CcUC05G092230 (gene) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAGTAGATAGGTAGCGTGAAAGTGATCAACCATAGTCGGAGAGAAGTCTCTATTTTGGTGAAACCAAATCAAGATTTTAGATCTCTCATTCACTCTCTCTCTCTCTCTTCCGATCCAAGTAATCTCCTCGCTGTGTTCAACACCAGTCTCGAGCGCCGACAATTTTTCTCCAAGATAATCCCGATCTGAGTTTCTCTCGCCTCAAGATCCGACATTAATTCCGTTTACCTGACTCGCTTCCACTTCCCCAAGTGACTCACTACCCATTTCTGAATTCTGCTTTTCATTGATGTTATGATATGCTTCCCAAACTTCCAACCTAGGGTTTCTATCCTCCATGGCAACCACTCAAACTCCGAGCTGGCGGGAGGGCATGTCCTCTGATAATGTTAAGGGCTTGGTTCTTGCTCTTTCCTCCAGTTTTTTTATTGGTGCTAGCTTCATTGTTAAGAAAAAGGGCTTGAAGAAAGCCGGCGCTTCAGGAGTCAGAGCAGGTATCTCCCTCTCTCTTCTTCTTGTTTGCTTCAATTTACCATAAAAGGATTAATCTAGTTCCTCGATTTCTTTGTTTCTAACTCCTCGTCGAATTTTTTGAAATTTTTGTAATTGGGTATTGACTATGTTGCAATCGGTATTTCATGCCTTGGCTCGTCCATTATTAGAGGTGGGTCACATTATTAATGAGGTTCTCGACGATTTTGCTTTTATTGAATTGTGAAATTGAATTTGTTATACCCATTTGTTAATCAATTATAGTATTTGCTTATTTGGAGGCCTATTGCCAAAAATGGTTTATTTAACTCCTATGTATCAGACTGCATTCCGAAGATTCCATACATTGTAAAACAGATAGATATATTTTTTAACTACTATTTGTTCCTTGGTAGATGAATAGCCCAAAAAGTTTAATTCCTTATATAGACTACTTTGAATTGAGCTAGTTGCGATGAATTTAATTCTGTATCGTTTTAATTTTGTCAACATTAATGAATACCAATTTTTATCCTTCAGCAGCCTGTCATTGTGGTATGGAGACTACACATGCTGAGCCAGAGTTTTGTAATTATGATTTGATTTGAATTTGATGCAAATCTATGCCAATTGAGAGTTCTTTTTGTAATCCCTTTGGCTTCATGGATATATCTTATCTCCCTTTGTGCATCTTCTTTTCTTAATTAAGTTTTGTTTTTCATTCATGACATTAATCGGAGTTGGGAGAGTGTTATTGTTCCTTTCTAATTACTCTTGTTAGTGATTGGTGCTTCCTTCTCTTTATCATGCTTTATGTGCACGGTAACTGTTATCTTCCACAATTTTACTGTAACTGATGTGACGATTTATGTCAGGAGTTGGAGGCTATTCTTACCTATACGAGCCTCTTTGGTGGGTGGGCATGATTACAAGTAAGACCTTTTTACTTTTTATAATGTAGCTTATATCGAAGGCCTTTATTATTTTTATCCCAGTCAGGCTTGGCATATTTGTCTGTTCAGTTTTTGAAGAAATCTTTTACATAGATACTAGATGGAACTTTAGGATCCATTGCCTCTCTTTGTACTCTATATATAATCTTTTTTGTTTTAGCAAGACATAATCTTTTCATTGGTATGTGAAAACGATGAAAAAGTTCAAGGATTCAGCCTCTCCCTAATTGGGAGAAATAGAAAAACGCCAAAAAGAGCCAACAACAACTAGAAAAAGGAACAAAAAAGAAAAATGTTTAGGATCTTCTGTATACCCTTTGGATATTTCATTTATCAATGAAATTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGATTACAAGAACCAATAATACCCAAAGAAAAAAAAAAAAAATCAAAATAGGCTACAAAATGGCTACCAAATCGACCAACCAATAAGCAGAGGTCGAATTCCAAACTTTTCTCTTGAGTATACCCATTACCAAAAAATGGACGTCACTTTGGGACACATGCGGATAGCCGCCCTATTGAAAGGGCTAAAAGTCAGCCAAAAGAACTAAACTCTTTTTTTAAGTTCCCTTTGAGTTCCACTTCTCAAGGAAAGTCGAGTCTAATAAAAGACGCCACTCTATTGGATTGGAGCTGCCACAAAAACAAATGAATCAAAAGTCTCAGAGGATTGGAGAACAACAAAGCCAAAAGGCCCAAGAGCACCATAATCAGACAAGAGTAGACAACACGAAACCAGTTGTAAAGCTTAAGAGACTGAAACATCTTAACGAGTGACTCTTGTAGGAATTGACATACTCAATTAACATCACATCTAGATACTCTGTTGATTATTTGGGGATTATTTTCCTTCCTGTTAATATTTTATCTTTGTATTTATTGTAAAGATATTTACTATATTTATTTCTTTCTTTATTTGTAATAGGTTTTCTTTTATATAAGAAAACCCTTGTCTAACAAAGAAAATAAGAGAAATAAAATATTTTAGCATGGGATCAGAGCCTGCTTGGAACCCTAATTTTTTTCTAAAAAAGAAAAAGAAACCCTAATCTAACCTAATCTGCCACCGCCGGCTCACCACTGCCACCACACCCTAGACATTCGTCGGACATCTCACCTTAGTCACCGGACAACTCCAGCACCGGTCGTCCGTGGATCCAATCGTTCGTGAAACCCAGACGCCGAACAAATCGCGAGTGAAGCTAGCCGACGCTGATGCCGACACCGCCTGGGTTCACCTCCTCTCCGCCGGCCGATCAAGTCTGCACAAGTTTCCGGGCAATTTCCGACCAGCTCCGGCGACTATCCGGTGGATCTTCATTCTGCCGCTGAGTGGATTCCTTTGGGTTGGTTAAAAATCCTTCTCTGTCATTTTTTTTCTTTTTCAGATTTGGTATTTTTTGGGTTGTGTGCCTACCTCTCTTGAATATGTCGGAAACTAAGGTATCTATCGCCAAGTCTTCAACAATCGGACCCATTCTAGCAATCCCACGGTCCAAATCACCACCATTCGACTTAACGGGGATAACTTTCTTCGTTGGTCCCAGAGTGTTCGGATGTATATTCATGGTCAAGGAAAGATAGGGTATCTCACAGGAGAAAAAATCGCTCCCAGTCCAGATGACACCTTATTCACTGTGTGGGACGTGGAAAACTCCATAGTCATGACGTGGCTTGTCAACTCTATGGTAGAAGACATCAGCAGTAACTACATGTGCTACACTACGGCCAAGGAATTATGGGACAATGTGACTCTAATGTACTATGATTTGGGGAACCAGTCACAAGTGTTCGAGCTGAACCTCAAGTTGGGTGATATATGACAAGGAGGCAACTCAGTTACACAATATTTTCACTCTCTGAAAAGGATATGGCAAGAACTTGATTTGTTTGAGACATATGAGTGGAAATCCACAGACGACCAAAAACATTATCGAAAAACTGTTGAAGATGGTCGCATTTACAAATTTCTTGCTGGCCTCAATGTTGAGTTCGATGAGGTTAGAGGCAGGATCTTTGGGAAAAATATTCTTCCAAATATTAATGATGTTTTTTCTGAAGTTCACAGGGAAGAAAGCCGCAAGAATGTTATGATTGGAAAGAAGGCAGTTGACTCAGTTGATAGTTCCGCGCTAGTGACTGAAAGTACTGCAATGAAAACTTCTGTTCAATCCAACAAAACTCATGACAAGCCTCGTGTATGGTGTGATCATTGCAACAAACCCCGTCATACGAGGGAAACTTGTTGGAAACTACATGGCAAACCTGCAATTTGGAAGAGCGCGAAACGATCTGAGAGAAATTCCCATCAGCATGCCTCCAACGCAAATATTGTTGATTCAAGTCCACTCAAAGAGCAAATTGATCAAATCCTGAAGCTGCTAAAATCCAATTCTTCGGGTAATCCTAGTGTTTCCTTGGCACAAATAGGTAATTCCTCTCAAGCTCTTTTGTATCTAAACTCCTCTCCGTGGATCATCGATTCCGGAGTTACTGATCATATGACTAGTTTCTCGTGTTTATTTGATTCATACTGCCCTGTTTATAGTAAAGAAAAAGTCCGTATTGCCGATGGTAGTTTACATCTATTGCAGGCAAAGGAACAATTTCCCTAAGTACAAAACTCATGCTACATTCTGTCCTTCATGTTCCTCAATTAGCTTGTAATTTACTATTTGTGAGCAAAATATCTAAGGATGCTAACTGTCTTGTTATCTTTTGTGAAACCCGTTGTCTCTTTCAGGATCAGGACTCGGGGGGAGACGATTGGACGTGCTAGGATGATTGATGGTTTCTATTACTTTGATGAAGTTTCAACTAGGCATAAAAAGATTCAAGGCTTGAGTAGTGTCAGTTCTCTTTCTGTCCAAGAAACTATTATGCTTTGGCATCGTAGATTAAGACATCCTAATTTCGTTTATTTAAAACATTTGTTTTCTTGTTTATTTAAAGGAATTGATTGTTCTATGTTTCAATGTGAAGACTGCATTTTCGCCAAACATCATCGATCTACTTTTTTACCAAAATCTTATAAACCCTCATCACCCTTTTATTTAATTCATACTGATTTTTGGGGTCCATCTAAGGTTTTGACAAAAAATGGCAAACGCTGGTTTGTTACTTTTATCGATGATCACACCCGTTTAACTTGACTTTACGTAATAACAAAAAAGTTGGATGTAAAAGAGGTCTTTGTTCGTTTCATAAAATGATTGAGACTCAATTTCAAACTAAAATTCACATTCTTCACTCTGATAATGGGACTGAATTTTTTAACGAACCACTAACCACCTTTTTACATGATAAGGGCATCATTCACCAAGCTACATGTCGTGATACTCCTCAGCACAATGGTGTTGCTGAACGGAAAAATTGACACTTGCTTGAAATTGCTCGTGCCCTTATGTTTTCGATGCATGTTCCAAAATATCTATGGGGGGATGCAGTCCTAACAGCTGCTTACCTAATCAATAGAATGCCTACTAAGGTGTTGAATTTTAAAACCCCTCTACAACACTTCAAA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MATTQTPSWREGMSSDNVKGLVLALSSSFFIGASFIVKKKGLKKAGASGVRAGVGGYSYLYEPLWWVGMITMIVGEIANFAAYAFAPAILVTPLGALSIIISAVLAHIILRERLHIFGILGCVLCVVGSTTIVLHAPQEREIESVTEVWQMAMEPAFLLYAALVMTAVFILIFHFIPQYGQTHIMVYIGVCSLVGSLSVMSVKAIGIALKLTLSGMNQLIYPQTWIFTLVVITCVLTQMNYLNKALDTFNTAVVSPIYYVMFTSLTILASVIMFKDWDRQSPTQVQQQAYQYGYLSMPRRMGLVVEKAFLSDDKNPRDCLDPLRIWFLFRFHADINLYSITNFYPLDIPFWIK Homology
BLAST of CcUC05G092230 vs. NCBI nr
Match: XP_038884185.1 (probable magnesium transporter NIPA4 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 535.0 bits (1377), Expect = 4.8e-148 Identity = 284/285 (99.65%), Postives = 284/285 (99.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. NCBI nr
