CcUC06G119600 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC06G119600
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr06: 16819843 .. 16828626 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC06G119600
SyntenyCcUC06G119600
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTTCACCTTAATGGGGTGATGGTCAATGATGAGACCACCCCATACTTCGTTAGAGTGGCATCGATCGACTCGGGTGCAGTAGGGCTTCGCTTCACCTCTATCGTGCCATCCAAGCCATAGGAGAGGCTTGAAGGAGTGCTCATGTATTTCTTCCACATTTAGCATGAGTGCCCCAGGAAGTCCGAGTGGATGAACAGCTCAGACCAGATCTCCTTAGTCCTGAGGAGGTTGAAAGGAGAGATGCCCGGGGAGAGGGCTCATTCCACCAGCAGGCTTGTGGGGTACAAACATAGGAATGTTGGGAACAACAGTGAGAGTTGATAGTGAGACCATTGGAAGAGGATGAACCCAACGAGGACGTTGGCTAGCTCAAATGGAGGAGGTTTGACAAACCCCTGATATTCGAAGCATGCCCGACAGGTGAGGAGTATGCCCATCGGGCATGTCTCTCTTGCTGTTCCATATGCTTCGGATATCAGGGGTCTGACAGTAGCCATCTATGGAGTTCTGGGAGGCAGTGGTTGAGAAATTAAATATAACCTGCCAGACCAACGAAACCCAAACCAAAACCAAAACCAGTTTTTGGAGAAGCCCAAACTAGGCTCCAAAACAAAGAATTTGATTGATTGAAATAAAACATCTCAGCCACCCTAAATTACCTTACATAATGCTATGTTTAGAACTTTTTGAGTTCGTGAGGCTAGGCCATCACTTTGGGGTGGCAATTCGTCAACAGCACTATTCAAGAAAAGCCAAAACATCGTCATGACATTGATCATCTAAATTTTCCACGTGTAAAAAACATGCCATCCCCCAATGCGTTCATGCCTTTGTTTTAATATAATTTTGTGCATTCAGGTTGGAGTTTGTATCTTCAAATACTTTATTGATAGTATGGCTGAGAAAAAAACTTGTAGCTTAAAGATACATGAAACATTGCGAGAGGTCTCACTCACTGGGTCATACTGTGTATCATAGGGAAAACATGTTTATGATTTGTTCTAAATATGTTATGTTATGTTACGTTTTTTGTTTTGTTTTGATCTTTGATTTTTTTTTACTTCCTATTGTAATTTTTGTTCTCTTAGACAGACGTGGCTTTTGGTTCTGAATAGATTAGATGAAGCAGGATTTGTTGTTTGAGTTAGAAGGAAAAAAAAGAAAAAAAATACTAGACAAAAGTGTGTGGTGTCTCAGAATTAGCCATTTATTGATTATTAAGGTGCTTAGAAGGTTGGACTCGATAGTTCAATACTGATGTGGAAGTCTTCTCGGTGAATACCCTTCATTCTGATCTTTATAATCATATATTTTACAATGCTTTCTGAATTCAACAGGGAAGTCAATAAGGCATTCTGTGGTTTCTTCGATCAATCAAAATTTAATCAGTATGAGAGTCTATTCTTAGAAAGTGGGCAAGATGTCACGGACCATACTGACACGTCAAGAAACAATCTCTCGGTAAAATTTCTTTCTTTTTTGTTTTGTATTTTGACATTATACTCAAATGATAAGTTAAGAACCTTATAGTTAGGATCATGATCATAATTAGCACTCTTAGATGATCCCCATTTTAAGTTTAGTTTCAAACTTTCTTATTAAAATGATTTTTTGTTACAACATGCTTTATGCTCATCAAATGCACATAAATTATTTGTTCTCCTGTTCCTAGTTTGCTTGCTTGGGTTTCTTCTTTATGGAGCTATTATTCTTCTTTATGGTGCTATTATTTTAGGTGCGTGAATCTACCTCGGATAGTAGAGAGAATTATTTTGGTACATCTCTCACTCCAGAACGCTTGGATCACAAAGATGATATTGGGATTGCAACAGGCAATTGGGGTTGTGGTGCCTTTGGAGGAGATCCTCAAGTGAAGTCCATAATACAATGGCTTGCTGCTTCTCAGGTACCTTTCAAGTGTTTGTATGGTTCCACATGCACAACATATTTCATAAGGGTAGTGATAAATAGCCTTTGACATAAAAAGTACGTTTATCCTGTTAAAACGCTTTTCAAAATGTTCAATGTTTATCTTCCGGGAGAAGTGCTTATAAAAGAATTGCTTTCACTTAAAAAACACAATCATTAAACTCATCCTTACACTTAGATTCATTTTCCTTACTAGTACCCACAAACAACCTTATTTTATCTACTTATGTTCTGCACATCCTTAGTTACCTTCCAATTTTTTGATGGATAGTGTTGAAAATAAAACAAGATTTTTGGGGATATTGTAAATTTTATTTTTTCTTTTTATATTTCTTAATATTTTTTCTTTTATAGATTTGGAGTCTATTCATTTTTCCTCCTCTTGTAACATTGAGTGTATCAAATTAATAAAAAGAGAAAATTTCTATCGTGGTTTTTTCTCCCTGTACTAGGGTTTTCCACGTAAAGCTCGTGTTCTTTTTCTTCTCTTCTTTTTCAATATGGTATCAGAGAGTGGTAACGAAACCCTAGAAACCCTAACCGTCGTCGACGACAACCAACCACTACAAGATGGAACCCGCTGCCGTCAACCGGTACCTAGTGTCATTGAACCCTAACTTCGCTGCTGCTGCCATCCAAGATGCTGTGGATTGGGAACTTCTGGCCAGATTGACAGCAGCTGGACCGTCGAATCGATCTGCCTCCTCAAACTTGAGTGTCGTTGCCATTGTTATCTAAGACACCATGTACTAAGAGCTTCTGACAAGATCGGCAGCAGCTGGACTCTTGAGTCGACCTTCCTCCTTGCGTGTCGCTAGGTCTGCCGTCAAATCTGTCTTCTCTGACCGTGTGGGAGCTGCGAATCTACCAGTAGTCGCTGGGGGTTTTTCCGCAATCGCCGCCGGTGGTTTTTCCAGCACTTATCCCCTGCCTCCGATCAATGTTGTAGCTGTTGGAACTTCTACCTATGCTGCGGGCACCTCACCTCCCTACCATGAGGAAAAGAATGGAGTCTTTGTTAGGTGTAACTTCCAGCACGATTCAACAGCAACTTGTCAATCTTCAAGCAAGTTTTCAACAATGGGGCAGCCCTTGGTGCTTCGACCAGTAAATTCAGGTATCCAATCAGATCTACTGATGTATCCAGAGAATCCGATAACTGTTTTCCTACCTTAACTACTGCACCCCTATATGTCTGGACCAATGGGCAACTCCACAGGACTAATCGTTGGTGGAAAGTTAAGTTGTCAAAATTATTTCTCCTTGTCTCAATCCGTTAAAATGGTACTTAAGGGACGCCACAAATTTGGGTATCTAACTGATGAGATACCGAAACCCAGACTAGGAGATCCCTCAGGAGCGCATTTGGAAAGGAGAGGATTCTTTACTCCGTTCTCTGTTGATTCACAATATGGAACCTCAAATTGGAAAACCTCTACTGTATGCTGCAACTGCTCGGGATATCTGGGATGTTGTTCAGAAATTATATTCCAAGAGACATAATGCATCACGGCTCTACACTTTGCGGAAACAAATTCACAAATGCAAACAAGGGAATATGGATGTCACACCATATTAACGAGTTGTCTCTTATTTGGCAGGAGATGGATTTGTGTCGAGAACTTATCTGGGACTGTCCATGTGGGGGAGTTCAATATTATAAACTTGAGGAAATTGATTGTGTGTATGGTTTTTTAGCAGGTTTGAATTCCAAATTTAATGCTGTGCGAGGTCAAATACTGGGACAGGGACCGATACCGACCCTGATAGAAGTCTGTTCCGAGGTTTGTCTTGAGGAAGACAAATCAAGTGCTATGAATATCATAGTCACTTCCGTGACTGACTCTGCCGCATTCAGTACTAAATCATTTGGTACCACTGAAGACAAGCAGAACGAGAAACCGCCCCCCGTATGTGAACACTGCAAGAAACCTTGACATACGAAGGATTAGTATTGGAAGTTACATGGTCGGCCCCCAAATGGCAGATGACGACCTCCAAACAGCAAGCCTAACTTTAGCCAGACTCTGGTGAGTGAAACTGCTAGTGGCTACCAGTCACAACCCCAGGAGAACTGTCTAGCTGACACCAGTGCCTCCTCTCTTGGGGCAATTCCCAATTAGGTACATCTCATTCCTTAAGTCTCCTCAGTATTACTAGTAAGAAGCCCTGGATTCTTGATTCAGGAGCTACATGTCATTTGACTAGATCGTCTAACAACTTTTTCTCATATCATCCATGTGCTGGTAATGAAAAAATCTGAATTGCTTATGGAACCTTTACTCTTGTTGCGAGCAAGGGTCGCATTTCTCCTTTTGATGGTCTGATATTACAGAATGTGCTGCACGTCCCTAAAATATCTTACAATTTATTGTCTATGAGTAAGATAACTAGAGATCTAAACTGTTGTGTAGTGTTCTCACCAAATGATGTTGTTTTTCAGGACTTGAGCTTAGGGAAGATGATTGGCACTGCCCAGCACAATAGGGAACTCTTTTTCCTTGATGATGATACTTCCTTCCTCTAGGCATAGTTATAGGACTAGTTTGTTGTCTTCCTATTTCTCAACTTCCGAAAATGATTGTATGTTGTGCCATTTTTGTCTTGGTCATCCTAATTCCAATATATGAAATATTTATTTCTTCCTTTGTTCAATAAGGTTGACATCTCTTCCTTGTCCTTTGACGTGTGTATTCGGGCAAAACAACATAGGGTCTCTTTTCCATCCCAACCAAAATCATCTTAACCTTTCACTCTTATTCGCAGTGATGTTTGGGGTCCCTTGAGGGTTCTACCTCTTTAGGTAAGCGCTGGTTCGTGACCTTCATCGATGACCACACTCGCCTTACTTGGGTTTTTCTTCTCACAAATAAGTCTGAGGTGTCATCCATTTTCCAATAATTTTATACTACCATCGAGACTCAGTTCAATGCCACAATTGTCATCATTCGGAGTGACAATGGTCGTGAATTCCTTACTCATACCCTGCGTGAGTTTTTGTCCACTAAAGGGATTGTTCATCAGAGCTTGTGTGCCTATACCCCCAACAAAATGGAGTGGTTGAAAGA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mRNA sequence

