CcUC06G117550 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC06G117550
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr06: 10250623 .. 10254587 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC06G117550
SyntenyCcUC06G117550
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGAAGGTTGAAATGGAAGAAAAGCATCATCCATCAAGACCATTGGTGAAACCGTATTGGTGACTCAACACCCAACCTAACCATTGAAAGCTACAAAAGTCAATATGTTTCTCAGTTGATAGTCGATGAGGGTGTCTGGAAGGAGGAGGTGGTGAACGACTATTTTGATCCCTTATATGTGCAATGTGATCATCTTGAACAATGACCTGAAAGATGTCTTCTTAGACATTTCTAGTATTTTAATTATTATGGTGCAATCATATTTGATGTTTAGATAAAAGACCAATTATTATGGAACATGTATATTTTTTGTTTAGAAAAGTGGTAAAAGAAATGTCAAATTTCAATTTATAAAAAAAGAAATAGACTCGATTTTAATTTAAAATTAGCAAAAAGGACCGATTCAAAACAAAGTGAAAATAAAAATTTAAAAATTGAAGAAAAAAAAAGAAAATGGCAAAAACAGAGAACTAAACTAATAATAAACCGATCCAAATAAAACCAATCCATTGTTTTTATTCTTCATTGGACATTGGTTTGGATCCCTTCCTTGTAAAATCGATTAATTTGGTTTGGTTCTTGGTCGGCCCTAAAACCGATAAAGTCGAACCGACTATCACCTTTAACCATGGATTTCATATTTTCTAACTAAACATGTGAATACTTCTTACCCAAACTCAAACAACAAAAAATCAAATATCAAAAACACTTATAAAAAGTAGATAAAAAACCAAAAGGTATAAAAATGTTTATAATCTTAAATTTTCAAAAATCGAAACACAAAAATTCAAATGCTTATCCACCAAGGCTTAAATTTTGTTATAAACTTTTGTAGTTGAACAAGTAGGGACTAGGGTGATATGATTCAAATTTGAAGGCTATACCTTAAGTTAACAATTTAACTATATACCCTATTGGCTTTTATAGTAAATATTGAAAGAAGTATTATCTACCACACAATATATACTTATACACACTCTGTCACAACAAGAACAAGAACAATAATAATCACAAATAAACAAGCCAAACAAATCAAACACACAGTTTGGTAACTCAGTTCAACGATATACCATTTACGTTTGGGAGGTAGTGTGCTCATAAAAGATAATTTCACTAATATGAAAAGTCAAGTGTCTTAACTTGTTGTTAATTACCCAGGCTCCCCCTAGATGTGAGATTCTCTCTTGAATGAACTTAGGCCCCCTAAGTTGGTGAATATTAGTTAGTGATCACTTAGGCTCCCTCTAAATGTGAGACCTCTTCTGATCAGCACCTTTATCTTTCCACTGTCAAATGAATAACACTTCACTCGAAAAAACTCAGGCTCCCCCCGAGTTTGTTAATATCCTCTCAATCAATGTAGACTAATTCAAGACAATCACAGTAACATTTAAGGAAACCACTAACAATAGCTTCTTTATCGAACAAGTCTATCATTTTAGAGCATTACAATCACAAATATTTACGTAGTCAATTTTTCTTTAGCAATAAATAATCCTTGGGTCGAACAGAATAGCAAAACGACCAACCCTAAAACTAAAGCAACATTTGCCTAAAAATGCACAATGGATGAAGGAAAAAATAATCCTTTCCACAATCGGCAGACACCCAAAAAGGAAACAAATCCACGAAAGAGTAAAACCGTAGACTAATCCATACACTACAAGAATTTTTGTCTCTGTTGACAATTTTTTCTATTAATGCAACAAAAAATATCGGTAGAGCTAATTTCTGCCGACGAAAGTATATGCGTGGACAAAAAGTTGTGTGGTATTAGTGAAAATCATTAACGTTGGTTTTTGCCGACGCTTAATTTAGTTTTTCCCCATGTAAGAAACGTGGGCATAAATTTTTAGTTTCTTCCCACGCAATATATATGGTCAAAAACTTTTTAAATCCCACATTTTCTTTTTTCCCCACATTTTCTTGAAACCCTACCCAATTTCATCTTTACCCATATTTTCTTTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTCCCTTTTTCCCCTCTCCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCGTTTCCCTCTTCTCACTCTCCCCCTATTTTCTTTTTTCATTTTATTTCTTCTCTCCACACAATAAACAGAAGACCTACAAATACCCTGACTGTCGCGTTAGAGACCCACACACGCCGTTATGTGCCGCTCCTGCCTACCGCCGTTGCTGCCATCATGAGAGACCCTTCATCGTTGCTGTCATTCGTGATGCAGTCGCCGACGTTGTCATTCACATTGGGTTGTCGCCGTAAAGTCTCTAGTAGTAAGAGTGGGTGAGTTGTTTATTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGATCTAGAGTTATATTCTATCACTAATGCTTTTTGCCTACGACACTTGTGTACTACAATATTGGTAGCGTTGAGAAGATTGAAACCTATTATTTGGTTGGGTAAGTTTTCTTTGAGTTTTAGAGTAATGTTATAGCATGGATTTAGGCCTATCTTGTATTTTAAATGTTGCTCTCTTTTGTCTTGGACTTAATCCAATGGTTCTGTAAGAGGAAGAAGTTTGGTTGTCGTTCTAGAACATAAGTTTTGATGTAGGGACTTTGCATTGTGCGACTTACCAATTGCCATATGAATGTTTTGAATGAAATTGTAATGAGAATGATTAGTGTTGATCTTTTAGGTTGGTTTTGAGTTTGAAAGCCACACTTAGGCATGTTTAAGTTGTTTTGGGAGTAGACACTTTTTAGGTACTTTTTAGTTGGTTATGAAACTCAAAAGAACACTTAAGAACTATTTATGTTGTTTTTGGAGTTGACAAATCTCTTGAAAACTTTTTAGGAACTTTTAAAGTTGTTTTGAGGGTAAAAATGTCACTTAGACACTCTTTATGTTCTTTTTAGGTTGATTTTGAGTTTGAAAGTCACAGTTAGGCATGTTTAAGTTTTTTGGGGAGTTAAAAGTGTTATTTATACACTTTTTAGGTACTTTTTAGTTGGCTTTGAAAATCAAAAGGACACTTAAAGAACTATTTTAGGTTGTTTTGGGAGTTGACAAGTCTCTTGGAAACTTTTTAGGAACTTTTTAAGTTGTTTTGAGCATGAAAGTGTAACTTAGACACTCTTTAGGTTCTTTTTAGGTTGGTTTTGAGTTTGAAAGTCACTATTAGGCATGTTTAAGTTGTTTGGGAGTTAAAAGCATTATTTATACACTTTTTAGGTACTTTTTAGTTAGTTTTGAAAATTAAAAGAACACTTAAGAACTATTTAGGTTAGTTTGGAATGTTGACACGATTGTATTTATTGAAACATATTGATTCTGAGATGAGGTCGCATACGGATAAACTGGTTGATACAGAGGATGTGTTACGACATCCAGCTGATGGTGCAGGATGGAAACACTTTGATAGAGAGTTTTCGCAGTTTGCTTCAGACCCGAGAAATGTTCGATTAGGGTTAGCTTCAGACGGATTTAATCCATTTGGGAATATGAGTACAACCTATAGCATGTGGCCAGTGGTGCTTATACCGTACAATTTTCTGCCTTGAAAGTGCATGAAAGAATCCAATTTCTTCATGTATTTGCTTATACTTGGACCGAAGTCTCTTAGAAAAGAGATTAACGTATATTTGCAGCCATTGATTGATGAGTTGAAAGTATTATGGAGTAATGGTGTGCGGACATATGATTACATGAATAAGGAGTATTTTCAATTACATGCATGTTTTTTGTGGACCATCAATGACTTCTCTACTTGTAAAGAAGATACATCATCATTTGGGATAAGAGGGAAAATATCTTTTAGGGGACATAGACATTATCTTCCCAATGATCATAGTTGACGAAGAAGTCAACAACATGATGGCAAATCCGAGCGTAAGCCTCCACCAGTTGTAA

