CcUC06G116710 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC06G116710
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr06: 8655410 .. 8665136 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC06G116710
SyntenyCcUC06G116710
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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CGCGGCGGGTGAGATGGGGAGGGAGAGATCGTTCCACGACTACGAGTGACTATAGAGTAAAATTGCGGAGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTCATTTAGGTTTTTCTTCCTCCTCCTCCATCGCCATCGCGCATCGCCATTCCCATCTTCTCTCTCCAGCTTGCCTCAGACACTGCAACGCCGCTCTGCCTCATCGCCGTCGCCGGGCTTCGCATTCCAACTCTCTTTTCTGCCTTTTATCCAAGGTTACTCAGCCACATCTTCTCCCTCATCGCTGTTCTTGATTCTTCTGTTGCTGCTGTAGTTTCATCCTTCTGAGCCCTCATTGACTCTCTAATTATTGAGAATAAACTTACATGGGAGATTATTCATTGTTAGTGCTTTGTACGTAATTCTTTTTTGCACCTTTTTAATTTCTTTAGGCTAATTAGAGGTTTAATAAGTGATTAGGAAGTGGGAAAATAAGAGGCACGATGTAAACCGTTCTCTTGAAGTAAATTTAGTCTGCATTTTAGCTTGCATGGTTAAGTTTTGATTTATTTGATGTTTGGTTCTGTAATTGAATGTTATCTTTAGTTTTCTTCTTAATATGCGTATTTATTCTTTTGTAGGATTATTGAATGTGCAAGTGACTGCGTAAGCACTGAGGATTTCCACCTTGACCAGTTATTGGTCTTCTAACATGGTCAATGCGGTCTTTGTTTGAGCATTAATTGTCACATTATATCGTCCGTTTAAGTAGGGGCCGATGAGCACGCATAGTTGCTCAAAACAATACAGTAGAAGGAGTAAAAAGCAGACCCAGAGCAACTCTAATGATGAAAGTGCAGCTCGAACTAGGCCACTCAGCTTTGAAGACATTATGCTTAGAAGGAAGAATAAAGGGTCAGCTGCTACTGTTGAGGTGGGTGCCACTGGTAGCCATTCAAGAAGGGGAAGCATAGATAAGCACAGTACTGATAATCGTGCATCTGAAAGGAATCTTCGTCACAGTAAAGGTTATTCTCTTGATGTGCAAAACCTCTCGATTGAGGAATCAGCCAAAGATAGTTCAAGAAGGAAAAAAGAGGAGACATTGTTGAAGGACAATATGGTGGTTAGGAGTGATAGAAATAATTATGAATCTGGATTGTCACTGATGAGTAAGCTTAAATACGACAGGAGTGGAAAGGATAAAATAGAGAAATATGGCCAGGAAAATCTTGGTTGGGGAAAAAATGACCAGAGTTCTAGAATTGACATTGAAACTGAAACTGGAAAGAGGCATTCAAGAGATACAGCTGGCAAGGATAGACGTGAAGATCATGGTAGGGGGAAATTTGAAAGAGAAAATAAGAGAAAATCTCAAAATGGTGATGATGACAGGAATAGAGACAAGTACATTGCAAAGAGACATGATCATGGCAAACATCGTGACCTAGAAAATAGAGAAAGAAAGGAAGCTAAAGTATCATTGACTTCACATTATGAAGATTCTAGATTGAAAAGAAGACGGGAAAGAAGCCGAGATCGTGAAAGTAAACATAGAAGATCTGTTTCACTTTCTCCAAGACCGCACAAGCACTCAACTAAGTTAGCTAGGCAGAAGGAGTTGCCGTTAGATTCTCATGTAAAGAAGTCTGGAAGATGGCATTCTGATAGTGATAGAACAGGGGATTTTACCAACACTTCCAATAGCCAATACCGGCGACATTCTGGGTCCACAAGTGGGCTTGGTGGCTATTCGCCTAGAAAGAGAAGAACTGAATCTGCTGTCAAGACTCCTTCACCTGCTCGATCACCAGAGAAGAAAAATGAAGTGTTGGATGTTCCTCCAACAGAAAAGGTTAAATTATTTTCTGGCTCAGTTACTTCCAACTTCCAGCCGCCAAATCCTACTGTTTCCTTGGGCATTAGTAATGATCAATCTGGTGGTGCACTCTTTTCTTCTGCTATGGGGAAATCTTTATCAGGGGTTTCTTCAAACAATATAGCAACGAAGACAAAGGTTTCTCTTGATTTGATTCAGCTGACCCAAGCTACTCGGCCAATGAGGAGGCTTTATATTGAAAACTTACCCCATTCTGCATCTGAGAAAGCAATCATTGATTGCCTGAATGGTTTTCTTACGTCTTCAGGTGTTAATCACATTGAAGGAACCCAGCCATGTATTAGTTGTATTGTAAGTGCTTTATTCTATGTTCTAAATGTGTGTTGCTATTTTGTTATGATATTGTCTGATGGGAGTTTTGGTGCATAACACCACTTGTGCAGATACACAAAGATAGGGCGCAAGCTCTTGTCGAATTTCTTACACCTGAGGATGCTTCAGCAGCTCTTTCGTTTGATGGAAGTGACTTCTCTGGGTCTATTCTAAAGATTCGGCGACCAAAAGATTATATCGAAATTGTAGTAAGAATAAATATCCAGAATTCTTGGCCATCTCGATTCTCTTGATACCCTCAATCTATAATACTTTTTGCATTGTTTGAATTAATTGTTCCATTGATTGGATGAGTAGTATAGTTTTAACTTGTAAGGCAAACCTAAAATTGTTGAGCCATAGTTTCCCAGGTATCAGCACCCTGCATGACTCTCTTCTGATTGTTGGGGACCTTTTTTTGTCTTTGATTCTTTTGTTTTGAAAGTACATTGTGCCAGTAGCTCAGGATTTAGATGAAATTGTCTTACGTCTTCTTTTTATGGGACAGGGGAGGTAATTTGTGGTAGTTTTTTCCTCCTGGCTCTCGAGAATGTTTGGTTAGAAAAATATAGGGAGAATCTCCATTTAAGTAAGTTCTCCATTATGTGGATACATATTTTAGCTTAGTATGTGCAAAGCATGGATGCTAGGATGACTTGTCGCGTTGAAAATGGCCTGTGTTATATTTAGGTATGTATTTATGGATTGAAGGACACCACAATGGTGGAATCTACCGCTAGTGCAGAGGAATTTCCCTGAATCTGGGGAATGAGAATGTAGGAATTGTTCTTTTGTAGTGGTATTACTATTAAAATAACTCATCAAGTGCATGGATCAATTGTGGATATTCCTTCGAGAAAGGTTATGCTCGGGCATGCAGTCAACACAATTGGAGGACCTATTAGTTGAGGAGGGTCTTAAGTGATTACGAGCGATGTAGTGAACGCTCTCATGATTTTATAAGAAAAACCATTGACATTATTGAATGCAAACAAGTGCACAAGCTTGTATAAATGAGTAAGGTTAAAACTTAAAAGTGGTGGATAGTCTGGCTCCTCTAGCTCTGGCTAATAAGAACTTAATTAGGACAGATAAACTGGAAGAAAAGCTCTTGCTATTGATACCATATTAAACCAGAAGCCTATAGCTCAAGGGCTGATCGTGAGAGTGGTAAATGATATCATGATATGTAGCCATTTGACAAAAACGCACAACTATGGAGCGATTAATTCAAATTCAATTTGATTCAATTTCTTTATTTGATGATGGGATGTACGTATCCAAATTCTTGTCTTGCATGGCTACATTTTAAGTTAAGGGATTCAATAACTGGGTTTGAGTTGGGGTTATCACTCCGTAAGTTTTTGTTTGCCCTTTGTCAAACCTTTTTCTTTTTCCTTTTCCTTTTCTCCCAACAAATTATTAGCTCGGGTTCTAAACTTTGCTTATATTTTCTATAGCACATATAGAATCTGTTTCTTCATCCTTGTCATTTCAGTTTCTGAGGTCTATTGTGGTTACTATCATGTAGCAGGTTTTCAGACAGTTGCTATTTTCATGCAGACTGGTGACCTGGACAAGTCGGTGCCGGTAGTAAATGAAATCAGTGATGTTGTTGAGGACTCACCAAACAAGGTATGTATTTGAATTTTTTGACACTGAGGAGCTGAATGTTAGTTTCTGCTTATGATGGGGACTGGGAGTGAAGTCTCTAGTAGTTATTATTATTATTGTCATTGTCATTGTTATTTTGTTGTTGTGGAGGGGTGGAGGTTGAAAAGAAAACAAAGAGGTAATGAGTCAAGAAATATCTCTGTCTTCCCTTCCCCCTCTTATCCAACTCTTTATTACCTTTCACCTTTTTTGGGACCATAAAACTACGGCTCTCTTTATAACATAATCGTGTAAAATTTAAACAAGAAAATCACTGAAGATTGCTGGCTGAACAAGGAAAATGCCGAAGTCATCCTTCGGGACCAAGATTCCAAGCAAATGGGCCACAAATAAACAAATGGTTTAAACCTTCATTCTTTTTTATAAACGTTTAAGACTACCTTGGATTGAGATGAGCTGAGCCAAATGAGTTCTTTGTTGGATGCTGTCTGCTGTGTTGTTCTTGTTCATAACTCCCATGCGATGCTGACCACAAAAAGTTATGGCCCTTTTTCTTTTTTTTGCAAACTTTCTTCCAATACCACTATTACGCTGTTAGTTGATAATTAGTCAATTGTTTACTGCTTTTTAATAAGTGTCAATTAGCTTTCTTTTTTCTAGTAATCGTGGAAGATTCTAATCCCTAGCTGCACCAAACAGACAACCCAACTAAGGAGGTTGCTTACCACCATGGTCCTTTGGACCCACAAGGAAAATAGAGTGATCAATTATCATTAATTACATCAGTACTTGAGCACATTTTTCCTTAAACCATTTTCCAAATCTCTTCGCTGTTAATTCCAAGTATTACAAATACCTATAAAGGAAGCCTTTTCCCAAAGTGCCTGCCCATTCCTAGTTCCTAATACTTAAGTTCTCCCTATTAGAGACTGTGTACAATTTTATTTCGAACTCTTTCCAAAATCAGATCCTAGTTGCTGAGGCTTCTAGGATTTCTCTCAGAGGTAGAGTATAAAATATTTGATAGTAATATTTTCAATAGCATATTCCCAGTAGGCAGCTCACATTAGAAACTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCAGGTTGAGTATAGCTATTAGGATTCTTATGTTATAGCATCATTTAAATATTTTCTATTTTGTGTCTGTTGTCTAAATGGTACTCACCGGTTATTTAATATA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mRNA sequence

CGCGGCGGGTGAGATGGGGAGGGAGAGATCGTTCCACGACTACGAGTGACTATAGAGTAAAATTGCGGAGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTCATTTAGGTTTTTCTTCCTCCTCCTCCATCGCCATCGCGCATCGCCATTCCCATCTTCTCTCTCCAGCTTGCCTCAGACACTGCAACGCCGCTCTGCCTCATCGCCGTCGCCGGGCTTCGCATTCCAACTCTCTTTTCTGCCTTTTATCCAAGGATTATTGAATGTGCAAGTGACTGCGTAAGCACTGAGGATTTCCACCTTGACCAGTTATTGGTCTTCTAACATGGTCAATGCGGTCTTTGTTTGAGCATTAATTGTCACATTATATCGTCCGTTTAAGTAGGGGCCGATGAGCACGCATAGTTGCTCAAAACAATACAGTAGAAGGAGTAAAAAGCAGACCCAGAGCAACTCTAATGATGAAAGTGCAGCTCGAACTAGGCCACTCAGCTTTGAAGACATTATGCTTAGAAGGAAGAATAAAGGGTCAGCTGCTACTGTTGAGGTGGGTGCCACTGGTAGCCATTCAAGAAGGGGAAGCATAGATAAGCACAGTACTGATAATCGTGCATCTGAAAGGAATCTTCGTCACAGTAAAGGTTATTCTCTTGATGTGCAAAACCTCTCGATTGAGGAATCAGCCAAAGATAGTTCAAGAAGGAAAAAAGAGGAGACATTGTTGAAGGACAATATGGTGGTTAGGAGTGATAGAAATAATTATGAATCTGGATTGTCACTGATGAGTAAGCTTAAATACGACAGGAGTGGAAAGGATAAAATAGAGAAATATGGCCAGGAAAATCTTGGTTGGGGAAAAAATGACCAGAGTTCTAGAATTGACATTGAAACTGAAACTGGAAAGAGGCATTCAAGAGATACAGCTGGCAAGGATAGACGTGAAGATCATGGTAGGGGGAAATTTGAAAGAGAAAATAAGAGAAAATCTCAAAATGGTGATGATGACAGGAATAGAGACAAGTACATTGCAAAGAGACATGATCATGGCAAACATCGTGACCTAGAAAATAGAGAAAGAAAGGAAGCTAAAGTATCATTGACTTCACATTATGAAGATTCTAGATTGAAAAGAAGACGGGAAAGAAGCCGAGATCGTGAAAGTAAACATAGAAGATCTGTTTCACTTTCTCCAAGACCGCACAAGCACTCAACTAAGTTAGCTAGGCAGAAGGAGTTGCCGTTAGATTCTCATGTAAAGAAGTCTGGAAGATGGCATTCTGATAGTGATAGAACAGGGGATTTTACCAACACTTCCAATAGCCAATACCGGCGACATTCTGGGTCCACAAGTGGGCTTGGTGGCTATTCGCCTAGAAAGAGAAGAACTGAATCTGCTGTCAAGACTCCTTCACCTGCTCGATCACCAGAGAAGAAAAATGAAGTGTTGGATGTTCCTCCAACAGAAAAGGTTAAATTATTTTCTGGCTCAGTTACTTCCAACTTCCAGCCGCCAAATCCTACTGTTTCCTTGGGCATTAGTAATGATCAATCTGGTGGTGCACTCTTTTCTTCTGCTATGGGGAAATCTTTATCAGGGGTTTCTTCAAACAATATAGCAACGAAGACAAAGGTTTCTCTTGATTTGATTCAGCTGACCCAAGCTACTCGGCCAATGAGGAGGCTTTATATTGAAAACTTACCCCATTCTGCATCTGAGAAAGCAATCATTGATTGCCTGAATGGTTTTCTTACGTCTTCAGGTGTTAATCACATTGAAGGAACCCAGCCATGTATTAGTTGTATTATACACAAAGATAGGGCGCAAGCTCTTGTCGAATTTCTTACACCTGAGGATGCTTCAGCAGCTCTTTCGTTTGATGGAAGTGACTTCTCTGGGTCTATTCTAAAGATTCGGCGACCAAAAGATTATATCGAAATTGTAACTGGTGACCTGGACAAGTCGGTGCCGGTAGTAAATGAAATCAGTGATGTTGTTGAGGACTCACCAAACAAGATTATTGTTGCTGGGATCTCAAATAGAATATCATCTGAAATGCTTAGGGATATTGTTACTGCATTTGGATGTTTGAAGGCCTATCACTTTGAGATGAATGATGATATTAATGAACCTTGTGCCTTTTTAGAGTACGTTGACCAATCAGTTGTGTCCAAAGCCTGTGCTGGTCTAAATGGTATGAAGATTGGAGGGGAAGTACTGAAAGTGTTTCCAGCTGTTCCTTTTGCATCAACGGAACGTAATGGATGTCAACCATGTTATGGGATCCCAGAGCATGTTAAACCTCTTCTTCAACAGCCATCAGTAGTGTTAAAAGTTAATAATGTGTTTAATGCAGATGTCCTCCCAGAACTCTCTGAGTCAGATATTGATGAAGTTCTTGAAGATATTCGGTTTGAATGTGCTAGGTTTGGAACTGTTAAATCCATGAATTTTGTAAAGCCATGCGATGGCTGTGTCAGTGCAGAAGAAGAATACAAGAAAATTAGTGATGTCACTGATGTGGAGATCAAACATGAGATTCAGGAAAACAGTACAATGGTAATTTCAAGAAACAATAATGATCTTGAAGATAACTACGCTAACCTTGATAATTGCCCCAATGATACCAATCAGAAGCAGGTTAATTCCCCTAGCAATGGTAGACATCAGGATGAAGGTGTGGAGGACAAATTCTGTCAAATGGGTAACGATGATGCTACATGTTTTGATTTCGTAGCTCGTGAGAATGCTTCAGAAAGAATCCCTCAAGGACTCTCTGACCAGCGAGAAAATGAACTTCAGAATGCAAAAGTAGCTGAAATAATTGAAACTGATGAAACTGTCTCGGACAAGAAATCGGTTTGTCTAGATTCACCTATGGTGGTGGATGATAATGAGAAGAAAGTTCTAAATGGATTGGATCCCATGGCGAGAACAGGTTCTGACGCATCTGATAAAAGCGAAAAGAAGGATCCTAATAATAATCTGGAGAGTTTATTTGTGTTGGGGAGTGTCTTTGTCGAGTTTGGCAGAATGGAAGCCTCGTGTATGGCTGCACATTGTTTACATGGTAGGATTTATGATGGACAAGAGATTAGCATCGAGTACATTCCCCACGATGTCTATCGGAAGAGGTTTCCTAAATGACTACAGTTGAATTCTGAATGTGATGATTAACTGGTTGCTGAGTTTGGCATGAAAGCTCCACTTATTAGCAAGTTTCATTACTGAAGAAGGCATTTGTTAATGGCTCATTTTAGGCCAGCCTCAATATTTTTTTGATCATTTGGTTCGAAATCCGAAGCATGCTGTATGGTGAAACGAGTCATTTCTCAAGCACCATATGGATGATATGCTGAAATGAAAGCCTGGGAGAGTATAAGTCTCCCACAGTTTAAAAGCCTTTTAACCTGCCTGTCCCCGTGCGATTCTGATAGATTTTCTTTTATATGCTTAACAGGTACAAGGATCTAGGTTATGGACATGAAAGATTTACGGCCAGATTACAAGTTTGGTGCAAGGTTATTATTATATCTTTGGAGCTCCCTCTTTTCTTCATTAGACTTCATGTAGATTTATCTATCAAGTTGGGATGCAACTTTGTTAAGAAGCTGATCATAGGGAATAATGTTCTTTATATGCAGCTTGTTACCTCAACAAATCAAATGTAAGAGTTAAGGTACTAGTAACCTATTTTGTAGGTTGCAATTTCAAATCTTTAGGCTGTACTGCGCT

Coding sequence (CDS)

ATGCTTAACAGGTACAAGGATCTAGGTTATGGACATGAAAGATTTACGGCCAGATTACAAGTTTGGTGCAAGGTTATTATTATATCTTTGGAGCTCCCTCTTTTCTTCATTAGACTTCATGTAGATTTATCTATCAAGTTGGGATGCAACTTTGTTAAGAAGCTGATCATAGGGAATAATGTTCTTTATATGCAGCTTGTTACCTCAACAAATCAAATGTAA

Protein sequence

MLNRYKDLGYGHERFTARLQVWCKVIIISLELPLFFIRLHVDLSIKLGCNFVKKLIIGNNVLYMQLVTSTNQM
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC06G116710.1CcUC06G116710.1mRNA