CcUC06G126540 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC06G126540
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr06: 28818345 .. 28821387 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC06G126540
SyntenyCcUC06G126540
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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ATGAAACTCACTAGAAAGCTCTTGAATACTGTGTTGGACATAGTGCCCTTTCTGATCGGGTGCCACAAGTGTAATGAATTGGCCGTTCAGAAAATTTTTGAACCTTACATTCCAGATCATTTTGTTTGTACTAGTCAAATTATCTTAATACATTTTTGCACCAAATTTCATTTGCTCATCAAATAATTATGCTACGTTCTGACTTTTCCTCAATTTGTTCACATCGTCAGATAATTGTTGAACAAATTGAGCAATCAATTAGCTGGATAAAGTCAGCATTCAGGTGAACACAGTCCATGTTGGATTTTGCTGAAATAGAAACATGCAAAATTTGGTAATCACGAAACATGTGAGTTCTACGTTCTATCTCTAGCTGTAGCTCTTAGTAATTGTGAATTTATAGTGTCCTGGTGAATGCTCAAGGGCCTTTTAATCATCGTGTTTAAATCTTGAGGTAATTGTATTCAATAATTGTAGCTACGAGTAGCTGCTTCTCCCTTTTCCATCATTAGAATAGAGTTGTTTCTTGCCCTTCCCAAGGTTTTGAATGTGCAAAAGAGAATGCCTTTCCAATCGCATTGCAAAAGTATCCGTTAAATGAGGGTTGACATTTTCAAGCATCATTTTGGATAGCTTGCTTAGCTTCTTTATATCTATCTTCCTATTCCGACCGTCGTGGTGAAAAGGACTTCTCTTGGCGGGTGGTGATAAGGTGGGGATGGCTTATATGGTCTACCGCAGTGCGTTTCTTTGAAAATAAACTCAGCGTTTATGTGTAAGTGGTTTTTGAAGCTTATCAATGAACCAAATAAATCATGACCGATGACACCCAGTCATCTCATGTTCCCAAGCTTGCATAGGAAAGAGAAAGGGGGTGGTTAACAAGAGAACAGAAGAAAGGAAGGAGAACCAAATGCCTAGTTGCATATTTCCTCTGTCAGACTTGAAAATTGCATTAATACGTGTTTCTTTTTGAAAGGGTAATAGGCGGTGTTAGTAGCAGACATTTAATGCAGAAATTTCCTTCTCGTTATGCTTTAGCACACTTTAGTCGGATGCTACAATAATGTAGTTCTGGAAGAAACTACTGAATCCTAGAATTTGAACCGGAGGAAAATCTGTATAAGTAGGAGATTAAGGAATTTTGTTTCCTTTTGGAGCTGTTGGCTGAAATATGGCCTAAGAGAGGAGGTGACATATGGAGGTTATCTTTTATTGATGCGCTTTTCTCAAGATTAACAGCTACCATTTCCTTGCTATTCCAAAATCTAGCACTATCAATTTGGGAAGTAAGGAGTACTGAAAGATGTTTAAATTTTCTATTGGGCCACGTTTGTCGACTCTTGAAAGGCTAAACGCAATGGAGAGACTACAAGGACGTTTTGCATTAATGGCATTATTACCAATTACTGCTTCTTTATTTAGGAAAGTAGGGGAAACACAGAGCGTTTTACCAATTTCTTTTCCCCTGGCATCGGAAAGCTCTTTTTCTTTCTTTTGACTTCGCTTGGGCTTTTTATTTCGCTTGTTGGGCATAATTTGATACAGCTTCTGTGTGGAACCAACTTCAAAGGAAATACAAAGATTATTTAAAGGAATACTGTTAAAGCAATTACTTGGAGTTTATGACTTGAAAAAAATTGTTTGATTTTCCATGATAGGGATAGATTCTATAAATTGACAAAATTTCAATGCTTCTCCTAGTATTCCTATTCCTCTTGACCCTTCCAATTGTTCCTGTGACAAACTCCTCACTTTTGTGATTAGCTCTAATTTGGATACTTTTTTGTAAACCCCTTTATGGGGGGAGAGATTAATTCCTCTTTTATCTAAACTTTTTATATTTTTCATCTCAGCTTCTTATACAGTTTTCTTTAACGTCTCTCTGCCTTTTTCCCCCACTGAAGCCTTTATAGAATTAAAGATAAACTCCCCACCATAGCTTTTTAGTTGTCAAAAGTGCAGTTTTTTGTGTTAAAAAATTGGTAAAGTTGTTGGGGATTTTTTATAGTTTCAGATTTGACACCTTTAAGCAACGAGGAAGATAAGAATGCAAGATTAAAGAGTGTATTTGACCATTCTTTTTAGTTAATGAAAGTATTTTTTTTTTTAACTATTTTCAGTTTTTGATTACATGTGACTATATAGTGAAATAACATTTAGAGATTCGAATTCTTTAACAAGTACGAAACTTGTATTTTATATACGAAAATATTGCATTTAAAAAAATATTACTTTCATGTGATAGAATAGAATCTTCTCATGAAACATTACGAAAGATGAAACTTAAGAAAGGTAATATTTTTTTTATGAGTGGTCGAACTTTTCAGGCTAAAGTAAGCATCTTTTCCCCGTTTGGCGGCCAAGTTAGTGGCAGACCACAAGGTCTTCAAAATATTGTCCGTAGAGCATGCCTCTGCAATGCCTTGTGCTGTGCTCTTTTATTTCATGGGATATTGCTGCTCTGTTATTACAGAAATGGTAGTAAGTAGTTTTTACCTTTAATCATGCGTTATCGAAACTTTACTTTTTTGCTTTCTGACATTTCATTTTTAACCCTGACTGCCAATTAGATGAGTTTAGGGAAGGTTAAATGGTAAACTTAGTTCACATGGTCCTGAGAAAGTTATAATTTAGTCCATATGGTTCGATAAAATTTTTATAGGGACTACTTATGAGTATTTTATCAAATCACAAGGACTATTTATGAGGTTTTATCAAATGGTGGGACTAAATTCTAATTTTTAAAATTATAGGGACTGAATTCTAATTTTTTTCAAATCATGGGGACTAAATTTGTAATTTAATCTTTAGAGAAATATCTTATAACGACTGACTTTTTTTTTTTATTCAACAACATATGCATGAGTGGACCAAAATGCTTAACTAGCTTAAAGTTTGTACTACCAATTTCGAAGTTAGAATTGCACCCCACATGGTAGGGAATTCAGATCTCTACCCCTTTATGAAAGACATATTGTTTAACTAAATAAACTATGTTGAGATTGAAACTTACCTCTAGTTAGTTGCACCTAATATGGCT

