CcUC07G137220 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC07G137220
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr07: 22287463 .. 22292993 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC07G137220
SyntenyCcUC07G137220
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CATATTTTAACTTCGACTTTTCCACTAAAAACTAATTTTTAGTTTTCATTTTAATGTCTATTAATTAATTTTGAAATCTAAGTAACCGAAATAAAATCATATGTCAAATTTATATATGGTGTGATTACGAAAGAGAAAAGGGAAAGTAATAAGTGGAAATAAGGAGAGAGATAGATTACCGAAAGGAGGAGGCCGAATTCGACGGAAAGAAAGAGAACACCAAGAAAAGCTGCAAGGCAAGCCAAGAAGTCGAGCTTGTCGATCTTCCAGATATTATAAGCTTTGTGAAGATCAATAAGGCCTGGAAGTGCAGATAGAATAATGGAAGCAAGAATGGCGTTGGGAGTGAAGTAGAGGAGCTTGGTGAACATCTCCAATGATATCATCACCGTCACCGCCATCACCACGTTCGAAACCGCGGTCTCACACCCGGCACCGAAATTAACCGCCGACCGTGACAGAGAACCTGTTGCTGCGTAGCAAGAAGTGAGAGAGCCGGCTAGGTTCATGAAGCCTAACGCAACCAGTTCTCTGTTCCCATCAATGTTGTAACCTTTCATGGACGCCAGTGACCTCCCCACAGCAAGGGCCTCCTGAAATATGAGGAAAGTAAGTGATTTTTAACTATAATTCCAAATTAAATAATTGTATTATATTATATTATATTATATTAAAGGTAAGGAATATGGGACCGTGAGGGCTATGACGGCCACGATGAAGGCGGCGTTGAGGATTTGGGAGAAGTGAGGGGAGTGGATTTGGATGTGGCGAGCCGAGATGGGGTTCAGGCCGGCGGGGACTCGTTTGACGATCTTCACGCCCTGCCGGTCGGCTCTTGTGAGGAACACCAAAAGCGTCGATAGGATTACACACAACAGTGGAGCTATGGCAGGTAACCAGAATACTTTCTTGTACTTCTTCCCCTGTATTCAAACCTTTTAGTTTCAACACTTTGTTTCATTTCTTAAATTCAAATATTGGCAAACAAACAAATTTAGAGGTTTAGCTTTGTTTTTAAAAACCATGGTTATCAAATAGGATAAAGTGGTCATCATTTTTATTCTTTAACTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGCGCTTCTCTTTTACGTAATCCTCAATTTGTTACTATTTAATTCCTTTTTTTTTTTTTTACCTATAATTATTTTTTTATAATATATTATCATCTATAATTGAATCAAACTTCATAAAATATTGTCTCCTCTACCTATCATATTGGGCCAAATTATTTCTATATGGCAATGGACTAACATTTTCTAATTAGATAAATGTGTTAAGTTGACTGTATGGTTTAAGACTAAGTTTAAAACAGAAGAAAATAGATGCTTTTGTTTGTGACTATATAAGAACCCAATTAAATATTTTTAAATAATTGAAACTAAGCTGAAGAAAATTAAAACTTTTAAAATTACAAGGTTTAAATTAGGAAACTATGTCGGAACCTAATAATTTAACTTAAAAAAGAATCCTAATTTAACAGAAAGAAAGTATAAGAAGAAAAGAAAAACTATACTTACAAAACTCTGTTCTTTTTTCTTTCTTAATTTGAAATCAGTTCTTAAAAAAAGCCCAAAAGGGAGAAAAAGCCGTAGTATAAAATTGTGTATACAGTTCTTCCCTACCCCAAGGCGATTTCTAATATGGTGAATAGTTAAAGGAATTTATTTTTTTTTTAAATTATAAGTTTCATACAAAAAATTAAGATTAATAATAAAATTTAAAATTGTGATTAAAGTTTTAATACGTTAAACCAAACACATAATTAAAAATTAAGTTAAAAAAAAAAAATGATAAAAACTTAATACTTTTTAAAAACAATGGTTTTAAAAAAAAAAGTACTAAATGAACTATATTTCTCCCTTCAAGTCATTTATTCCAATTCCACATAAGTTATACTTATTATAAATATTATTATAATAATATTTATAATAAGTATAACTTATGTGGAATTGGAATAAATGACTTGAAGGGAGAAATATAGTTCATTTAGTACTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAATCAATTCCTTTAACTATTCAACATATTAGAAATCGCCTTGGGGTAGGGAAGAACTGTATACACAATTTTATACTACGGCTTTTTCTCCCTTTTGGGATTTTTTTAAGAACTGATTTCAAATTAAGAAAGAAAAAAGAAAAGAGTTTTATAAGTATAGTTTTTCTTTTCTTCTTATACTTTCTTTCTGTTAAATTAGGATTCTTTTTTAAGTTAAATTATTAGGTTCCGACATAGTTTCCTAATTTAAACCTTGTAATTTTAAAAGTTTTAATTTTCTTCAGCTTAGTTTCAATTATTTAAAAATATTTAATTGGGTTCTTATATAGTCACAAACAAAAGCACCTATTTTCTTCTGTTTTAAACTTAGTCTTAAACCATACAGTCAACTTAACACATTTATCTAATTAGAAAATGTTAGTCCATTGCCATATAGAAATAATTTGTCCCAATATGATAGGTAAAGGAGACAATATTTTATGAAGTTTGATTCAATTATAGATGCTAATATATTATCACCATCCACTTATAGGTAAACTTGTCAAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAAATAAAATAAATAAAATAAATCAAGGATTCTTTTGAAAAAAATAAAATAGTGAACAAACAATAATCCTAATGCTAAAAAAATTGAACTAACACCAAAAGTTGTTATGAAAATAGGATCTTAGAATTTTCCCATAGAACTGGCTAGGTTCATTTCATCTTTCACTTTTATGGTGTGTGCCATAACTTTTTCTTTTTCTTTGTTACTTTACGACAGCAAAACCCACCAATTCATTAAATCATAAATTAAATTCAAATATAAAAATTAACTTCTTCCTCATCTACTTCATAACTAATATATCAATCAATTTAAATTATAAAATTACTCTCTAAACTTTAAGTTTCTCTGAATTACAAAATTTTACTCTATAAACTTACATTTTCTTTCAAAATCTACAAATTTACTGGACATTAAAATGTTTTAGGTTCTATTAAATTTTTTAAGATTTTAGAAATTGGGACCTATTCAAATGATTTAAGGTTAAGCTAAACTTACCAATAATTTGGTGATGAGGATGAAGGACAGGAATGAAGAGCCAATGATGAAGTTGAAGGGATTCCATTGCTGAAAATTTTGAGAGGGAGAAGAAAAAACAAAAACCACATGAGATTAAATTTTGATTAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGATTTAAAGTTGAGTTTAATATGAATTAATATTACATCATTATGATGATGGAATGATCCAAACACAGCTTCCATAACAGATAGAATGTCAGTTTTGTTAGTGAAGTGAGTGATGCCAAGCAATCCTTTGAGCTGTTGAAGCCCAATTACAATGGCAGCTCCACCCATGAACCCAACTATGGCAGCATGTGACAGAAAATCCACCAAAAACCCCAGCCTGAAATATTATAATAAATATAACCCCATTAGCATTATTTTTTTAAATTACAAATTCAATTTAAAAAAAAAAAAATCAAATTTATTAGTATTCCTAGTTCATGATATTTTAATTTTTAAAATGTATAAACTAAATTTTTAACTTTCTATAAACTATAAGAATCAAATTTGTAATTTAATTATTTTGTTTGGTAGAATTATGCTTAAAGACTTATTCATTTTTCCACATCTTACAAATTTAAATACTATTTTGATTTAAATCTCATCTTATTTTAATCTTTATACCTTTCATTTATGTACAAAATTCAGTTCAATATCGAAAGTTGTACTTTCGATGAAACTTAAAATAATCCGAAGTTAACATTTTAAAACCAAATTTGAAATTTATTGAGTTTGAATTTACAAATTTGAAAGTGTAAAAAAATTAAAATAAAATGCAACTGCATGAACATAAAATAGTATTTTAACCAAATGAAAGACAGCATTAATTACCATCAAAATCCAATTACTTCCATGACGATAGAGCTTGATTGCAACACTCTTTTTTAACCCACATTATAGAAATCAATTCCATTATAAAAATCAATTGATATAAAGTAGGTATGTTCGACTTAAGAGGTTAAAGATTTAAGTTTCTCTTTCATATAAATAATTTTTAAATTAATAAGAAAAAGGTTAATTTGTAAATTAAGTATCTACACTTTCATGAAAATTAGAATTTAGTTCTTATGATTTATAACTAAAATTTAGTCACTATCATATTTTCACAAAAAAAAATAATAAATTTAGTATCTATGATTTAATAAAAACTTTAAAAATAGTCTTTATGTAAAAACAATTTGAATAAAGTGTAGAAATTAAATTATAATTTATTAAACTATAGAACTAAATTTGTAGTAAATAATAATAATAATAAAAGGTATGTTTATGCAATTTTAAAGGAAAAAGATGAAAGAAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTCTTGAAGAGAAAAATAAAGAAAAACTAGTTATGAAACTGAAACAATTGGAGGAGAAGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACCGAAAGAGTCCAAAGGCGGCCTGAAAGATTCCGGCGAAGAAAGTGACGGTGAAGACAAGGTTTTTGTAGGCAAGAGGGTTGGCGGCGGGATCTTGAATTTTCTGAATCATTGACGGCAAAAGTAAAGATACTATGGCCACCGGTCCGATTGCTATTTCCCTCGAACTTCCCAACACTGCATAAACCAGCGGTGGCACAATGCTTGTATCTGCCCACAAAACTAACCTTCAATTCATTTTTTTTTTTTTTTATTATTATTAATCCCCAAACCCAAATCAAAACCTTTCCATCTAATTAATTAATTAATTACAACACTTACACAGCCCATATTGAGGATCAAGTTTAGCCAGATTTGCATATCCAATACTCTGCATCACCCCAGTTAATTACAACTTTGATCATCATTTTGTAATTAAATTACTTAACATCATTCTTAATTCAATTTACCTGGGGAATGCAGAGGCTAGCCAGGGTCAAACCAGCCAAGATGTCATTCTTGAACTTCCCCAGATTGTAGCTCTGTCCCCAGCAGAGGATAGGGAACACACCCTGCAAGAGGCTTCCAACCACCGCAGTTCCGGTCTTGTTCTTCAGGGACGAAAGCTTGTTCGGATCGGGAAACATGGTGTCACGGAGAGACTCGATTACCTCTCGCCATATCCCTGGCGGCTCTGGTGGGTTTGCCACCCACTCAGCCCTCTCCGCGGGGCTGCTTTTCTCGACTGTCGAGACGTCCGACATAGTCAGAGATGTGTCGGCGTTAGCGACCGACATGTGTGTTGAAGTGTTTGGGGGAACAACGTTAGGAGAGCTGTGTGTCAGTGACGACACAGCTCGGTGAGATTCCGGCTAGTCAGAAGCAAGGTTATGAAGGTTAATTGCATGAAAAAGCTTGGCCTTGACGCAGCAGAGGAGAAGGGTGATTGGGGAATGTGTGTTCATATCATTCAACCATATATAAGCACTCAAAATTTTATATTAAGAGATGCCACTTTCACTTTAT

