CcUC09G162630 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTCTACGTAAACTAACTCTTTTATTAGGTGTAAGAGCAACTCTGAAACTCTTGGAACTGTAAAGAAGAAAGACGTAGTGTGTCTTATTTTGACCACTACACCATTGAAGCTCTCATGATATATAGTCTAAGCAGCCTGTTCAATTCTCTAATCCAGTCATTCCGAAGAATACTTGCCCCCCTGTCTTACCGCGGCTGCTGGCACGGAGTTAGCCGGGGCAATTGGGCCTCGACCGAACACCTTGGGCTTAGAGAAAAATACAAGGGTTGTCTTATTTTAGGGCGTTAGACAAATGAAACTTCACAAATATCTTTAAATTGTAATATATTTTATATCCCCATTTTGCTTTAATTTTTGTCCATTTTTGGACAAATATAACCTCGATGTTCATTCTCTAGTTTTAAATTTCTAATTTAATATTAATTAAAAATTTAATCGAAAATATGTTTAAAATTTTGTATTATCAGTTAATATTGTATATTAAATGAATATTATTTTATTCTTTCACTTATATAGTATTTATCTCTTCAATTTAAAATTTTTTTTTTTAAGCTTTTTGCGTTTTGAATTATTATCTAATGAATATTATTTTATTTTTTCACTTACACGTTATTTATGTATATATACAATATTTGTTTCAAATATGTATGAGGTTTATTTCCGTTGTATTTAGAAATAAATACAAATTTAAGATTTTATATAATGTATACCTCATGCTTTAATGTTAGTCTCGTTTCTATTCATATATATATTTCACCTGCTTTGTCATATATACACATGTAAATTATACTAAGATAGATGACATTCTCTGATTATTTGAAGTAACCCATATAAATTTGAAATTGAAAACAAAATGTATGAATAAATCTCATATATACTATGTACTATAACCTATGTGACTTTTATATGCAAGTTATTAATGATTGGACAACATGAATATGATGTTTTTTTTTCATACGTGTCTATTCTCATTTATATTTTTTGTCTTATTATTACTTTTCAAAGTATTTGAAATTCTATAATTTTTTTTCATATTAATATGGAAAACATCACTTAAGGTATGTAAACATGTATTTTTTTTTCCATATGTGTCTTTTCTTATTTATATTTTTTCTTATTATGTTTAAAATTCACGGAGGGTGATATAGACATTTGGGCCAATTTTTTAGGTAGTATTTAATCCCATTAGGCTATTCATAAAAAAAAAAAAACTAAGACAACTTTGAAATTAGACATATATAATTAGTTTATATGCGCAGAAAACCTTTGTTTTATATTAAATTTCTTTTCAAAACTTATTTTCATAAATTTCAGGATATTTTTTAATATTAGATTTAATGAGATTTCAGGCAAAAATAGCCCTTTTAAGTATTTGGTTGAGATTTTCAAATATAAATTTCAATGCGGTCTTTAAACATAAATTTTTTAGATTTCCATGTTTAGGCATCCTTTCTTTTATTGTTTTACTCTTTTATTTATATATATATATATATATTCTCCATAATTTAGATATAACATGCAACCTTTCATACTTCAAGTTAAATAAATAGTTGTCTATGTATTTTAACTTAGCAATAATTTATATGTATCATTTGTCAAAACTAGTTTAACTCAATAGTAATTGACATGACATTTCATTTTAGATGTAAGAGATTTGATTTTCTATCTCCATAATTGTTGCACAAAAAGTAATTTTGTAAGAATCGTTTCTTGTAATGTTAGAAGTTTGATTATCACACAGTTTGGAGTGCAACATAAAACCAACAAATCAAAGATCCGAACCAATCCAACTGATTCAATGGTTGGCTTTGGTTTTTTAATATGAAATTGGACATATTGGTTTATATTTGGAGAAAACCAAAAAGTATTGGTTCGGATTGACTTTTTAACAGAAAAGCCAACCAAAACTAAATCTAACCAGTGATATATATATATATATATATATATAAACAAACTCTTCATGTTTAGATAAAAAACCAATTATTATGGAACGTGTATGTTTTTTTATTTAGAAAAGTGACAAGAAAAAAAATGTCAAATGTCAAATTTCAAATTTTTTTTTTTAAAGACCCAAATTTAATTTAAAATTAGAAAAAATGGCCGATTCAAAACAAAGTGGAAATAAAAATAAAAAAAATTGGAAGAAAAATAAAAAATACAAAAAATTGAGAACAAAACCGATAATAACCTAATCCAAATAAAACCAATAAATTAGTTTTTATTTTTTATTGGACATTGGTTTGGATCTCTTCTTTGTAAAATTTGGTCTGGTTCTTGGTTGGCTCTAAAATCGATTTTATTGAACCGACTATCACCCCTACACTTAGCCATCGTCGCAATTGTTGTTGTATTTAATAATAATAACAACAATAATTAAAAGAAAGGATTATTTTATTTTTATTTTTATTTTATTTTATTTTGTTTAAGTAAAAGGAAAAACCCGAACGAGTAGCTTGCATACAAATTGATTCTTCAAAGGTGGAATTTTGCATCCATTTTTATTCTAATTTCCTAAAGTCAGAAAAGCTTCCCCCACCAAACTCGCGCGGCTTAAACCCATTCCCAGCTTACCCAAAAATGGCGGAGCTCAGTAAGCTTACACAGTACATCGAGTCCTTCGTCGACGTATCTAGTACTCCGTCTCAACAGGTTATTGCTCCATTCCCATTTCGCTTTTTAACTCTCAATTTCTCAATATTGCATGGCAAACTAGGCGATTATCAAAGCGGGTTCGACTTTCTGAACTCAACCACTGCAAATTAATCGGTTTTTGCATTAATGGCTATCACTTATACCTCAACTCGTTCTCCCCATTTAATTAGTTAGAAACGGAAGTAGAAAGCTCGGAAATCCCGGGAGCTGCACAGTGTGTATGCGAGTGTTTTCGAGAAAACGGTGCAAAAGGGTGAGGTTTGGGAAGTTACTGTTTGACAAAGGTGACAAATGTCGTATACACAGCTGAAATTAGGAAGTTAGTTCCAACCAACTACGATATTTGCTTTAAGAGTTAGGTTACAGATGACAATGATCATTGATTTGGCTTCATTTGGATGTGCATAAATACTCGGTTATTTGCCTGTTTCTTAGGCATAAACTTGTTCATGTTCCCGAAATTTTCATTTACAAGGACTTGCATTTGTCTTTTTGGTTTTTCGTAGCTGGATTTAACTTTGAACCCATGAAACTAGTTGCGAATTATGGTACCAAGATGCAACATCAAAAATCAACATCTAACTTGGACAGTTTTGAAATGGATAAAATTCAGCAACTTAGATTGGGCATCGAGCAATATGCAACAAACGACAGATATAAAGGTTCAAAAATTACTGAAGAACAGTAAAACATTGTAGCAGAATATATAGAACAAGACTGTATAACGAAATTAGAATTTTTTTTTTTAAGGGACAGTTGCAAATATAGCAACAGATTCAAAGTAGTATCATATATAACAACATTTTAAAAATATTGCAAATATAGCAAAGTCTATCAGTGATAGACTTCTATCACTGATAGACCACCACCAACGATATTTTCCATCACTGATAAACCATAAGAGCCTATCAGTGATAGAAGTCTATGGATGATAGACTTTGCTATATTTCTAATTTTTTAAAAATGCTATACACTTGGTTATTATCCCTAAAATTGCTACTCATTACAATTGCTCATTTTTTTTTAATATGTAATATGAAGTTTTTTAAGTAACTATTACAATATATGCAACATGGGTTGGTATGTTTACATATTGATATAAAGGAATCAGAAATTAACATTTAGAGGAGTTGAGGGGAACCTAGTGATGTTTAATCCCTGGTAAAATTCTATGTTTCTCATGGGGCTTCAGCGACAAAGTCTTTTTGTAATTATTCAGTCTCATTTCTCTTGATTGGAGTACATTTCTTTAGTGGGGTTCTCTTTTATGAGCTTTATTCTTTTGGTTACTCTGACAATATTTTATTTTTTCTCAATGGGAGTTTGGTTTCTCATGAAGAAAAAGGGTTGTGAAATTAACGACGAGAGATTGAAACATATTCAATAATTTTTAAAAGTTGACAATGGAAAAGTTATCAGATTATGGGAGGAAAACGGAACTAATTCTTTTCCCCTCCCAACGACCTCTTTCCAGGACATGCACAATTTTTAACCAAAATGATCTGGCGATTAGTCCTTGTCGGGATGTAGAAAATTGTTTGGTCATTATAAGAAACCTCTCTTTGATGGAGAGATCAATTTATTGTAATCATTTTCTTATGTTCGAGGAATGGATAACTGTTAATAGAAGACAGGACAACGTGGTCTTTAGACTCTCTGGCCTCTATTCTTGTAGGACGGTCTTTCTGTCTCACTTCAATTATGCTTGAGGACATTTTCACTGCAGTTTGGATGGAAAGTGGCCAGAGAAGATGAAAACCTTACTTTAGGTGTTGTTTGATGTAAGGGCCTTAGACCAATGATAGACACCCAATATTGTTTATTCAGTCTGAATTGATGCTTCTAATTTTATTTATTTATTAAATTATTATTACTTTTTGGCAAAGACCATGTGGCAATTGCTAACCTTATTTTTTGGGGAAGCCTGCATATTACTCATCTGTGTTTCTTTATGCTATGATGTTTCATCTTTGTAACAATGTGCTGATTAGGAACACCATGAAGAACAATGGACTAATGAGAATATATGTGATACTATAGGCCACAAGCTTGGAAGCAATCACCTCCCTTGCGAAGAACAATGTTCTAACAATAGAAACTCTGGTATTTTCTGCCTAGCTTCTACTTCCCTTCCACTTTGTTCATGTTTCCTTTAACTCTATGCTGTTTGTTATACTGCCTTAAATTCTTATTTACATGATTTAGGTTAGAGAAATGGGGATGTATTTGACAATTACTGATAACATTATTCGAGGCAGAGGTACTTCTACATAAACTTCTGATTTGTTATATTTTTATTACCATTACGAGTTAATATTGTTATTACCATTACAAATTAT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Homology
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BLAST of CcUC09G162630 vs. NCBI nr
Match: XP_004141784.1 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN45580.1 hypothetical protein Csa_016609 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2016.1 bits (5222), Expect = 0.0e+00 Identity = 1039/1147 (90.58%), Postives = 1085/1147 (94.59%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G162630 vs. NCBI nr
Match: XP_008462416.1 (PREDICTED: MMS19 nucleotide excision repair protein homolog isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2012.7 bits (5213), Expect = 0.0e+00 Identity = 1034/1151 (89.83%), Postives = 1094/1151 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G162630 vs. NCBI nr
Match: XP_038898521.1 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1953.3 bits (5059), Expect = 0.0e+00 Identity = 1005/1099 (91.45%), Postives = 1049/1099 (95.45%), Query Frame = 0
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Match: Q0WVF8 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MMS19 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 988.4 bits (2554), Expect = 6.9e-287 Identity = 547/1153 (47.44%), Postives = 762/1153 (66.09%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G162630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E7FBU4 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Danio rerio OX=7955 GN=mms19 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 206.5 bits (524), Expect = 1.7e-51 Identity = 273/1177 (23.19%), Postives = 483/1177 (41.04%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G162630 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DCF2 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=mms19 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 201.1 bits (510), Expect = 7.2e-50 Identity = 276/1168 (23.63%), Postives = 481/1168 (41.18%), Query Frame = 0
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Match: E1BP36 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=MMS19 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 1.1e-47 Identity = 272/1175 (23.15%), Postives = 476/1175 (40.51%), Query Frame = 0
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Match: A0A0A0K7A1 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G452350 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2016.1 bits (5222), Expect = 0.0e+00 Identity = 1039/1147 (90.58%), Postives = 1085/1147 (94.59%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G162630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CIF3 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500778 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2012.7 bits (5213), Expect = 0.0e+00 Identity = 1034/1151 (89.83%), Postives = 1094/1151 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G162630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CGZ1 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500778 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1937.9 bits (5019), Expect = 0.0e+00 Identity = 992/1103 (89.94%), Postives = 1050/1103 (95.19%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G162630 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GPG0 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455939 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1923.7 bits (4982), Expect = 0.0e+00 Identity = 991/1144 (86.63%), Postives = 1054/1144 (92.13%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC09G162630 vs. TAIR 10
Match: AT5G48120.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 988.4 bits (2554), Expect = 4.9e-288 Identity = 547/1153 (47.44%), Postives = 762/1153 (66.09%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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