CcUC06G119550 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTCAAAAGTTTAAAAAATACTCCTAAATTAAAAAAAAAATATATATCATCGTGAGTTAACAGAAACTATTAGTATCTTGTTGAAAAAATAACTCAAATTTTAGAAAAAAAAAAAGTTAAAAAATGCACGTATCATTAGTATGGTGAGCAATTTGTTCGAAGTTTTCTTTAGTTTGAAAAGAATCAATTTTAAAACAAATTATATGTACATCTTTAATTTTTTTTTAAAAAAAATAGCTTATTTTTCTCCTATTTTTTCAATTCTTATACCAATTTTTTTTTCAAGAACCAAAATTTTAAGTTAAAACATAAAATCGCACAAAATTTCACAAAACTCCAAAATTAAAATCTTCCTTAAGAACATACCAAAATGATAAATGGTCAAATAAAAAATATATATTTAACTCTTAACACACACTTAACGCACAACTTTGTGAAAATATTTAAGTCCCAAAATCCCTTGGTGTTTCCATATTCTTTTTCTTCTTATTAGTGCATATACCTTAATTGAATTCTGCAATTTTATTTTTTTATTTATTATTTTTAGATAAAAAATCTAAAAAATTAACAAAAGGCGAGAGTATCAAGGTACTGAAGAAGAAAATGAGAAAAAAAGAGGAAAAAGAGGGAAAATAGAGAAGTAATATGACATTAATGGTCTCTATTCCTATAGAGAAGTAAGATGACATTAATGGTTGCTATTCATATAACTGTAAATGAGAAAAAAAGAGGGAAAATAGAGAAAAAAAGAGGGAAAATAGAGAAGTAAGATGACATTAATAGTTACTATTCATATAACTGTAAAGGTATTTAATTTTTTTAAAAAAAATTTAACGGTAGTTTTTTAAACTTTCAAAATTTATGAGTATTTTTGGCACAAAACACTAACGACTTCTCTCGAACCTAATTTTAAGGGTAGTTTTAAACTCATTTTGGAAGTTTAAAGATATTTTGAAATTTTTAAAATTTCAAAAGTATTTTTGAGACAAAGTACAAAGTTTATAGATATTTTTGTATAATTTAGCCTTAAAACTTTAAAAAGGAAGAATTTAATACATGAGGTTTAGAAAATATTTATAAATGATAAATGAGTGATATTGTCTAACAAAAAAAAATTTGACGTTGTATAATTGAAGTGTGTGAATTGTTGAAAAAATTCTAGTGTCTTTGAGATTGAGTGCCCATGTTCACACTTTCAAAAAGATTTTTTAACGGTGACGATCAATTAGTGCGAGCAGTAAAGTTTTTCCGCCCATTGTTAAGTGACATGGATATTTTATTAATTTTATGTTGATTTTACCTTACACGGGTTCTCTATTTTAAAATTTTAATTTTATTTTCTCTTCCTTTCTTTTCCACTCTTCTTTCCCCACACATTTTGAATCTGAATCTCGAAATGGAGAATTGATTCAAGAGAAAACAAAAAGAAATTGGAGTGGGTGAAAAGAGGGAGAGGAAGTGAGAAGAACAAGAACAAAAATAAATAAATAAATCGTCATTTTTTCGTTAGTCAACAATGATCAATACCACTCAAATGACTATTTTAAAATATTTTCTAAACTTTTGGGTAGAGTGGACTATTATAGTCCATGAAATAAACCACTCAATGTTTGTGACTCAAATTATAATAGTTTGTATTTCCTTTTTTATTATGGTAGATTATCTTAAATGACAAAACTACTTAAAATAATTACAACTAATAACAAAATATACAGTCTATCTGCGATAGACCGCGATAGATCACGATAGACTACTATCTATGTCTATTGTGACACAGACAATAGTCTATCACAATTTATCGCGGTCTATCACAGATAGATAGTTAAATTTTGCTATATTCGTAATTATTAGTTATTTTTGCTATATTTGAAAATAGCCCTTTTATTATAGTGTTTATTATTCCTTACATAGACTAAAATAATTTAACACCCCAAACATAAATTATTATAATATACGAACTATAATAACTATTGACTATAATATCTAATTGATTAGCATCCCCAACCACCCTTTCCATACTCAAGTTTTAGAGACAAAAAGTGTAATTTATTCTTATATTTGATAAAAAAGTCATTGTTCTATGTCTAATGACCAAAACTTATCAAGTGATTAATCAATTCTCTAAATATTTGATAATTCACATCATTTAATAGACTAAAATTCCATTTTAATATCAAACAAATTAAAGGATGGTGTGAATTTAAGTATGTGTATTAACGTGCTAACGTAAAAATACATTAAAGCCACCTAAGCTAGTTGAAGTGGACATTGAATGATAAGACAAAATGAAATTCATCACAAAATAAGGGAAAGACTTGTTATAAAATAGGTGAAAGTTAAAAAAAAATAAGAATATGAGAGAGTACAAAAAGAAGATGAAAGGAAGAGAAAATAGAGAGAATATTTAATTAACATTTAGCTTTTGGATGAGTGTGTTTTATATAAATGATCTCTACAATGGTAGAAGTGTAAACATAATGTATAAGATCTACCATAAATAAGACTAAAACTGACAAAGTGAGCTTTCTTTAAGGGTAATTGACGTGACATTCTATTTTAGAGGTGGGGTGATTTCATTTTTAGTTTTCTATCTCTTGAATTTTGGAAAATTATTTTAAATGACAAAATTGTTGAAAATATTTACAAATAATAACAAAATATCACCATGCATAACAGTGAAATTTTGCTATATTTGTAAATATTTTGGTTCATTTTCCTATATTTGAAAACAATGTTAAATTTATGCTTATGCCTTACAAATTTCACCATTATGTTTTGACTTATCTCACAAACGAAACTTGGATTTGTAGTCAAAATTTAAAACTAAAAAAAAGTTTTGAAAACTACATATTATTTTTAGTATTCAAAACTTATCTTAGTAAACATAAATAGAAAGTATATAACAAAACCAAGAACTCGTGGTAAAAGTAGTGTATAGTAGGGGTGGAAACGGTTCGATTTGGTGGTCAATCGAACCAAACCGAAAGTTTAAAAATTTTTATATGTGAATCGAACCGAACCAAACCAATCTTTCGTTTCAAACTAAATCAAACCAAATCGAATACATGCAATTCGGTTCGGTTTTAAATTCGATTATGTTTTTTGTTAAAAAAGAATATGTATATATACATATTTAATTTAAAATGGTACGGTTCGGTTTGGTTCGATTTTAAATTCAATTTTGCTCTTTAAATTAAAAATGGTTTAGTTTTGAATTCGATTTTGCTCTTTTTCTTAAAATATACAAATATATATATATATATATATAATATTAGTGGTTCAGTTTGGTTACAAATTCAATTTTTGAAATTGAACCCAAATCAAACCGAATTGAATAATTGGTTTGAAGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAGTGGTTCAGTTTGGTTACAAATTCAATTTTTGAAATTGAACCCAAATCAAACCGAATTGAATAATTGGTTTGAAGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAGTGGTTCAGTTTGGTTACAAATTCAATTTTTGAAATTGAACCCAAATCAAACCGAATTGAATAATTCGGTTTCAAGATTTCTTCAAACCAGACTAAACCATATTTTTTGGTTCATTAAGTTTTCGGTTCGGTTCGGTTCGATTTTGAAAAATGATTCGATTTTTGCAGTTTTAATGACCATCCCTAGTGTGTATTAGTTTCATTTTAAAAACAACAAATAATAGTTCATTTTTTTATTGATTAGGTAAAACTTTTTTTTATTAGTTTACAATAACATCTAACTGTGGAGAGATTCAAACTTCTAATTTATTGATCAGGGATATGTACTTTAAGCAGACGATGATGCTCATAATAAGAGCTACAACAAACTTTAAAACTTTAAAAATATGTTAGATTACCAATTGGGTCTCTATACTTTGAAAAAGTTAGACTTTAGTTCCTATAAGATTTTAAAAGTTAGAATTTAGTAATCTTTAGAGTGTGATAAAATTTCATAAATTGTTCATATCGTTTGAAGGGACTAAATTTTAATTATTATAAACTATAGGGACTAAATTCTAAATTTCTCACTACTATAGGACCAAACTACAATTAAGCTTTTAAAAATAGAATTAATTCACTAATTAATGCAATAAACTTGGAAGCTGGTTCTTTTGTGATCTTAATATATATAAGATGATTCGAAAGAATCAAATAATAATTTAAAAAGAAAGTTGAAACTACACCACCAAGGGTATATGAATTGAAACTTCAGATATATATTCTTTATTCTTTGATAGCATGCCCAAAACCACAATTATTAATTAATTAATTAATTTAAATATAGCAAAAAGCACTTTAAATGAAGGAATACCCAATATCCAATTTGTTGTGAGAAACTTTAGGCCTTGGATTAGGGGAACCTTCTGACCAAAGAAATTCATTTTCACCCTGCTTTTAAAAGTTTTTTTTTTTCTTTTTCCACATTGCTTTAATTTTCTGAGAAAATAAATAAATAAATAAGTAAAAGCATATGATAATGACTCTTGTCTTATCTTCCTATAAATTTCCTTTATGTTTATGCAACTCAATCCAATGGTGGGTTCATCGATATCTAAGGTGAGTGAAATTTAATTTCATGTTTTTGTTTTGAGGAGTTTTTGTTGTATTTTTCTCTTCTATTGAAAGGAATGGAAAGTTTCAATTATTTATGTGTTTATGATCTCTACTTGTTTATATGTTTGCAGTGTGTTTGAAGTACTTATAGAAGCTATCAACTGATTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTTATCCTCCATTTCAAGAGTAAGGAATTGCTATTTTTTCTTGTAATTTTCAATTTAGATATTGATAATTAATTCTTATTTCCATTTATGAAGAAATTGTTTTATTTTTTCATTTTTAGAAATTAAAAAAGTAAGAGATTTGAACCGACTCTTTTAAAAAAAATTAGTATGGATAATTAGAT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MIMTLVLSSYKFPLCLCNSIQWWVHRYLRHQQKMVSRKVDLRSDTVTKPTESMRAAMAIAEVDDDVLGHDPIGLELEEEMAKIMGKEAGLFVPSGTMGNLISVLVHCDIRGSEVIVGDNSHIHILENGGIATIGGVHPRTVKNNADGTMDIHLIEAAIRNPKAQLFFPTTRLICLENTHANSGGKCLSVEYTDEVGELAKKHHLKLHIDGARIFNASIALGVPVDRLVQAADSVSVCLSKGLGAPVGSVIVGSKDFITEATRVRKALGGGMRQIGILCAAGLIAIKENVQKLQADHEKAKQLASGLYQIKGLKVDPKSVETNIIFFEIEEDYGISLETLCKSLEERGVFMMLESQIRARIVLHHQISTSDVHYTLSCFQQTLSGIQVVNGN Homology
BLAST of CcUC06G119550 vs. NCBI nr
Match: XP_008453666.1 (PREDICTED: probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 651.7 bits (1680), Expect = 3.9e-183 Identity = 326/363 (89.81%), Postives = 347/363 (95.59%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. NCBI nr
