CcUC05G093330 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGCACGGAAGTACATCTGGGAAGGTGCAATTCCATTACAGATTCATCTCCATGAATCTGAAGTCACCACCGTCCCTCCTCCACCGCCTGCAATGGTAATTCTCTGTTTTCTCCCTTCGCTTCACTTTCCCTTTTCTATCTATCTAATTTGAGCCTCTCAGTTTGATCAACGGATGAACATCATGGGTTCATTCTGTTTATTTATCTCTTTTCCTCTGAGAAATTTGACTTTGGTTACAAGGGTTATTTGAATTTTCTGTTTCTTGTGTTTTCAATTTGGTGTTTGAACAAGGGATGATTTTTATATGTCTACTGTACGCTCAAGTAGAACTTCGATTGAACTTAATCTAATTGAATTGCTTTCAATGGGGGATTTTTGTATTGTGACCTACTATAGGTCTTAGCTCCTCGGATTGGCTACCTGCCTCTGTTGGCTTCTCAGATTAAACCTTACTTCAGTACTACGCTTCCTCCTGGAGTTGACACCATCTGGTTTGAGTACAAGGGTTTGCCCCTTAAATGGTACGATCTTCTTTTCTCTTTTAAATTTAATCTTTGTTAAAAGTTTCTTTGAATTTTCTTTAACAATCTACCAATCATATTTCGAGGTTGAACCTCGTACTGTTCTCTGTTTTTGCAAGTACTTACTATACACTGCTCTTCTCCGTCAACTAATTATTTTTGCTACTTTTTCGCTTTTGATCCAACTCTTTCTATCTCTCATTGCGTATGTCTCGCAAGTTACACTGTGCACCATCTCACGAGGTACACTCTGGAGAAGAAGCTGAAAATTGAAATATGTTAAATTAAAATTATTGTTATGTATTATTTTTTAGTTGGAAGGACTTCAGTTAATATAGAAACTGGAAAAAAGAAAATAAGACTGATATTCATCTCAACCTAGTCGAGTATGATTATGGACTCATCATTTAGAAGGGAAGAAGATGCTAGACACTCATGATAAAAGGGAAACAAATATCGTAGGTGAAGTAAAATAAATGAGAGGAAAGGAGAGCCTTAACCAATGCTAATGGGAGTTACAAAAAGGCCTGTTAGGATATATATCTGTTAAAGAATGATTACAAAAGGCTTTGTTAAGTCTACACCTTGAATGCTGTCTAAGGATGCAATCCCCAAGAAAGGGGGAAGTTTTCTCCAAACACTAGAAACGCACAATGATTCCTTTTTAACCAAAGATTCCATAAGAAACTTGTGATTAAACTAATCCATACAAGATTAGCCTTTTCCTTGGAGTGGTGGTTTTGCAAGAGGGAGTGAAGATTAACATGAGCAGAGTTGAACCGGTTAAGTTATATGCCCTTGATCAAGAGGTCGGAGGGTTGAATTCCCCCACCCCCACGTTTGTTGAACTAAAAAAGAGGGAGTGAAGATTGGAAATAATGTCTTTATCACGTGGATGGGCCTAGCAAAAATAGGTTGTAGTAGGATTCCACATGGTGGAGACAAACTGGCAATGAACAAAAATGTGATTTTGTTGTTTTGAGCTCCTCTTGCAAAGAACAAACCAGTTAGGGGAGAGAGCTGGATGCAGATTCTGCTTCTGAATTTTGTCATGGGTGTTGGTGTTGTTTGGACTATAGAGATTTCCCAAATGAAAATATCCAAATTGCCTTGCAAAAATCAGAATTGAATAAGTTCCTATATCAGTTTAGGTCTTTGGGAAGAGACTTGCATAATATTCTGAAAGATCAAAAGTCCAAGATCATTAATCTGGAGAAATGAGGAGGAACATCCTTTAATAATTACAAGGGAGAGAGTCAATCTGCGAAGTCTTTGTCATTGGACTTTCTTGTGAACAAATTCCAAATCAAAAGTTTATTGACCAAATTTGGGCAACTATCGTATTGGAATCAACATAAGGGCAATGAAGTTGTAGGTAGAGGAAGCAAGGGAAGTATTACCTCTCCAAGAGTCTTGATACACCAACAATGAGAACTTTGGTGTGGGCTATCCTTTGCAATCCTTTGGTTATGTGCACCTCCACAACTTAAGGAAAAGGTCAGAAACGGATCACTTTATGGTCTATGACCAAGAGATTAGAGAATTCATTCTTATCTCTGGGTTGAAAGTTGAAACACTCCCAAGTTTGGTAACTAAACTTGAATATTTCCAGATGTGCAATCTAGACACAAGGCTTGTAAGGGGAATTGACTCTGGAACATCAAGAAAAGTAATCAAATCATTCATCATTAAAGTTTGAGAAGAATATAACACTCCTTGGGTTTACACAGCCAATGGTGGGAAATAAAGAGAATCTAAAAACCCTAGGTCTTGGAAATCCCTAAATAATTAGGGGATAATTAGAAACTTGTTTTAAAATTAGGAATTTCAAGATAATTGAAAATTGATTCGTCTAGCATTCACTCCTAATAATAATATATGGCATTAAAATAGCAAAATTTGAAAGAAGCAAAATCCTTCTAGAAGGAGGCAAGGTTGGTGACAACCCTACGAGGCAAGACACATAGATGTAGGGGTGATGCTTGATACAAGCAGCGGGTGGGCGTGCGCCTAGGTGATCATAGATGCATGGCGTATGGTTGTGAGTGCATGTAGGCTTGTGCTAATTGGCGTGTGTGTGTGGGCTTCCTTCATGGATGCACGTTGATGGGCTACGTGAGGAAAATGCTTATGGGCTAGAGACTAGGCATGCATGGGTGGGCTTGCACAAGGAGCAGTGTGTGCAATGGGCCATGCAGATATGTTATTGGGCATCAATGTGTGGGTGTGCGGATGGACTGATGGCTAAGTGATGTGATGTAGTCTAATTAGCCTCAAGGAGTAATCCTCCTCCAATAATCAAGATTTTGGATCTTTTATTAGAATGATAAAATGTGTTTCATACAAGAGGTGAAGGTTCCTATTTATAGATTTTTATTATAAGTGGGGGTAAAAAGGGAATTAATCTAGAATATTGCCTAATTACCAAATCAACCACTATTCTTCTTACATCATTCTACCCCTCCAAAAAGAAAACTCTCTTGTTTTAAAAAGAAAAATATTATGAAGCAAAGAAGGGATGAAATAAACTTGTTCAATGGAATATGATCAAACCAATCTCCTATATTTTAATATATTATGATCAAAGGCATACATTTGAGACAAAAAATCCAATATTGCCACCAAAAAATGAACTTTGACATCCTCATAAACCCAAAAAAGATCCTTCTTCAAGCTCATTCAAAACCGTATTTAAAGGACCAATCACTAAAAAACCACCTTCCAAAGACAATCGTTCAAGAATCACGTCTTCTTTATCATTTGTTTCAAGTTCTTCGACAGTTTGGTCATCCATTTCCACCGCAATCTGTGTGTCATTGTTCTTGTTCGATTCTTGTTCGGTGTTCGATACTTTTTTTCCATCTTCTTCATTGGATTTTTCTTCTTCACTCGAAACTATTTCCATATCAACATCTTCAAATTCTTGTTTTCTTCAATGTTATCTTCAAGATTTTCTATTTGAAAATTTTCTACTTGTGATTCCTTTGTTTTTCTTCGGTATATGAAGTCAATTCGTTCTTGAACTCTTGCAAATGAATTGATAGTTGATCAATAAGTTGAGTCATTTTCCTCAATGAATGTCAGATTTCTTTTGTTGTTTTCTTCATTTCCTTCAATGCTACAAGATCAAAGTAGTCATTTTGTTGGATTCCTGAATCTGTTTTAATCTCATAGTGGATATAGGACTCATCCATTGATTCTCTTGAATCAACCTTTCTTGATCGTGCTTCATAACCAAAAGAGTAATTTGAGTCTTGAACATTCTTCTTGAGCTATAAAAATCCATTCTTGATGATCCTCGATGATTCTTTAATTCATCTAACTCCCAATGTTTACGTTGATTTCTTGAAAAATGGGTTTGATTGGATCGTTGGGCCCTTTTTCGATATGGTCACCTTCTTATGCCATCCCACACTTCCTTAGAAACATCACCGGAGTCACTAGAATCGAATTTCCAATGTGGATAATGATAGGTTCTTTGAGAAATCGAGCATCAGCAAAATTAGTATGTTGAAATTCTTCTTCGGAATCACTTGAGTCAGAATTCCAACACTGTTTTTGGAAGTAAATTTGATTTTCTTGTCTATACCAATTGCTGTATTTCTTCTTGGACATCTTCTTTGATCGGCAATAGTCTATTCTTCCAAAATCTTGACAAATCTTTGGTCTTTTCTTTCCTTCTTGGAATTTCAAGGGTTCCCCCTAATTAGATATTTGTTGTTTGGCAACAAGCACAACACCCAAAGCTCCCTCTTGTGATCAGCGTCACCAAGAGTTTTCCGGATTTCCACCGGCGGCTATCAACATTGGCCCAGGCGATTGCTATGATACCAAATTGATGTAGCCTAAGTAACCTCAAGGAGTAATCCTCCAAGAATCAAGATTTTGGATCTTTTATTAGAATGATAAAATGTGTTTCATACAAGAGGGGAAGGTTCCTATTTATAGAGTTTTATTACAAGTGGGGGTAAAAAGGGAATTAACCTAGAATAGTGCCTAATTACCCAATCAACCCCTATTTTTATTACATCATGGTGTGAGGTATCGAGGTTCCTCCTTAGAGTTCTCCCATGGGCTTACGTGAGCTTCTTATGCAATGTCATATTGGGATTATTAGGTGGCTTTCAACTTTTGGTCAGCTACTTCCGATCTTGGATCTTCTGAGACTTGGTCAAGATTGTGATCATATCAGGTGTCCTACAAAATGGTCTAAGACCATTGTCAAGAGAATGGTTAACTCAGTAAGATATTAGCTTTTGGGTTTTTCAAATTTCCTTCAAGGGCATTTGGAGTGCTTTGTGGTGTCATTCTCACTAACCCCTAGGAGAAGTCCCAAATTTAGCTTCACTGATTTCCTCGACAGTGAGCATTTTTTTTTTCTTGAGAGCATAGAGCAGTGCCAATAGACTAACACTCTTTAATTGACATAAAAAAAAGGGGAAGAGTCATTACAACGAGCTCTATAAAC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Match: XP_038906792.1 (autophagy protein 5 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 706.1 bits (1821), Expect = 1.6e-199 Identity = 339/358 (94.69%), Postives = 344/358 (96.09%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. NCBI nr
Match: XP_038906800.1 (autophagy protein 5 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 699.9 bits (1805), Expect = 1.1e-197 Identity = 338/358 (94.41%), Postives = 343/358 (95.81%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. NCBI nr
Match: XP_023528055.1 (autophagy protein 5 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 675.2 bits (1741), Expect = 3.0e-190 Identity = 321/359 (89.42%), Postives = 339/359 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. NCBI nr
Match: XP_022935040.1 (autophagy protein 5 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 674.9 bits (1740), Expect = 3.9e-190 Identity = 322/359 (89.69%), Postives = 339/359 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. NCBI nr