mRNA sequence

ATGAAACTCACTAGAAAGCTCTTGAATACTGTGTTGGACATAGTGCCCTTTCTGATCGGGTGCCACAAGTGTAATGAATTGGCCGTTCAGAAAATTTTTGAACCTTACATTCCAGATCATTTTGTTTCTTGCTTAGCTTCTTTATATCTATCTTCCTATTCCGACCGTCGTGGTGAAAAGGACTTCTCTTGGCGGGTGGTGATAAGGTGGGGATGGCTTATATGGTCTACCGCAGCTAAAGTAAGCATCTTTTCCCCGTTTGGCGGCCAAGTTAGTGGCAGACCACAAGGTCTTCAAAATATTGTCCGTAGAGCATGCCTCTGCAATGCCTTGTGCTGTGCTCTTTTATTTCATGGGATATTGCTGCTCTGTTATTACAGAAATGGTAGTAAGTAGTTTTTACCTTTAATCATGCGTTATCGAAACTTTACTTTTTTGCTTTCTGACATTTCATTTTTAACCCTGACTGCCAATTAGATGAGTTTAGGGAAGGTTAAATGGTAAACTTAGTTCACATGGTCCTGAGAAAGTTATAATTTAGTCCATATGGTTCGATAAAATTTTTATAGGGACTACTTATGAGTATTTTATCAAATCACAAGGACTATTTATGAGGTTTTATCAAATGGTGGGACTAAATTCTAATTTTTAAAATTATAGGGACTGAATTCTAATTTTTTTCAAATCATGGGGACTAAATTTGTAATTTAATCTTTAGAGAAATATCTTATAACGACTGACTTTTTTTTTTTATTCAACAACATATGCATGAGTGGACCAAAATGCTTAACTAGCTTAAAGTTTGTACTACCAATTTCGAAGTTAGAATTGCACCCCACATGGTAGGGAATTCAGATCTCTACCCCTTTATGAAAGACATATTGTTTAACTAAATAAACTATGTTGAGATTGAAACTTACCTCTAGTTAGTTGCACCTAATATGGCT

Coding sequence (CDS)

ATGAAACTCACTAGAAAGCTCTTGAATACTGTGTTGGACATAGTGCCCTTTCTGATCGGGTGCCACAAGTGTAATGAATTGGCCGTTCAGAAAATTTTTGAACCTTACATTCCAGATCATTTTGTTTCTTGCTTAGCTTCTTTATATCTATCTTCCTATTCCGACCGTCGTGGTGAAAAGGACTTCTCTTGGCGGGTGGTGATAAGGTGGGGATGGCTTATATGGTCTACCGCAGCTAAAGTAAGCATCTTTTCCCCGTTTGGCGGCCAAGTTAGTGGCAGACCACAAGGTCTTCAAAATATTGTCCGTAGAGCATGCCTCTGCAATGCCTTGTGCTGTGCTCTTTTATTTCATGGGATATTGCTGCTCTGTTATTACAGAAATGGTAGTAAGTAG

Protein sequence

MKLTRKLLNTVLDIVPFLIGCHKCNELAVQKIFEPYIPDHFVSCLASLYLSSYSDRRGEKDFSWRVVIRWGWLIWSTAAKVSIFSPFGGQVSGRPQGLQNIVRRACLCNALCCALLFHGILLLCYYRNGSK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC06G126540.1CcUC06G126540.1mRNA