CcUC08G159940 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC08G159940
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr08: 27855921 .. 27858613 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC08G159940
SyntenyCcUC08G159940
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGACACAGAATGGATCTCTCAGTACGTATCGATCTTTTTCTTCTTTTCTTTACGTTCAATCAAATTAGTTTTGCTTAATCTTGTGTATTTCTTGATCATGAACTTCGATTTGATCTGGTTTTCAAATTTGACTTTTCTACAACTGGAATTACTTTTGCGCTCCGTTTCTGAATTTAGTATTTAACTTTCATGAAAGGAATCAATGACGATCGTTCGAGGTTTTACTCTTGAAGATTGAGGGTGAAATGTCACAGAGTCGATGATCTTTCTGTGCGTATCGATCTTTTTTACCTTTTATTTATGCTCAATCCTCAATCAATTTCCCTTTGCTCATAAAAGGAAAGAGGTCAATGTTAATATTCTGTTTGTACTTGCTTTTAATTCCTTCAAAATCATTTCGATTTCTATGGATTTCACCTTATTCCATTAATCTCCGGAAGGATACGCATGCGGATTTTATTTTCATAAGAAAAGAGGTCAACTTTAATATATCTGAATGGACTTCTTCTTGTCTCACCTACTGATCAGGTCAGGTTGGATTGCATGATTGTGATCTCAGTCATGACCTTGCCGCAAGGTAAGTTTAACGTATGTTATAATTCTTTTTGTTTAGAATAATAACGTGTTATAATTCTCAAAAAGGAAAAAAAGAAAAAAACCCGTATGTTATATAGATTTTTAAGATCGCTTTTGTATCTTGTTGGTTGATGATGATTATAAACTATAATTAAGGTTATAAAAAAAGAAAGAGAGAGAAGTTAAAACCAGATTTCATAGTATAATTAGGGGGCCAAGAAAGCTGCAAAATGAACAGGTTTAAATTTAATAAATTTATTTTTATAATCTGAACATTTTGTGTCTAAGAGATTCTTAAATTTTCAATTTTTCACCATATTGTTTTAGGAAAAAAAAATCATTTTCGTCCCTAAAATTTGGGTCTAGTTTTAATTAGTTCTAATGTTTTAAAATCTAGCATTTTTGTCCCTAAGATTTCAATAATGCTCAATCTTAGTTCTTGAGATAACATAAAAACACCACAGTTGCCTTTTAATATGTGCATAGAGTGTCTCTCGAGTTGCTTTTTTAATTAATTTTAAATTTTTTTAGAAAAATTGTTGCATCGTCAATCTATTTAGTTTCAAAATCGGTCCAATTATCATACAAGTCATATTTTCATTATCACTAACAGTTTTGTTATCTCAAGAACTAAAATTGAGTATTATTAAAATCTCAAGGACAAAAGTGTTAAGTTTTAAAATATAAGGAACAAATAGAAATTAAACTCAATACCTGAGACTAAAAAGGTATTCTTTTTTCATTGTATTTAATAGATTCTTGACTATATTAGACATTTTTCAAAATTAACTAAAAAATTGTCAAAATTAAGCTATGAAACATTTCCATCTTTCAGAATTAGCACCCTTTAGAAAATTTGTTTAGAAAATTTGTTGAAATAGTTTTCTTAATCCATCTATATGGAGATTTGAAGACTATTTCTAACAATTTTTCAAATTAATTAGACATAAATTTGAAATTTATATTGAAGAGGTTCCTAAACTTCTAATTTGAATGACTACTCATTTATGAAATTTACAAATGTTGAATAGGTATAAACACAAATAAAAGTTTAAGCCTATTTGATAAATATGATCTTACTACCAATTCATTTTCTCAAGTTTCTTCGTAATTGATTCGCTTGGTTGTTTTTCAAATCTGAGAAAATTCTTGGAATTTATTAAAAGAAAATGAATACGGAAAAACTGGTTATTTTTTTCTTAAATTAATTTTTTTGCTTGATTTTTTTAAACATTTAAATATTTCGTTTACCTTGAGAATCAGTTTGGGTTCATTTCCAACTCTAAATGCTAACCGAAGGCTACCGCAGGAATTTTGCAATTAGTTTGCAAGGTGAATTACAAACTGCTCGTGGAAACTTCTTCGTTAACTGGAGCTAAATTTCAAACCAAACCAAAGTTAGGAAGAAGAGAAAAGACAGAATATTTGGGATAATGGAGCTGAATTTACATTCTATTGAAAATAAAGAGTACAGTCAACCTAAACATCTAAACATTGCTCAACTAGTTTAAGAATGTGTCCTCGATCAAGAGATCAGAGGTTTGAGGTTTGAGTCTCCCACATGACATTTAACTAAAAAAAACAATAGAGGATAGAACAACGACCATTAATTATCTAATACAGTGTGATGAATGTACGTAGGGCTACTGGAATGGACAAGTTTTGTTCACCTAACCTTGTATAATACTCGGGCAAATGGACAGGTGATCATTCCATGATGATGAGATGCTTTATTTCACTTCAATTATTTCCTAGTCTGAAAAATGACCAACAACTCGAGCTTCTGATCTTAGTGCTTCCAATATACTATCAACCCATCTGCATCTCATCAGTCATCATGTTTGTATATATTCAGTATTCATTATACTCGATCTGCTTGAAAGATTGTTCTGAACTTAAGAAGTGCATTAACTAGAAGATTCTTGTTAAGTTGAAGTACGGAATAACTCACCCTTCCAAGCCAGGATTCTTGGGGTAGTAAACGTTTTTCAATCCCAATCTTTTTGCTGCTGCTGCAGTTGTTTCCCCAATACAGGCAAGTGATTTGTCCCACTCCTTTGGCTCTGAAATAAGATTGACCCATGCACTGTTGCGACAGATGGAACAAACAAAATAA

mRNA sequence

ATGACACAGAATGGATCTCTCAGTACATTGAGGGTGAAATGTCACAGAGTCGATGATCTTTCTGTGCGTCAGGTTGGATTGCATGATTGTGATCTCAGTCATGACCTTGCCGCAAGTGTGATGAATGTACGTAGGGCTACTGGAATGGACAAGTTTTGTTCACCTAACCTTGCAAGTGATTTGTCCCACTCCTTTGGCTCTGAAATAAGATTGACCCATGCACTGTTGCGACAGATGGAACAAACAAAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGACACAGAATGGATCTCTCAGTACATTGAGGGTGAAATGTCACAGAGTCGATGATCTTTCTGTGCGTCAGGTTGGATTGCATGATTGTGATCTCAGTCATGACCTTGCCGCAAGTGTGATGAATGTACGTAGGGCTACTGGAATGGACAAGTTTTGTTCACCTAACCTTGCAAGTGATTTGTCCCACTCCTTTGGCTCTGAAATAAGATTGACCCATGCACTGTTGCGACAGATGGAACAAACAAAATAA

Protein sequence

MTQNGSLSTLRVKCHRVDDLSVRQVGLHDCDLSHDLAASVMNVRRATGMDKFCSPNLASDLSHSFGSEIRLTHALLRQMEQTK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC08G159940.1CcUC08G159940.1mRNA