ATGCTTCACCTTAATGGGGTGATGGTCAATGATGAGACCACCCCATACTTCGTTAGAGTGGCATCGATCGACTCGGGTGCAGTAGGGCTTCGCTTCACCTCTATCGTGCCATCCAAGCCATAGGAGAGGCTTGAAGGAGTGCTCATGTATTTCTTCCACATTTAGCATGAGTGCCCCAGGAAGTCCGAGTGGATGAACAGCTCAGACCAGATCTCCTTAGTCCTGAGGAGGTTGAAAGGAGAGATGCCCGGGGAGAGGGCTCATTCCACCAGCAGGCTTGTGGGGTACAAACATAGGAATGTTGGGAACAACAGTGAGAGTTGATAGTGAGACCATTGGAAGAGGATGAACCCAACGAGGACGTTGGCTAGCTCAAATGGAGGAGGTTTGACAAACCCCTGATATTCGAAGCATGCCCGACAGGTGAGGAGTATGCCCATCGGGCATGTCTCTCTTGCTGTTCCATATGCTTCGGATATCAGGGGTCTGACAGTAGCCATCTATGGAGTTCTGGGAGGCAGTGGTTGGAGTTTGTATCTTCAAATACTTTATTGATAGTATGGCTGAGAAAAAAACTTGTAGCTTAAAGATACATGAAACATTGCGAGAGGTCTCACTCACTGGACAAAAGTGTGTGGTGTCTCAGAATTAGCCATTTATTGATTATTAAGGTGCTTAGAAGGGAAGTCAATAAGGCATTCTGTGGTTTCTTCGATCAATCAAAATTTAATCAGTATGAGAGTCTATTCTTAGAAAGTGGGCAAGATGTCACGGACCATACTGACACGTCAAGAAACAATCTCTCGGTGCGTGAATCTACCTCGGATAGTAGAGAGAATTATTTTGGTACATCTCTCACTCCAGAACGCTTGGATCACAAAGATGATATTGGGATTGCAACAGGCAATTGGGGTTGTGGTGCCTTTGGAGGAGATCCTCAAGTGAAGTCCATAATACAATGGCTTGCTGCTTCTCAGATTGACAGCAGCTGGACCGTCGAATCGATCTGCCTCCTCAAACTTGAGTGTCGTTGCCATTGTTATCTAAGACACCATGTACTAAGAGCTTCTGACAAGATCGGCAGCAGCTGGACTCTTGAGTCGACCTTCCTCCTTGTGAGTGAATGGATTTTGGCACACAAATGGACAGTTGGTGATCTATGGAGTATGTTGGTGGAGTATTCTTCTCAAATATCGAAGGGACAAACTCATATTGGTTTCTTTGATTGGCTCCTCCCAGCCTCCTCCAAAACTAACTCATGTTGTTTCTCTTGATTTGGCTAACCCTAAAATGCTCTCAACAATGTTTGGATTAAATTATATGTATATGGTCAGTTTTACCCTCATTTTAAAATCTATCTCAATTTTACCCTTAGACAGAATGACATGAAGCTTGGAATGAGACTGACACCAAGGTTTAAAATGTCAATGTTGACAGAAATATCTAGACCTTAATTTTATGAAAATTTTG

Coding sequence (CDS)

ATGCTTCACCTTAATGGGGTGATGGTCAATGATGAGACCACCCCATACTTCGTTAGAGTGGCATCGATCGACTCGGGTGCAGTAGGGCTTCGCTTCACCTCTATCGTGCCATCCAAGCCATAG

Protein sequence

MLHLNGVMVNDETTPYFVRVASIDSGAVGLRFTSIVPSKP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CcUC06G119600 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC06G119600 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC06G119600 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of CcUC06G119600 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC06G119600.1CcUC06G119600.1mRNA