CcUC06G116430 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC06G116430
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr06: 8165225 .. 8169321 (+)
RNA-Seq ExpressionCcUC06G116430
SyntenyCcUC06G116430
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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GTCACCCTACCGTTGCATTGTCGGCCAATGCATAACGACGGCACCATTCCACCTGTTCCGACGATCCCAGCGCACAATGCTTGTAGCACCAGCGGCAGCGAGCGCAGTAGCCAACCGTCATCTTCGTTGTCTACACTATCGTTGCTACTGCTGCGTCGTTCATCGCCGGCCAAACCTCACCTCACTGACAGCTTCATCATCTGTATCGTCGTTCGTTGCTCATCGCGTCTAGCTATCGCCAGTCTCGAATGACAGTCTCTGAGGCTTCAGATCTCGCTGGAAAAGTCACTTCCAACTCTCCCCACTCTTGTCTGGTCCAGATCTCGCCCAAAAAGTCGCGTCCAAATCTCGTCGTCGATGGATCTCGCTACTCTTGTCTCACTGCTAGTTGTTACTACTATCGCAGGGACTTCTCCGAAAAATGGGGAAGGTACTGATGTTTCTTTATCATTTATAGCATATTGGTTTTATTGTATAATAATGTTTTAGGAAAAAATTGGGAAGGTACGTCAAACACAATAAGCCATAACCAAATAAATTTTAACGTTTGAGGTCTAGATTTGCAAGTTTGGACGTTTTTAGACACCAACCAACAAGGTTCAGAGCCTTTTTGGTAAGATTCAATAAGGATTGTTTAAATCTTCTTCGAATTTGATTTAAGAGGTTGTATTAGTTTATAAGTCCATGGAATTCTTCTATTGTTATGTTTGTTTAAATTTATATGGGTCAATTAAGGTTTGGTAAGTTCGAACTCATTTCGAGCTATTTCAAACTTAAATAAAGTGTGTTAAACCACTTTCTTACATGAGGAAAGCTTGTTGTTTGTGGTTTTTGACTAGCTCGAATTGATCGACTAAGGTTTATTGTTGGTTTTTGTTGGTTTTGGGTAATATTATCTCTCTTAAACATTCTTTCAGTGTTGGTTAAGATTTTCGAACTATATTGTAACACCTAAATATTATTTTTGTTGTTTAAACCTCTAGGAAGTTAGCATTTGTTCAAAGAAGTAGATTTTGTTTTTGCTTGTGAGATAGACGTATTGTTTCTGCTTGTGCACTAGAGTTATATTCACTTAATGGAAATTTTGTTTTTGGCATAGAAGAGTTTGTTATATTTGTAGTACTTTTAAATTGATGTATATCTTTTTTATCCTTGATGTATATCTACAAGCTTACCAACTTTTTATGAATTTCAAAGAACCTTGAAAGATCATTGTTCGTATAGTGCAATCTATTAAGGTAATTTTCCCCGCTCCCTTTGAGTTGATATTGAAATGAAGTTGTCTGGCTTACAAGTTGTGTGGTGTTAGTTTCACAATCTTTATACTATTTTTATAAGTTTAATTGGACTTGGTTACCATAAGTAATGATATATAAGTTTGTTTTCTTTTCACTATGATTTTGATGGGATTCTGTATAGGATAGGTTCACTGGGCTTTGGAAATAGAATATTATGTTCGTTAATTGCATCTATTTGCTTTCACTATTAGCTTGATCGGATTTTGGTTTTGCTAAAAGTTTTTATTTAGTCTTTATAAAAGTTCACACAATTATGACTATTCTGCAGTTATGGTAGTCACAGATTAGTTGTATTGATAAATTATTTAGGTATTTATGGTGCTTCTTGCTTGTTCAGAACATGAACTTGTTGAGTTTGTTCTTTTAGGTATAGTTAAGTTGTTTGTAGTATAAGAACACAAAACATAGGAGTTCTCATCTGTTTTAAGTACTTGAACCACTTGCTTCATTCAAACAATAATAAGTAACATGTAGCTTAAGTCACTTTAACATGTTGTAATGTAGTTACTCTTGGTAATGCCTTGTTGTATTTAGTTTCTTTGTAAAATTAGCTTTACCAAGTTTGGTTATTAGTCTGCTTGTATTGGAGACATTCGATAGTTTTCTAGTATATATTTAGTTTCTTTGTAAAAATATTATCAACTTTATTCTTATATAAAAGGTTCTTATATATGTTTGTACCAATTTTGTGTTAGAATAGGATTAATTGTGTTTACAACCCCCCCTCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAGAAAGAAAGAAAATAAATGAAGTTTCATTGTTTGTGGATTAGATTAAGTGTTGAAGTATTTTGAATATCCTATAGTTAAGGTAGTATTAGTTGTATTGATAGATTGTTTAATTGATGTGTGTTTGATAAGTCATGTTGGAATGTCAATTAGAAGTTATTGTTAGTCTTTTTCCTTCCTCTTGACAACCTTGGTTGCTTGGGTTGATAAGTTATTGTTTATGGTGCTTCTTGGGTGTCAAAGTAAGGCCTTAATCATTTTTTAGTTTGTTTCAAGATTGAAATTGTCACTTAGATATATCTTAAGAACATTTTACATGGTTTTCATAGACAAAGTGTGACTTAGCCACCTTTTAGGAGCATTTTAGGTGGTTTTGAGGGCAAAAGGGAGACATAGGCACTTTTTAGTTTATTTGAGAGTGAAAATGTCACTTAAACACTTTTGAAAAACTTTTATTGTGATTATGGGTGTTCATACTTGTGGGTGTAGGTTATGACATCAATATTTTGGGCAATATCGATTGAGGTGGATAAGTTGTTGACATTGAAAAGGTAAAAGCTTCTTTCATTATTATCATTGTCGATATTGATGTGTAGAGTTGAACTCTAAAATGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTCTTACTAGGTTTTGCAAGAATGCATTGGAGTAATGAAGCAATGGAGCAATTGATATGTTTATTAGACATCTTTTTATAGAGTTAATGGCAAAACTTTGGGTGCAATGCACTTATTGTACCTAAATATAGCTATAGTTTCTTGTAAAATCTTCACTAATTGCTATTATTTGTTCATTGTTGACAATTAATTATTGTCATAAAAAAACCATTTATGACATTTCTCAACAAATGTCATTGAAGCTTCTACCTTTACAAGCGATTCAATGATTGAAAATAAATGTCACGAATTTTAAATCCGACAGTTTTTAAATGTAATTGAATCCCAAGTTTCTTCTAGTGACTGCTTTCAACTTGATTGTCTTCCTCGTGACTCAGTGAATCTTCACTGATAAATTTTAGGTCCCCCTAAGATGGAGAAATCCTTATCAAGAATGACGTCATAGGCTCTTCTTAAGACTGAGAATCTCTTCTTTATAGAGATGTCTTAGGCTCCCCTAAGACAAAGATTATCTACAAGGTTTTAGCTCTCGTTGAATAATGAAGATGCACAACAAAATAAAGTGAGCAAAGAGCAAAATGCAATGATGCACAACTCGACCACCAAGAACACAAATTCTCTCTTCACAATAAACAATTGTGGCAACCCTAAAAGATCAACATAAATCTCGTTAAAACAAACAAGGCCAAGTAAGGAAATAAATATCGTCAATGGAAATAATAATCAGCACTTGCAATAAGAAGAAATATTGGGCAGAATATATCTGTAGGAAAATTTCAAATAAAGAAAGCAAATATTCTACATAAATTTTTATTGTCATAGTCAGATGTTAGGACTACAATTGTGATAACAACAAAACCTCCACAAACTGGTTGAAAGAAATTGAGAGCCAATAATCAAATCTCCAACCACTATATTTCAAAGTTATTGATTGAAGTACATCACCTTCATTTGGTAAAATAAAGAAGAAATTGAAAATCGTGCATGTTGGTTAATTTTATAGAAATGTACCTGGGGTTAGAGAGAGAAGAGGGTGAAATGCCTGGGTGAGGAAGAAGACAGAGATCGAGAGACCAAGATTGCAGTTGAGGAAGGTCCTTTGAGAGCCAACTGCCTCATGCTCATGAACTCAGATTCAGTTGCCTCCACCTCGTGTTCGTGAACTCAAATTCAATCCCTCATTCTCCATGTTCTCTGAGCCATGAGATGAAGTCGAACGGTAGACGAAACTGGAACACAAAGCTCGTGAGTCGTGAGATGAAGTCGAGCGGATCGTGGACGAATCTCAGAGCTGATTGTTTTGAGTACTGA