mRNA sequence

ATGGAAGAGACCCACACACGCCGTTATGTGCCGCTCCTGCCTACCGCCGTTGCTGCCATCATGAGAGACCCTTCATCGTTGCTGTCATTCGTGATGCAGTCGCCGACGTTGTCATTCACATTGGGTTGTCGCCGTAAAGTCTCTAGTAAGTTATATTCTATCACTAATGCTTTTTGCCTACGACACTTGTGTACTACAATATTGGTAGCGTTGAGAAGATTGAAACCTATTATTTGGTTGGTTGACGAAGAAGTCAACAACATGATGGCAAATCCGAGCGTAAGCCTCCACCAGTTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGAGACCCACACACGCCGTTATGTGCCGCTCCTGCCTACCGCCGTTGCTGCCATCATGAGAGACCCTTCATCGTTGCTGTCATTCGTGATGCAGTCGCCGACGTTGTCATTCACATTGGGTTGTCGCCGTAAAGTCTCTAGTAAGTTATATTCTATCACTAATGCTTTTTGCCTACGACACTTGTGTACTACAATATTGGTAGCGTTGAGAAGATTGAAACCTATTATTTGGTTGGTTGACGAAGAAGTCAACAACATGATGGCAAATCCGAGCGTAAGCCTCCACCAGTTGTAA

Protein sequence

MEETHTRRYVPLLPTAVAAIMRDPSSLLSFVMQSPTLSFTLGCRRKVSSKLYSITNAFCLRHLCTTILVALRRLKPIIWLVDEEVNNMMANPSVSLHQL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC06G117550.1CcUC06G117550.1mRNA