATTATCTATGCTTGGAATGCAAAGTTGAGTTGGGGTATCTGGTGCAATTTTTCTAAACAAATTGATTTTGTATCAGATTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTCCTTTCTAATCTTAAACTAAATCCTCATTAAAACAAAATTTTTAACATTAAAAAGCGGTTAATTGCATAATCGTGGCCAAATGCAATTATCACACAATTTGAGCACTTAATTGCAACATAATCATGGCCAAATACAATTTTTTTTCTTCTTCTTTATTGAAAAAATGTAACATATTTTTACCACACAATTTGAATACTCAATTGCATAATCAGTTTGTTCACATCCCCAAATACGATTATCATATGATTATCTAGCATAAAATAAGATTATTTAATAGTTCATCAAATACAACATAATATATCACACGAAAATGGACAAAAGAAAAAAAAATCAGAGGGCTTTAGGATTGGGTATAGGTCGTTCATTGAAATTAAGAAATCCAACTCCAAACAAACAAAATTATCCTATGAAAGTTTTGTAAAATTGAAGCTGAATTTCTATATACAAAACAAGTAAAAAAGAATATTGAAAACAATTTAAATGGAAGCAAAAAAAGCCAATCGTTTAGTTAGATCCCAAAAATTTTTAGATCCAACAAAAAAAACCAAAAAGAAGAAGAATTAGTCAGATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTTTATACATAGTAGATCTTTGAAAAAATAGCATTAATCTTAACTCAACCATATATGCAACATCTATTTACATGTTTTGTTCAAAACACCAAGACTTAACCTAAGTAGAGTAGAGACATGATCTAATAGATGTATGAAACCACATGATTGCAACATCTAATTTATTGTAAAAGAAATTAAAGAAAAGTATCTTTTCTAGCACAATCTTTCTTTTAGTAACCACTTTTTATGAATTAAAAAATGAAAGTCATAAGTGGAAAACAAAAACGTTACAAAAGGATTGCACAATTTTTTTTCTTAAAATTTTATAATCACCCTTCTACATACAAATATAGCATTTAATATAGACGAAATACTATTATTTATATAACCAACATCCCTATGATAAACTTTAACGGTTGTAGAAAGTATGAGTTGAACATGCACAAAACTAGGGTTGTCATTAAGCGTCTATTTACATGTTCACAAAAAGTAAGGTTGTTCTTAAGAGTCTCGTTAGAGATGGTATTCACCGGAGTTGGTCCCCTGAGTGAATGTTAGTGTTGGTTGTTAGAGGTGGTTGTCACTAGAGTTGATCATCCAAGGTAGTCGTCTTCGGAGTTTTCATCAGAGGTGGCTATTAGAGCCCAAAGTTGATCGTCAAAGTTGGCCACGTGAAGGTGGTAGTCAGAGTATATTGTGCAGAATTGTTTGTGCAAAGGTAGTCATTAGAGTTAGTTGCTAGCGTTGTCATTAGAGGTGGTTGGCGGAGCTTGGAGTTGGTACCCGAAGTTGACTGCGCAAAGGTGGAAGTTGGAGTATGTCTCTAGATTTACTTGTGCGAAGATTGTCATCGGAGGTGGTTGCCGGAGCACGGAGTTGGTCATCAAAGTTGGCCGCGCAAAGATGGTTGTCGGAGTATGTCGCCAAAGTTTGGTAGAGATAGTCGCCGATGGTGGTCAATGAGTGGAGCCATTAAGAACATTGGAGGGAGAGATAATTGAGGAGAGTTGAGGTGAGCTAGGATGAGTTGAGGTAAATTGGTAAAATAACCAACTCAACTCCACCAACATTTAAAGTTGGTGGGCCAAACATTGAGTTGGTAAAAAAGTACCAACTCAACCTAACTCATGTTGGTGTGCCAAACACCCCCTTAAGGGAAAATCAATTTATACCACCGAACTTTAAGGATTATGTATCAATTAAAACTCTGAATTAATAATTGTATCAATTTTAAAATAAATTTTGGAAGCGTATCAATTTACATTCTCCGTTCTGTTTGGATAAACATGGGGTAAAGACTTATGATTTTATCTATTAAACGCCCAAAATTTCATAACTAGACCAATTTGGAGTCTCAATTAAGTTTTCCTTTGAAAAGTGTCTATGCATCAATTCCAATCGCCTATTTCGTTGATCTGACATTCGAATTAATCTACACACTTGTAAGAATTGATACATTGGCGATTTTTTCAAATGCAACTTTAATAAAGGGTTTAAATTGATTCACGTATGAAAATTTAGAAGTTTACTTGAAACAAGTATAAGTTTCACATAATATTTTTCGAATAAAATTTAAAGAGGGTGTAAATTAATACATTTACAAAAGTTAATAGTTTAAATTGATATAATTATTATTTGGGGTTTTAATTGATAACTCCAAAGTTTAGGGGTATAGATTGATATTTTTCATACATCTAATTGATAACACCTGACAAACAAGCCTCCAAGTCCCAAAGGGAAATTGAAGGAGCACTTTGTAATCTAGTGCAGGATGTCAGCATATTTTGAATATAAATAATCACTATGAAATGACTTTCAACAACCAAATGAGGAGAAAAAAAATTATTTGCTTATAGTTGCAGACAAGAGACATACCATGCCAAGTAAGTTCCCAACTACAATGGAACCAATCGGATCATAAATTGCATTCCCGGTGGTATTTACGGCAACAAGAGATGCAGCAGCAATGA

mRNA sequence

ATGGCCCACATCAACAACCTAGATGAGAAGACTTCAAAATTTGAACTCATGAAGTATAATATTAAAGCAAGGATCCAAAGAGAGACTTATCAAGCATCATACTGGATCATTCTTCAAGAATTGGAGAACTTTCTGCATATCATTTTCATCCATTGCTCTACCGATCAAAGCATGCCGATTACGTTGGATGAGGAATATGGCCACCTGCAAAAAACAAGAGACATACCATGCCAAGTAAGTTCCCAACTACAATGGAACCAATCGGATCATAAATTGCATTCCCGGTGGTATTTACGGCAACAAGAGATGCAGCAGCAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCCACATCAACAACCTAGATGAGAAGACTTCAAAATTTGAACTCATGAAGTATAATATTAAAGCAAGGATCCAAAGAGAGACTTATCAAGCATCATACTGGATCATTCTTCAAGAATTGGAGAACTTTCTGCATATCATTTTCATCCATTGCTCTACCGATCAAAGCATGCCGATTACGTTGGATGAGGAATATGGCCACCTGCAAAAAACAAGAGACATACCATGCCAAGTAAGTTCCCAACTACAATGGAACCAATCGGATCATAAATTGCATTCCCGGTGGTATTTACGGCAACAAGAGATGCAGCAGCAATGA

Protein sequence

MAHINNLDEKTSKFELMKYNIKARIQRETYQASYWIILQELENFLHIIFIHCSTDQSMPITLDEEYGHLQKTRDIPCQVSSQLQWNQSDHKLHSRWYLRQQEMQQQ
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G164140.1CcUC09G164140.1mRNA