Match: XP_023528056.1 (autophagy protein 5 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 669.1 bits (1725), Expect = 2.2e-188 Identity = 320/359 (89.14%), Postives = 338/359 (94.15%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FFI2 (Autophagy protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 434.5 bits (1116), Expect = 1.2e-120 Identity = 210/355 (59.15%), Postives = 256/355 (72.11%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2X052 (Autophagy protein 5 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=ATG5 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 379.8 bits (974), Expect = 3.4e-104 Identity = 191/365 (52.33%), Postives = 260/365 (71.23%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ZGL4 (Autophagy protein 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ATG5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 375.9 bits (964), Expect = 4.9e-103 Identity = 190/365 (52.05%), Postives = 259/365 (70.96%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1DMA1 (Autophagy protein 5 OS=Neosartorya fischeri (strain ATCC 1020 / DSM 3700 / CBS 544.65 / FGSC A1164 / JCM 1740 / NRRL 181 / WB 181) OX=331117 GN=atg5 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 1.5e-27 Identity = 68/191 (35.60%), Postives = 108/191 (56.54%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5B2Q6 (Autophagy protein 5 OS=Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) OX=227321 GN=atg5 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 2.6e-27 Identity = 69/186 (37.10%), Postives = 106/186 (56.99%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F9G3 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442026 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 674.9 bits (1740), Expect = 1.9e-190 Identity = 322/359 (89.69%), Postives = 339/359 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3F6 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442026 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 668.7 bits (1724), Expect = 1.4e-188 Identity = 321/359 (89.42%), Postives = 338/359 (94.15%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IXC8 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481509 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 665.6 bits (1716), Expect = 1.2e-187 Identity = 317/359 (88.30%), Postives = 335/359 (93.31%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J5M0 (Autophagy protein 5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481509 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 659.4 bits (1700), Expect = 8.3e-186 Identity = 316/359 (88.02%), Postives = 334/359 (93.04%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T773 (Autophagy protein 5 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold379G001340 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 652.1 bits (1681), Expect = 1.3e-183 Identity = 319/351 (90.88%), Postives = 331/351 (94.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G093330 vs. TAIR 10
Match: AT5G17290.1 (autophagy protein Apg5 family ) HSP 1 Score: 434.5 bits (1116), Expect = 8.3e-122 Identity = 210/355 (59.15%), Postives = 256/355 (72.11%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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