mRNA sequence

GTCACCCTACCGTTGCATTGTCGGCCAATGCATAACGACGGCACCATTCCACCTGTTCCGACGATCCCAGCGCACAATGCTTGTAGCACCAGCGGCAGCGAGCGCAGTAGCCAACCGTCATCTTCGTTGTCTACACTATCGTTGCTACTGCTGCGTCGTTCATCGCCGGCCAAACCTCACCTCACTGACAGCTTCATCATCTGTATCGTCTCTCGAATGACAGTCTCTGAGGCTTCAGATCTCGCTGGAAAAGTCACTTCCAACTCTCCCCACTCTTGTCTGGTCCAGATCTCGCCCAAAAAGTCGCGTCCAAATCTCGTCGTCGATGGATCTCGCTACTCTTGTCTCACTGCTAGTTGTTACTACTATCGCAGGGACTTCTCCGAAAAATGGGGAAGTTGCCTCCACCTCGTGTTCGTGAACTCAAATTCAATCCCTCATTCTCCATGTTCTCTGAGCCATGAGATGAAGTCGAACGGTAGACGAAACTGGAACACAAAGCTCGTGAGTCGTGAGATGAAGTCGAGCGGATCGTGGACGAATCTCAGAGCTGATTGTTTTGAGTACTGA

Coding sequence (CDS)

GTCACCCTACCGTTGCATTGTCGGCCAATGCATAACGACGGCACCATTCCACCTGTTCCGACGATCCCAGCGCACAATGCTTGTAGCACCAGCGGCAGCGAGCGCAGTAGCCAACCGTCATCTTCGTTGTCTACACTATCGTTGCTACTGCTGCGTCGTTCATCGCCGGCCAAACCTCACCTCACTGACAGCTTCATCATCTGTATCGTCTCTCGAATGACAGTCTCTGAGGCTTCAGATCTCGCTGGAAAAGTCACTTCCAACTCTCCCCACTCTTGTCTGGTCCAGATCTCGCCCAAAAAGTCGCGTCCAAATCTCGTCGTCGATGGATCTCGCTACTCTTGTCTCACTGCTAGTTGTTACTACTATCGCAGGGACTTCTCCGAAAAATGGGGAAGTTGCCTCCACCTCGTGTTCGTGAACTCAAATTCAATCCCTCATTCTCCATGTTCTCTGAGCCATGAGATGAAGTCGAACGGTAGACGAAACTGGAACACAAAGCTCGTGAGTCGTGAGATGAAGTCGAGCGGATCGTGGACGAATCTCAGAGCTGATTGTTTTGAGTACTGA

Protein sequence

VTLPLHCRPMHNDGTIPPVPTIPAHNACSTSGSERSSQPSSSLSTLSLLLLRRSSPAKPHLTDSFIICIVSRMTVSEASDLAGKVTSNSPHSCLVQISPKKSRPNLVVDGSRYSCLTASCYYYRRDFSEKWGSCLHLVFVNSNSIPHSPCSLSHEMKSNGRRNWNTKLVSREMKSSGSWTNLRADCFEY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 24..41
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 12..41

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC06G116430.1CcUC06G116430.1mRNA