CcUC06G124820 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC06G124820
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr06: 27293761 .. 27296841 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC06G124820
SyntenyCcUC06G124820
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATTTCTCGTCGTGGTAATTAAATGAAAAGTTGACAAATTCCATTGAATTAAATTAAAAGTTTTGGAAATATCGACAAAGTTTTTCCCATTATTTTAGAAGCCATACAATATTTAAAATATCTGAGAACGCACGTTGATTTGAGGGGAAAATTTTAGTACTAGATTTTGACAATGCAATCACATCCGATCACGTGGTAAGTGAGATACGTGGCAGTCGCAGATATGTCCACGACCAGAAAAGGCCGACAAAGGAGCGTCTAACCGGACGCCACGCGTCCGGTACGTATTGGCGGATGACATGGCAAATATATACTGGTCGTACATTACAATCCTAAAGAAAGCATCTAGAACGTTCTTTTGTGTATGCGTGGGGTCCACCATAGATTCAACAGGAAACTCGTGAAAGTCCTACCCACCGCATTTTTCGGAGCGGACTTCAAATTCTTTATTTAAATTTAATTAATTGTCTAGCACAGAAATTTCAACCGGAATTCATCTTTAGATTTTTCATTTTTTTTTATTTTTTCTTTTAGAAGTTTCTAAAAAGTATCTATGAATTTAAGGAGAAATTTGAAGTTTTTTTTGTTCCTTGGAAGAATACCATAAATTTTGGGACGTTGAGTTAAATTATTAAAGGCACGTTTGACTTAATTTTAAAAATAATAGTTTTTCAAAAATTTATTTTTATTTAAATATTTTTTATAATAACTAATTAAAATAAAAAATTTAATTGCTTTCAAAATCCATTTTGACTGGGTGTTGAACACTTGTATTTTTTTCAAAATGATTTATCTTTCAAATTAAACACTTGAAACTTGTATTCCAAACACACCCTAATTTAGTTAAATAATTTTTGTACGAGGTACAAAATTGTTTAACAAGAAGCTTTAAGATTTGTGTGTTGATTTGAATTTGAAATTTATATTTTTAATGTATTTGAAATAAGTTTGAAATATGTCTAAATTTAATTCAAGGAAATGTTAGATTTCCATGCAAAATTTGATTTAGATTTGGAATATAATTTTAACATTCACACTGTGAAATTTGATTTCAGATAAAAATTTGATTATGCCCAACTTCAATTTGATCCTATTGAAACTCCAATATTTTCTTGGATGAATGTCCAATTTATACATAGAAATAAAAGAAAATCCAAATAAGAAAAAGGAAAAGAATAAGAAAAGATTCTAATTGGCTAAATTATATAAAACATATAAGGTAACGAATAGAATCAAAATTTAAAATTATTTAATTTGTCTTTTAATCTAAATTTAACCATTTATAATTATAATTTGGATCAAGTTTCCCAATTTGATTAGATTCTGAGTATGTTTAAAACAATGGTTCATTTTAAAATATTTTTTTAAAAAATATTAACCTTGTTTTCTTGGGTGGAGGGAGAAAAACGACTATTAAAAAGGTGAGGAATATGGAGTATCTTAATAAATGTGCATGAAGTATACAAGGTTGAAGTTGGTGGGAGTATAATTATTTTAGTATTAGATTGTGGAATATGTGGATCAAACTATAACTCAAGAAAATTTCTAGTACTCCCATAATATCATACTTACTGTGTTTACATTATAAATTTGCCTTTCATTGATTTTATGGACGACAAAATGATGTTAGTAAGTCTCATTGTATTTTTAAAAGCACATTAACGTGGCAAACATTAAATAAATGAAGTATGAAAAATTTTTATACTACTATAATATATAAAATTATTCCTAATAATTCACCTCAAGTTCGTAAGTCAAACCATTTTTTTTTTTATTGGAAAAAGAAAGCCAATATGTTAACATGGGCAAGTTGAATTGATAAAGATGTTATTTATCTTCCCTAAAGATTCTCCTACTCTTATGTTTGAACTACACAAAAAAGAAAATAGGCGTGCTTGTTAACATTTTATTTTACTTTATTTTTATTATTTTTTTTAAATTAGGTTTGTTTCGCACAATTTTTTATTATGACTTTCACATTTTTTGTATAAATATACGAATTCTTAGCGAAACTTAAAAATAAAAACAACTTTTCTTAGTTTTTAAATTTTGGCTTTAATTTTGAAAGCATTACAAAAATTTAGACAACAAAACATGCAAATCAATAGATGGAAGTGCTTAATTTAAAAAAAAAAAAAAATAATAATAATAATAATAATAAAACAAAATTGTTGACAACTTTAACCATTTAGTTTCTAAACTTTAGCTTGTAACCATTTAATCCATAAACTTTCAATTTTATAACAATCTACTCCTTTAATTTTAATATGCAACAATTTAATCTAAGTATTTTAGAGTTTGTAATAATTTAATCTCTATAATAATAATAAAAAATTACTAAAATATTCAATAAATAAATAATAATAATAATAACAACAACAACAACACTTATTTTACTTTATTTCAGTACAAGAGAAAAAAATAACAAAGATTTAAGGGAAAGGCAAATTAGTAATTTTCAACTCAAGTTTCAGGAAATCCAAAAACTGGAAGCATAGGAAGCTAAAATATGAGCAACGAAGGTACACCTACGATTGACCAGGAAAAGTCTAAGATAGAACCCATCACGAAGAAAATCTAGAATGAAGTTGACGGATACTTGAACCTCTTTTTGATAAAATTTTCGTAATAGTGATTATAAAATTACAAACTTAAAAGCATAAAAATCAAAATAATATATATATATATTAAATTACATGAACTAACTTATTACAAATTTAAAAATACGAGACCTAAATTGTTATAAACTATAACCAAAGAGTTTAGGGAGTAAATCCTAAGTTCTGTTAGAGAGACCAAACACATTTTTTGAAATAATAATTATAATAAATGGAATCAACATGTCTGGAGATGGTACATAGATAGATATAACACATATTTGTTAATATTTTATTTAACAATATAATAATAATTTCTACGCGCCTAAGAGCGTTTGAATCATACGAACTCCTCACTATTTAATGGTCAGATTTTGCCTCTTTCACTTATCCGTCATGAACACTGCAACCATCGGAAGCGCATCGGATGCTCTGTTTTTCACTCTAACACTTCCCGGCGGCCTTCTTCATTCTCCCTTCCTCTC

