CcUC08G150570 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC08G150570
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr08: 18727620 .. 18737221 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC08G150570
SyntenyCcUC08G150570
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GCGGTTGAGCTTCAAATCACCGTCGCACTCGAACGAGATATCCGCTGAGCTTCTTCCAAGTCCTTCAGAAACCTGGAATACCAGCCAAATGGTGATATCATGAAAATAATGACACTTCTTCAATGTGTTTGCTAAGGGTTTACAATTATATAGTAGGTCCCAATATGGTAACCAATAAACTTGTGAAGAGTGTTTGTAGGACCGTCAACTACTTAATTACTCTTGCAACCGCCTCATCTAACTCATCAGATAGGAACAGTTACTAATTGTAGCAATAGGATTTATATCATAAATAGACATAACTCTACTCATATAGATACACAAAGTATGACAATATCCTTTCATTAAATAGGAAATTAGCAGTGATAGTAACTCATAAACTAGACCATGAAATCAAATAACCAACATCGCTTACCTCCTAGAATTTAGAACCACAGAACCACCTAGGATAAAACGTATTCCAGAAGTAGTTGCGTTTTGTAAAGCTACAGCACGTGACTCCTCATATGTCGTCCCACCTACAATGAAAATGATGACTTCTTGTGGCCTGCTTCATACCAAAGTAGCCAAGTTAAATGCAACAAAAGTTTCTTTTTGAATATAGAGCGCACAATTATTATTAGCTAAAATAAATACTAGACTCCTTTGGTCCAGTGAAGTGACAGCCATTTTATGGAGATTGTGGCACGAGAGTAACAAAAGAATATTTCAAGAGGAGGACATGAAAACGGACAGTTTTTGGAACCTAATGAGTTCTTCTTTTAATCCTCTCACACGTTTTTTTGTACTTCTATTTTGATAATCGAAGTATTGTTTTTTTAAGGGGAAAATGATCATATGATTCCAGAGATATCATATCAAATTCTTGGGAAACTACTTTAACCACGTAAACGTAAGAATCTAAGAACAGGCATCTGAATGCCTTGTTCCTTATCTAATTAAGAATCATTGTTCATAACAAATTACTATAAGCTACAAGCATCAGAATCATCAATCTTCGAACACAATACACAGGTTACCGAAGGAGAGGTAGACAACATTTATTGATGTGAAAATGGCTTTGTATAAGAAACACAACCACACATCATATAACTTACAGTTAAGACTAAATTAAAGTTTAGTGGCTGAAGTTTCAGTATGTGTCCATTGGTACTTATTTGGTCTTTAAACTTTAAAACGTGCGTAATATATCCTTAAAACTGTCAACTTTATGTCTAATAGGATATTGAATTTTCAATTTTGTGTCAAATAAGTCCTGGGCCTATTCAACATTTTCTAATATTCTCTTATCAAGAAAAAATTATTTTTTTATCATTCAGGAGGTATTAGGCATAAAATTGTAAGTTTGAGGTCAGCTAATAGATCAGTTAATTTTTTAAAAAACTTCAAATATATTAGGGGCCTATTAGACATGAAACTGAAAGTTTAAGCACTTATTAGACATTTTCTTATGAAACTAGATTTGTAATTTAACCTAAACTATCTTGAAATTTATGGGACTAAATTTGTAATTTAGTCTAAACTATTTTAAAGTTTAAGCCCTTATTAGACATTTTAAATTTGTAATTCAACCTAAACTTGTAACTAACCTAAAATTTAATATGCAAAGAAAACAAAAGTTTTAGCATAAAAGAGGATAGAGAATGGGGCACGCTAACACTAGCAACAAACCTTCCTTGCTGAAACTGATTCCCAACAAACGGGTAGTCCACATCTCTCAATCGTCCCTTGATTATACTTTCCATGGTCTGGACCACAAGAGGTTGGTGCTGAGTGTATACGTTCTCAACCCCCTAAAGCAGAAGTGAAGAGAACAACATATAATTACCCTAAACTGCGAACTAGAAGAAATTATATGTCTTTCATACAAGTTTCCAGCATACCTTTAATCCACGAGCCATGTTACGAGCAATATTCAAAAGATCTCGATTTCCATAAAGATCACCCGTTCGCTTATCAACACCAGCTTGTTTTAAAAGAAACTGGACAAGCTGTCACATCATGTTGTTTTGAGCACATCAAGATAATTGAAGACTAACCTACTAGTTATAATAGAAGTATGTAAACTATATTGTGATAATGGTCTGCCAAAGAATGAGTAGTTTCTCACGAACACACAGGATAAAGAAACAGAAAACTTTTCACATCCTAAGAAAAAGATACCATGAATCGGCATAGTAAAATAATACCCCCATAAAATAATCAAACATGTTACAAAATTTTAAATAGAGAAGTAGAAGTTCAAAAAATGATGAAAATGAGGCTTATACGTATATACTACCCCTGTTTTATATTTGGCAGAACGAGAAGCCAATTTGTTGAAAAGCTGCATCAGTTGGACAGGACTCTCCTTCTCATACCGTAAGGCATACAACATAACTAGCCGCAGACGGTCTATATCAGAAATACTCTCATTGTTCAAAAGATTTGTTACAGCCTGAAAAGCACAAGAGCAGAGGTGGTCATGCTGAAAGTTACATCTATATCACATCAATTAATCTCATAGGTAATCAATAGTTCCACGCTGAGTTGAAAAGTCCAAACATTTTACAGATAACTCATGGGCACATAAGGAAAAAATGCTGCAGAGAGATTACAAACAACAATCATCTAACATTTAATAAAATTTATTTCAATCATAATAAATTCCCCAAAACTGACTGTAACATTTTCTTGTAATATCAACACACACAAAAAAAAAAAAATGAAGACAATTCACATGGCCTTTAATTCTCCTATCGCTCCTTCCCATTTCCCAGCAAAATAGCAGAACCAGATTCTAGTCCATTAGTTTTGCACTAAGAAAACCTCTAAACTGGATGTCAAAGAAAACTGAAGATGGGACAATGTCATGATTTCACATGTTGACTTTGTACAGATATGAAATGCAATGCATATTCACAAAAAGATAAGCGATGAAGAAAATATTATAACCTCAAAAGCAGCCACTTGTCCACCATTGCAAGCCAATTCCTGTTCTGTCTGTGAAACTAACATAAGCTTTCGCTCCTCAACTATTTTACTCATCTCTGTCACCAACGTCACATGTTTTGAAACATTACCATGCATTTTTCTGTACTCTGGATAATTGTCAACAAACTTGGCCATGTCCTCTGTAGAACAAAAAAATAAAAATAAAAAAAGAAATTAGCGACGCAATTTTCTCCCGTAGTTTGATCCTTCACAAATACCTAATAATTTCAAACATTATTCCATACAAACCTATTGTCTGTATGTTCTGGTTACTTTTGGCAATTTGCTGAAAATCATCCACCAACTTCTTTATATTCATTCCAATATCTCCAAAATTCTCGTACATGTTGGCTTTATAAAACGAATCTTGCTCTGATGATAGCACAACCTCCTGCAAGTTCCCAAAAGGTCAAATGCAACTAAATAGAATAGTGAATTAGTTTAATTGTCTAATAGAAAATGTATACTAGTGCAGAGAAGAACAATGAACTTTATACCTGTTGATCCTTTGAAGATTTCCCAATGCTTTTCAAGTCCACTTTATTGTCTTGAATACCTAGTAATTCATGAACCATTGCCTAGAAAACATAACTAAGAATAACCAACACAAACATATAGTAACAACAAAGCAAAATAACTTTTGTGATTCCAATACCTGATAAGTCCATTGATTCAGCAGGGGAGTCAGCGGGTCATCCCTCCTATCAATTACCAGTAACAAAGGGGAAATTTCCATTCTTCGAAAATCAAACAGACCACTTTCTTGCTGATACATAAGTTTCTGGTACATCAGAAACAATATAAATTAGAATTGTGACCCTTAAACTTGTGATAGAAAAGCGTAAAGTAAAATATATACACACACACACACATATATACAAATTTGAAGTCATGACACCACTTCTAGAGTAGAGTATAATTGTCGAAGGGTTAACTGACAAATTAAAGTAACAAAATGCAACTTGTAATCGTAAGAATTTACGTACCAATGTTTCCTGTGCTATCCTCTTGGCAACATCAGATGTCCTTTGGTACCTAATAACAGGTCTTTGTTTTAAGGCCAAGAAAAGTGCTGCAATGCCATCTACAACTCGGTCACAGAAATGTTGCAAACTTGGAGGATCAACAACTGCTGGGATCATGTATATATGGTTTGATGGCATATTTAAAGTGAAATGATAAGGATCAATGGCCACGAAATCCCCATAAAACTCCTGCATGATCCATTCAATAATTATGTATGATTATCAAAATTAAAGCTAACACGTGAATACAATACAATATACAACTCATGCAAACCAGCTATATCAGATAATGAACAGGATGACCAGAAAATGGAGTTCAACTCTTAGGCTAATGAACAAGCTCAATGACACATAATAAGGTTCATTCATACCATTGATAAACTAACCATCTATTTTGATATTGCACAACAAAAGGGAAGGACCATAATTCCAGGATACTATTCTACTTTACTTAAGATGGATTATTCTTCTCTGATCTCATCCACATATAAGATTTTAATAGCATGAATTTGAGAGAATCACCAAGAAGTTTATTACTAAAAAACAAACTGATACAATTGATGTTTTCTGGCCACGACTTATGTCTTATATAATTCCTGTAGAAGAAAAATTACCAAAACTTGCTGGACAACATCCTGCTCGTCTGAATCAGCTAGTATATGAATCTGAGTTTCCTTCAAAATGTTGGAGAAAACTGTAATTCAGATATACAGAAGAATGATTAACGTATATCAAAGTTACTTACACAAATTAGAAATCCATAAAAGATATGAAGAACTCACAAAGGTGATACTCCCCAAATCTAGGATTAGCCAGCTGGCGACGCAAAAGCTGTATATTCTCTGACGTGGGCCTGAGAAAGCAAACTGCTTTAAGATGATACATGGATTCCCTAGACTTCGATACGGCATCTACCAATTCAACCAAAAAGACTTCTTTTTGAAGAAGCTCCGACTGTGAGTACACCACACTGACAACACTAACCTGAAACCGAAAATAATA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mRNA sequence

