CcUC08G161200 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC08G161200
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr08: 28822997 .. 28829181 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC08G161200
SyntenyCcUC08G161200
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTAGGGTATTTGTCATTTTATTGTGTTTAAAGTGTCATAATTTCCTGCCTCTCATTTGGTGAATTTTCCTAAATACAAGTCATGTAATAATATATCCCTCTCGGGAAGTTCATCATCTTGATTGAGTGTTTATGCCTCTCTTTTTTTTTGTTTAAGTTGTTTTCGTCGCTTTACATTAATTGAATGATTTAAGTTTCGTTTGACATTGTTATAACTTTAAAATAATTTTTAGTAACTTTACTAAATCAATTGTAACATTGAAGCGTATTAGTGTTAAATAAATGTTAATTTTATAATTGAGTAATTTAGTTACAAGTGTTTGATTAATAAATACTAAATTATCATGTTTTAGATATATATATAAAAAAGTACCTAATAATATATTTTTTTTATATATATTTTATAATAAGCAGTAGTGTTGGTTTTTTGTGTTAGAACTATATCATGATTTAAGTGGGTAACGAGGATATATAGACCTTCATTAGTTGAGCCATGATTCTTTTAATCAAACTATTCAAGGATCGTATCCTCTTTTTTTGAGTGAAAATTATATAAATACTTTTCTTCATTTATTGTTTTCATTCTTGTGATTCCGTTAAATAATTTTTCTTAAAAAATGTAACGAAAGTTGAAATATACTTTTAGCAGGTTGACTTTATAGTATTAAGGTTTAAAAATTTAGATATGAAAATGAAATAAATACACGAATTGAAAAGCTATTAAAGTTTAATTTATCAATATGCAGTACTTTTTATAGTTAATAATAATAATTTTTTATTTTTATTTTTAAGTAGAAGAAACAACTTTAAGGATCATGATAATAAAATAGGAGGGAATAAACCACCTATAATAAATGGTTTTCAAGCCAAATTACTACTAATTGATGAATAAAGAAAAGAAAATTATCTATAAATAAAAAAAATATCAAACTATTTATAAATATAGCAAAATTTTATTTTTTATTTATGATAGATCGCAATAAATCCAGATAGACGTCTATCTGCGTTTATCGCTAAAGTGATAAATATCTATATAAGTCTATCGCAGTCATAGATAGAAAGTAAAATTTTGCTATATTTGTAATTATTTTCAACCGTTTTTCTATTTTTAAAAATATTCCATAAAAAAGTAATTAAGTTGAAATGTGAAGCTATAAACTACTGTGATACAAAAAGCTTTAAACTATTAAATAATCCACCCTATTGATTCACAAATCTAAGTTGTGTTGGTTGGAGACAGAAGAAGAAAGAGAAAGAAAACAAAATCATAAATATATAAAAACTTAACAGACCATGGACCATTTTCAGACCATTCTCAAATGTCATAAACCAAATGCACATCTACCTTAAAACTCACAAATCATAAATGGTTATTTAAAAATTTGGAAGTAAATCAACCTCACAAAAAACACGAATTTAAACTTCAGAACCAAAAGTGTAATTTTTCTATTTTAATACATAAATATTTTAAAATTAGTTAAATTTTTTTAATTCAACAAATTTAAAGTGGAAAATTAAATTTCACAAATGTCTTTATCTATAAATATATTCGTAAATTTGTAACTCACATTCACGTTTCTTGATTTTTCAATAATTTGAAATTTACCATACATTTTAGCCATTTTTTTGGGTTAATTTTAAACAAAGTTTAAAGCATAAATTAGCCACAAAATGGGCCTAAAAATTTGGGCCTCTTGGGGAAATGAATTGTAGGCTGGACGTATCTATGTATTTTGTGGTTCAGGCCGACGCACCGCCAATATTTCATTAAAGTTCATTTTTTGTTTTTTGTTTCTTTTTGTTTTCTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTCTTTTGTTGCGCGCGCGTGTTAGTTATACATTAAAATTATTTTAAAATCAATAGGTTAAAAGTGTACTACCAATACAGCTATTTTTACAAAGACATATTTACCAGCTATTTTTAGTCCAAATATCAATACCCTTACGTTTTTTTTGTTGTATCGATAAAAACCCAAAATTAATAATTCTATTAAGAGAAATTGTATATAATGGAAAAAAAAAAAAAATAAAACTCTCATTTGTATGAATGATCCATTTTTAAATTTTTTGGTTTATGGTCATTACACTATGTGGAGGTCCATCCATTTACTTAATTTCTCTATTTTACCCCTCAATTCCATGGTAACTTCAAATAATAAAATAAAGAAAACAAATATTTTCTCACAAATTTATGGTTTTTTTTTTTTGTAGTTTTTAAATTTTTTAAGTAGATTTTGTATGGATTTGGTAAACCCAAATAAAAATTATGTGTTGTTTTTTTCTTCCAAAAAAGACTTCTACCTTTGTCCAGGTGACATTGATAAATTATATTTTCCAAATTATGTTTTTTAAAAAATTATGATTGATTCTATCATACCTTTTTAAGATTGGTTCTACGATCGTTTATGAAAGTGACATTGCTTAATCATTTAGTCATTAGATTGACATTCTCAAAACGTATTCAAACTTAAGGTATGTATTGTATTTTTGTATTAGGGTTTATAGATTGGTTTGAGGTATTTTTGCATACTAATTTGAGGGGTCTCTAAATCGACGATGATTGGAATGAAAAATGAATTGGAAATTTGAAAATAATTGGTATTTCTTTGGGAGAATTGTAGTAGTGTAGGCAACATGAGAGGTTGGGAAGGAGAAAGGGTGTATTTGGTGGTGGTGAATCTACTGTGCACACAAAAGACACCATGGAAGTTGAGAAGATAATAAGTTGTTTAGATTTTGGCCTAGACTTTAGGTTTTTAGTATAAAGTATGTGTAAGGTTCAGTTGATCGTTTTTTAGTTTTAAGTGTTTATGAGTTTACGAGTAGAATGTGTTTGTGGGGTTCAATAGACTTCATTTGATAATTATTTTGAATACTATTTATTTGCTTATTTCATGTCTAAATTTTGAGTTGTTAATTATAACTTTTGTAGTGTTCAACTATAATTTTTAATTATGTTTTTTTTTTCTTCAGATTTTTGTAGCTCTATTTTAGTTTGTATGATATTATTTTCTATAACGAAAGTTAGTTTTGATGTGTTATTTGATTTAAATATATTTTTTGCTTCATAACAAATGTATGTTCAAATTTCAAATTTATAAGATTTTTTATGGTTGAGTTTATTAGATTTTGTTTCATGTGGTTAGATTTTTCTTTGAAATACAATGTAATCTTAGAGATTTGATAGCAAGGATACTTTTGTCTATTATTAAATTTTAAGTAGTATTAGAATTAGTCGTTTGACCATTGTCACTGATCAAAACTCGTTTGACCATTTTTTTAAAATGTCATTTTGTTTTGACCATTTGTCCAATCGCCCATTCTATTAATTTAAAGATTGAACACCGAACATTCATAGGTGGATCATTTATATTATTTCTCAGTGATTTCCAATTATTCTCACTTGAATTACCTAAGCAGAATTATCCTTATCCAAAAATCGCACTAAAGCAAAAAGAAAAGAAAAAAGTCACAAAATTATTTGGGAAGAGTAAAAAAATATTAAGGAAAACGAGCATTTTAAAAATTACTATTATCTATTTGATTATTGTATTTCTCACTAATTTACATTAATCCTTACAATTCAACAAGCCTTAAACATGTGTGAAATTATGCATTAATAGTTTTAAAACAAAATTAGTTCACTCATCAATACTTAGACTTTAACTCAGTACAATTAGTAGTTTGAACTTTTAATCAATATGATTTTCAATCTCTTAAACAGTATCAATTAATATATACACGTTTATTTATTTACCAAATCATCAATTATGAAATCACATTTGAACTAATGTTTGATGGACACTAATAACAATTTTACAGTTGGGGTGTTTTAGAGTGCTAAAATTGAGTTATTAAATCTAGAGTTTAACATGTTGGAGTTAGGAAGTCTCTCTTTGAGGGTGCATAGTTAAAAATAGAATTTCTTGACAAAAGTGTAAAATAGAGAAAGATCAAGAAAAGATAAAGCTCATTGATAAATGTGCAAAAATCCAATAGTACTATTAAAGTTGAATTTTTTTACATCAATTGATGAAGTTAGTGGGCCAAGTACTCCTTAAGGAAAGTTGAATTTTTTAACATCAACTTATGAAGTTTGTGGGCCAAACACTCCCTAAAGACCCGTTTGGATTGCATATATTATTTCATAGGTATAAATATTAAATATTTAGGATTTGAATGTTTGAGTTTTAAATGTCCGAGATAATTAATGTCTATGTTTGGATATACAAGATATTTAATGTTTGAAAGTTAAATATGTGTGTTCAATTTACCAATTTTGTATATAAAAACAAATTATTAAGTAATTAAATGCAAGAGACCAATTTAAGTAGTCATCAATTAAATTTAGATTATTTAATTTATCAATATTAATTAATTATTTCATCCATTAAAATCAAAATAAATGAATACTTTTATATTAAACCTAATTAAATTATTTAAATTAATTACTAAAAGCAATTAAATTAATATAAATTAATTAGAATATTCATAATCCATAATAATAATTTATATTAAATAGTAAAAGAAGTTGAAATTTATTAAGTCTAAATAATAAATCAATATATATTTAATAATTAATTAAAATTACTAGTAATCAATAATTGATATTGGTTTATTAATTAATTATGCTATATTTTACCATTCATCTTTCGGGCATAAAAATCTCACAATTATGCATAGTATTAAAAAACACATGACAAATGTGTTTTAAAGTTGGACAATAATATCTTGGGTTTTAGAAAGTAGAATTTTGTGAAACAAATATGAATATTAAATGTTTGTTCGAAATCTCATAGGAATATTGTGAAACAAAGAGACCACGAGTTGACAAGAGTACCAAATAATAATAAAGAAAAAAAAAATAGAAAGAAATACTTCATTGAAGCATCGAAAGAGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTCTTCGGGGAAAAAAAATACTGAAAGCTTTACCAAGAAAAAAGGTTTAAAGA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mRNA sequence

ATGGCTGGACGTATCTATGTATTTTGTGGTTCAGGCCGACGCACCGCCAATATTTCATTAAAGTTAAAAGTGTACTACCAATACAGCTATTTTTACAAAGACATATTTACCAGCTATTTTTAAATATTCTTGTATTATAATTTAGATATTACAGTAAAAGGTTTTGATAGATTGATAAGTTTTGGTAGGTTTGAGATTGGAAAGGAGGAAATTTGGATGCTATGTTTGTGTGTAGCTGACATGGAATTGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTGGACGTATCTATGTATTTTGTGGTTCAGGCCGACGCACCGCCAATATTTCATTAAAGTTAAAAGTGTACTACCAATACAGCTATTTTTACAAAGACATATTTACCAGCTATTTTTAA

Protein sequence

MAGRIYVFCGSGRRTANISLKLKVYYQYSYFYKDIFTSYF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC08G161200 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC08G161200 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC08G161200 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC08G161200 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC08G161200.1CcUC08G161200.1mRNA