CcUC08G156000 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC08G156000
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr08: 24463766 .. 24468590 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC08G156000
SyntenyCcUC08G156000
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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CGTCTGACTATGCAATCAAATGACCCCAAAAATGTTAATTTGTTGAGAGTGCTTTTCCTAATTTCAAAAGTTATCCCAAACTTACGTTAAGTTAAATGGGTGTGCAAATAAATTAGATTGCTTATTTATTATATTATTCAAAACAAAGTTTTTATGCTGTATTAGATGAATGTGTTGCACTTTAGATACTAAACTTATACTATAAAAAAATAATAATAAATAAACTTATGGTTATTGTCTTCAAAGTAAGTTTAACTTTAGCGATAATTCACGCTCTTTATGAGATTGAAGGTTTAATCTTCATTGTCGCATATTTTTTTATTACATAAATGTGAAGTTTGAAATTTTGTTAACTTCTAAATGCAAGATAAAGGAACATGTGTATTATTGAAATATGTTAATTGTCGACACTATTTTACAATGCTTTAAAATTCAATTGATACCATACATGTAAAATCAAAAGCTTTCGTAAATATTAGGTATCACTTGAATGTTTAGTCTGTTTGATTCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTGAAGGTTTTCTTAAAACAAAATGCACTTATATGTGCATTAGAATTTAGAAATAATGTTATGTCATCCACGTAAAATAACAAGGTGTTTTGGAAAATTGGACTAGAAAATGTACACACATACATATATTGAAAATTGTCGTGTAGCTGTTATTAAAAGTTGTTCTATTATACAATGTATTTCTAAATAAAGATCGATTGGTTAGACTCAAAATGATCAAACATTGATATTTATTTGGTCAAATTATGGTGGTTGGGCAAATTTTAAATTTGAAAGATGTATAATAGACTGAATATTTGTCAGACGTACTTGCTAATGTCAACATTCAAACAAAGAAAAGAGTATTTATCACGTGCAATAATGGTAAACTTGTTTAGAAAGAACAAGAATTTGCAAAAGAGAAAAAAGAATAAAAAACATGCACATCGATGTGATGTTTACTACACGCTCCCGATGTAGTTAGAGTTTGAGAGTGAGAATCAACTTACCCCTCCTTGGAGTTATAACAAGGTTATGTCCTCCTTATGGTTTTAGAGTTGCATAAGGATAATCTTTAAACTCTTCGACTTGGGGCATGCTATAGGACATTTTGCTAAAGTCGGCCTTGAGCATCTTCCTAGAGAGCCTAGGGTGATGTTTTAGGCCTACCCGTATGTGGAGCATAGCTCACTAAATATCTTGTCAGGTCGAGTACCAAAGCTCAAGCCAACGCTCTCCTTTACGCCTATTTTGATCTTAGGGTGCTATTTTTGACATGAATCTTATTACTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAGGAAGAAGGGGGGGGGGGGGAAGTTGAAGGGTGGCGGTGTGAAACTAAAAGCCGCTTTCTTGTCCCCTAAATGCATCATATTGCTTTTCCTTTGCTTCTTCTTTGTCCCCTCTCCCCTTACACCTCACCTTCCCCTTCCCTCATTTTCCTCTCTACGTAACTTCCCACTACTCTCTCTCTTCACTACCTACATTTTTCATTCATTTCCTTTCTCCAAAGTTTTCCATTCCTATATCGTTTCATCTACATCTTTCTCTTTTTCCTATATTACCCCTTACCTACTCGACTCGATCCATCACGACTCTCTATATTTTTTACACTAGTATGATATATGATGGGGAAAATATCTAGCACTACAATATTCATTCATTGATTGCCGTAAAATAACATTTAGGATTGTACGAGACTCATCATCGAATGAAATGTCAAATGCCAAACGAGAGTAATATCTACTACTTTAAACTATCAAACATTTTTTCATAATTTTATTCAACTCACCCTACCTGGTTGGTTCCTTTATTCACACATATATCTAGTTTAACTCTTATAGTTGTGGAGTTTTAGTTTGGTTAAATCCTACAAAATATTGATGTCGTTACTATATATATATATATAACGTTTTTATTGCAAAAAAAAAAAAAAAAATGTAATCATCTAGTCTTTTTAGTCTCTTGTTCAATTTAGACCCATTGGTAAAAAACATGAGTAGAAACAAATTATCAAACCTCCAGCCTTTTTATTAGTAATATATAATTTTTTGTGTGCTTCAGATTCAATTTACTTCAACATGTGTTCACCAAATTGCATGAAAAGAATCCACTTGGTGCAGCCTACCATAATCCTATGTATATAAGTTTCACTTCCCCAGTTGAGTAATATTCTCATTCAGATAATACTTTAGCAATTAATTAAATATTAATTACACTAGTGAAATTTAAAATAATGGTTGCATTTATTAAATAAAAAAAAGAACATTTAAGAAAAATATAAGCAATAGAATTTAAATACAATTTTTGGTTTCAAATTTCGATAGTGGTGTTGGGAAATTCTATTTGCGTGGAATGATTTCAATGGATAGTACAGACTCTATAAATAATTAAAAAAAAGAAATTATAATTTTTCCCCCAAGGCATCAGGTGGAATTTCCATATATGCCCCTTAAGAGAAACAAGTGGGTCCCACATCATGTGAAAGTATCTGGGTTGGAATCCATTCTACCAAGTCCTGCATGATGCATGTCAACTTGGAATTGGTGGGATCCTGGGAAAGGGGCATTTTGGGTATTATTCAAAATTAATTCAAGAAAAAGATGCTCATTATGTCCCCTGGGGACGAAAAGTAGAGGATCTATTCTAATTTTGTTTTCTTTCTTATTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTAGAATAATAATATTTAAAATCATAAGTGGGGTTGGTTGAATTTTTCACACCTTTGAGCTTAGCCAAAATGCTTGTTTTCTTTGTCTTAATTATCACATTCTCCTTTTTCTTTTTCCCTTTAAACTCGCTAATCCAGTTGAAAAAATTAATAATCTTACAAACTTTAATTATTGAAATGGTAACACTCTTGAAAAGTTTGTACTGTGGAAATATCTTTATTGACACGTAAACAATTGTGATAGTAAAATATGTAACTAAAGGAACCAGTTTTAAATAAAGTGATCTCCTTGGCTAAAGGAAATGTGTACTTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATCGACGAGCTTTGAAAGGAAGATGTAGATAGTAAAAAAATTAAACAATGATTTAAGAATGTTTAAATTCTAAATTTAGTAGATAAACTTCCAATTTTATTAAAATTTGTGTCTATTTGGTTCATGGTATAAAAAAAAAAAAATTAGAAGTTTAGTATATGGACTATCAAAATTCTATTAAACACAAAATTACAAGTTTAAGGGTTCATTAGACATATAATTCAAATTTCCATCTAACAAACCAATTAAATTTGTTTTACAAAATTAGATTTGTTATAGACATACCAAACACAAACTTGAATTTAGAGACTTTTTAGATACTTTGAAAAATTAATAATTTATTTGATATGAAATACAGATTGCAATCGCTAAACTTGTAATTTAAGTCTTGTTTCACAATAAATCTGAAAACATAAATTTGAAAATAAGAGTTTTCATGAAAATATAATTGCATTGAATTTAATGTTTTCATATATATATTTGGTTATTGGTAGCAAATTTTTGAAAAGAAATTAATTTTAACTTAAACTATCATTTTGAATGTGTTTGATACTATATTTATAAATTATAAAATTAATGATAGTTAATTACTATTAAGTTGGTAATTTATGAACATGTTTTCATGTTAAACAATTACTATTTTGTAACGAAATACATAATTTACTATTTCAGAAAATAACTAACTTTATAACATGACGACAATTTTCTGTTCTTATTGAACATAATTGTATAATTTTAAAATAATATAATAAAAATATAAAAACACTATTTTCTAAAAAATAAAAACAAATTTTATAAATAGAATCAAATTGCTTGTCAAATACCGGACGAATCTGAAAAAACATAAAACATAATATGTGGTTTAAGAAAATATTTTTAAAATTGGGGAAAAATGATGAGGTTAGAAGGGCTGAAGTAGGGGGGAGGGGCAGAATCGTCCAAGGGAAGGTTCGTGCATGGACGACGAGGAAGGAAAGGGATCGGACGGTGGATAAAGCAGGAGAGAGGGTTGGAATCGGGGTCATCTAGAAGAAAGAAACGACAATGGAGGGCTGTGATTTGGACATGTCGTAATTAGTGATTGATTGATTTTGTATTGAAATGACAAGTTTACCACTGTGGGCGAAATTGGTATTGTCCATTTGTTTGGCATCTTCCACAGTACGTTTCCATGTGCCCACACCACAGTGCCTTTTGCCTTTCCCCAAACAGTTGCTAACATGATCCACGCAACACGGCGCCGTTTCCCCCACACTTCACATTTTCATATTTAATTTCAAAAGCAAACTCCTAACCTAAGTAAACTATTCAATATTAATTTCATTTCGCTTCAACTCTAAAACTTTGTAGATGCTAATTACGAAAAGCATAAACAAAACTTTTTATTCATACCTTCCTCCATGTGA

