CcUC06G114320 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTTTTCTTAGAGAAAGAGAAATTAGGGATCCTCGTGCTGATCTGGCGAAAATTGGGAGAGAAGGATTTGAACTAATTGACGAATACTTTGGTCGAGCGCCGGCGGCTAGAAGGGAGGCGGCCAAGGCAAGGCCGATTCTGCCCCAGCCACCACGTAAGGAGGAGCAACCTCCGAGGAAGAGGACGGAAAAACCGGCGGCGGCAGTGAAAACCTCCGATCAGGTGGCGAAAACCGGTGGTGGAATCGTGGTAACAACTTGGCGTGCGTATGCAAAATGAATATAGCTTTGTTCCTCTCTAGAAGTAGAACTAGTTGGTGCTCATAATATATAAATATACATAAGTATGGGTACTTAACTGCAAAATATATATATCTATGTATGTAAGTGTAGCTCTGCTAGTTTGCCTTTTGCTTTGCTATGTAGAATCAATATAATATAAAGTAATGTATTTGATCTAAGCTTATGAAATCTCTCCCTCTCTCCTTGCAAAGGGGAAAAAAAAAATCTCACGTTTTTATCATTAAAAAAGAACCATTTAGAAAAAAGTTGAAATGTTTGGCAAAGATTTTAAATAACTTTTTTTAGAATTGAATTCATAAAACAGATTGGTTTGAGAGAAACACTTGAAGTAAAATTATCAAAATACCCTCACTAATCCTCGATCTCATTTTCACCAATGACCACCACCAATGACCAATTTAGTAGCCATCTTGCTCCTACTAGCTACCACCACACCAACGACCATCTCTAACTACCACCTTCAACAACAAATTACAACCTTTGACTCTAACAACGATCATCTTTGATGACCAAGTACATATATTATCTCCAACAACTAACTCTAACAAGTAACTCTAATGACCAATTAGACAGATCATATGCTAACAAAACAAAAAAGCTCAGCCAATGAAGATGTTTTTAAATAAAAAATTTGAAATGATAAGTTTAACCGTGGTTCTTTTCTAGTAATTTGCCATTAATAGAATCACTTTGAGTATGTAGCAACACAAACAAGCCTATAAAAATACTTTTGAGAAGAGATGCAACTATATACATGAGTGTTTTTATTTTAAACAATGTTTATAAAAAAAACGTTTAAATGAAAATGACTTTTTGAAAAATATTTTTTCCCAACAATCTAAACAAATCCTTAATATTTAGGTCAAATTACAAGTTTAGTTCCTAAATTTTGAAGTTTGTGTGTTTGTTATACAATACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGAAAAAGGAAACATCAAGTGAGGTTCATCGATATAAATGTGAAAACAAGGGAGAGGTTAGAGGAAAACCTTCCAGTTAAGAGGTATGGTCGAAGCATCATAATTACAAAATAACTTAGATTCGGTACACCAATTAGCAACTAAAGTGATGATGTTCTCCCAAAGATTAGCTTGACCCTTGGCATAATCCTTGAATATTCTATTGTTGTGCTCAAGTCAAAAATATCACAAAATAGCCCTTGTGACATTAATTCTAAGAGCATGAACTAACTCTTTTATCTTTAAAAAAGATAATATCATTAGAGACAATTGTAGCTAGGTATGAGCGGCTAAAGTTAAAGATGCCTATAGAGACTCAGTGAAGTTACAATGTAAGGAAATATGATCATCAATCTCACACTACTCAATTTACAAAGCACACGCCAATTTAAGTTTAAGCAGCAAGTAAATCGGATTTGAGATTTTTCAGCCATGTTCAATCTCTAGTAAAAAAGAGTCCATAGGAAAAACTTGCATTTCTAAAGAAGGAAAGAGGTCCATAAATTCTCTAACATTCGGATAAAAAAGGATAAAATAGACATAAACTTCAACGTTGAAGAACCGAATCATATTAAAGCATATTGCATTTATACACTTTCGAAAGTACACAATCGCATAATTGACACAAACCTCAAGTTCATGACCAGCGTATCAAATTAAGATAATTATTTCAAAATATAATTTAAAATATTCAACCATAATTACTAAAGGTTTAAATTTAAATATTACAGCATAGTCTAAAACCATTTAAAGTTGGAACTTTTATATATATATATATATATATATAAAAAGTCAGAAACCAATAAAAACATTAAATTTAAATATTACAAAAAGTTTCAAATAGTTCCAACCGTATATATTAAAGGAATTTTTTTTCCGTAGATTTTGAGACTAAAGTTCTCATTTTTGTCCTAAGTAATTAAAACATATCAGTCTTTAATTTTTTAAGTTTTGAGTTTAATTTCAATTTAAATCCTATATTTTAAAATGATACAAATTTACTATAATGGATATAAGTTGTGTTACAATTTGGTTCTTAAGTTTTAATATTTACACTTTTAACCTTGATTTTTAACTAAATACTGACTTTCAGTCTTTTACATTAATGAATACTATATAATTTAAAATAATTATGAATTTAGGTTTTAAAGTTAATCTTAATAATGATGAAAAATAGTTATACTTAATTAATTATCATTCTTTTAAATTAATTAATAGACATTAACACTAAAGGAGGAAAGTGACTATTTAGTGAAAAATCGAGGTTGAAAATGTAAATCTTGAAACCTAGGAACCAAATTGAAACAAAATTCAATTCTCAAAATAAAATTGTAACCTTTTGTAACTTAGGGACTAACTTGAAATTAAACTCAAAACTTAAAGACTAAACGTATAAGATTTTGAAATCTAGGAACCAAATAGAAATTTGACCCAAAATATAGGGACCATGAAGGTATTGTTTTTTCAAATAATAATAATGATAATTGTCATCGAGACGAGAACAAAGAAAAAGAGATGTGAAAAGAACTTCTTCGCCTCTATTTGGTTCCACATGAAAAAGAAATAATTGTCCTTGTTCCCTCCCTTCTTTCATATGAAGATTCTCTGATTTATTACGAACACAGGGTTAAGTCATGCACAAGGAATGTATTAGATAACATGAAGTTCCATATTAAAACAAAATTTGCAATGAGAGGAATAGCTGATCTAAAAGAGTGAGGTCTCTTGATTTTTCAAATATGGAATCTTCAACAGAATGAACGTTTATACATTTGGAAGTTTTTGTAATATTAATCCATCAACTTAAGCTGTTTTTGGGTTTGATGTTGCTGATAAACCAGCAAGAATAATAGAATTTTGTTCTCAACAAAGAATATAATTTTCCAAACTCTTGACCTTGAAGCTTAGTGAGAATTTGAAGCTTTTAGACTTAGAAACTCTCTTTACATTAGCTTTTATGGTCTTGATTAAATGGTTCAGGATTCAATATACTAACACCTTGGGGAGGGTTTTCTTGATCAAAACTTTTTAGTTGGAATTCAACATATCCATCCATGCATGGACCATATTATAAATCACAAACATATTACAATAATCTTTCTTTTGATGCTGTTATTCATGCAATACAACCCAATTATTTCTATTAAAATTACCAATAATTTTCCAATTTTCTTATAAAAAATGTTATAATCCTTGTGGTGATTCTGTTGTTGACCTAATCAAAGAAACAAACCTAACAAAAATAAAGTCTAAATTTATCTAAACTAGCAAAACAAAAAGAAGAGACAAGCCTCAAAGGCATTAGGACATTTGTGAAAAGCACTACATCGTCAGTAGGACGTAAAGGTGATGTTAATGTCAAATGAATTTTTCTTGACTGAAATTTGTCATCAACAATAATAATATATTTGAAACTATGAATGTTAAATCTATTTTTGACAATATCTGGCATGGTGAGACTGAAAGCTAGATTTTGAAGTTGATAGTACGAGTTCATGATAGTTGAGTTACGCTTATATTAACTTTAAGCCTCGTACCTCAGAAAAATATCTTTAAATTGTTCTGAACTTTGGAACTAAATACAATTCAATCTCAATCATAGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTATATATATATATATAATTAAAATAAAAAGACTTCGGCTTGATACGTATTTCTTTGGAACTTTTAGCGTTGTCTCATCCCTTGGATAAATACGAATAAAGCAACTTTTCTTTTAAAATTACAATCAAGCAATTCCCATAATTAAAATATTTATATATTTATATTTATACCCTTTTGCGCTACCATTCCTCGCCATCTGCCTTTTCCACGTATATATATATATATATAAACATCTTACGTGTCTATTAGATATAATAACTATTGAGATTTAAATCTTACTTAGCATCTAAAAATATATAATGATTAGTTGATTAGATTACCAATTTAGTGTGTTAGTTCTACGTTAATTGACATTAACTTAATCTTTCACTGAAGTCATATGTTAAAACTACTCATAAAAAGGGGAAAAAAAAAAACTTCTCATTATGAAACTATTTCATTTTAGGATTTTTTGAGGTGTTCATGAGTTGAGTTAGATTGAGTTGAAGCACTTTTTAGAATCGATTTAATTTTTCGGGTTATAAGATTTTTTAACCAAAATAGCTCTTATTAAATAATAAATCCAATCTAACCATGAAATGTTTTGTATTACTCGAGTTATTTATTTAAAATTTTGTTCTAAAAATAATTAAAATGTTAATATGTAAAAAAATTATTTAATTATTTTCATATATTGAATTAAGATAAACAACGCGATTTCAATTTATATTATGATTTTTTTTCCATATTGTTGAAATTGTGTTGTTGGAGAATAAATTATCCAAAAAAATTCATGAAATTAACTTGAATATATGTATATATAATTGTATCATAAGTACAAAAAACACTGTTTAAATTTAATAGTAAATTCAAGTTGGTTCAAGTTATTTTAGGTAAACCCGTAAACCAACCCAATCCATAAAATTTTCATTTATTTGAATCCAACCCAAACTAAAACTACATTTATTTTTAGTTTTCAAAATTTAGCTTAGTATTTGAAAATATTGGTAAAAAGTTAGATAACAAACCAAGAAACCTAGAAGTAGAACGAGTGTTTATAAGTTTAATTTTCAAAAATTAAAAACTAAAAATCAAATGGTTACC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ATGGGTTTTCTTAGAGAAAGAGAAATTAGGGATCCTCGTGCTGATCTGGCGAAAATTGGGAGAGAAGGATTTGAACTAATTGACGAATACTTTGGTCGAGCGCCGGCGGCTAGAAGGGAGGCGGCCAAGGCAAGGCCGATTCTGCCCCAGCCACCACGTAAGGAGGAGCAACCTCCGAGGAAGAGGACGGAAAAACCGGCGGCGGCAGTGAAAACCTCCGATCAGGTGGCGAAAACCGGTGGTGGAATCGTGGTAACAACTTGGCGTGCAGAAAGAGAAATTAGGAATACTTGTGCTGACCTGGCGACGATTGGGAGAGAAGGATTTAAACTAATTGACGAATTCTTCGGTCGAGCGCCGGCAGCCAGAAGGGTGGCGGCAACGGAGAGGCCGGCTCAGCCGCAGCCGTCGCGTAAGGCAGAGCAACCTCCATGGAAGAAGAAAGAAAAACCACCGGCGGGCGTGACTTCCGATGAGTTGGCCAAAACCCGCGGCGGGATCGTGATAACAACTTGGCGTGCAAAACGAAAATAG MGFLREREIRDPRADLAKIGREGFELIDEYFGRAPAARREAAKARPILPQPPRKEEQPPRKRTEKPAAAVKTSDQVAKTGGGIVVTTWRAEREIRNTCADLATIGREGFKLIDEFFGRAPAARRVAATERPAQPQPSRKAEQPPWKKKEKPPAGVTSDELAKTRGGIVITTWRAKRK Homology
BLAST of CcUC06G114320 vs. NCBI nr
Match: KGN47422.1 (hypothetical protein Csa_021740 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 125.9 bits (315), Expect = 3.4e-25 Identity = 72/92 (78.26%), Postives = 76/92 (82.61%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G114320 vs. NCBI nr
Match: KGN47421.1 (hypothetical protein Csa_021737 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 2.3e-18 Identity = 69/96 (71.88%), Postives = 72/96 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G114320 vs. NCBI nr
Match: KAG6575081.1 (hypothetical protein SDJN03_25720, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 3.4e-17 Identity = 57/82 (69.51%), Postives = 62/82 (75.61%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G114320 vs. NCBI nr
Match: KAG6575082.1 (hypothetical protein SDJN03_25721, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 9.8e-17 Identity = 55/81 (67.90%), Postives = 60/81 (74.07%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G114320 vs. NCBI nr
Match: XP_023548315.1 (multiple organellar RNA editing factor 3, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 79.3 bits (194), Expect = 3.6e-11 Identity = 44/56 (78.57%), Postives = 44/56 (78.57%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G114320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KG95 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G318690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 125.9 bits (315), Expect = 1.6e-25 Identity = 72/92 (78.26%), Postives = 76/92 (82.61%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G114320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KI19 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G318680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 1.1e-18 Identity = 69/96 (71.88%), Postives = 72/96 (75.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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