CcUC06G116330 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTGCAGAGCCTTGGATTGTGAAAATGGGGAACCAGGTTAGTGCTAATCTCAAACACGCCCTCCTCGAATCTTCTAAGAACAAGAACTCTAGAAAACCAGAAATCGGTGGCAATACTAAGCAAACAATCGGTATTCTCTCTTTTGAAGTTGCTAATGTAATGTCCAAAACGATTTACCTTCATAAATCCCTGTCTCATTCTGCCATTTCGAAGCTCAAGAACGAGATCTTGAGCTCCGATGGAGTTAAAAACCTTATCTCCTCTGATGAGGTTCATCTTCTCGAGCTTGTGGTTGCTGAGAAGCTTGAGGATTTAAACCGAGTGGCTAATGTGGTTTCTAGGCTTGGGAAGAAGTGTTCTCAACCTGCGTTACAAGGGTTTCAACATGTGTACTTGGATATCATTAATGGAGTTATAAATGTGAAGGAATTGGGGTTTCTAGTGAAGGATATGGAGGGCATGATGAAAAAAATGGAGAGGTATGTGAATGCTACGGCAAATTTGTACACTGAAATGGAGGTTTTGAATGAATTGGAACAGGCTGCAAAGAAGTTTCAGAACAATCAGCATGAAGAGAGCAGAAAGGCGTATGAACAGAAACTTATATGGCAGAAACAAGATGTGGGGCATCTCAAGGATATTTCTCTTTGGAACCAAACGTATGATAAGGTTGTTGAACTGCTGGCGAGAACTGTTTGTACAGTTTATGCGAGGATTCATTTAGTATTTGGGGACCCTTTTCTGAAGAAGGATGTGAATGAGAATGGTTCAAGTAATGATGTGAATCATCATGTTCAAAATGGTGCAGAGTTGATGGAATCGAAACGTGCGTCTGCCGAGAGAGGCCCCGGACCAAGACGGGGGTCGAGTATTAAGTCTCAAATTAGCTCAAGAAGAGGTGAGGTTTCATTGCTTACACCTGATGACTTCAGTTTCCCTTGTGGAACAAATCCTGGGAGGCTTCTCATGGATTGCCTTAGTTTAAGTAGTTCAGTTTCCAAGTTGTATGATGAGGATGATGACAGTTATGTTGACCGTGACAATCGAAGCTGCCAAACCTCCGGTCGTAGCATTAGGAACAGTGGTTCCAGCCAATTTAGTTCTTTCAGTCAGGTACAGTTCTCTATTCCATTTGGGGTGGATCAAAGACAAGCAAAAAGTGTGATGTCTAACAGTGGAGGAAACTTTGGCCTCAAGAGTAGGTTATCTATCTATGCACCAGTTTCAACCATCGGAGGCTCTGCTCTTGCTTTGCATTATGCAAATATCATCATTGTCATTGAAAAGTTACTTCGTTATCCTCATTTAGTTGGTGACGAAGCTCGAGACGATTTGTATCAGATGCTACCAACAAGTTTAAGATCATCCCTGAAAACACATTTGAAATCTTATGTTAAGAACCTGGCCATATATGATGCTCCTCTTGCCCATGATTGGAAGGAGACTCTCGATGGGATCTTGAGCTGGCTCGCTCCGTTGGCACACAACATGATTCGGTGGCAAAGCGAGCGTAATTTCGAACAACATCAGATTGTGACTCGAACAAACGTATTGCTGATCCAAACTTTGTATTTTGCTGATCGCAAGAAGACTGAGGAAGCCATATGTGAGCTTCTTGTTGGATTGAATTACATTTGCCGCTACGAGCATCAGCAAAATGCATTGCTGGATTGTGCAAGTAGTTTCGACTTTGAAGATTGTATGGAGTGGCAGTTGCAATGTAAAGCTTCGTATCTTACTTGAAGACGATGGTACAGCCTACAGGCGTAGACATGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTATTACACAGTGCATTTAGAGCAATGATAGTTCAATAGAATTGTGAATACTGAGCAGCTTGAGCACACTGAAAGACATGATTGATGGGCACTTCAATTCGTCACTGTTTGCTGTTGAGAGGTATGAAAGTTCAATCCAAATTACTCAATTGCATCTTTAGTGAAATGAAACATTATCCTCCTTTTGGAATCTTTATATACTTTGTTGGATTGAATATTATAGTTCAAAACATTGCCATTTTTCATCTTTCTTCTTGACGTACATCCTGTTGCTCATGCTGTTTAAAGCTTGACGCAAGTTATATATTACCAACTTATGGCCAGTTGTTGATATATTCAGGCATGTTCATGTTCTCCATGGAGAATTTGATCTCGGTAGGAAATCCACACCCCGATCTCGATGAATATTAATGGAGAATTCTTAGAGATGGTGAATAAAATGAGGGGTGGGGGGGGGGGTGGGGACAGGGAAGCTATTCCCATCCCCGGCCTGTTCCATGAACCCTTGATATATCTGATGTCTTATTGATCACTTCTAAATTCAAACACAGGTCTTTGCATTGCATTTCATGGTCATAAGCAATCTAGTAAAAACATCAGTTTAAGATCATCTTGCTGTTGTTTCAGCCTATAAACTGTCTAGATGTTGCATTTCTAAGTCTGTTATTTTGCTAACTGTTCTTGGGACTGCTTTTCATTTAGTCTTGAACTAGTAGAAACTTGAGTATCTATTGAAGGCATTTTGCTTTTCAGGTGGAAAATTTCTGTTTTTCTCCATTAAGCAATGAGGCTGAATCTTTCAAATGAAGATGGAAAAAGGGGAATTTGGTGCTCAAATCTCCTGATCCCCAACTTCAGCATTCATGCTTATAGATCATACAGTTAGCTATTTCTCCCCTATTCTGTCTTGTCCCACGATTCGTTTTTTGTTTTTTTGTGGTTGTAATTTAAATATAAAACAGTAGCTTGATGTATTTAAATCACAACCATATCAATATTATGCCAAGTCAATGGATGAAATATACTTCTTACAGGACATTTCTGCTACACAGTCACTTCTTTCTTCTCTCAAAGTTTCTGTCATTAGTCTTTTCTTGCAAATTCCACTATATTAGCTACTGAAATATCTGGTTAGTTCTTGAGAACATGTTAAGAGCAATAAATCTATTTCAGCTGTGCAATGTAGTTAATGTTCACAAATTTTACAGACACTATATTTTTATGTATTCAATCAGCTTTCATTTTTTAGCAGAAAGAAGGATGTTTTTTTTTTTTGAATGAAGAGTGGAAATAAAATGGTCCAAAGTTTCCTTAAAGTTGAAGTAATGAATATGGTGGCTTCACAGCTCTGTGCAGCCATAATGGGATGGATGAAGTTGCATTCATTGTGGCCTTAAATATCATTTGCCCATGTAGTTGGGTGCTCATAATGTGCTGCCATGTGCACCTTTAATTCATCTAATCTGTTTCTACAATATAAATTTGTCTTTAATACAAGGGGAAAAAATCTATTTCATTTCATTTAGTTGGGAGATCTCTTTTATTTTTGGTCAAAAGCTTCTGTGTTTTTATTTGTAATGATTTAATCTCTTAAAAGATGTTTTTATTTGTAATGATTTAATCTCTTAAAAGATGGAAATATGGCCATCAGATTCTTGAGGTAATGTTTACATGATTGAAAATCAATAAATGGACAAAATAGGGACAAGTGAGTGACATAGGCAAACCTTGTATGATTCAAAACTTACCCTTGTTGCTGACCTAACTATAACTTAATGAATAAGTCACTATTATATTAAATGTTGATAACTTGATAATTTGATATTCTACCTATACAATTGCCAAACTTGATAGTTGTTTGGTTTTTGAAAATTAAACTTGCAATTATTGGCTATCTATAGCTTTTTTTCTTTTTTATTTTAAAAAAGTTACCATTTTTAAAATTTTGCTTTAGTTTTTGGAGTTTGTCTATAAATTTTAATGTTTACGTAGGAAATATAAAAATTATTGTAAAGAAAATTATGAAAAAACAAATTAAATTTTTAATTAAAAACTAAGAATCAAATGAGGGACTTTAATTATTTTTTATGGTCAAAATTATCTTAGACATGCCAACTATGACTGTCATTCTTGTAGCAATTAGATGTATGCTAGGCGCTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGCCCCTAAAAAAAATTAAATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATAGATGAAGTTTCTTTTGAAATATAACAAAATATCACTGTCTATTAGTGATAGATAGCAATAGACACT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BLAST of CcUC06G116330 vs. NCBI nr
Match: XP_038875820.1 (protein PSK SIMULATOR 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1096.3 bits (2834), Expect = 0.0e+00 Identity = 556/581 (95.70%), Postives = 568/581 (97.76%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. NCBI nr
Match: KAA0065685.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold90G001520 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK08216.1 uncharacterized protein E5676_scaffold1503G00360 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1080.5 bits (2793), Expect = 0.0e+00 Identity = 550/581 (94.66%), Postives = 560/581 (96.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. NCBI nr
Match: XP_011649159.1 (uncharacterized protein LOC101220789 [Cucumis sativus] >KGN61618.1 hypothetical protein Csa_006489 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1079.3 bits (2790), Expect = 0.0e+00 Identity = 548/581 (94.32%), Postives = 562/581 (96.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. NCBI nr
Match: XP_022138835.1 (uncharacterized protein LOC111009906 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1009.6 bits (2609), Expect = 1.8e-290 Identity = 519/584 (88.87%), Postives = 541/584 (92.64%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. NCBI nr
Match: XP_008460732.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499494, partial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 960.3 bits (2481), Expect = 1.3e-275 Identity = 492/520 (94.62%), Postives = 502/520 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GWQ2 (AT-hook motif nuclear-localized protein 20 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AHL20 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 233.0 bits (593), Expect = 1.4e-59 Identity = 126/249 (50.60%), Postives = 171/249 (68.67%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SR17 (AT-hook motif nuclear-localized protein 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AHL19 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 216.9 bits (551), Expect = 1.0e-54 Identity = 116/206 (56.31%), Postives = 147/206 (71.36%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22130 (AT-hook motif nuclear-localized protein 22 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AHL22 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 4.9e-52 Identity = 111/230 (48.26%), Postives = 153/230 (66.52%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49662 (AT-hook motif nuclear-localized protein 24 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AHL24 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 205.3 bits (521), Expect = 3.2e-51 Identity = 114/231 (49.35%), Postives = 150/231 (64.94%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23620 (AT-hook motif nuclear-localized protein 23 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AHL23 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 202.6 bits (514), Expect = 2.0e-50 Identity = 98/179 (54.75%), Postives = 135/179 (75.42%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VIT4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1503G00360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1080.5 bits (2793), Expect = 0.0e+00 Identity = 550/581 (94.66%), Postives = 560/581 (96.39%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LIJ7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G190750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1079.3 bits (2790), Expect = 0.0e+00 Identity = 548/581 (94.32%), Postives = 562/581 (96.73%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CAM1 (uncharacterized protein LOC111009906 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111009906 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1009.6 bits (2609), Expect = 8.9e-291 Identity = 519/584 (88.87%), Postives = 541/584 (92.64%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CD70 (uncharacterized protein LOC103499494 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499494 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 960.3 bits (2481), Expect = 6.2e-276 Identity = 492/520 (94.62%), Postives = 502/520 (96.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EQU9 (uncharacterized protein LOC111436967 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436967 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 955.7 bits (2469), Expect = 1.5e-274 Identity = 496/578 (85.81%), Postives = 527/578 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. TAIR 10
Match: AT3G23160.1 (Protein of unknown function (DUF668) ) HSP 1 Score: 653.7 bits (1685), Expect = 2.4e-187 Identity = 358/589 (60.78%), Postives = 441/589 (74.87%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. TAIR 10
Match: AT5G04550.1 (Protein of unknown function (DUF668) ) HSP 1 Score: 310.8 bits (795), Expect = 3.8e-84 Identity = 209/586 (35.67%), Postives = 331/586 (56.48%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. TAIR 10
Match: AT5G51670.1 (Protein of unknown function (DUF668) ) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 1.2e-66 Identity = 194/573 (33.86%), Postives = 278/573 (48.52%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. TAIR 10
Match: AT4G14465.1 (AT-hook motif nuclear-localized protein 20 ) HSP 1 Score: 233.0 bits (593), Expect = 1.0e-60 Identity = 126/249 (50.60%), Postives = 171/249 (68.67%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G116330 vs. TAIR 10
Match: AT3G04570.1 (AT-hook motif nuclear-localized protein 19 ) HSP 1 Score: 216.9 bits (551), Expect = 7.4e-56 Identity = 116/206 (56.31%), Postives = 147/206 (71.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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