mRNA sequence

ATTTCTCGTCGTGATTTTGACAATGCAATCACATCCGATCACGTGGTAAGTGAGATACGTGGCAGTCGCAGATATGTCCACGACCAGAAAAGGCCGACAAAGGAGCGTCTAACCGGACGCCACGCGTCCGAGCGTTTGAATCATACGAACTCCTCACTATTTAATGGTCAGATTTTGCCTCTTTCACTTATCCGTCATGAACACTGCAACCATCGGAAGCGCATCGGATGCTCTGTTTTTCACTCTAACACTTCCCGGCGGCCTTCTTCATTCTCCCTTCCTCTC

Coding sequence (CDS)

ATTTCTCGTCGTGATTTTGACAATGCAATCACATCCGATCACGTGGTAAGTGAGATACGTGGCAGTCGCAGATATGTCCACGACCAGAAAAGGCCGACAAAGGAGCGTCTAACCGGACGCCACGCGTCCGAGCGTTTGAATCATACGAACTCCTCACTATTTAATGGTCAGATTTTGCCTCTTTCACTTATCCGTCATGAACACTGCAACCATCGGAAGCGCATCGGATGCTCTGTTTTTCACTCTAACACTTCCCGGCGGCCTTCTTCATTCTCCCTTCCTCTC

Protein sequence

ISRRDFDNAITSDHVVSEIRGSRRYVHDQKRPTKERLTGRHASERLNHTNSSLFNGQILPLSLIRHEHCNHRKRIGCSVFHSNTSRRPSSFSLPL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 24..49
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 24..43

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC06G124820.1CcUC06G124820.1mRNA