CcUC06G111990 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGTAAGAGAATTCAAATATTCATATGCTAGTTGAGTTACGAAAAATAATGTGAATTTTATCCTTTCATTTAACCAGATGGTTGAGGAGAGGATAATCTTTGAATAATTGAAAGTATTGTGTTTATTGGGAGCACAAACTTTACCTTGTCTTCAAGTCTTCCTTTCTTCATCATTTACATTTTCTCTCTCAAATCTCAAAATCCCAATTCCAAAGCTCCACAGCAAACTTCATCAATGGCGTCTTCAACTTCTGCCCCTTTCATGAAACCCCATTTTCCCCATTCTCCACTTCCACCAACATCTACCACTCACCATAGCAAGTCCTGTGCACAGTTTCTCTGTAAATCCCTCTTCTTCTGCATTTTTCTCCTCCTCCTCCCTCTCTTCCCTTCCGAAGCTCCAGAATTCGTCAATCAGACTTTGCTCAACAAATTCTGGGAGCTCTTTCATCTCTTGTTCGTCGGCATTGCTGTTTCCTATGGTCTCTTCAGCAGAAGGAACATCCAGGTGAGTGTTGACGAACCTCGCTTCTCCAATTTTGAAAATCCCCAGTTGTATTTGTCTAAGATGTTTCACGTCGCTTCGATTTTTGAAGATGTTGACGATTTGAGTATTTCTGATGAGAGGAAATTGAGTGAAGTTTTGTACATTCGGCCAAATCTTGGATCTGTGAGTGATTTTAATGCCCAATCCCGTGAACAGGAAAATTTTCATTATTCAATACCGGAAAAAAGGTATGAAAATTCTCATGAATTTGCCGATACCGATAATGTCGGTCTTGCTTGTAAATCGAGATATACTCGCGGTGGATCTGTGGTGGTTGTTGCCGAAACAAACCGTAGTTCTGGTGAATGGTTGGAATCTGGCGCCATTGTCAATTATAAACCTCTAGGTTTGCCTGTTAGGAGTCTGAAGTCGAGTCTTAGTGACCTCGATGATGTCGAATCCGATTGTGGTCATGAATCTTGTTTGAGTTCTAAAAGTTCTTCCAAGAGCTCTGAGAATAATTGTGAAAGAAGAAATGAATTTGGTGATAATTTTTGTGTGAATTTGGAGGAGAAGTTTGATGAAACTGTAATTGCATCAATGTCCCCATTTCAATTGCGCGAGAAATTTGGTAAGAAGATGATGAGAGAAAGAAGAGTTAGGAATGCTGTTCTTCGCCCTTCCCATTTGAGACCTCTCTCCATTGATGAAACTCAATTTGAATCACTGAAAAAATCAAGTTCTCTTCATTCTAATCTATCTCAGTCATCACAAACTAGTTCCCTGTCTTCTTTGTTGTCATCTACGACAAGAAAACACCGTAAAATGTCGTCGCTCGGTAACATTTCCTATAAGCCGTTGCATTCTCGACAATATAGTATGAGTTCTCTGTCTGAAAACAGTAGAGGGAGCTCTGAAGACCCTCTGATTGAACCAGAAAATTCATCTGAATGCAATGAATCTGTGGTAAGTTCCCCGCGTTTGGACAGGAATTTCGCAAGTCTTCCGAAAGCTTTATCTCGGGGAAAATCCGTTAGAACAATTAGAGCAAATGCAATTGCCATAGAGGAAATGAAAACTCAAGAGAAGATGCATAGAAACCAAGTTGAAAATGATGACAATGTAGGGAATAAGTTTGAAGATGGAATAGGACACGGATGGCCTGGTGTTGATAACCCGAATGCTGGTAACTCGAATCCTTTTCCAAAGACGACGTTCACGGGGATTGAGGAGCAAAAGGAAGACACTGAGAGTCAGCTAACAGATGATGGTAAAGATAACTCTGAGTGGGAGGGTGAAAGTTTGTTTGCGAGTTCAGATGAAGAAGTTGCTTCGAGTATGGCGGGCGATTCGGAATCAGGGGCTCACGAGGTTGACAAGAAGGCGGGGGAGTTCATAGCCAAGTTCAGAGAGCAAATACAGCTTCAGAGGATGGCTTCAGTAGATAAAAGATTGAGAGGAGGATGGGGCTCATTCAGCAGCACAAGCAGCAGCTATTTTAGTTGATTGCCCAAGCCTTCAACCTTAAAAAGGTTTTGTTCTAAACCATTTATATATTTAAGGTTAAATATGTACTTTGCTCTCTAAGATACATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTAATTAATAATAAGTTCTAAAACCTATAATACTAGATGCTACGTATGCTCCTCTCTTAACCTATTAGTATTTCACTCACTTGATGATTCAAGAGATTAGAATCGTAGCATGTATTTGTAGGTCATTTGTTTTTGTTCTCTTAAAAAGGTTTTTACATAATTATGAGGTGAGGTTAACCTTTTAGAACAAATATAATTTTTTAGGGAAATTATTATAAATAAAAAAAATATCAAACTATTTATAAATATAGAAAAATTGTCCCGTCTATCAGCAATAGGTCATAAGAGACTTCTATTATTGAACAATAGAAGTTTATTACGGTCTATCGCCCTTTGATACAAGTCTATTGCGGATTATCGTTGATAGACAGTGAAATTTTTCTATAGTTGTAAAAATTTTGGCTTATTTTGCTATATTTAAAAATAATTTTGTTTTTAGGTAAAAAAATAAATGTCTTAGCACTTAAACTCTGCTTTGTTGAAAATCTTCCATGATAGAGGCTATATGTAAAGACAATATTTAATCTACAATAACTCATAAAATAATATTAAAGCTTTTATGAAATTGTTTTATTACTTTTGTCATCACTCATTAAATCATTTAAAAACTTGTTTCAAAATCAATTTTGAAAGTGGAAAATCAAATAATAAATTGATTTTGAACTATTAAAGTGATGTTAATAATCACATAATTAACAATTGTTTTTGTTTTTGGTAATCTCTATAATTATAATGGTAAGAATAAACTTATTGTTGGTAATGGAAAGGAACTAAAAATATCGCATGTTGGCATTTGCATGATACGTTCTTTTAAACTTAGAAATGCACTAAATCTTTCAAGCATTAAGGAGATGTTTGGGATGTAGAGGTTAATTTGTGTGTGAAGTTAATTTATTTATGAAGTTAGTAGTAAATCTGTGTTTGGGGTAAGTAAGATAGTGGGGGTAAATTTCAACTTTTAGATTGGAAAAAATAAATAGTTACAGTGTCTAATAATAGAGTTGTGTGATTTAGTTATATTGACCAACGTAGATCTAAGGTGTGTTTGAAATACATTTTTAAGTGATTAGTTTAAAAAAATAAATTATTTTGAAAAAAAAATTAGAGTGTTTGACAATCACTTAAAATAGATTTTGAAATGTATTTAAAACAATTTTTATAAAAAAAAGTTTAAATAAAAAATGAGTTTTTTTGAAAAAAAAAAAAAAACAATTTTTTCTTAAATCAATCTTAGCGGACCCTTATTATTTTAATTATTTTCATACTAAATTTAATTTATAATTTATTACAATATAATGTACCACCACATGTTACATAATTTAGGCTAATTTTGGAAAACATATCTTTAAATCTTGTGTGGTCGGTTAATTTTGGGTACTTTTTGACGGTATTTAAAGTAGAGAAATCGAATCTCTAACTTTAAGATTAATAATAAAAGGAATTTTGAATTAGGGTGGTTTGGATCATGGATATTTTTTTGAATCCTCCCTCATTATTGGGCTAGCACAACCCTAAAACGTAAGCTCGACTCAAACTCAAGTCCAAGGATCTAAAACATTTTTTGAACTTGTATTGGGTTGACTCAAACTTCAATTGCCAAATTATGAGTCAACTTAGGCTTGGCTCATTGGTACAAATTATGAGTCGGTTTAGCTTGACTCATTGGATTAGCAATTGAATATTAATTATTTTAAAAACAATACAGGTGTATTTTAGATTTTCTTAATAAGATATTATTAAATTTTATTAAAATTCTATTTTTTTATTAAATTGGTATTAATTATTTTGTATTCTTAATTACTTTTTATTAATAAAATTATATAAACTTTTATTTAGTGTTTAATTTTCTTAACAAATTTTATTAGATTTTTAAACCTAAAAAATTATATATTAACTAAAAACTATGATATATCTAAAAGTTAACATTGAAAATATTATTTTTTAATATATAAAATATAATATAAGGAGAATTATATACACATATTTGGGTCAACCCAACCTTAAGTTTATTGGACCGGCCAAAATAATGATTCATATCCAATCTGATGAATAAATGAGTTTGACTAAGCAGAATAGTCAAACATTGATTTTGAGCCAAGCTTGGATTGAACATGGGCTCGGCTTAGGCCAACCTTTGAGCTTCAAGCACGTTTATAAGGCTGTGTATAGATATTAAACATGCTAATTTTCAAATATAGCAAAATTACCCAAAATATTTACAAATATAGCAAAATGTCATTATATAACACCAATAGGCATCTATGAGTATCTATCAATATCTATCACTAATAGACAATTGTATTATGCTGTATTTAAAAATATTTTCAGTAGTTTTATCATTTAAAATAATTACCATTAAATATATAAGATTTAAATGTATGCGATAAATAATGTTGTGTTTAAACATGCACAATAATTAATGTGTATTTGGTAATTGAATATGCACAATAATTAATGTGTATTTGTTTGATTTACTAGTTGTGTATATTATAACAAATTAATTTTTTTCTAAACAAAATACTAGATTAAGTAGTTACTTAATTAAATGTAAGATAGTAATTAATGTCGTCAAATTAAATTTAGTATTATTTAATATATTGTTATATTCATTAATTATTTAGTCACTTGAAACAAAAATAAATTGATTTTTTTTCATATTGCATATTATTTAAACTATTTAATTTAATTACTAAAAATAATTAAAAATCAATCCCACTATTAATAGAATAATAAATTTAACGTTAACTAGTTAGAAATTAAGATAACATAAAAGGTTGAATATAAAATATTAATTGGAATTTAATTTAATTATCAATTTAAATTAATAGTAATAATTAGTTGATATTAATTAATTTATTAATTAAATTATAT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Match: XP_008459772.1 (PREDICTED: nucleolar protein 6 isoform X2 [Cucumis melo] >TYK24723.1 nucleolar protein 6 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1860.5 bits (4818), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1052 (89.92%), Postives = 978/1052 (92.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. NCBI nr
Match: XP_008459771.1 (PREDICTED: nucleolar protein 6 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1855.9 bits (4806), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1053 (89.84%), Postives = 978/1053 (92.88%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. NCBI nr
Match: XP_031741940.1 (nucleolar protein 6 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8648875.1 hypothetical protein Csa_008491 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1853.2 bits (4799), Expect = 0.0e+00 Identity = 943/1052 (89.64%), Postives = 971/1052 (92.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. NCBI nr
Match: KAA0039774.1 (nucleolar protein 6 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1850.1 bits (4791), Expect = 0.0e+00 Identity = 945/1064 (88.82%), Postives = 977/1064 (91.82%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NRY2 (Nucleolar protein 6 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=nol6 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 394.4 bits (1012), Expect = 6.3e-108 Identity = 301/1039 (28.97%), Postives = 494/1039 (47.55%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8R5K4 (Nucleolar protein 6 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nol6 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 386.3 bits (991), Expect = 1.7e-105 Identity = 295/1028 (28.70%), Postives = 494/1028 (48.05%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5M7P5 (Nucleolar protein 6 