Match: XP_022922721.1 (probable magnesium transporter NIPA4 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_023552525.1 probable magnesium transporter NIPA4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >KAG7015012.1 putative magnesium transporter NIPA4 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 534.3 bits (1375), Expect = 8.2e-148 Identity = 282/285 (98.95%), Postives = 284/285 (99.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. NCBI nr
Match: XP_022984760.1 (probable magnesium transporter NIPA4 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 534.3 bits (1375), Expect = 8.2e-148 Identity = 282/285 (98.95%), Postives = 284/285 (99.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. NCBI nr
Match: XP_008456039.1 (PREDICTED: probable magnesium transporter NIPA4 isoform X1 [Cucumis melo] >KAA0038946.1 putative magnesium transporter NIPA4 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK11198.1 putative magnesium transporter NIPA4 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 532.3 bits (1370), Expect = 3.1e-147 Identity = 282/285 (98.95%), Postives = 283/285 (99.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. NCBI nr
Match: XP_011651286.1 (probable magnesium transporter NIPA4 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN57607.1 hypothetical protein Csa_011718 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 530.4 bits (1365), Expect = 1.2e-146 Identity = 280/285 (98.25%), Postives = 283/285 (99.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LNK7 (Probable magnesium transporter NIPA3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g34470 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 2.8e-127 Identity = 238/281 (84.70%), Postives = 259/281 (92.17%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94AH3 (Probable magnesium transporter NIPA4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g71900 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 453.4 bits (1165), Expect = 2.4e-126 Identity = 234/281 (83.27%), Postives = 259/281 (92.17%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JKQ7 (Probable magnesium transporter NIPA5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g09640 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 442.6 bits (1137), Expect = 4.2e-123 Identity = 233/284 (82.04%), Postives = 255/284 (89.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LIR9 (Probable magnesium transporter NIPA1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g23870 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 394.4 bits (1012), Expect = 1.3e-108 Identity = 197/273 (72.16%), Postives = 240/273 (87.