CcUC08G149880 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC08G149880
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr08: 17674707 .. 17680864 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC08G149880
SyntenyCcUC08G149880
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTGCAAAGTGCTTCGGCGTTTTTTTCTATTGTTCTTTACATCAGTGATTTTATTGATCTTATTACTCACCTAGAATTAGGATTTCTTCCACTTTTAGTGAAGTGGGATAGAAGGAGTTTTAGAATACCCATAACTAAAACGTTGGTCCAATTGGAAGAAGTTATAGATATGTGCCTATTTGTATCTTTTGTGCCTATTTGTATCTTTTGGACGAAAGATTTTATTTGAGTTGCCATTGTTTTAAGATTTTGTTTGAGTTGGTGTTTATTTCATATGTAAGGTATCTTTTTGTGAAGGGTTTGAATTGAGAAGAAGAGCACAAGATTTGATTATGATAGTAAAATGGAAATTCTAAAAAATTAAGGAAGATCCTCCTTTATCCGACCTTCTAAAATGGTTCCGTCCTAAAAAAAACTCCGTTAAAATATGGTTCCTGTTTCAGGTCCCACGCGATTTAGAAATTGGAGACCCGTTTCCATTGCTACAATCATTCCTTCTCCAATTGCCAATGCTTCACCTTCGCCGAGCTCGGAGTTCCGGTGAGATCTCCGATCACATTTCGATCAACCGAACCTGCATCAGTCTTCAGATTAAAAATCGGGGGATTTGGAGCCTTCCATTGTGTCAGGCGAGTAACTTTTTCCTTTGTTTACCATTTCATCGCTTCTGCTTTAACAAATCTTCGTAAAAAATTGCTCCTATTTCCAATAGCAATGTTTCTTGAATCTTGATTGTTTGTTCAGTGAACCTAACAGTTTACTCATCAGCAATTGCGGAGAAGATGATTGTTTCGTTAATCAATTTCAGTATTTAAGAAAGTACAAACTATATATCTGTGCTGATGCATCCATAACTGTATAAGTTTTGCTCCGAATCTGATCTTCATACAGAAGAAACTTGAATGTAGACATAATCGCGCGTGGAAGAAAATGTGCATCAGAGAATATCTAAACTGATTTTTAATGATATATAAGTGGATTTCTTTGCTGAATTTCCTAAAACTAAACTCCATTTTCTGATGTGTAATGACAACGGCCCGAATTCTTTTAGGGGGAAATGCCTGCTTGGCAGCAGAGGCTGTTATTGGGACTCTTCCTTGAAATTCGATATGTTAGGATTTCATAGTCATTGGCCTTTTTTTTGTTCCAATTTTGAACAATGATACCAATTACCATTCTTCAGTATATATGGTGGTTACAGAGTTTATTTCATATTTTGCAGGAGTTATATTGAATGATGGGACTGTACATCAAATTATGCAAACAAGCTGTCTCCAAGGTAATTTCTTGAGATCTTTGTCTATCTAAATTCAACTCTTGAATTCTATTAATGCATAGTCCACCTGTGAAGTAAGTTGTACTGAAATTATGCTAATTTTCACATCTATGTTTCAACATTTATCATGTGATCAAACTGTCATGAGTTTCAAGTTTAGTGTGTCATGTTTCTTATAAGTTTTTAATAAGACGAGTGGATTTTGCCTTTGTAGAGTGGGATATTATACACTGCCTTCATTATTTACCTTGCAAGTTTCCCCCACTCATACACCGCATCAGCATCTTTCCAAATATCCTAGAGTTCATTGGCAGTTGGAAACATAGCAATCAAACCCAAAGTATAAGGAGATATAACACAATGCAAAAGAATTTGCAAATATAGCAAAATTTAGATCCAGCTCTCGAAGTCTATTACCGATAGTTTTGCTATATTTGCAATTCTTTGAAAATGTTGCTATACACTTAATTATTAGTTGTAAAAGTACTACCAATTGCAATTATCCTTTATTTTATGGCTTACTTCCATTTGACCACTAGGATTGTGCTAGAGAAGATGTCGGTCCAATTGACATGGGGTAGGAGCAATTAGAAGGGCTCTTGATGCTGAATGCTTTTATCATGTCTCCATCAGTCTTACCTGACAAAGTGATCTATCATCATCTATTATTCATTTTCTTCCTTTTTTGTTTTCTTTTCTTTTCTTAGCCACTGAACCTGTAAATGCAGTTTTAGCTTTGTGTTACTTAATTCTATTAGACTATACATGCTCGAACTGCTGGCTGTTAAAATTTATAGCGAAATGATGTTTAATCCTAGATGCTTTACAAAGCTATGCATTACAAAGGTTGCGATCTTGTGACTTGTGAGTTTAGATCCTGTAGATAGCCTGCAAAAAAGAATTATTAGACGCGTCAATCACATCACCCTTTGCCTCTAATATGTTAAAAAATTGGAAGTATTTTAATGAGCTGTATTTTGCCTATATGATTAGGTTACATATTAAACTTTGCAACTAAGTTAATGCTTTTATAAGATACCTGATACTGTATTTTCTTTCCATGTAGATCAAATCCTTTGTTTGAATACTAGTCAGGTTTATGTGGGTAAGGTTAGTATGATATTAATAAGGGCTATTGGTAATTAGTTAGGGGTGCTTTGGTTATAAATAGAGGGTGTTAGGACCTTAGAAGGTGTGAAGATTTTTTTTGGTAGTGTCCACTGTAGAACTTGGGAGAAATAATCCTCTCGAAAGGCTATTATATTGTAATTTCTTGATTAATATTACAGTATACTTATGCTTAGTGTTTCATGTACTTCTGCGTTTGGGTACCTACACACTAGATTGTGTCACTTTTGCATGCTTGATGTCTGATAACAAGGGTGATGCTTAGAGAAACTGAGACTAATAAAACTTGAGTGAAGGCAAATTCAATATGCTTACATAAGCCAAAGTGAACTTATAGTAATTGTTATTTTCTTAAAATCAGAAGTTCAAATTTCCATACTTGTACTAAATTGTATCATTTATATACATATGTAATCTTTTCAAACAATTTTACATGTTCAATTAGGTTTCGGGCGAATCCTTGATGATCAAGGCTAAGAGGGGTTCTCAATATGATTGCTGAAGAAAAGGTCATGATGGAGTGCCTCGTGTCTCCAACGGGCAGGAGCAGACATAATCCTCCCACATTTAGCTCTCTAGATCTTTGTGCAATGGAAAGAGGTGAGTCTTGTTAACTGTATGCTTGTAGAGAATTTTTAGGTCGTCAAAATTTGGTCCCTTTGATTAGGAAAAAGTTAGAATTTTAGTCTTTATAGTTTGACAAAACTTGTGATTTGATAAACCCCCTCGTAAATAGTCCCTACCATAGGAACTATTTAAGAGAATTTAATCAAACTAGAGGAACTAAATTCTAATCATAAACCATAAGAACCAAAATCGAACTTTCTCCAAACTATTGAGATAAAATTCGTAATTTAACCTCAAAATTTCAAACTAGAGTTCCCTTTCGTAATCAAGCCTGTGACATTAGAATTGTGGTTCATAATTTAATTCAATACTCAATCTGCCAGTATGTTAGTTTCGCAGGCCACAATCACAATTGTGATGAGATAGAGCCTTCATTAAACCAAGTGTATGTTCTTTCTTCTTCGTAGTTCAACTATGATTATTACTTCAGAGGTAACCACACTGCCAACTGCGCATAACCTTTTGATTTCTTAGGACCGTTGATAACCATTTGGTTTTGGAAAAAGTAAGCTTATATAAACCATTTTCAACTTATAGTGTTGATAGGAATGGTACTAGAATGTTATGAGCGTATTAAAGGTATATTAGTAATTAGCTAGGGGATTTGATTATACTTGTTGGTTTTAAATTAAGGGAGAAGGAAAGTGAGGAAGATAGGCATTATTTTGGTGAGTAATTTCGGACTTGAGAGTGACTTCGAGATTGGAGGGTAGTACTTTGAAAACTTGGTTTATCTTGTAATTCTGTTATTTTTTTATCTTGCAATATATTTTCAAAATCCAAGCAGAATTTTGAAAACTAAAAAAAATATCTCCTATTTGATGGCCATTTAGTTTTTGGCTTTTAAAAATTAAGCCTATAAATTTACTCTCACCTATTGGTTTCTTTGTTTTATTGTTTAATTGTGTTTTCAAAACCTTAAGTCAAAATTTTTAATACTTTTTTTTTTCTTTTTGTAATTTGCCTAAGAATTTTGTTTGCCTATGAAAGTTGAAGAAAACAATCACATTTTTCACAAATTGAAAACCAATTGGTTGTCAAATAGAACTTTACCTTTAAAAACTTATTTTTGTTTTCAAAATTTGACTGGAGTTTTAAAGGTTTCTTTAAGCCATATGAAAAACCATCGTAAAGAAACAGTAGAAAAACAAACAAAATTTCAAAAACCAAACGGTTATCAAATGGAGGCTTTAGTCATTCCCTTCATCACTACCATTGCTTTTTGAGAAGTTCAATTTAAGTTGTTGAAGGTTACAGGGTCATACAACACCATGAACCATAACATAAAATACACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCATTAAAAAATATATCGTGTAGCGGTTACCTACGACGTCCCGTGTCTCCTAATCATATATAATTAGGACGGGGTGCAACTAACTTTCCCTTCACAACATATCAACCCCACGTAACATAGTCCGAAAACTTGCCGGAGGTAATCACATCTTTGAAGTAGAACATTTTTTGAAGCGCCGACAAGAGGCATGCAAACTGGTTTCTTGAACTTGTTTGCCTCTCATTCTCCATGCTCGTACAGGTACCTCTCGGCGATGGTTGCATGAGTTGCAGCACCGATCGGGAGGACGTCTTCATCGATCATAAAGTAGGGGGAGTGGCCCGTGTGGATCGAGCCTAAAGTTTCATTCCTGACTCCTATGTAATAGAAGGCTGCAGGAACAAACTCTGAGTAGAAGGAAAAGTCCTCAGCTCCCATCATTGGTTGGACAAGCCTGAAATTTTGTGAACCATGAAGATCAATTGCCACTTTCTTCACATGTTCATACATTCTTTCATCATTTACAGTTGGTGGGTATATGGTGTATTCTTTTTCAAAGAAATCCACCATCGCTGAGCATCTATAGACACTGGCCTGCTCCACAATTACCTGTAAGGTAGGATTGTTCATGACCAAAATTTAGTTTAGAATTGAACTTAATTTGGGACGGTTT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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGTGCAAAGTCCCACGCGATTTAGAAATTGGAGACCCGTTTCCATTGCTACAATCATTCCTTCTCCAATTGCCAATGCTTCACCTTCGCCGAGCTCGGAGTTCCGGAGTTATATTGAATGATGGGACTGTACATCAAATTATGCAAACAAGCTGTCTCCAAGTCTTACCTGACAAAGTACCTCTCGGCGATGGTTGCATGAGTTGCAGCACCGATCGGGAGGACGTCTTCATCGATCATAAAAGGATTTGCTTCACGAGACACAATCCCCTGCAAGCTGACAACCGCAGCGGAGGCAGCGAGAACTGGGTCGACGGACCGGTGTGGCGAACCGGCACGACCCTTCTTGCCGGTAATCACGGCCCTAAAGAAGCCACAGCCGGCAAGAAGAGGACCGGGGCGGGACCCGATAACGGCGGTGGGATGTTCATGAGAAACATGAACTGCAAATATGGCTTGAACGTCTCTTAA

Protein sequence

MCKVPRDLEIGDPFPLLQSFLLQLPMLHLRRARSSGVILNDGTVHQIMQTSCLQVLPDKVPLGDGCMSCSTDREDVFIDHKRICFTRHNPLQADNRSGGSENWVDGPVWRTGTTLLAGNHGPKEATAGKKRTGAGPDNGGGMFMRNMNCKYGLNVS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 114..139

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC08G149880.1CcUC08G149880.1mRNA