Match: XP_038877077.1 (probable low-specificity L-threonine aldolase 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 645.2 bits (1663), Expect = 3.6e-181 Identity = 323/358 (90.22%), Postives = 344/358 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. NCBI nr
Match: XP_011660269.1 (probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X2 [Cucumis sativus] >XP_031745916.1 probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X2 [Cucumis sativus] >KAE8637487.1 hypothetical protein CSA_016969 [Cucumis sativus] >KAE8653610.1 hypothetical protein Csa_006916 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 636.0 bits (1639), Expect = 2.2e-178 Identity = 319/358 (89.11%), Postives = 339/358 (94.69%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. NCBI nr
Match: XP_008453667.1 (PREDICTED: probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 632.9 bits (1631), Expect = 1.9e-177 Identity = 319/363 (87.88%), Postives = 339/363 (93.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. NCBI nr
Match: XP_031736719.1 (probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031736720.1 probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031736728.1 probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031745913.1 probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031745914.1 probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031745915.1 probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 629.4 bits (1622), Expect = 2.1e-176 Identity = 319/364 (87.64%), Postives = 339/364 (93.13%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RXU4 (Probable low-specificity L-threonine aldolase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=THA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 8.2e-144 Identity = 249/353 (70.54%), Postives = 301/353 (85.27%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FPH3 (Probable low-specificity L-threonine aldolase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=THA2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 485.7 bits (1249), Expect = 4.8e-136 Identity = 242/344 (70.35%), Postives = 287/344 (83.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O07051 (L-allo-threonine aldolase OS=Aeromonas jandaei OX=650 GN=ltaA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 280.4 bits (716), Expect = 3.1e-74 Identity = 159/346 (45.95%), Postives = 216/346 (62.