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B3LFA3 (Probable magnesium transporter NIPA2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g13800 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 389.0 bits (998), Expect = 5.6e-107 Identity = 198/275 (72.00%), Postives = 232/275 (84.36%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J9H2 (Probable magnesium transporter OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482945 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 534.3 bits (1375), Expect = 4.0e-148 Identity = 282/285 (98.95%), Postives = 284/285 (99.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E4W8 (Probable magnesium transporter OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430631 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 534.3 bits (1375), Expect = 4.0e-148 Identity = 282/285 (98.95%), Postives = 284/285 (99.65%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TA80 (Probable magnesium transporter OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold227G00390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 532.3 bits (1370), Expect = 1.5e-147 Identity = 282/285 (98.95%), Postives = 283/285 (99.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C299 (Probable magnesium transporter OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496090 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 532.3 bits (1370), Expect = 1.5e-147 Identity = 282/285 (98.95%), Postives = 283/285 (99.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LAD9 (Probable magnesium transporter OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G228350 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 530.4 bits (1365), Expect = 5.7e-147 Identity = 280/285 (98.25%), Postives = 283/285 (99.30%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. TAIR 10
Match: AT1G34470.1 (Protein of unknown function (DUF803) ) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 2.0e-128 Identity = 238/281 (84.70%), Postives = 259/281 (92.17%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. TAIR 10
Match: AT1G71900.1 (Protein of unknown function (DUF803) ) HSP 1 Score: 453.4 bits (1165), Expect = 1.7e-127 Identity = 234/281 (83.27%), Postives = 259/281 (92.17%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. TAIR 10
Match: AT4G09640.1 (Protein of unknown function (DUF803) ) HSP 1 Score: 442.6 bits (1137), Expect = 3.0e-124 Identity = 233/284 (82.04%), Postives = 255/284 (89.79%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. TAIR 10
Match: AT3G23870.1 (Protein of unknown function (DUF803) ) HSP 1 Score: 394.4 bits (1012), Expect = 9.4e-110 Identity = 197/273 (72.16%), Postives = 240/273 (87.91%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC05G092230 vs. TAIR 10
Match: AT4G13800.1 (Protein of unknown function (DUF803) ) HSP 1 Score: 389.0 bits (998), Expect = 4.0e-108 Identity = 198/275 (72.00%), Postives = 232/275 (84.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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