CcUC05G094270 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC05G094270
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr05: 13829624 .. 13831861 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC05G094270
SyntenyCcUC05G094270
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
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AGTAAGTGTACTTGCAGTGGAGTTCAAGGTTTGATGAATTATTATCAAACTGAATATGTAATGTGTTTTCTCATGGGATTAAATGATTCATTTGCTCAACTTCGCACTCAACTTCTACTGATGGAACCGGAACCTCAATCAACAAAGCTTTTGCACTTGTTTCTCAAGAAGTTGAGCGACGCTCTATTCCTACTTGAGTTGCTCTGTCTCAAAATTATACAGCGTTTGTCGTTTGAAACAATCCTCCATCTTCTTCGACCAATCAACCTACCATATTTTAGAATAATTTCGGACAAAATAAACGTTGTGATCCCCCAGTTTGCACCTATTGTAATATATTGGGTCACACGATTGAAAAGTGTTACAAGTTACACGATTATCCACCGGGTTATCGTGAACGCAGCAATCAGCGTCCTTCTCCTTCTTCAACCTCATTCATTAAACCAACAGAATCCTCTATTTCTGTAGTGGCTATCTTCTACTTCTATTGATCCATTATCTTCGATCAACAATGAGCAATGTCAAAGTCCTTTGGCTCTTTTATAGAATCATTTGAGCAAGGCAACCTCCACTGAATCTTCACATGTGGCAGGTATATGTCTCTCTGTTTCACCATTTGATTCTATGTCTGATAAATGGATCCTAGACTTTAGAGCTTCTTCTCATGTTTCTTGTTCTCGACAATATTTTCATAACTTGCGTGCTATAATTGGTATGTTAGTATCATTGCCTAATACATCTCGGGTGATTGTAGAATTTATGGGGGATATTTGTCTCAACCAGCATATTACATTGTATAATGTCCTATACATACCTTCGTTTTCCTTTAACCTCATCTCCATCAGTGCATGACTGGTCAATTATTGAAATTAGATTTAGTGGTGATTTTTGTGTTCTCCAGGACAAGTCCTCTTTGACAACCATTGGCAAAGCTAGGAAAACTCATGGATTATATGTTCTGGATGTTATTCCTCTTTCGGTGGTTGGTAATCCATCCCCCTCTCATTCACATATTACTTGCTCCACTGTAAACTTTGATACCTGGCATTGTCGTCTTGCCCACCCATCCATTAAGCATATGATTGCTCTTAAGGATGCTATTCATGTTGAAACTAAGAATTTTAATTCTTCATCCCCTTATTCCATTTGTCCTTGAGCTAAACAAAAGAAACTACCTTTTGTATCACATAATATTGTAGCTTTATATAGCTTTGATCTTATAAATTGTGACATTTGAGGACCTTATCAACATCCTTTTCATTTTGGTTATCGCTGTTTTTTAACTATTGTGGATGATTTCTCTCATTTCAAATGGACTTTTATGATGAAAAGAAAGAGTGAGGCTTCAGTTATTGTTCCTTTGTTTTTTGCTGTGATTGAAACTCATTTTGGTGTGCATATAAAATAATTTAGATATGATAATGCTCCAGAGCTGGCTTTCACAGGGTTTTTTAGTTCTAAAGGTGTTGTACATCAATTTTCTTGTGTTGCTAGACCTAAACAAAACTCTGTTGTGGAGAGAAAACATCAACACTTGCTTAATGTTGCTCGATCTTTGTTATTTCAGTCTTGAGTTCCTATTAAATTTTGGGTTGATTGTGTTTCTTCCTACTGCTTTTTTTATTAATCGCACACCATCCTCTCTATTAAAATGGAAAACTCCTTATCATCAATTGTATGGCAAGTCTCCTGATTACTCTATGATGAGATCTTTTGGTTGCTTGTGCTTTGCTTCCACCTTATCATCTCAAAGAACCAAATTTGAACCTCGGGCTATTCCAACTGTGTTTATTGGTTATCATGCTGGTATGAAGGGTAATAGATTATATGATATTGAGCATCAACGTTTCTTTATATCTCATGATGTTGTGTTCCATGAGCATGTTTATCCTTTTCATACAGTTGTTGACAAGGAAAACCTCCATGTACCTTTTAATGATATTGTTTTGCCTAAGTCATTTGATTTTGTTGGGTTGCCAAATGACACTCCTTCTGCTTATAATCCTACTACTACTACTGCTAATGTTGTTGATGTTGTTGTTGGTTGTTCGAATGATTCTGTTAGTCATAGTTCTGGCTTGAATATTGATAACAATCCTAAGGTTAGTACACATAATGGTTCTTAGTTGAATAATATCAATGATACATCTGTTGCTATTGATGATGTTGGAATACCAGTGTTTGATTCTGTACAACCTGAATTTGTTACCTTTGACCCAGCCACAAGACAAGCTTTAG