mRNA sequence

CGTCTGACTATGCAATCAAATGACCCCAAAAATGTTAATTTGTTGAGAGTGCTTTTCCTAATTTCAAAAATACTAAACTTATACTATAAAAAAATAATAATAAATAAACTTATGGTTATTGTCTTCAAAAATCCACTTGGTGCAGCCTACCATAATCCTATGTATATAAGTTTCACTTCCCCAGTTGATACGTTTCCATGTGCCCACACCACAGTGCCTTTTGCCTTTCCCCAAACAGTTGCTAACATGATCCACGCAACACGGCGCCATGCTAATTACGAAAAGCATAAACAAAACTTTTTATTCATACCTTCCTCCATGTGA

Coding sequence (CDS)

CGTCTGACTATGCAATCAAATGACCCCAAAAATGTTAATTTGTTGAGAGTGCTTTTCCTAATTTCAAAAATACTAAACTTATACTATAAAAAAATAATAATAAATAAACTTATGGTTATTGTCTTCAAAAATCCACTTGGTGCAGCCTACCATAATCCTATGTATATAAGTTTCACTTCCCCAGTTGATACGTTTCCATGTGCCCACACCACAGTGCCTTTTGCCTTTCCCCAAACAGTTGCTAACATGATCCACGCAACACGGCGCCATGCTAATTACGAAAAGCATAAACAAAACTTTTTATTCATACCTTCCTCCATGTGA

Protein sequence

RLTMQSNDPKNVNLLRVLFLISKILNLYYKKIIINKLMVIVFKNPLGAAYHNPMYISFTSPVDTFPCAHTTVPFAFPQTVANMIHATRRHANYEKHKQNFLFIPSSM
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC08G156000.1CcUC08G156000.1mRNA