mRNA sequence

CATATTTTAACTTCGACTTTTCCACTAAAAACTAATTTTTAGTTTTCATTTTAATGTCTATTAATTAATTTTGAAATCTAAGTAACCGAAATAAAATCATATGTCAAATTTATATATGGTGTGATTACGAAAGAGAAAAGGGAAAGTAATAAGTGGAAATAAGGAGAGAGATAGATTACCGAAAGGAGGAGGCCGAATTCGACGGAAAGAAAGAGAACACCAAGAAAAGCTGCAAGGCAAGCCAAGAAGTCGAGCTTGTCGATCTTCCAGATATTATAAGCTTTGTGAAGATCAATAAGGCCTGGAAGTGCAGATAGAATAATGGAAGCAAGAATGGCGTTGGGAGTGAAGTAGAGGAGCTTGGTGAACATCTCCAATGATATCATCACCGTCACCGCCATCACCACGTTCGAAACCGCGGTCTCACACCCGGCACCGAAATTAACCGCCGACCGTGACAGAGAACCTGTTGCTGCGTAGCAAGAAGTGAGAGAGCCGGCTAGGTTCATGAAGCCTAACGCAACCAGTTCTCTGTTCCCATCAATGTTGTAACCTTTCATGGACGCCAGTGACCTCCCCACAGCAAGGGCCTCCTGAAATATGAGGAAAGTAAGTGATTTTTAACTATAATTCCAAATTAAATAATTGTATTATATTATATTATATTATATTAAAGGTAAGGAATATGGGACCGTGAGGGCTATGACGGCCACGATGAAGGCGGCGTTGAGGATTTGGGAGAAGTGAGGGGAGTGGATTTGGATGTGGCGAGCCGAGATGGGGTTCAGGCCGGCGGGGACTCGTTTGACGATCTTCACGCCCTGCCGGTCGGCTCTTGTGAGGAACACCAAAAGCGTCGATAGGATTACACACAACAGTGGAGCTATGGCAGAGGCTAGCCAGGGTCAAACCAGCCAAGATGTCATTCTTGAACTTCCCCAGATTGTAGCTCTGTCCCCAGCAGAGGATAGGGAACACACCCTGCAAGAGGCTTCCAACCACCGCAGTTCCGGTCTTGTTCTTCAGGGACGAAAGCTTGTTCGGATCGGGAAACATGGTGTCACGGAGAGACTCGATTACCTCTCGCCATATCCCTGGCGGCTCTGGTGGGTTTGCCACCCACTCAGCCCTCTCCGCGGGGCTGCTTTTCTCGACTGTCGAGACGTCCGACATAGTCAGAGATGTGTCGGCGTTAGCGACCGACATGTGTGTTGAAGTGTTTGGGGGAACAACGTTAGGAGAGCTGTGTGTCAGTGACGACACAGCTCGGTGAGATTCCGGCTAGTCAGAAGCAAGGTTATGAAGGTTAATTGCATGAAAAAGCTTGGCCTTGACGCAGCAGAGGAGAAGGGTGATTGGGGAATGTGTGTTCATATCATTCAACCATATATAAGCACTCAAAATTTTATATTAAGAGATGCCACTTTCACTTTAT

Coding sequence (CDS)

ATGTGGCGAGCCGAGATGGGGTTCAGGCCGGCGGGGACTCGTTTGACGATCTTCACGCCCTGCCGGTCGGCTCTTGTGAGGAACACCAAAAGCGTCGATAGGATTACACACAACAGTGGAGCTATGGCAGAGGCTAGCCAGGGTCAAACCAGCCAAGATGTCATTCTTGAACTTCCCCAGATTGTAGCTCTGTCCCCAGCAGAGGATAGGGAACACACCCTGCAAGAGGCTTCCAACCACCGCAGTTCCGGTCTTGTTCTTCAGGGACGAAAGCTTGTTCGGATCGGGAAACATGGTGTCACGGAGAGACTCGATTACCTCTCGCCATATCCCTGGCGGCTCTGGTGGGTTTGCCACCCACTCAGCCCTCTCCGCGGGGCTGCTTTTCTCGACTGTCGAGACGTCCGACATAGTCAGAGATGTGTCGGCGTTAGCGACCGACATGTGTGTTGA

Protein sequence

MWRAEMGFRPAGTRLTIFTPCRSALVRNTKSVDRITHNSGAMAEASQGQTSQDVILELPQIVALSPAEDREHTLQEASNHRSSGLVLQGRKLVRIGKHGVTERLDYLSPYPWRLWWVCHPLSPLRGAAFLDCRDVRHSQRCVGVSDRHVC
Homology
[Close]
BLAST of CcUC07G137220 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0P0VU64 (Os03g0195475 protein OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os03g0195475 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 6.7e-04
Identity = 26/44 (59.09%), Postives = 32/44 (72.73%), Query Frame = 0 

Query: 2  WRAEMGFRPAGTRLTIFTPCRSALVRNTKSVDRITHNSGAMAEA 46
          W AE+G RPA TR  I TPC SALV  T +VDR+T +SG MA++
Sbjct: 52 WLAELGLRPACTRWMILTPCLSALVAYTAAVDRMTDSSGEMADS 95

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC07G137220 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC07G137220 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC07G137220 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0P0VU646.7e-0459.09Os03g0195475 protein OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os03g0195475 PE... [more]
BLAST of CcUC07G137220 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC07G137220.1CcUC07G137220.1mRNA