GCGGTTGAGCTTCAAATCACCGTCGCACTCGAACGAGATATCCGCTGAGCTTCTTCCAAGTCCTTCAGAAACCTGGAATACCAGCCAAATGCCTGAAAAGCACAAGAGCAGAGGTGGTCATGCTGAAAGTTACATCTATATCACATCAATTAATCTCATAGGTCTTTGTTTTAAGGCCAAGAAAAGTGCTGCAATGCCATCTACAACTCGGTCACAGAAATGTTGCAAACTTGGAGGATCAACAACTGCTGGGATCATACTTCGATACGGCATCTACCAATTCAACCAAAAAGACTTCTTTTTGAAGAAGCTCCGACTTTCTGATCCCGACAGGAAAATTGGTGAATGCGGCGGCAAGAGAGTAGAATCGCAAACGCAGAGAGAGGGCTGGACGGAGGATCTCAGATCTGCGACGACCGACGAGGGAAGTTGCCGATTAATCACGATGATCTTCAAAACGCACCGTCTCGTTCACTCTTCCAAAATTTATATATGCAAATCATCAGTTGTAACTCAAACTGCTCATAAGTTGGCTTCTCATACTCGTATATCAATTCTCGTTTCGGTT

Coding sequence (CDS)

ATGCCTGAAAAGCACAAGAGCAGAGGTGGTCATGCTGAAAGTTACATCTATATCACATCAATTAATCTCATAGGTCTTTGTTTTAAGGCCAAGAAAAGTGCTGCAATGCCATCTACAACTCGGTCACAGAAATGTTGCAAACTTGGAGGATCAACAACTGCTGGGATCATACTTCGATACGGCATCTACCAATTCAACCAAAAAGACTTCTTTTTGAAGAAGCTCCGACTTTCTGATCCCGACAGGAAAATTGGTGAATGCGGCGGCAAGAGAGTAGAATCGCAAACGCAGAGAGAGGGCTGGACGGAGGATCTCAGATCTGCGACGACCGACGAGGGAAGTTGCCGATTAATCACGATGATCTTCAAAACGCACCGTCTCGTTCACTCTTCCAAAATTTATATATGCAAATCATCAGTTGTAACTCAAACTGCTCATAAGTTGGCTTCTCATACTCGTATATCAATTCTCGTTTCGGTT

Protein sequence

MPEKHKSRGGHAESYIYITSINLIGLCFKAKKSAAMPSTTRSQKCCKLGGSTTAGIILRYGIYQFNQKDFFLKKLRLSDPDRKIGECGGKRVESQTQREGWTEDLRSATTDEGSCRLITMIFKTHRLVHSSKIYICKSSVVTQTAHKLASHTRISILVSV
Homology
[Close]
BLAST of CcUC08G150570 vs. NCBI nr
Match: KAF7829753.1 (Vacuolar protein sorting-associated protein 45-like protein [Senna tora])

HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 6.6e-04
Identity = 26/33 (78.79%), Postives = 29/33 (87.88%), Query Frame = 0 

Query: 25 GLCFKAKKSAAMPSTTRSQKCCKLGGSTTAGII 58
          GL F+AKK+AAMPSTTRSQKCC + GSTTAG I
Sbjct: 45 GLRFRAKKTAAMPSTTRSQKCCSVEGSTTAGSI 77

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC08G150570 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAF7829753.16.6e-0478.79Vacuolar protein sorting-associated protein 45-like protein [Senna tora][more]
BLAST of CcUC08G150570 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC08G150570 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC08G150570 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC08G150570.1CcUC08G150570.1mRNA