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q21890 (Uncharacterized protein R102.4 OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=R102.4 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 269.6 bits (688), Expect = 5.4e-71 Identity = 152/354 (42.94%), Postives = 213/354 (60.17%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P75823 (Low specificity L-threonine aldolase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=ltaE PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 253.1 bits (645), Expect = 5.3e-66 Identity = 138/329 (41.95%), Postives = 201/329 (61.09%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BXZ8 (probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494316 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 651.7 bits (1680), Expect = 1.9e-183 Identity = 326/363 (89.81%), Postives = 347/363 (95.59%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BWA2 (probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494316 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 632.9 bits (1631), Expect = 9.0e-178 Identity = 319/363 (87.88%), Postives = 339/363 (93.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWI0 (probable low-specificity L-threonine aldolase 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024142 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 613.2 bits (1580), Expect = 7.4e-172 Identity = 312/359 (86.91%), Postives = 333/359 (92.76%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EZ04 (probable low-specificity L-threonine aldolase 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440844 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 607.8 bits (1566), Expect = 3.1e-170 Identity = 310/358 (86.59%), Postives = 326/358 (91.06%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HN30 (probable low-specificity L-threonine aldolase 1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466119 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 606.7 bits (1563), Expect = 6.9e-170 Identity = 309/359 (86.07%), Postives = 325/359 (90.53%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. TAIR 10
Match: AT1G08630.1 (threonine aldolase 1 ) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 5.8e-145 Identity = 249/353 (70.54%), Postives = 301/353 (85.27%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. TAIR 10
Match: AT1G08630.3 (threonine aldolase 1 ) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 5.8e-145 Identity = 249/353 (70.54%), Postives = 301/353 (85.27%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. TAIR 10
Match: AT1G08630.2 (threonine aldolase 1 ) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 5.8e-145 Identity = 249/353 (70.54%), Postives = 301/353 (85.27%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. TAIR 10
Match: AT1G08630.4 (threonine aldolase 1 ) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 5.8e-145 Identity = 249/353 (70.54%), Postives = 301/353 (85.27%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G119550 vs. TAIR 10
Match: AT1G08630.5 (threonine aldolase 1 ) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 1.8e-138 Identity = 243/353 (68.84%), Postives = 291/353 (82.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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