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=nol6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 386.3 bits (991), Expect = 1.7e-105 Identity = 306/1047 (29.23%), Postives = 488/1047 (46.61%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9H6R4 (Nucleolar protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NOL6 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 364.0 bits (933), Expect = 9.2e-99 Identity = 302/1083 (27.89%), Postives = 505/1083 (46.63%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8IH00 (Nucleolar protein 6 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Mat89Ba PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 287.7 bits (735), Expect = 8.4e-76 Identity = 280/1034 (27.08%), Postives = 464/1034 (44.87%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DM56 (Nucleolar protein 6 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G002820 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1860.5 bits (4818), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1052 (89.92%), Postives = 978/1052 (92.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC59 (nucleolar protein 6 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498805 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1860.5 bits (4818), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1052 (89.92%), Postives = 978/1052 (92.97%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBE8 (nucleolar protein 6 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498805 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1855.9 bits (4806), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1053 (89.84%), Postives = 978/1053 (92.88%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T8I5 (Nucleolar protein 6 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold122G00390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1850.1 bits (4791), Expect = 0.0e+00 Identity = 945/1064 (88.82%), Postives = 977/1064 (91.82%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GEN8 (nucleolar protein 6 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453502 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1840.9 bits (4767), Expect = 0.0e+00 Identity = 935/1052 (88.88%), Postives = 969/1052 (92.11%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. TAIR 10
Match: AT1G63810.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nrap protein (InterPro:IPR005554); Has 396 Blast hits to 382 proteins in 182 species: Archae - 3; Bacteria - 2; Metazoa - 142; Fungi - 146; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 60 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1222.2 bits (3161), Expect = 0.0e+00 Identity = 620/1049 (59.10%), Postives = 787/1049 (75.02%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC06G111990 vs. TAIR 10
Match: AT3G60380.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: hydroxyproline-rich glycoprotein family protein (TAIR:AT4G16790.1); Has 6102 Blast hits to 3981 proteins in 424 species: Archae - 6; Bacteria - 372; Metazoa - 2603; Fungi - 655; Plants - 291; Viruses - 28; Other Eukaryotes - 2147 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 144.4 bits (363), Expect = 8.1e-34 Identity = 139/398 (34.92%), Postives = 192/398 (48.24%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 43.5 bits (101), Expect = 2.0e-03 Identity = 52/183 (28.42%), Postives = 89/183 (48.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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