mRNA sequence

AGTAAGTGTACTTGCAGTGGAGTTCAAGGTTTGATGAATTATTATCAAACTGAATATGTAATGTGTTTTCTCATGGGATTAAATGATTCATTTGCTCAACTTCGCACTCAACTTCTACTGATGGAACCGGAACCTCAATCAACAAAGCTTTTGCACTTGTTTCTCAAGAAGTTGAGCGACGCTCTATTCCTACTTGAGTTGCTCTGTCTCAAAATTATACAGCGTTTGTCGTTTGAAACAATCCTCCATCTTCTTCGACCAATCAACCTACCATATTTTAGAATAATTTCGGACAAAATAAACGTTGTGATCCCCCAGTTTGCACCTATTGTAATATATTGGGTCACACGATTGAAAAGTGTTACAAGTTACACGATTATCCACCGGGTTATCGTGAACGCAGCAATCAGCGTCCTTCTCCTTCTTCAACCTCATTCATTAAACCAACAGAATCCTCTATTTCTGTAGTGGCTATCTTCTACTTCTATTGATCCATTATCTTCGATCAACAATGAGCAATGTCAAAGTCCTTTGGCTCTTTTATAGAATCATTTGAGCAAGGCAACCTCCACTGAATCTTCACATGTGGCAGGACAAGTCCTCTTTGACAACCATTGGCAAAGCTAGGAAAACTCATGGATTATATGTTCTGGATGTTATTCCTCTTTCGGTGTCATTTGATTTTGTTGGGTTGCCAAATGACACTCCTTCTGCTTATAATCCTACTACTACTACTGCTAATGTTGTTGATGTTGTTGTTGGTTGTTCGAATGATTCTGTTAGTCATAGTTCTGGCTTGAATATTGATAACAATCCTAAGTGTTTGATTCTGTACAACCTGAATTTGTTACCTTTGACCCAGCCACAAGACAAGCTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTGGCAGGACAAGTCCTCTTTGACAACCATTGGCAAAGCTAGGAAAACTCATGGATTATATGTTCTGGATGTTATTCCTCTTTCGGTGTCATTTGATTTTGTTGGGTTGCCAAATGACACTCCTTCTGCTTATAATCCTACTACTACTACTGCTAATGTTGTTGATGTTGTTGTTGGTTGTTCGAATGATTCTGTTAGTCATAGTTCTGGCTTGAATATTGATAACAATCCTAAGTGTTTGATTCTGTACAACCTGAATTTGTTACCTTTGACCCAGCCACAAGACAAGCTTTAG

Protein sequence

MWQDKSSLTTIGKARKTHGLYVLDVIPLSVSFDFVGLPNDTPSAYNPTTTTANVVDVVVGCSNDSVSHSSGLNIDNNPKCLILYNLNLLPLTQPQDKL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC05G094270.1CcUC05G094270.1mRNA