CcUC07G137690 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC07G137690
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr07: 23302373 .. 23308209 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC07G137690
SyntenyCcUC07G137690
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGAGGGTCAACTGAATGGTCAGCGTCTTGAAAGCTGTTTGCTGCACCAGAACCACATTCTTGTCTGAAAGTGTCATATGGAACTTGAAATGCAGACGGAGGTGAACCACTTGCCTGCAAAGGAATGATATCCGGTTATACCATATTTATATATCATTATTTTCTACTTGGCAAAACATTATTAAAAAAAAAAAAAAATTAAAAATCATTCAAAAGAAGCATTGATAGGTCATAGATAGAATGTAGGACAAACAGTTCCAGAAATCAGAGATTTTAAGTACCATTTTATTTCATCAACGGATTTTCCTCTTTATTTGTACTGGTTTATTCTTTGTAAGTATGCATTCACACAAGTGAATCATGAATCATTAGAAGAAAATCATCTTTCTTTGGCTTTGTCCTTGGTGTAGCCTAAAGGATAAAAAGGAGATTATTCTCCATGAATAAAATCAATGTCTTTATTACCAATCAAAAATTATCAAACAAACACAATCCCTCTATTTATAGAGAATTGGAAAGTAAACTAATCCTCATTTTAATTAATTAAAGAAGCTGATGAGGTAGGATTAGAGTAAATTAGGATATCTTGGTCAAATTCTTTATTGATTAGGATTAGAATTAGTTTCTTTAATTATTAGGATCTGTTTATTTGGTTTATTAACATTAGGATTAGTTTCTTTTATTAATTAGGATTAGGAATAGTTTGCTTTCCAATTCTCTATAAATGGAAGGATTGTCTTCTTGCTTTCAAAACTTTTGATTCATAATAAAGACTTTGATTTTATTCTTGGAGATTTCTCTCCTTTTATCATTTATTATTATTATTATTATTGGAATTCTAACTCCTTTTATCATTTAGGCTACATCAGAAACTAATCCTAATCCTAATCAATCAATGAAACTAATTCTAATCTGAAACTAATTCTAGTCCTAATCAATCAATGAAACTAATTCTAATCTGAAACTAATTCTAATCCTAATCGATCAATGAAACTAATCTTAAACCTAACCAATATTGCTTTGGTATTTGGTGATGTATTTTGTGGCAACATTCGATAACTTTTAGTAGGCCCTCGGTTGATTTGGGATAATATCATAAAGGTTATGCTTGCTGAACTTTGGTTTGAAATGAATCAAAGGTTTCGGGGATACAAAACTTGGGTGGATCGATTGTTGTGAAGTGGCTCAGTTGAATGCTTCATCTTGGTGCACCTTGTCCAAGCCTTTTGAAGACTTTTCCATTCAAGATTTATGTCTTAATTGACATGCTTTTATTTTCCAGCTTAAGATTGGAAGGATCTAATGTTTTGTTCCACCTTTATGGCTTTGTGTTTTAATTCCAGCCTTGTGGCTGTTGTTTTTGTTCGTCTTGCTTCAAGTTGTTTTTGCCCCATTGTATTCGGGGTGTATTTTTGTTATGTTTGGACTGATTATTGGCCTTTGGTTATTTTGCTTTTTGATTGGAGATGATGAGAGTGCTACTTTGTTGAGATGTCCGGGTGCACTCACTGATCTATTGGTTTTTGCTCTTGTATCCCTCTTTGTAACTTGAGCATTAGTCTCATTTCATTATTTCAAGGAAGAGACTTGTTTCCTTTTCAAAAAAAAAATGGAGGGAGAAAGCTTCTCATGAAAAACAGGTTTCTTTACTAAATTGAGGGACATTTAGTTGAAAAGAAATAGGAATTGTTTCCTTTTCAAAAAAAAAATGGAGGGAGAAAGCTTCTCATGAAAAACAGGTTTCTTTACTAAATTGAGGGACATTTAGTTGAAAAGAAATAGGAACGGTCTTTTGGGTGTTGAGAGGTCTTGAGGGGGTGAAGTTTGGAATTAAAAGTTTCACAATTTTTTTAAATTACCAACATTTATGACTCCTTGGACTTGTATTTTATCTTTCTAGTCGTTCCTTTGTTGGTTGGGCTCTTTTCTTGGAGGCTCTTGTTCTGTATAATTTCATTCTTCCTAATATGCTTTCTTATCCCAGAAAAAGAAAAAGAAAGAAAAAAAAGGAAAGTCATAAATATGGAGTGTCTTTGAACTACCTAATCACAGAAGCCTAAGTAAAATGATACCAGGAATAATGATCTAAGTCACCTACTCAATGAAAATTTTTGCTTCATTGTCAATGATGATCTAAGTCACACTTCCAGCACTTCCTCGGTCTTATCTTTTTAAAGATCCTTTTGCTTCTATCTCTTCAAATACTCCAGACTTTATTTCATGCTTTCTAATGGATCTCTAGAAAGGAACATAACAACCATCTTTCAAGGAAAAGGGAAGCTCTTTTGATAGCTTGTTTGAACTTATTATCTATTCACCTATGACATGGTGCAAATGTACATCTTTCTTTAGTTCTTACAATCTTAATCTCTCTTAACCCATTCGAGAAATCTTTAAACCTCCACAGACTTTCCATAAATTAATTACAATCTTAATTCTCTCATATATATTCGTATTCTTCTGTTACTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTAATTTTTTTAATTAACAGTAAACCAAATTTCAATTATAGATTGAAATAGACAAAAAGGTCAAAGACCAAAGAATGCAACCAAGGAATCACAGAAAACCCTTCTAAATGATATTATAAATTACAGCGCAAAGCATCTCATATATAATGACTTATCTCAGTGCAAACTAAACAAGAAAGTATCTATTAAACCAAATCCATAGAATCAATTTAACATGAAATTGATAGAATAAATGGACCTTTATGGTTCATAACAAAACCAAGAAAGATGAACATGCTAGCGCAATTCATGTGAATAGAAGAATAGGCAAGTATACATATAGAGAGAGTGTCAAATAAACAAGCAAGAATAAGAAATTACCTTGATAATCTCATAGCTACGCCGCAATCGGTACCAATCATTAGTAGCTAAATGCTGCGCTCTAGGATCACCAGCTTCAACAACCAATTGCACAGCTGCATCCCAGTCTTCATTTGTCTGCAAGTCTGCTAACTCAGAACATACTTCGGCAGCAATGTCTGGAGAGGCCTTTGGAACATTGGGTTTGCCATACATGTACCTTCATTTGATCCCACACCCATAAATCATAATAAAAGCTAATTTACAAAATGTTTTTCTACATGATATATTCTATAGCAAAAAGTTGAGCAACCTATTCTGCTGAATAATTCAACCATCATTAAGCTCATGACATCTGGGAGGAGATATTACTATACTTGCTCAACATTGTCAAGAATACATTTGTTCAGCTAATCAGACATTTTCATCATACTCTCTATCGTTCTTTCATAGACTGTGGGGCCCATCTTCTAATAGCATTAAGTCAGTATTACAGGCAAGAAAAAGACACAAGCACCACTAACATTGACAGTCATACTTCCATTCATTAACTAAGAATGTGAAATTTCGTGCTAATCCTATTTAAAATAATAATTACCAACAGAAAGAAAAAAATCTTCAAATAATTTTCCAAAGGAAGGCCATTATGGTACACACCATCTTAAGTACAATCCTGTCCCACCAGAAACTATTGGAACACGGCCATTATCAAGGATACATCTTGTCGCTTCCCTTGCATCCTCAAAAAACTGACCAACAGAATATTCTGGACAATTTTAACAATGAGTTCAAACATTCTTGCACACAAGAAATATATACTATTGCATTCAATGTCTAATTTAGATATCATTACAAAGCGATTATGGAAAATCAATTGGAGTTAAATTCACAGATGACAGATCCAGTGGAAAGCATACCTTCAGATGGACGTCGAATGTCAAGCAGATGATGTGGAACCTCCTAAAAAAAATGAAAGAATGAATTCTTGATCGAATGTATGAACAGTGTATTCAATCAACTTGACTACAGAATTTAAAAGTACATATCTACTAGTTAAAACAGTCACTTAACAATATTAATTATAAATATATGTGACATCACTCGGCCATAACAAAAGTAATTTTATCTTAACCCAAAAATATAAAGCATGTTTCAGGAGACAGATTATATGTGAAATGAATCGAGGATTCAAGATGCACTTATCAATATCAGAAACACATGGGTAGATGGACATCTGTCTGTATCTGCATGCATGGATGGAACAAATCAATTCCTTTAAAAGGACTCCAGCATCAAAACTGTATGGTTAATTTTTATATTTAGCATTTGAGACTATGCAATCANTGAAAGAATGAATTCTTGATCGAATGTATGAACAGTGTATTCAATCAACTTGACTACAGAATTTAAAAGTACATATCTACTAGTTAAAACAGTCACTTAACAATATTAATTATAAATATATGTGACATCACTCGGCCATAACAAAAGTAATTTTATCTTAACCCAAAAATATAAAGCATGTTTCATATGTGAAATGAATCGAGGATTCAAGATGCACTTATCAATATCAGAAACACATGGGTAGATGGACATCTGTCTGTATCTGCATGCATGGATGGAACAAATCAATTCCTTTAAAAGGACTCCAGCATCAAAACTGTATGGTTAATTTTTATATTTAGCATTTGAGACTATGCAATCAATCATTCTCAATATTCTTATGCTGGTCCAATTATTTTAAGTAGGGAAGATGTTAAGAATAAAATGAAAACTTGTAAGATCTGATTCCAATTACAGCTGACTTTGTATTTGATTATTCATCATTGATTTAATGTAATTTCTACTTTTATGTCACTCACACACTTTCTTCTCCTTTCTCATTAGCTTCTCAATCTAGAATTCCTAAGCACCTTTAAAATAGAGGACTAGATAAGGATTCCTCGAGCTTCAGTTACTAATTAATAGCAAAATTTTAGAGTGCGTAAGATATGAGACACCTTTCTATCCCTTGCAGAAGGCTTCGCAGATCCAATATCAAGACCCTGGTACACCTGAAATTAGCCAGATGGATAATATTAGCTTTCAAGAAACTGGTTCAGTACTATTACAAAGAGAAAAACATTCAAACTCCAAGTAAAATTAGAAATCATATTAGCAAAGGACCCCTTATCTA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mRNA sequence

ATGAGGAGCATACAACGACAGATATTGTCAATTGACCTGCACAGAGTCGGCGCTGATAATTTCACCATTAAGACGCTTAGCAAGCTCCATAGCAAGCCTGCTCTTCCCAGCACCAGTCGGGCCAGATATAACAATCACCTTCGCGTTCCTTTCCTTGTTGGCGGTGGCTGCAGCAGAGCAGAAGGTCGGAAAAAGACGCCGGCGGCGAGTTCTTCGGCAGGACATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGAGCATACAACGACAGATATTGTCAATTGACCTGCACAGAGTCGGCGCTGATAATTTCACCATTAAGACGCTTAGCAAGCTCCATAGCAAGCCTGCTCTTCCCAGCACCAGTCGGGCCAGATATAACAATCACCTTCGCGTTCCTTTCCTTGTTGGCGGTGGCTGCAGCAGAGCAGAAGGTCGGAAAAAGACGCCGGCGGCGAGTTCTTCGGCAGGACATTGA

Protein sequence

MRSIQRQILSIDLHRVGADNFTIKTLSKLHSKPALPSTSRARYNNHLRVPFLVGGGCSRAEGRKKTPAASSSAGH
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 56..75

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC07G137690.1CcUC07G137690.1mRNA